Spiroplasma chrysopicola: SCHRY_v1c10000
Help
Entry
SCHRY_v1c10000 CDS
T02676
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K02004
putative ABC transport system permease protein
Organism
scr
Spiroplasma chrysopicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
scr02000
]
SCHRY_v1c10000
Transporters [BR:
scr02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
ABC-2 type and other transporters
Putative ABC transporter
SCHRY_v1c10000
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FtsX
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
16152399
NCBI-ProteinID:
AGM25572
UniProt:
R4U2H2
LinkDB
All DBs
Position
complement(1091414..1094869)
Genome browser
AA seq
1151 aa
AA seq
DB search
MKNLVKEATRGFTKKITQLIGLILFIITAVMTFTALFSAVFQVQNGINNLAKQSGSYDYE
INLTSLYVDNNVIKKGDNEINLANRTFLEFFYDSTAIDNLELNFNTIKSDLGKLECSKDD
GLCQWTKAPSYLNPSTGTAAFTTLAKNFNQNLESLLLSYLFNNQGKSFLESNNLSAQIAF
SLNYQFVIKDLSAQNQYFNATPIAKNFDEMYYGDDWMNLNMFTSSFNRVYDSYHQKVVNN
TPTRTVYLTQQYGQYKNLAVGDSFNLLDSVGLQYQIKGWASRYSTIYPNLASLAVIANQK
ESVSLKNGSLLFLNDDDYNQIKYNFGTGTEIMTAFIKMEGSPNFAQKTEVLSNLLSKNFI
SPDNAIFDFNSTYAGDTVMLANTTFIIDGSIAFACSIIIIFIIAFFIKKDIHMQKKQIGV
LKALGYGRHQLSIVFIINIALATLIGCLIGWVLSMPFQMYFTASNLYSIGISLTLFYFNP
LIFIITILVIPLCFAILAFIISYSLLKNSALDLIYDLKATNLHVRYKKVKKAKRYYHLGL
SFNAHLSFTFALKSLGKWIMVMVVLAFASFLLIFQLDADVMAQKFVKDSFRYFKDDIKSY
LIASYDQQEIAVQSQNKESYQWINQDQVEQYYHQADILEDSTKFNFPNPLTCLMTLTSTG
KGCGDFLNIIGNINKTDYHSKIRVVDGKYPYLSSQTVEALVDYQMLGNNGQLVNGWNRIK
EMLENPLYQEILINQGNLTKGDIQAAIGVVNLIRNIKTLTDGNYPDVYFGPYMVYNPKYD
FPYISSPARWQASDVANAKNPITRLGLVGLSNNRSEREQLFNFKSKKLSLDDLQEQVFGY
DINPNPLQISDLNKAINEPIPVILSTRLYQAMQAQPGQIFTLKAQITNTIGYVPIAFKIV
GDNLGDINSANIYMNKNSLVRVMNQWVKITGKGEIFDDNNYNNAIASKKSKNGSVLQPYR
IISSYSLTNNYDFTMYNEQKKLDPTRVADLRANLKVLNNFNRIFPFDMLRESYQEGMKTV
SEILTVLEGLTILIVALILAVLIGMVLDENRRTILTMKVLGYPTHKIILIVLGFYFFAIL
IGYAASFGLAQIAWWIILKVLFMQNGLLIIPEFSLSVVLYASLAIGIILCTIVSLGIWQI
KRNALTNITMY
NT seq
3456 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaatttagttaaagaagcaacacgaggttttacaaaaaaaattacccaattaatc
gggttaattctttttattatcacagcagtaatgacatttacggcattattttctgctgtt
tttcaagttcaaaacggaattaataacttagcaaaacaaagtggaagttatgactatgaa
ataaacttaacaagtttatatgttgataataatgttattaaaaaaggtgataatgagatt
aatcttgccaaccgaacttttttggaatttttttatgactcaacagcaattgataattta
gaattaaattttaataccattaaaagtgatcttggaaaattagaatgtagtaaagatgat
gggctttgtcaatgaacaaaagcaccaagttatttaaatccaagcactggaacagcagct
tttacaactttagcgaaaaattttaatcaaaatttagaaagccttttattaagttatctt
tttaacaatcaagggaaaagttttttagaaagtaataatcttagtgctcaaatcgctttt
agtttaaattatcaatttgtaatcaaagatttatcagctcaaaatcaatattttaatgca
acaccaatcgctaaaaattttgatgagatgtattatggtgatgattgaatgaatttaaat
atgtttacaagttcatttaatcgtgtctatgattcatatcatcaaaaagttgttaataat
actccgacccgaacagtttatttaacccaacaatatggtcagtataaaaatttagcggtc
