Stanieria cyanosphaera: Sta7437_3707
Help
Entry
Sta7437_3707 CDS
T02406
Name
(GenBank) protein of unknown function DUF490
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
scs
Stanieria cyanosphaera
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scs00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
scs02000
]
Sta7437_3707
Transporters [BR:
scs02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Sta7437_3707
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFZ37203
UniProt:
K9XXF4
LinkDB
All DBs
Position
complement(4189722..4195175)
Genome browser
AA seq
1817 aa
AA seq
DB search
MTKFLQNPPPNPEPSSFWQMFLEKIKHPSKITIIGFSTFAIVGLGYWGTKVLVKQKLPSF
LEQQISQIINRPVDFGEVESVSLRGITFDSLTVPPTATDPGKVAIDRVEVGFNILPLIFK
RTLPLEITLVQPEVYLEQAKDNSWLDLNLQTQDGEPSIYVDLTVNVEEGNITAVPYNQSP
IEVQLDGSGRYNPTGDQLVEYDLDAAIEQAKAKIKGQTTIASGQTNTKLQINDLVLTDVT
SLIPNSPINLNSGKLNADLDINIPSFEEITAANIEGQVNLQNVQGEVEDLSSSLTAKSQL
NFGGRNAQVNDTQVNLGNLTAKLKGTVDLQQGYDLNVDVLPFSLSGLQQTFNTSFPVDLA
GEVAAQLQLSGAIKEPLLTGTINNTKTLTVAQTKLKSVQANFAANLSEVVLKNLEAIPLA
GGQIQGQGIIDTNIQQSLENHQAIDATNMPLAFNFKATLPTEKIVSPYYNFPQEIAVNTF
NAEGKVRGTLANPQANLQWQIPQASTTTVENISGSGTVLFADNQLLLDDTEVLVGEGRLN
VEGNANLNNQQWQTNITASALALSPFLSQLNTSAVNFDRPITLEKGTINLNGRLDQLNPN
QVTGIANLNLAVNGSDVNLDSRLTSGNLQATANTGRIALNQFIPSLPLATTLESSRINLS
GQLQQLLTLADNPNLSTIKANLDANLAVANGTINAQGSLNNNRWQTNLNANNLNSNLLAQ
TFAPQNLQNLNLDNLDGQIELAGSLNPLLNNQVNLPIQANQIALQLGEQSLNAQGDLILS
NLTTNPDLDRVNLNVDANLDFEQLPIDQLIAQTSNNNDLLAESVNVYGQANFQGQFVGNN
LISAPTNPENLNLTGNLSLNNFAFNDVVFDPVMAGQVNINPANELAVNLKGEQDVIAATA
EPCTANRCRFPYLPTSLELRQGENTSQPVIATGNRQGDVFSLDIQNFPLALLNLAPGEPL
GIQGALNGQTTGEINANLFTLATTGNVTVEQPAIGYIQAKKFAANFNYNPEQNLAEVATS
SLEFGNSEYNFNGGVNLATGQLEGELNIPQAYVQDILTTFRWFTLEDLTRLFQTPNYAQA
NQVAPNNIETASESLVRKLKLLRQIENQIQAEAAAKQAGEVPTDLDIRGAYGGEILLAGT
ITNPQINFSVEANDWEWQPQPAFANIVPPLGFIKEEIQFIAINQILLQGIYQDSIVNLDN
ARIQVEDATVALQGKLSPAQPENASFQIENLSLDVINRFINIPVDIAGVINSNGTITGTL
SQPQLEGNITFSDGAYNGQALPETIAGNYIYTDDKLQFATTEPSSIQVDATVPYPIQPGN
DTITANLDLGTEAFSLLGIFTQDNLTWLGGEGTATLRATGRLDLNRATPLYALNATGEVN
LQDAQVKNKYFSEPLIATGKATLNNQLVNVEQLTGKFAEKDLTVTGTLPILYSVSSIENP
LTINLPEGKINLEELYEGDVAGNVIVTGAALEPIIGGEVFLTDGEVFIPEQEDNDSTVAT
NINLIRNNNADSPAIITRLNNFQVNLDNFKIEQSPLYEFNVQGNLSLNGTADTVSNIEPK
GTIFINKGNVDWLSSNFTLVRNRQNTAVFTPEAGFLNPYLDVQMKTEVSNLNNLRQLEPD
RNEISDDISQVGRTEVITVNLIIDGEAEELLPTLGQTASNCNVRPDNVPPSGEVNYSQTE
LNQLATCINVAALNGQRDRNLLNSPAVQLTSTPTRSQGEIVNLLGNQFLSFAEELQNSNA
EELLNFGVAQFVITPIQRRLFYRVEDFVVGVGQNIGLDYLRVYPYLEGIYEIKNDASVRA
