Spiroplasma chrysopicola: SCHRY_v1c09500
Help
Entry
SCHRY_v1c09500 CDS
T02676
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
scr
Spiroplasma chrysopicola
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
T2SS-T3SS_pil_N
Big_2
DUF6839
HL_N-beta
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
16152464
NCBI-ProteinID:
AGM25522
UniProt:
R4U2D5
LinkDB
All DBs
Position
complement(1028781..1031393)
Genome browser
AA seq
870 aa
AA seq
DB search
MHYNNGMLKLLTLLFMTTLLSIVTIFIIFSLAINSKKEEIILDSTRVELLEKQTDEVTIK
NFNDLKNVKIVNWDESLISVFLENNKILITGIKVGETTINIVADNKQMVEVSVKVHELIK
KQIILDKSAVSMKEGFEQNVLITNYSQFVNIRVSPKDYTIVDSSYKNGTINIFGKKVGTT
IINIVADNGYHSLVTVSVNPNPDIKENIILNANSSVVRINTISVVNILNYSDLKNIQVSS
DNSLIARVALFNDDIIIIGDLQGSTIITVTADNGNTTSIATKVVQQLRGGINTSSDSIIV
EVGKSTDVKITNFISLTNVKVWVEDINIINYSIFDNAVIVKAINVGSTSLLIRADNGFIK
VVTVRVIPKSKININLDSQNASVQTSNIVNVNIINFIDLENVEVSTDNSLIANAELVDNV
INIIGIAQGTTNIIVTADNAYDNQIAVTVEPRAKINIDLSASSAIVDVDSSTNVQILNFI
DLVNPQVAVFNSSIASVTLEGSNILVTGISYGETTITITASNGISNILNVIVNQKQFKTI
NLERTEITITETASANIVITNFADLSEIKLVAQNNLIADISLEDDTIIIKGLTVGTTSVL
VGANDAFIATIDVTVNPKEKIDINLLTNSTTIEVNSNTNVEIINFNELENIQLLIDDSSI
VNARLIDNNINITGLAEGTTVVKVKADNGKTTSLTIIVNSIPKINIQLSSTSAILTTTKP
TSVSILNFDDLINPHVWSNNEEIAIAHLANNKVNINGKSLGIVIITVTADNANSVNIAVT
VTKSNTKIKVDYYNLTAYVNNIEIINIINFDDLVNVWVHSTEQKIGSAILEEDRIVIIGY
KPGTFKIIVNADNALPIEINITIIKTKNIY
NT seq
2613 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcattataacaacggtatgttaaagttattaactttattgttcatgactacattatta
tctattgttactatatttattatattttctttagcaataaactcaaaaaaagaagaaatt
atattggactcaacaagagttgaacttcttgagaaacaaacagatgaagttactattaaa
aattttaatgatttaaaaaatgttaaaatagtaaattgagatgaatcattaatatcagta
tttttagaaaataataaaatattaataacaggtattaaagttggtgaaacaactattaat
attgtagctgataataaacaaatggtagaagttagcgttaaagtccatgaattaataaaa
aaacaaattattttagataagagtgcagtttcaatgaaagaaggatttgaacaaaatgtt
ttaattacaaactatagtcagtttgtaaacattagagttagtccaaaagattatactatt
gttgattcaagttacaaaaatggaactattaatatttttggcaaaaaagtaggaacaaca
ataataaatattgtagctgataatggttatcattcattagtaactgtatcagtgaatcct
aatcctgatattaaagagaatattattttaaatgcaaattcaagtgtggttcgtattaat
acaatttcagtagttaatattttaaattatagtgatttaaaaaatattcaagtatcatca
gacaatagtttaattgctagggtagcactttttaatgatgatataatcattattggagat
ttacaaggatcaacaataattactgttacagctgataatggtaatactacttcaattgct
actaaggtagtacaacaattacgagggggaattaataccagttctgattcaattatagtt
gaggtaggaaaaagtactgatgtaaaaattactaattttattagtttaactaatgttaaa
gtatgagtagaagatataaatattatcaattattctatttttgataatgcagttattgtt
aaagctattaatgttggttcaacatcattattaattagagctgataatggctttattaaa
gttgttacagtaagagttattccaaaatctaaaattaatattaatttagattctcaaaat
gctagtgtccaaacaagcaatatagtaaatgttaatataattaattttattgatttagaa
aatgttgaagtatctactgacaattctttgattgctaatgctgaattagttgataatgtt
attaatattattggtatagcacaaggaacaactaatataatagtaactgctgataatgct
tatgataatcaaattgcagtaacagtagaaccacgcgctaaaataaatattgatttatca
gcatcatcagcaatagttgatgtagattcaagcactaatgttcaaattcttaattttatt
gatttagtaaatcctcaagtcgcagtttttaattcatcaattgctagtgtcacattggaa
ggaagtaatattttagttactggtatttcttatggagaaactactatcacaataactgct
tctaatgggataagtaatattttaaatgtaattgttaaccaaaaacaatttaaaactatt
aatttggagcgtactgaaataacaattacagaaacagcaagtgctaatattgtaattact
aactttgctgatttatcagaaattaaattagttgctcaaaataatttaatagcagatatt
agtttagaagatgacacaattataattaaaggtttaactgttggaacaacctctgtatta
gtaggtgctaatgatgcttttattgcaactattgatgttactgttaatccaaaagaaaaa
atagatattaatttattaactaattcaacaacaattgaagttaattcaaacactaatgtt
gaaatcattaattttaatgaattggaaaatatccaattattaattgacgattcttcaatt
gtaaatgctagattaattgataataatattaatattactggtttagcagaaggaacaaca
gttgtaaaagttaaagctgataatggtaaaactacttcattgactattattgttaattca
attccaaaaattaatattcaattaagttcaacttcagctattttaacaacaactaaacca
actagtgtttctattcttaattttgatgatttaataaatcctcatgtatgatcaaacaat
gaagaaattgcaatagcacatcttgctaataataaagttaatataaatggaaaaagttta
ggtatagtaattattactgtgacagctgataatgctaattctgttaatattgcagttact
gtaacaaaatcaaatacaaaaattaaagttgattattataatctgactgcatatgtaaac
aatatagaaattattaatataattaattttgatgatttagtaaatgtttgagtccactca
actgagcaaaaaataggctcagctattttagaagaagatagaatagtaattattggttat
aagcctggaacattcaaaattattgttaatgctgacaatgccttaccaattgaaataaat
ataactataattaaaacaaagaatatttattaa
DBGET
integrated database retrieval system
