Spiroplasma chrysopicola: SCHRY_v1c03120
Help
Entry
SCHRY_v1c03120 CDS
T02676
Symbol
spoU
Name
(GenBank) RNA methyltransferase, TrmH family
KO
K03437
RNA methyltransferase, TrmH family
Organism
scr
Spiroplasma chrysopicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
scr03016
]
SCHRY_v1c03120 (spoU)
Transfer RNA biogenesis [BR:
scr03016
]
Prokaryotic type
tRNA modification factors
Methyltransferases
SCHRY_v1c03120 (spoU)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SpoU_methylase
SpoU_sub_bind
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
16152251
NCBI-ProteinID:
AGM24897
UniProt:
R4U0T5
LinkDB
All DBs
Position
339535..340335
Genome browser
AA seq
266 aa
AA seq
DB search
MIREINSTDNNHIKTLIKLKNGAKIIEDAKFLVEGWNIIKEALNTLAVVEIITTKEQQDY
FITTAPTIPLTIVSEHVANKLKGSVNSQNIFAVLDLNKLKNYNYLDFNTDMLILENVQDP
GNMGALLRTALGFNFNNILILGDSVSIFNEKVLRASQGAFLKLNLKVIKTNYLSVLQELA
TTQAYYLISTGLNQRAVYLDQYSFITKQKIALMFGNEGNGLSSELLTMSQLNLKININPQ
LESLNVSQASAIIMYEINKQKGGSNV
NT seq
801 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattagagaaattaattcaactgataacaaccatattaaaaccttaattaaattaaaa
aatggcgctaaaattattgaagatgctaagtttttagttgaaggttggaatattattaag
gaagctttaaataccttggcggtagtagaaattattactacaaaagaacagcaagattat
tttataacaacagcaccaacgattccattaacaattgttagtgagcatgttgctaacaaa
ttaaaaggaagtgttaatagtcaaaatatttttgccgttttggatttaaataaattaaaa
aattataattatcttgattttaatacggatatgctaattttagaaaatgttcaagatcct
ggtaacatgggagccttactacggacagctcttggttttaattttaataatattctaatt
cttggtgatagtgtcagtatttttaatgagaaagttttacgggcttcacaaggagctttt
ttaaaattaaatctaaaagtcattaaaacaaattatcttagcgttttgcaagaattagca
actacgcaagcttattatcttatttcaacaggattaaatcaaagagcagtttacttagat
caatattcttttataaccaagcaaaaaattgcgttaatgtttggtaatgagggcaatggt
ttaagttcagaattattaacaatgagtcaattaaatttaaaaattaacattaatcctcaa
cttgagtcattaaatgttagtcaggctagtgccataattatgtatgaaattaataagcaa
aaaggaggtagcaatgtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
