Spiroplasma chrysopicola: SCHRY_v1c02650
Help
Entry
SCHRY_v1c02650 CDS
T02676
Symbol
smc
Name
(GenBank) chromosome condensation and segregation SMC ATPase
KO
K03529
chromosome segregation protein
Organism
scr
Spiroplasma chrysopicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
scr03036
]
SCHRY_v1c02650 (smc)
Chromosome and associated proteins [BR:
scr03036
]
Prokaryotic type
Chromosome partitioning proteins
Condensin-like complex
SCHRY_v1c02650 (smc)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SMC_N
SMC_hinge
AAA_23
AAA_21
AAA_15
AAA_29
DUF7491
PRK
DUF6673
ABC_tran
SbcC_Walker_B
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
16152173
NCBI-ProteinID:
AGM24850
UniProt:
R4UFD3
LinkDB
All DBs
Position
280864..283830
Genome browser
AA seq
988 aa
AA seq
DB search
MLFLKRLEAVGFKSFADPLTINFDHEMIGIVGPNGSGKSNITDAIRWCLGEQSIKSLRGD
NSEDVIFNGSDAKSALNMAEVKLTFDNTRRIFNLDYDEIEIVRRVFRGSGENEYFINNQR
VRLKDVQEFALDTGLTKSSLAIISQGNINAFAEAKPLERRALFEEAAGVAKYKKRKLESL
KKLDRANENLDRLKDIINEIERKLPTLKRQSSKALRYKEKKDKLNEIELSILVKDITFFN
EKLLELREQQKVITSEKHEAERDLKNKENEYNELTKVNYGLDSKINSLSKDFQGLVTEIG
NLKVQKIELDNKKNSLKMANNDITIVEMLAKYNDLKVIVQMETEKLAALKTQQVEDHDRQ
RSLVKTQGSLNEQLGALNRSIIRLETDLDQAQRNIDNQDNLHPGVKNIIKNKNVLPGIIG
LVQEIISFDDKYEYAIAVSLSGRLQDIIVKNVDSAKKAISYLKQNNAGHATFIPLDRIQP
RYISDNEQFIIKSVPGFLGLGHNLVATKKDYRQAIDYLLSRYIICDNFDSAQEVGQLLKF
KYNIVTLDGEIIRPQGAITGGSRNVKQIIANFEKELTIIREQLAKKVAEQEAINKQLNGL
KTQLDEINEKIAENQASIGASKRQIEIVEQDKLKIKNEYQLLTAKNIDESEFESGSESIN
IIDLINQKEIIKVNIEQQLNVARSLKEKQTVTLNDLNNYISERRYYISALQEQVGKISTD
ISMLNVKTQQDLMRLTEEYHMTYEHATTLSLAAIDNEEAVREEIKQLRSDLADIGNVNLE
AIAEYQEEDSRYNFMLGEYEDLNKSVKNLLHSISEMDTLMQEQFDQTIKAVNKNLSHTFE
VLFGGGTAKIIYTEPDNILETGVDIKVSPPGKNIANLNLLSGGEKSLVALSVLFAILKAR
PIPLVILDEAEAPLDPANVERFAKYIKTFIDTTQFLIVTHRVGTMANCDILYGATMQKKG
VTKIVSIKLQQAEELIKNIENEGENQTN
NT seq
2967 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgttatttttaaagagattagaagcagtaggatttaaatcatttgctgatccgttaacg
attaattttgaccatgaaatgattggaattgttggtcctaatgggagtggaaaatcaaat
attactgacgccattcgttgatgtttaggagaacaatcaattaagtctttacggggagat
aatagtgaagatgttatttttaatggttcagatgctaagtcagcattaaatatggccgaa
gtcaaattgacttttgataatacgcgccgaatttttaaccttgattatgatgaaattgaa
attgttcggcgtgtttttcgtggttcaggagaaaatgaatattttattaataatcaacgg
gttcgtttaaaagatgttcaagaatttgcccttgatactggcttaactaaatcatcatta
gcaattatttcgcaaggaaatattaatgcttttgccgaagctaaaccattagaacgccgg
gcattatttgaagaagcagccggagtggcaaaatataaaaaacggaaattagaatcgtta
aaaaaattagaccgtgctaatgaaaaccttgatcgtttaaaagatattattaatgaaatt
