Entry |
|
Symbol |
gyrA
|
Name |
(GenBank) DNA gyrase subunit A
|
KO |
|
Organism |
scr Spiroplasma chrysopicola
|
Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:scr00001]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:scr03032]
SCHRY_v1c00040 (gyrA)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:scr03400]
SCHRY_v1c00040 (gyrA)
Enzymes [BR:scr01000]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.2 DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
SCHRY_v1c00040 (gyrA)
DNA replication proteins [BR:scr03032]
Prokaryotic type
DNA Topoisomerases
SCHRY_v1c00040 (gyrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:scr03400]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
Facilitator
SCHRY_v1c00040 (gyrA)
|
SSDB |
|
Motif |
|
Other DBs |
|
LinkDB |
|
Position |
4957..7416
|
AA seq |
819 aa
MNPEDNNYDYDGKIKDVDISDEMKTGFLDYAMSVIVSRAIPDVRDGLKPVHRRIIYAMWD
LNMTYDKQHKKSARIVGEVIGKYHPHGDTAVYEAMVRMAQDFSYRYPLIDGHGNFGSMDG
DAPAAMRYTEARMSKIAGELIKDIEKETVIFADNYDGSEQEPTFLPGYFPNLLVNGASGI
AVGMATNIPPHNLGEVIDGVIAITKNKEITTAQLTKIIRGPDFPTGALITTGTSLLKAYE
TGNGAITIRSKVSIEENNNKKKIIISEIPYQVNKAKLVEKIADLIKEKTIVGIADLRDES
NREGVRIVIELKRDVQETFILNKLYKMTPLQTNYSLNILALSKNQPKIMGIKQILNYFIE
HQINIIIKRSQYDLKKCQNRLLILEGLRIALDHIDEVIRIIKQSPTTQEANDGLVRAFKL
AVEQAKAILEMRLQRLTGLEIKKIISEIIAIKTEILELEKIINNSDYQIEIMIKELEEIK
NKYGDQRRSQIIQEELTEIDPEELIKQESILILLTKDGYIKRVTEDTFKTQNRGGKGIIG
TANNVDDSINKIVLANSIDSLFFFSNSGKVYKLRAYQVESYSRQARGLPIINLIAIDKKE
QIKTILTINESISQESNLFFVTKKGLIKKTKLAEFSQIRQSGKVAIELKDGDELVDVIVS
EDNCDIIIANDDGKVIRFNEKEIRSMSRQSIGVKGIINDKGETISISSRLAGEEYILSVT
ENGFAKKTLISEYRVTGRGGKGVKSMNLTYKTGKLNFVNFVRNDAEIIIATKQGNIIRLP
LSQIPTFGRTTSGVKLIKLNKDDKIEVVELLRINDLKGE |
NT seq |
2460 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgaatccagaagataataactatgattatgatggaaaaataaaagatgttgatatttct
gatgaaatgaaaacaggttttttagattatgctatgtcagttattgtttcacgggcaatc
ccagatgttcgcgatgggttaaaacctgttcatcgtcgaattatttatgcaatgtgagat
ctaaatatgacatatgataagcaacataaaaaatcagcgcggattgttggggaagtaatt
gggaaatatcacccgcatggagatacagctgtttatgaagcaatggtaagaatggcacaa
gatttttcatatcgttatccgttaattgatggtcatggaaattttggatcaatggatggt
gatgccccagcggcgatgcgttatacagaagcaaggatgagtaaaattgctggggaatta
attaaagatattgaaaaagaaacagtaatttttgctgataattatgatggtagtgaacaa
gaaccaacttttttaccaggttattttccaaacctattagtgaatggggcaagtggaatt
gctgttggaatggcaactaatattccgccccataatttgggggaagtaattgatggagtt
attgcaattacaaaaaataaagaaatcacaacagcccaattaacaaaaattattcgtggt
ccagatttcccaacaggagctttaattacaacgggaacaagtttattaaaagcatatgag
acagggaatggggcaattacaattcgttcaaaagtaagtattgaagaaaataataataag
aaaaaaattattatctcagaaattccctatcaagttaataaggcaaagttagttgaaaaa
attgctgatttaattaaagaaaaaacaattgttggaattgctgatttacgggatgaatca
aaccgtgaaggggttagaattgttattgaattaaaacgcgatgtgcaagagacatttatt
ttaaataaattatataaaatgaccccattgcagacaaattattcattaaatattttagcg
ttgtccaaaaatcaaccaaaaataatggggattaaacaaattcttaattattttattgag
catcaaattaatattattattaaaagaagccagtatgatttaaaaaaatgtcagaatcgt
ttactaattttagaaggattaagaattgccttagatcatattgatgaagtgattagaatt
atcaaacaatcaccaacaacacaagaagccaatgatggtttggttagagcatttaagtta
gctgttgaacaagctaaagcaattttagaaatgcgtttacaacgattaactggattagag
attaaaaaaattattagtgaaataatagcaatcaaaactgagattctggagctagaaaaa
attattaataatagtgattatcaaattgaaattatgattaaagaattagaagaaattaaa
aataaatatggtgatcaacgtcgaagtcaaattattcaagaagaattaacagagattgat
ccggaagaattaattaaacaagaaagtattttaattttattaacaaaagatggttatatt
aagcgtgttacagaagatacttttaaaactcaaaatcggggtggtaaaggaattattgga
acagctaataatgttgatgatagtatcaataagatagttttagctaatagtattgattca
ttatttttcttttctaattcgggaaaagtttataaattacgagcataccaagttgaaagt
tattcacgccaagctcgcggattaccaattattaatttaattgcaattgataaaaaagag
caaattaaaacaattttaacgattaatgaaagtatctcccaagaaagtaatttatttttt
gttacaaaaaaaggattaattaagaaaacaaaactagctgaatttagtcaaattcgtcaa
tcaggaaaagtggcaattgaattaaaagatggtgatgaattagttgatgttattgttagt
gaagataattgtgatattattattgcaaatgatgatggtaaagtaatccgttttaatgaa
aaagaaattcgttcaatgagtagacaatcaattggagtaaaaggtattataaatgataaa
ggggaaacaatcagtatttcatctcgattggccggcgaagaatatattttatcagtaaca
gaaaatgggtttgctaaaaaaactttaatttctgaatatcgcgtaactggtcgtggtggt
aaaggtgttaagtctatgaacttaacatataaaacaggaaaattaaattttgttaacttt
gttagaaatgatgcggaaataattatcgcaacaaaacaaggtaatattattcgactacca
ttatcacaaattccaacatttgggcgaacaacatcaggtgtcaaactaattaagttaaat
aaagatgataaaattgaagtagttgaattactaagaatcaatgatttaaaaggagaataa |