Spiroplasma chrysopicola: SCHRY_v1c09710
Help
Entry
SCHRY_v1c09710 CDS
T02676
Name
(GenBank) superfamily I DNA/RNA helicase
Organism
scr
Spiroplasma chrysopicola
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_12
AAA_11
AAA_30
AAA_19
Viral_helicase1
ResIII
PhoH
nSTAND3
nSTAND6
Get5_bdg
DEAD
C2185-like_N
AAA_22
AAA_25
SRP54
TsaE
AAA_5
HTH_22
UvrD_C_2
AAA_16
Mg_chelatase
AAA
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
16151933
NCBI-ProteinID:
AGM25543
UniProt:
R4U4Q3
LinkDB
All DBs
Position
complement(1053510..1057403)
Genome browser
AA seq
1297 aa
AA seq
DB search
MVNDFIINGNNYNGKALLLNFYLLTNGKNKFTDKDVQNLKLENIKTIKDLYGFFKKYICL
ADFFVCLINDQAKIKKDKSGKEKTLYDILIRFKSITFLNELIDPNLSLTVLGDIDPGLGI
VNVKNIFLTGMEKTAQDFETPAQDIVLEVSDNFNHNEAKIRTIFGSDIMSKMKFLVSNFQ
DEKEEWIKYLNFQQQDLDYKRKKAAIFLGRQLLEYVKIPRSNEHYQQFHDPHFALNNFWY
VKKSLFHQQSLTIYPNFEEVTVAFLDLLVEQPEQIADLQKLVNLSLTNWQLNREYSSDNP
LSIFNFTFNEAFAQDNSDSFELGFTVPLAKDTIVQNSQQFYQNLIAIFQSHQPLQGQVDE
LKAVGKILAEQLKNYYSVIVCYEFKSENDYEYDFLLKNVPEYGYLGYLGKGESTLIRRSN
MIIDKIVRNDVANPYLINYLFNIKDLKLKFSNKVLQEEDLTFAAKNLNNSQKAAIVKALN
SQDIFLLQGPPGTGKTEFIAELVYQYAKLNKKVLISSQNHTAIDNVLTRLFKSPLIVPLR
LTGEEVRKKNRFNDFNPDRVVFNNYRFMYSYLTLEYLTKWEGIDDQYLLQKEALQNLKAN
AKMLAKEIKEYQELESKILRLKTTQEENLTNLLKLKNHNKKLLVEINNIDNFQELLNDSE
WNGHVQNTNDLTTLFNQHFGTLIHEKLNLDFDVSYSIPEVYRQLLADSLDPETINAIADK
KAQLMVLKQVEPAYRDDNWATQLLTLNEAIINLQKQTSLKQGNVVHLQQVRELQVGLEAL
KYKYQNQIKDNEKLIATAEENQTDQELFYLETEFNGLEQKINQLKVDVENIVYNINQIFN
LTLNIKDITTTINELDEIIVNLDQEIKTIQKEKIAKGKFVNNMINFLDRNYQMAQFLTGE
NFNNNIFNSALEKDTKTYANQFLQNNVNVVAMTATSNQIYLQSKNKILADYNISDIDIKS
FSFDVVIIDEVSKLTPMEILMPLVYGKAVVLVGDYRQLPPLMQFQESDVSKINELYHENY
SYFDFTQLVTQSMFKKLISQCDDSVKGILVEQYRSHGDIMKVVNVFYENQLQLGDPTHQN
LQKQHYLNVGNNQQPIIFSSNKAIYWLDSSRDINQELVYEQGEAGSTSLFNWLEIELTIA
TLKLIDQGYGALPAKLTHKPNVAVISFYGLHVKKLRKALQTVKLKNISLEISTVDDYQGR
ESDIVIVNTVRHPKNQARANKEFVQKYERLNVAFSRAKNMLVIIGAINFFANIEVEIPTI
MNPVLTKLTRVYDEIIKIIRTFGNVWTAEDICENVKE
NT seq
3894 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggtcaatgattttatcattaatggtaataattacaatggtaaagcactgttgctaaat
ttttatttgttaacaaatggcaaaaataagttcacagataaagatgttcaaaatttaaaa
ttagaaaatattaaaaccattaaggatttatatggtttttttaaaaagtatatttgttta
gctgatttttttgtttgtttaattaatgatcaagctaaaattaaaaaagataaaagtggg
aaggaaaaaaccttatacgatattttaattcgctttaaatcaatcacatttttaaatgaa
ttaattgaccctaatttatcattaacagtattaggcgacatcgatccagggttaggaatt
gttaatgttaaaaatatttttttaacgggaatggaaaaaacagcccaggattttgaaact
ccagcccaagatattgttttagaagttagtgataactttaatcataatgaagcaaaaatc
cgcacaatttttggttcagatattatgagtaaaatgaagttcttagtttctaattttcaa
gatgaaaaagaagagtggattaaatatttaaattttcagcaacaagatttagattataaa
cgaaaaaaagcagccattttcttgggacgccaattacttgaatatgttaaaatccctcgt
agtaatgagcattatcagcaatttcatgacccacattttgccctaaataatttttggtat
gttaaaaaaagtctttttcatcaacaaagtttgacaatttatcctaattttgaagaagta
acagtggcttttttagacttactagttgaacaaccagaacaaattgctgatttacaaaaa
ttagtaaatttaagtttaacgaactgacaattaaatcgtgaatatagtagcgacaatcct
ttatcaatttttaattttacttttaacgaagcttttgcccaagataatagtgatagtttt
gaattagggtttactgttccattagcaaaagatacaatagttcaaaatagtcagcaattt
