KEGG   Spiroplasma chrysopicola: SCHRY_v1c00040
Entry
SCHRY_v1c00040    CDS       T02676                                 
Symbol
gyrA
Name
(GenBank) DNA gyrase subunit A
  KO
K02469  DNA gyrase subunit A [EC:5.6.2.2]
Organism
scr  Spiroplasma chrysopicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:scr00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:scr03032]
    SCHRY_v1c00040 (gyrA)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:scr03400]
    SCHRY_v1c00040 (gyrA)
Enzymes [BR:scr01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.2  DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
     SCHRY_v1c00040 (gyrA)
DNA replication proteins [BR:scr03032]
 Prokaryotic type
  DNA Topoisomerases
   SCHRY_v1c00040 (gyrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:scr03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   NHEJ (non-homologous end-joining)
    SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
     Facilitator
      SCHRY_v1c00040 (gyrA)
SSDB
Motif
Pfam: DNA_topoisoIV DNA_gyraseA_C TBCC_N
Other DBs
NCBI-GeneID: 16152222
NCBI-ProteinID: AGM24591
UniProt: R4UGY2
LinkDB
Position
4957..7416
AA seq 819 aa
MNPEDNNYDYDGKIKDVDISDEMKTGFLDYAMSVIVSRAIPDVRDGLKPVHRRIIYAMWD
LNMTYDKQHKKSARIVGEVIGKYHPHGDTAVYEAMVRMAQDFSYRYPLIDGHGNFGSMDG
DAPAAMRYTEARMSKIAGELIKDIEKETVIFADNYDGSEQEPTFLPGYFPNLLVNGASGI
AVGMATNIPPHNLGEVIDGVIAITKNKEITTAQLTKIIRGPDFPTGALITTGTSLLKAYE
TGNGAITIRSKVSIEENNNKKKIIISEIPYQVNKAKLVEKIADLIKEKTIVGIADLRDES
NREGVRIVIELKRDVQETFILNKLYKMTPLQTNYSLNILALSKNQPKIMGIKQILNYFIE
HQINIIIKRSQYDLKKCQNRLLILEGLRIALDHIDEVIRIIKQSPTTQEANDGLVRAFKL
AVEQAKAILEMRLQRLTGLEIKKIISEIIAIKTEILELEKIINNSDYQIEIMIKELEEIK
NKYGDQRRSQIIQEELTEIDPEELIKQESILILLTKDGYIKRVTEDTFKTQNRGGKGIIG
TANNVDDSINKIVLANSIDSLFFFSNSGKVYKLRAYQVESYSRQARGLPIINLIAIDKKE
QIKTILTINESISQESNLFFVTKKGLIKKTKLAEFSQIRQSGKVAIELKDGDELVDVIVS
EDNCDIIIANDDGKVIRFNEKEIRSMSRQSIGVKGIINDKGETISISSRLAGEEYILSVT
ENGFAKKTLISEYRVTGRGGKGVKSMNLTYKTGKLNFVNFVRNDAEIIIATKQGNIIRLP
LSQIPTFGRTTSGVKLIKLNKDDKIEVVELLRINDLKGE
NT seq 2460 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaatccagaagataataactatgattatgatggaaaaataaaagatgttgatatttct
gatgaaatgaaaacaggttttttagattatgctatgtcagttattgtttcacgggcaatc
ccagatgttcgcgatgggttaaaacctgttcatcgtcgaattatttatgcaatgtgagat
ctaaatatgacatatgataagcaacataaaaaatcagcgcggattgttggggaagtaatt
gggaaatatcacccgcatggagatacagctgtttatgaagcaatggtaagaatggcacaa
gatttttcatatcgttatccgttaattgatggtcatggaaattttggatcaatggatggt
gatgccccagcggcgatgcgttatacagaagcaaggatgagtaaaattgctggggaatta
attaaagatattgaaaaagaaacagtaatttttgctgataattatgatggtagtgaacaa
gaaccaacttttttaccaggttattttccaaacctattagtgaatggggcaagtggaatt
gctgttggaatggcaactaatattccgccccataatttgggggaagtaattgatggagtt
attgcaattacaaaaaataaagaaatcacaacagcccaattaacaaaaattattcgtggt
ccagatttcccaacaggagctttaattacaacgggaacaagtttattaaaagcatatgag
acagggaatggggcaattacaattcgttcaaaagtaagtattgaagaaaataataataag
aaaaaaattattatctcagaaattccctatcaagttaataaggcaaagttagttgaaaaa
attgctgatttaattaaagaaaaaacaattgttggaattgctgatttacgggatgaatca
aaccgtgaaggggttagaattgttattgaattaaaacgcgatgtgcaagagacatttatt
ttaaataaattatataaaatgaccccattgcagacaaattattcattaaatattttagcg
ttgtccaaaaatcaaccaaaaataatggggattaaacaaattcttaattattttattgag
catcaaattaatattattattaaaagaagccagtatgatttaaaaaaatgtcagaatcgt
ttactaattttagaaggattaagaattgccttagatcatattgatgaagtgattagaatt
atcaaacaatcaccaacaacacaagaagccaatgatggtttggttagagcatttaagtta
gctgttgaacaagctaaagcaattttagaaatgcgtttacaacgattaactggattagag
attaaaaaaattattagtgaaataatagcaatcaaaactgagattctggagctagaaaaa
attattaataatagtgattatcaaattgaaattatgattaaagaattagaagaaattaaa
aataaatatggtgatcaacgtcgaagtcaaattattcaagaagaattaacagagattgat
ccggaagaattaattaaacaagaaagtattttaattttattaacaaaagatggttatatt
aagcgtgttacagaagatacttttaaaactcaaaatcggggtggtaaaggaattattgga
acagctaataatgttgatgatagtatcaataagatagttttagctaatagtattgattca
ttatttttcttttctaattcgggaaaagtttataaattacgagcataccaagttgaaagt
tattcacgccaagctcgcggattaccaattattaatttaattgcaattgataaaaaagag
caaattaaaacaattttaacgattaatgaaagtatctcccaagaaagtaatttatttttt
gttacaaaaaaaggattaattaagaaaacaaaactagctgaatttagtcaaattcgtcaa
tcaggaaaagtggcaattgaattaaaagatggtgatgaattagttgatgttattgttagt
gaagataattgtgatattattattgcaaatgatgatggtaaagtaatccgttttaatgaa
aaagaaattcgttcaatgagtagacaatcaattggagtaaaaggtattataaatgataaa
ggggaaacaatcagtatttcatctcgattggccggcgaagaatatattttatcagtaaca
gaaaatgggtttgctaaaaaaactttaatttctgaatatcgcgtaactggtcgtggtggt
aaaggtgttaagtctatgaacttaacatataaaacaggaaaattaaattttgttaacttt
gttagaaatgatgcggaaataattatcgcaacaaaacaaggtaatattattcgactacca
ttatcacaaattccaacatttgggcgaacaacatcaggtgtcaaactaattaagttaaat
aaagatgataaaattgaagtagttgaattactaagaatcaatgatttaaaaggagaataa

DBGET integrated database retrieval system