TYDYVLNEGRIEYQLRF
NT seq
5454 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaaaatttctacaaaatccccctcccaatccagaaccttctagtttttggcaaatg
tttttagaaaaaattaaacatccttccaaaataacaatcattggcttttctacctttgca
atagttggtttgggttattggggaactaaagttttagtcaaacaaaaattaccttctttc
ttagaacaacaaatcagtcaaataattaatcgccctgtagattttggcgaggtagaaagt
gtctctctgaggggaatcaccttcgactctcttactgttcctcctactgccacagatcct
ggtaaagttgcaattgatcgagtcgaagtcggtttcaatatcttacctcttatttttaaa
cgaactttacctttagaaattactttagttcaaccagaagtttatttagaacaagctaaa
gataattcttggttagatttaaacttacaaacacaagatggagaaccttctatttatgta
gatttgacagtaaatgttgaagaaggaaatatcactgctgttccttataatcaatccccc
attgaagtacaacttgacggtagcggtaggtacaatcccactggcgatcaattagtagaa
tatgatttagatgcagctatagaacaagctaaagcaaaaatcaaaggacaaactaccatt
gcttctggtcaaactaatactaagctacaaattaatgatttagttttaactgatgttact
tctttaatccctaattctccaatcaatcttaatagtggtaagctgaatgccgatttagat
attaatattccttcttttgaagaaattactgctgctaatattgaaggacaagttaattta
caaaatgtgcaaggtgaagtagaagatttatcttcatctttaacagctaaatctcaatta
aattttggtggtagaaatgcccaagtaaatgatactcaagttaatttaggcaatcttact
gctaagttaaaaggtacagtagatttacaacaaggttatgacttaaatgtagatgtttta
ccctttagtttatcaggtttacagcaaacttttaatacctcttttcctgtcgatcttgct
ggtgaagtagcagcccaattacaattatcaggtgcgatcaaagaacccttattaacaggc
acaattaataatactaaaactttaactgtagctcaaaccaaattaaaatcagttcaagct
aattttgctgctaatttaagtgaagttgttttgaaaaatttagaagctatccccttagct
ggaggacaaattcaaggacaaggaatcatcgacactaacattcaacagtctcttgaaaat
catcaagctatagatgctacgaatatgcctttggcatttaactttaaagctactttacct
acagaaaaaatagtatctccatattataattttcctcaagaaatagccgttaatactttc
aacgccgaaggaaaagttagaggaacattagctaatcctcaagcaaatttgcaatggcaa
attcctcaagcttcaaccacaacagtagaaaatatttctggttcaggaacagttttattt
gctgataatcaattattacttgatgatactgaagttctagtaggtgaaggtcgattaaat
gttgaaggaaacgctaatttaaacaatcaacaatggcaaactaatattacagcttctgct
ttagctttatcaccatttttatctcaattaaatacctcagcagttaattttgaccgacca
attactttagaaaaaggtacaattaatttaaatggtagattagaccaattaaaccccaat
caagttacaggaatagctaatttaaatctagctgtaaatggtagcgatgttaatcttgat
agtagactcacttcaggtaacttacaagcaacagctaacacaggtagaattgcactcaat
caatttatacccagtttacctctagctactactttagaatctagcaggattaacctttca
gggcaattacaacaattattaactttagctgataatcctaatctaagtactattaaggca
aatcttgatgctaatttagctgtagctaatggcacaattaatgctcaaggaagtttaaat
aataatcgatggcaaactaatcttaatgccaacaatcttaactctaatttattagcacaa
acatttgcgcctcaaaatcttcaaaacttaaatttagataatctcgacggacaaattgag
ttagcaggtagtctcaatcctttacttaacaatcaagttaatcttcccattcaagctaat