tatcagaatttaatagccattttccaaagtcaccagccattgcaaggacaagttgatgaa
ttaaaagcggtcggcaaaattttagctgaacaattaaagaattattattcagttattgtt
tgctatgagtttaaaagcgaaaatgattatgaatatgattttttactaaagaatgttccc
gaatatggttatcttggctatctaggaaaaggagaatcaacgttaattcgtcgtagtaat
atgataattgacaagattgttcgtaatgatgttgctaatccctatttaataaattatctt
tttaatattaaagatttaaaattgaaatttagtaataaagtattacaagaagaagattta
acttttgcggcaaaaaacttgaataacagtcaaaaagcggcgattgttaaagcgctaaat
tctcaagatatctttttactacaagggccaccaggaactggaaaaacagagtttattgca
gaattggtttatcaatatgcaaaattaaataaaaaagttttaatttcttcgcaaaatcat
acggcaattgataatgttttaacccgcctttttaaatcacctttgattgtcccattacgc
ttaacaggtgaagaagtgcggaaaaagaatcgtttcaatgattttaatcctgatcgggtt
gtttttaataactatcgttttatgtattcctatttaaccctcgaatatttaacaaaatga
gaagggattgatgaccaatatctattgcaaaaagaagctttacaaaatttaaaggctaat
gcaaaaatgctggcaaaagaaattaaggagtatcaagaattagaaagtaaaatcttaagg
ttaaaaacaacccaagaagaaaatttgacaaatttattaaaactaaaaaatcataataaa
aaattattagttgaaattaataacattgataattttcaggaattattaaatgattctgag
tgaaatggtcatgttcaaaataccaatgatttaacaactttatttaatcagcattttgga
actttaattcatgaaaaactaaatttagattttgatgtttcctattcaattccggaagtt
tatcgtcaattattagccgatagtttagatccagaaacaatcaacgcaattgctgataaa
aaagcacaattgatggtgttaaaacaagttgaaccagcttatcgcgatgataattgagcg
acacaattattaacattaaatgaagcaattattaatttacaaaaacaaactagtttaaaa
caaggcaatgttgtgcatctccaacaagttagggagttacaagtagggttagaggcctta
aaatataaatatcaaaatcaaattaaggataatgaaaaattaatagcaacagcagaagaa
aatcaaacagaccaagagttattttatttagaaaccgaatttaatggtttagaacaaaaa
attaaccagttaaaagttgatgttgaaaatattgtttacaacattaatcaaatttttaat
ctgacattaaatattaaagatattacgacaacaattaatgagttagacgaaattattgtt
aaccttgaccaggaaattaaaacaattcaaaaagaaaaaattgcgaaaggaaagtttgtt
aataatatgattaactttttagaccggaattatcaaatggcgcaatttttaaccggggaa
aactttaacaataatatttttaactcagcattagaaaaagatacgaagacttatgctaat
cagtttttacaaaataatgttaatgttgtggcaatgacggcaacttcaaatcaaatttat
ttacaaagtaaaaataaaattttagccgattataatattagtgatattgatattaagagt
tttagttttgatgtggttattattgatgaagtaagtaaattaacgccaatggaaatttta
atgccattagtatatggaaaagctgttgttttagtgggcgattaccgtcaattaccgcca
ctgatgcaattccaagaaagcgatgttagcaaaattaatgaattataccatgaaaattat
agctattttgattttacacaattagtaacacaatcaatgttcaaaaagctaatttcacaa
tgtgatgattcggttaaaggaattttagttgaacaatatcgcagtcatggagatattatg
aaagttgttaatgttttttatgaaaatcagttacaattaggagatccgacacatcaaaac
ttgcaaaaacaacattatctaaatgttggtaataatcaacaaccaataatttttagttca
aataaagcaatttactgattagattcctctcgtgatataaatcaagaattagtttatgaa
caaggcgaagcaggaagtacaagtttgtttaactggttagaaattgaattgacaatagca
acattaaaattaatcgatcaaggttatggtgctttaccagctaagttaacacataaacca
aatgttgctgtgattagtttttatggtttgcatgttaagaaattacgtaaggctttacaa
acggtgaaattaaaaaatattagtttagaaatttcaactgttgatgattatcaagggcgt
gaaagtgatattgttattgttaatactgttcgtcatccaaaaaatcaagctcgggctaac
aaggaatttgttcagaaatatgaaagattaaatgttgctttttcccgggccaaaaatatg
ctagtaattattggagcaattaatttttttgcaaatattgaagtagaaattccgacaata
atgaacccagttttaacaaaattaacaagagtttatgatgagattattaagattattcgg
acatttgggaatgtctgaacagctgaagatatttgtgagaatgtaaaggagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
