Entry |
|
Symbol |
uvrA
|
Name |
(GenBank) excinuclease ABC subunit A
|
KO |
K03701 | excinuclease ABC subunit A |
|
Organism |
scr Spiroplasma chrysopicola
|
Pathway |
|
Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:scr00001]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
SCHRY_v1c01380 (uvrA)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:scr03400]
SCHRY_v1c01380 (uvrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:scr03400]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
GGR (global genome repair) factors
SCHRY_v1c01380 (uvrA)
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHDIR (short-homology-dependent illegitimate recombination)
Supressor
SCHRY_v1c01380 (uvrA)
|
SSDB |
|
Motif |
|
Other DBs |
|
LinkDB |
|
Position |
156298..159138
|
AA seq |
946 aa
MAKDWIIVKGARENNLKNINVKIPKDKLVVFTGLSGSGKSSLAFNTIYAEGRRRYIESLS
SYARQFLGGNEKPDVDAIEGLSPAISIDQKTTSNNPRSTVGTVTEIYDYLRLLYARVGVP
YCINGHGVIKSVSIKEIINNLKQQLNEDEKFMILSPVIRDKKGSFKELFLKLRQESFIRV
NINGELRNLDEDIELDKNKRQNIDIVIDRIIFHNNEEIISRIHDALEIALKYGNGLVKIA
FQEQGKDALFSTNYACSICGFVIPELEPRLFSFNSPNGACPDCKGLGIKLEVDEELLIPN
QNLSVLQGGIVYLKNIINTTNIEWQKFTVLANHYHIPLDLPISDLTKTQLNYLLRGSDET
IDYNFKTASGNIMRGYDYIEGIGQLIERRYTETTSESAREYYKQFMSDRKCTTCHGQRLN
EIPLAVKVNDLSISDFTNLSVEEELSQVLNLRLTEYQQEIAKLIVNELVNRLDFLSRVGL
GYLTLSRSAATLSGGEAQRIRLATQIGSQLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDKLIETLKSLR
DLGNTLIVVEHDEDTIRASDYIIDIGPRAGINGGEVVAYGQLEDIMKNPNSITGKYLTGE
LEIAIPKTHRGGNGLTLEVKGARENNLKNINVTIPLNKLVCLTGVSGSGKSTLMHEIIWK
GIKKNLGLATERPGAYDKIVGIDNIDKVINISQDPIGKTPRSNPATYTSVFDDIRDLFAG
TNEAKARGYLKGRFSFNVPGGRCENCQGDGIIKISMHFLPTVFVNCEVCDGKRYNDETLM
VKFKEKNIYDVLEMTVDQAALFFEKQPKIYQKLLTMQEVGLGYIKLGQSATELSGGEAQR
VKLSTFLLKRTTGKTLFLLDEPTTGLHVDDVKRLLVVLNRIVDNGDSVLVIEHNLDVIKV
ADYIIDLGPEGGNGGGTVVATGTPEQIVKKSDISFTGQYLKLILNK |
NT seq |
2841 nt +upstreamnt +downstreamnt
atggcaaaagattgaattattgttaaaggtgcgcgggaaaataatttaaaaaatattaat
gttaaaattccaaaagataaattagtagtttttactggattatcaggaagtggtaaatca
tcattagcttttaatacaatttatgccgagggtcgtcgtcgttatattgaaagtctttcg
agttatgctcgtcaatttttagggggcaatgaaaaaccagatgttgatgcaattgaagga
ttatcccctgcaatttcaattgatcaaaaaacaacaagtaataatcctcgtagtacggta
gggacagtaacagaaatttacgattatttacggttattatatgcgcgagtaggagttcct
tattgcattaatggtcacggggttattaaatcagtttcaattaaagaaattattaataac
ttaaaacagcaattaaacgaagatgaaaaatttatgattttatcgccggtaattcgtgat
aaaaaaggtagttttaaagaactatttttgaagttacgccaagaaagttttattcgggta
aatattaatggtgaattacgtaatttagatgaggatattgaattagataaaaataaacgg
caaaatattgatattgtcattgaccgaattatttttcataacaatgaagaaattattagc
cggattcatgatgcccttgaaattgccttgaaatatggtaatggtttagttaaaattgcg
tttcaagaacagggaaaagatgccttgttttcaacaaattatgcttgtagtatttgtggt
tttgttattccagaattagaaccacgactattttcgtttaattccccaaatggagcatgt
cctgattgcaaggggttaggaattaaattggaagttgatgaagaacttttaatcccgaat
caaaacctgagtgttttacaaggagggatagtctatttaaaaaatattattaatacaact
aatattgaatgacagaaatttactgttttagctaatcattatcatattccgttggattta
ccaattagtgatttaacaaaaacgcagttaaattatttactacgcggaagtgatgaaaca
atagattataattttaaaactgctagtggtaatattatgcgtggttatgattatattgag
gggattggccagttaattgaacgccgttataccgaaacaacaagtgaatcagcacgggaa
tattataagcagtttatgtcagaccgaaaatgtacaacttgtcatggccaacggttaaat
gaaattcctttagcagttaaggttaatgatttaagtatttctgattttacgaatttatct
gtggaagaagaattatcacaagtattaaatttacgcttaacagaatatcaacaagaaatt
gctaagctaattgtcaatgaattagttaatcgtcttgattttttatcgcgggttggttta
ggatatttaactttgtcacgtagtgccgctactttatcagggggtgaagcgcaacggatt
cgtcttgctacgcaaattggtagtcagttaacaggagttttatatgttttagatgagcca
tcaattgggttacatcaacgtgataatgataaattaattgaaacattaaaaagtttacga
gatttaggtaatactttaattgttgttgaacatgatgaagatacaattcgggcaagtgat
tatattattgatattggtcctcgagcaggaattaatggtggagaagttgttgcttatggg
caattagaagatattatgaaaaatcctaattcaattactggaaaatatttaacgggagag
ttggagattgccataccaaaaacccaccgtggaggtaatggtttaacattagaagttaaa
ggtgcgcgggaaaataatttaaaaaatattaatgtaacaattccattaaataaattggtt
tgcttaactggtgtatcaggaagtggaaaatcaactttaatgcatgaaataatctgaaaa
ggaattaagaagaacttaggattagcaacagaacgaccaggagcatatgataaaatagtt
ggaattgataacatcgataaagttattaatatttcccaagatccaattggtaaaacaccg
cgtagtaatccggcgacatatacttcggtctttgacgatattcgtgatttatttgctgga
acaaatgaagcaaaggcacgtggttatttgaaaggtcgtttctcatttaatgttccaggg
ggaagatgtgaaaactgccaaggggatggaattattaaaatttcaatgcacttcttacca
acagtttttgttaattgtgaagtttgtgatgggaaacgttataatgatgaaacattaatg
gttaaatttaaagaaaaaaatatttatgatgttttggaaatgaccgttgatcaagcggcg
ttattttttgaaaaacaaccaaaaatttatcaaaaattattaacaatgcaagaagttggg
ctaggttatattaaattaggtcaatcagcaactgaattatcagggggtgaagcccaacgg
gtaaaattatcaacttttttattaaaacgaacaacaggaaaaacattattcttactagat
gagccaacaacaggattacacgttgatgatgtaaaacgcttattagtcgtgttaaatcgg
attgttgataatggggatagtgttttagttattgaacataatctagatgttattaaggta
gcagattatattattgatttaggaccagaaggtggtaacggcgggggaactgttgttgca
actggaacgccagagcaaattgttaaaaagagtgatattagttttactggtcagtattta
aaactaattttaaacaaataa |