Spiroplasma chrysopicola: SCHRY_v1c04020
Help
Entry
SCHRY_v1c04020 CDS
T02676
Symbol
recD
Name
(GenBank) exodeoxyribonuclease V subunit alpha
KO
K03581
exodeoxyribonuclease V alpha subunit [EC:
3.1.11.5
]
Organism
scr
Spiroplasma chrysopicola
Pathway
scr03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scr00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03440 Homologous recombination
SCHRY_v1c04020 (recD)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
scr03400
]
SCHRY_v1c04020 (recD)
Enzymes [BR:
scr01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.11 Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.11.5 exodeoxyribonuclease V
SCHRY_v1c04020 (recD)
DNA repair and recombination proteins [BR:
scr03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
SCHRY_v1c04020 (recD)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_19
AAA_30
SH3_13
OB_YrrC
HHH_RecD2
UvrD_C_2
Viral_helicase1
AAA_11
UvrD-helicase
SLFN-g3_helicase
PIF1
AAA_22
AAA_29
NAT10_TcmA_helicase
RuvB_N
AAA
AAA_5
FliG_N
WHD_HELB
AAA_12
DJ-1_PfpI
ResIII
AAA_16
nSTAND3
T2SSE
NPHP3_N
PhoH
Mg_chelatase
DEAD
FtsK_SpoIIIE
AAA_7
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
16151721
NCBI-ProteinID:
AGM24984
UniProt:
R4UAP6
LinkDB
All DBs
Position
443673..445826
Genome browser
AA seq
717 aa
AA seq
DB search
MTVIKGYLKLIVFESANGYRICKFQLEHDRNHHIFIKGFLMEMHQDQLYELTGEVKNNPR
YGQNFEVQQIKKIMPQTKDDLIRYLSSDLFPTIGAKTAEVIINHFQEDVINKIKNNLATL
NDIKGLTPNQVKIIQTTFSKMTQEDEINHLFSQNNLSLQILSLLKTKYDVDQIMAILQKD
PYSLLLKDNISFKAIDKIFLTFNSNPTDYIRIGYYAWYYAKEFCNSTGDTYLELEQLTKI
LQKNFVTVTKEIILAGLKYVKNLNLLIFKNEKIYVAEIYHSELNIAALLNSLNTNAAISV
DEVNTIFQQVEAQKQISYNLQQVKAIKEAVLSNFLLIVGGPGTGKTTVVDGIVSILKKSF
KNNKIILAAPTGKAAKRLRDKTKQKAVTIHKLLKYDPLTNQFFHNENNPLEIDILILDEV
SMVDTLLLSAIAKASLNLKKLILIGDVNQLPSVACGDVLRDIIGTDIFNVVPLTEVYRQQ
EGNDILELSYAIQQDYFEYHFDNKQDVKFINSSNSNEILNTVGELYQNLVKQHQGQYDQI
QIIAPMYNGTLGINTLNNYLQNKINPDYGQKHCKIGYQEFRVNDKVMQLKNRPELEVYNG
DVGIIVDIKQDKDLNNILIIQFDEQLIKYSPELYYDITLAYACSVHKLQGSEYEYVIFVI
TKAFWIMLNRNLVYTGITRAKNQLFLLGEQQALHYAVNNVLKKRKTTLGEVIKDFKG
NT seq
2154 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacagtaattaaaggttatttaaagttaattgtatttgaatcagctaatggttatcga
atttgtaagtttcaattagaacatgatcgtaatcatcatatttttattaaaggtttttta
atggaaatgcaccaagatcaactgtatgaattaacaggggaagtaaaaaataatcctcgt
tatggccaaaattttgaagtccaacaaattaaaaaaatcatgccccaaacaaaagatgat
ttaattcgttatctatcaagtgatttatttccaacaattggggccaaaacagctgaggtg
attattaatcattttcaagaagatgtcattaataagattaaaaataatttagcaacatta
aatgatattaagggtttaacgccaaatcaagttaaaattattcaaacaacgtttagtaaa
atgacccaagaagatgaaattaatcacttatttagtcaaaataatttatcattacaaatt
ttgtcactattaaaaacaaaatatgatgttgatcaaattatggcaattttacaaaaagac
ccttattcattattgttaaaagataatattagttttaaagccattgataaaatcttttta
acgtttaattctaacccaaccgattatattcgaattggctattatgcttggtattatgcc
aaagaattttgtaatagcaccggagatacttatttagaattagaacagttaacaaaaata
ttacaaaagaattttgttacagtgacaaaagaaattattttagctggattaaaatatgtt
aaaaatttaaatttattaatttttaaaaatgaaaaaatttatgtcgctgaaatttatcat
agtgaacttaatattgccgctttattaaatagtttaaatactaatgctgcaattagtgtt
gatgaggttaatactatttttcagcaagttgaggcgcaaaaacaaattagttataatttg
cagcaagttaaagcaattaaagaagcagttttaagtaattttttattaattgttgggggt
cctggaactggtaaaacaactgttgttgatggaattgttagtattttaaaaaaaagtttt
aaaaataataaaattattttagcggcgccaaccgggaaagccgctaaacgcttgcgtgat
aaaacaaaacaaaaagcagtaacaattcataaattattaaaatatgatcccttaacaaat
caatttttccataatgagaataatccacttgaaattgatattttaattttagatgaagta
agtatggttgatacattattattatcagccattgcaaaggcaagtttaaatcttaagaaa
cttattttaattggggatgttaatcaattaccatcagttgcttgtggcgatgttttacgt
gacattattggtactgacatttttaatgttgttcctttaacagaagtctatcgtcaacaa
gaaggaaatgatattttagaattaagttatgcaattcagcaagattattttgaatatcat
tttgataataaacaagatgttaaatttatcaacagtagtaattcaaatgaaattttaaac
acagttggggagttatatcaaaatttagtcaagcaacatcaagggcaatatgatcaaatt
caaataattgccccaatgtataatgggaccctcggcattaatacccttaacaattatctg
caaaataaaattaatcctgattatggtcaaaaacattgtaaaattggttatcaagaattt
cgggtaaatgataaagtgatgcaattaaaaaatcgccctgaattagaagtatataatggc
gatgttggaataatagtagatattaaacaagataaagatttaaataatattttaattatt
cagtttgatgagcaattaattaaatatagtccagaactgtattatgatattactttagct
tatgcttgtagtgttcataagctacaaggtagtgaatatgaatacgttatttttgtcatt
acaaaagctttttgaattatgttaaatcgtaacctagtttacaccggaattacccgtgct
aagaaccaattatttttattaggcgaacaacaagctttacattatgctgttaataatgtt
cttaaaaagcgtaaaacaacgctcggtgaagttattaaagattttaaaggctag
DBGET
integrated database retrieval system