gaacgaaaattacccactttaaaacgccaaagtagtaaagcgttacgttataaagaaaaa
aaagataagttaaatgaaattgagttatcgattttagtgaaagatattaccttttttaat
gaaaaattattagaattacgtgaacaacaaaaagttattacatcagaaaaacatgaagca
gaacgtgatttaaaaaacaaagaaaatgaatataatgagctaacaaaagttaattatggg
ttagatagtaaaattaactcattatcaaaagacttccaaggattagtaacagaaattggg
aatttaaaagttcaaaaaattgaactagataataagaaaaattctttaaaaatggctaat
aatgatattacgattgttgaaatgttagcaaaatacaatgacttaaaagttattgtccaa
atggaaactgagaagttagcagcgttaaaaactcaacaagtagaagaccatgatcgtcaa
cgcagcttagttaaaacgcaaggtagtttaaatgaacaattaggagctttaaaccgttca
attattcgtcttgaaacggatttagaccaagcacaacgtaatattgataaccaagataat
ttacaccccggggttaaaaacattattaaaaataaaaatgttttaccagggattattggc
ttagtccaagaaattattagttttgatgataaatatgaatatgcaatagcagtctcatta
agcgggcgtttacaagatattattgttaaaaatgttgatagtgctaaaaaagcgatttca
tacttaaaacaaaataatgctggtcatgcaacttttattccgttagaccggattcaaccg
cgttatattagtgataatgaacaattcattatcaaatctgttcctggttttttaggatta
ggacataatttagtagcaacaaaaaaagattaccgtcaggcaatcgattatttattgagt
cgctatattatttgtgataattttgatagtgcgcaagaagttggccaattattaaaattt
aaatataatattgtaaccttagatggggaaattattcgtccgcaaggagcaattactggg
gggtcaagaaatgttaaacaaataattgctaactttgaaaaagaattaacaataattcgt
gaacaattagcgaaaaaagtggcggaacaagaagcaattaataaacagctaaatggttta
aaaacacagttagatgaaattaatgaaaaaattgcggaaaaccaagcatcaattggggca
agtaaacgccaaatcgaaattgtcgaacaagataaattaaaaattaaaaatgagtaccaa
ttattaactgcaaaaaatattgatgaatccgaatttgaaagtggttcagaaagtattaac
attattgatttgattaatcaaaaagaaattattaaagtcaatattgaacaacagttaaat
gttgctcgtagtttaaaagaaaaacaaacagtaacattaaatgatttaaataactatatt
tctgaacgacgttattatatttcagcattacaagaacaagttggtaaaattagcaccgat
atttcaatgttaaatgttaaaacccaacaagatctaatgcgtttaactgaagaatatcat
atgacctatgaacatgcaacaacgttatcattagcagcaattgataatgaagaagctgtc
cgggaagaaattaaacaattacgaagtgatttagccgatattgggaatgttaacttagaa
gcaattgcagaatatcaagaggaagatagccgttataattttatgttgggagaatatgaa
gatttaaataaatctgttaaaaatctcttacattcaatttctgaaatggatactttaatg
caagaacaatttgatcaaacaattaaagctgttaataaaaatttgtcgcatacttttgaa
gtattattcggtgggggtacagcaaaaattatttatactgaaccagacaatattttagaa
acgggagttgatattaaagtttcaccaccagggaaaaatattgctaatttaaatttacta
tccgggggagaaaaatcattagttgcattatcagttttatttgcaattttaaaggcgcgc
ccaatcccgttagtaattttagatgaagcagaagccccattagatccagctaatgttgaa
cgtttcgctaaatatattaaaacatttattgatacaacccaattcttaattgtaacccac
cgggtaggaacaatggcaaattgtgatatcttgtatggggcaacaatgcagaaaaaaggg
gttacaaaaattgtaagtattaaattacaacaagcggaagaattaattaaaaatattgaa
aatgaaggagaaaatcagacaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system