ggagatagctttaatcttttagatagtgtagggttgcaatatcaaattaaaggttgggca
agtcgttatagcacaatctatccaaatttggctagtctagcagtaattgctaatcaaaaa
gagagtgttagtttaaagaatggttcgttgttatttttaaatgatgatgattataatcaa
attaagtataactttggaacagggaccgaaattatgacagcttttatcaaaatggaaggt
agtcctaattttgcccaaaaaacagaagttttaagtaacttattaagtaagaattttatt
tcccccgataatgcaatttttgattttaattcaacttatgctggggatactgtgatgtta
gcaaatacaacttttattattgatggttcaattgcctttgcgtgttcaattataattatc
tttattattgctttttttattaaaaaagatattcatatgcagaaaaaacaaattggggtc
ttaaaagcattaggatatggtcgccatcaattatcgattgtttttattattaatattgct
ttggccactttaattggatgtttaattggttgagtcctttcaatgccatttcaaatgtat
tttacagcttctaatctttatagtatcggaatttcattaacattattttactttaatccg
ttaatttttatcatcacaattttagttattccgctttgctttgcgattttagcttttatt
atttcatattcgcttttaaaaaattcagcattagatttaatttatgatttaaaagccaca
aatctacatgtgcgctataaaaaggttaaaaaagcaaaacgctattaccatttagggtta
tcttttaatgctcatttatcatttacatttgccttgaaatcccttggaaaatgaattatg
gtaatggttgttttagcttttgcctcgttcttattaatttttcaacttgatgctgatgtt
atggcccaaaaatttgttaaagattctttccgttattttaaagacgacattaaatcttat
ttaattgcttcatatgatcagcaagaaatagcagttcaatctcaaaacaaagaaagttat
cagtgaataaatcaagatcaagtcgaacaatattatcatcaagctgatattttagaagat
tcaaccaaatttaatttccctaatcccttaacttgtttaatgactttgacaagtactggt
aaggggtgtggagattttttaaatattatcggaaatattaataaaacagattatcatagt
aaaattcgtgttgttgatggaaaatacccttatttatcttcccaaacggttgaagctctt
gttgattatcaaatgctaggcaataatggccaactagttaatggttgaaataggattaaa
gaaatgttagaaaatcccctttatcaagaaattttaattaaccaggggaatttaacgaag
ggagatattcaagcagcaattggggtggttaatttaattcgtaatattaaaaccttgact
gatggaaattatccggatgtctattttggcccttatatggtttataatcctaagtatgat
tttccctacatttcaagtccagcgcgctgacaggcaagcgatgttgctaatgctaaaaat
ccaattacaaggttaggattagttggcctttccaataaccgttcagaacgtgaacaatta
tttaattttaaatcaaaaaaattatcattagatgatttgcaagaacaagtctttggttat
gatattaatccaaacccattgcaaattagtgatttaaataaggcaataaatgaaccaatt
ccagtcattttatcaacaaggttatatcaagctatgcaagcgcagccgggtcaaatattt
accttaaaagcccaaattactaatacaattggttatgttccgattgcatttaaaattgtt
ggggataacttaggtgatattaattcagctaatatttatatgaacaaaaactctttagtt
cgagtaatgaatcaatgagtaaaaattactggcaaaggggaaatctttgatgataacaat
tacaataatgcaattgcttcaaaaaaaagtaagaatgggagtgtcttacaaccatatcga
attatttcttcttattcattaacaaataattatgattttacaatgtacaatgaacagaaa
aaattagatccaacccgagttgctgatttaagggctaatttaaaagttttaaataatttt
aatcgtatttttccctttgatatgctccgagaaagttatcaagagggaatgaagacggtt
agtgaaatcctaacggtcttagaaggtttaactattttaattgttgccctgattttggct
gttttaattgggatggtgttagatgaaaatcgccgaacgattctaacaatgaaagtatta
ggatatccaacgcataaaattattttaattgttttaggattttacttttttgcgatttta
ataggttatgctgccagctttggtctagctcaaattgcctggtgaattattttaaaagtt
ttatttatgcagaatggtttattaattattccagaattttccttatcagttgttctatat
gctagtttagcgattggaattattttgtgtacaattgtcagtttaggaatttggcaaatt
aaacgcaatgctttaactaatattactatgtattaa
DBGET
integrated database retrieval system