Spiroplasma chrysopicola: SCHRY_v1c00040
Help
Entry
SCHRY_v1c00040 CDS
T02676
Symbol
gyrA
Name
(GenBank) DNA gyrase subunit A
KO
K02469
DNA gyrase subunit A [EC:
5.6.2.2
]
Organism
scr
Spiroplasma chrysopicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
scr03032
]
SCHRY_v1c00040 (gyrA)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
scr03400
]
SCHRY_v1c00040 (gyrA)
Enzymes [BR:
scr01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.2 DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
SCHRY_v1c00040 (gyrA)
DNA replication proteins [BR:
scr03032
]
Prokaryotic type
DNA Topoisomerases
SCHRY_v1c00040 (gyrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
scr03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
Facilitator
SCHRY_v1c00040 (gyrA)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_topoisoIV
DNA_gyraseA_C
TBCC_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
16152222
NCBI-ProteinID:
AGM24591
UniProt:
R4UGY2
LinkDB
All DBs
Position
4957..7416
Genome browser
AA seq
819 aa
AA seq
DB search
MNPEDNNYDYDGKIKDVDISDEMKTGFLDYAMSVIVSRAIPDVRDGLKPVHRRIIYAMWD
LNMTYDKQHKKSARIVGEVIGKYHPHGDTAVYEAMVRMAQDFSYRYPLIDGHGNFGSMDG
DAPAAMRYTEARMSKIAGELIKDIEKETVIFADNYDGSEQEPTFLPGYFPNLLVNGASGI
AVGMATNIPPHNLGEVIDGVIAITKNKEITTAQLTKIIRGPDFPTGALITTGTSLLKAYE
TGNGAITIRSKVSIEENNNKKKIIISEIPYQVNKAKLVEKIADLIKEKTIVGIADLRDES
NREGVRIVIELKRDVQETFILNKLYKMTPLQTNYSLNILALSKNQPKIMGIKQILNYFIE
HQINIIIKRSQYDLKKCQNRLLILEGLRIALDHIDEVIRIIKQSPTTQEANDGLVRAFKL
AVEQAKAILEMRLQRLTGLEIKKIISEIIAIKTEILELEKIINNSDYQIEIMIKELEEIK
NKYGDQRRSQIIQEELTEIDPEELIKQESILILLTKDGYIKRVTEDTFKTQNRGGKGIIG
TANNVDDSINKIVLANSIDSLFFFSNSGKVYKLRAYQVESYSRQARGLPIINLIAIDKKE
QIKTILTINESISQESNLFFVTKKGLIKKTKLAEFSQIRQSGKVAIELKDGDELVDVIVS
EDNCDIIIANDDGKVIRFNEKEIRSMSRQSIGVKGIINDKGETISISSRLAGEEYILSVT
ENGFAKKTLISEYRVTGRGGKGVKSMNLTYKTGKLNFVNFVRNDAEIIIATKQGNIIRLP
LSQIPTFGRTTSGVKLIKLNKDDKIEVVELLRINDLKGE
NT seq
2460 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatccagaagataataactatgattatgatggaaaaataaaagatgttgatatttct
gatgaaatgaaaacaggttttttagattatgctatgtcagttattgtttcacgggcaatc
ccagatgttcgcgatgggttaaaacctgttcatcgtcgaattatttatgcaatgtgagat
ctaaatatgacatatgataagcaacataaaaaatcagcgcggattgttggggaagtaatt
gggaaatatcacccgcatggagatacagctgtttatgaagcaatggtaagaatggcacaa
gatttttcatatcgttatccgttaattgatggtcatggaaattttggatcaatggatggt
gatgccccagcggcgatgcgttatacagaagcaaggatgagtaaaattgctggggaatta
attaaagatattgaaaaagaaacagtaatttttgctgataattatgatggtagtgaacaa
gaaccaacttttttaccaggttattttccaaacctattagtgaatggggcaagtggaatt
gctgttggaatggcaactaatattccgccccataatttgggggaagtaattgatggagtt
attgcaattacaaaaaataaagaaatcacaacagcccaattaacaaaaattattcgtggt
ccagatttcccaacaggagctttaattacaacgggaacaagtttattaaaagcatatgag
acagggaatggggcaattacaattcgttcaaaagtaagtattgaagaaaataataataag
aaaaaaattattatctcagaaattccctatcaagttaataaggcaaagttagttgaaaaa
attgctgatttaattaaagaaaaaacaattgttggaattgctgatttacgggatgaatca
aaccgtgaaggggttagaattgttattgaattaaaacgcgatgtgcaagagacatttatt
ttaaataaattatataaaatgaccccattgcagacaaattattcattaaatattttagcg
ttgtccaaaaatcaaccaaaaataatggggattaaacaaattcttaattattttattgag
catcaaattaatattattattaaaagaagccagtatgatttaaaaaaatgtcagaatcgt
ttactaattttagaaggattaagaattgccttagatcatattgatgaagtgattagaatt
atcaaacaatcaccaacaacacaagaagccaatgatggtttggttagagcatttaagtta
gctgttgaacaagctaaagcaattttagaaatgcgtttacaacgattaactggattagag
attaaaaaaattattagtgaaataatagcaatcaaaactgagattctggagctagaaaaa
attattaataatagtgattatcaaattgaaattatgattaaagaattagaagaaattaaa
aataaatatggtgatcaacgtcgaagtcaaattattcaagaagaattaacagagattgat
ccggaagaattaattaaacaagaaagtattttaattttattaacaaaagatggttatatt
aagcgtgttacagaagatacttttaaaactcaaaatcggggtggtaaaggaattattgga
acagctaataatgttgatgatagtatcaataagatagttttagctaatagtattgattca
ttatttttcttttctaattcgggaaaagtttataaattacgagcataccaagttgaaagt
tattcacgccaagctcgcggattaccaattattaatttaattgcaattgataaaaaagag
caaattaaaacaattttaacgattaatgaaagtatctcccaagaaagtaatttatttttt
gttacaaaaaaaggattaattaagaaaacaaaactagctgaatttagtcaaattcgtcaa
tcaggaaaagtggcaattgaattaaaagatggtgatgaattagttgatgttattgttagt
gaagataattgtgatattattattgcaaatgatgatggtaaagtaatccgttttaatgaa
aaagaaattcgttcaatgagtagacaatcaattggagtaaaaggtattataaatgataaa
ggggaaacaatcagtatttcatctcgattggccggcgaagaatatattttatcagtaaca
gaaaatgggtttgctaaaaaaactttaatttctgaatatcgcgtaactggtcgtggtggt
aaaggtgttaagtctatgaacttaacatataaaacaggaaaattaaattttgttaacttt
gttagaaatgatgcggaaataattatcgcaacaaaacaaggtaatattattcgactacca
ttatcacaaattccaacatttgggcgaacaacatcaggtgtcaaactaattaagttaaat
aaagatgataaaattgaagtagttgaattactaagaatcaatgatttaaaaggagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