caaattgctttacaactaggagaacaatctcttaatgcccaaggtgatttaattttatct
aatttaactactaatcctgatttagatcgagttaatttaaatgttgatgctaatcttgat
tttgaacaattaccaatagatcaattaattgcccaaacttctaataacaatgatctctta
gcagaaagtgtgaatgtttatggacaggcaaactttcaaggacaatttgttggtaacaat
ttaatttcagcaccaactaatccagaaaatctcaacttaactggtaatttaagcttaaat
aattttgctttcaatgatgtagtgttcgaccctgtaatggcaggtcaagtaaatattaac
ccagctaacgaattagcagttaatctaaaaggagaacaggatgtaattgctgccacagca
gaaccttgtacagcaaatcgatgtcgttttccttacttaccaaccagtttagaattacgt
caaggagaaaatacttctcaaccagttattgccacaggaaatcgtcaaggagatgttttt
tctttagatattcaaaactttcctttagctttacttaatcttgccccaggagaaccgtta
ggaattcaaggtgcattaaatggtcaaacgacaggagaaataaatgctaatctttttact
ttagcaactacaggaaatgttaccgtagaacaaccagccattggttatattcaagctaaa
aagtttgctgctaattttaactataatcccgaacaaaatctagcagaagtagcaactagt
tctcttgaatttggtaatagtgaatataactttaatggtggagttaatttagcaacagga
caattagaaggagaactaaatattcctcaagcttatgtccaagatattttaactacattt
cgttggtttactctagaagatttaactagattatttcaaacgcctaattacgcccaagct
aatcaagttgctcctaataatatagaaaccgcctcagaatctctagtcagaaaattaaaa
ttattaagacaaatagaaaaccaaattcaagctgaggcagcagcaaaacaagcaggagaa
gttcctacagatttagatattcgtggtgcttatgggggagaaattttattagcaggaaca
ataactaatccccaaatcaactttagtgtcgaagcgaatgattgggaatggcaacctcaa
cctgctttcgctaatattgtgccacctttaggatttattaaagaagaaattcagttcatt
gctattaatcaaattttgctccaagggatttatcaagatagtattgttaatttagataat
gccagaattcaagttgaagatgcaactgtagcactacaaggaaaattatcacctgctcaa
ccagaaaatgctagttttcaaatagaaaatctttcccttgatgtgattaatagatttatc
aatattcctgttgatatagcaggagtaattaattctaatggcacaattacaggtacttta
tctcaacctcaactagaaggaaatattacgttttctgatggtgcatacaatggacaagca
ctaccagaaacaattgcaggtaattatatttacactgatgataagttgcaatttgcaact
actgaaccatcttcaattcaagtcgatgccactgttccttatccgattcaaccaggaaac
gatactattacagctaatctagatttgggtacagaagctttttcgctgttaggtatcttt
actcaagataatttgacttggcttggtggagagggaacagctacactaagagcaacaggg
cgtttagatttaaatcgtgcgacaccactttatgctttaaacgctacaggagaagtcaac
ttacaagatgctcaagtcaaaaacaaatatttctccgaacctttaattgctacaggtaaa
gctactttaaataatcaattagttaatgttgaacaactaacaggaaaattcgctgaaaaa
gaccttactgtcacaggaacattaccaatcttatattctgtttcgagtattgagaatcct
ttaactattaatcttcctgaaggtaaaatcaacctagaagaattatatgaaggagatgtg
gcaggaaatgtaattgtaacaggggcagcacttgaacctataattggtggtgaagtattt
ttaaccgatggtgaagtttttatcccagaacaagaagataatgattctactgtagcgact
aacattaatttaatcagaaacaataatgctgattctcctgcaatcattactagactgaac
aattttcaagtaaacttagacaatttcaaaattgaacaatcccctctctacgaatttaat
gttcaaggaaatctgagcctcaacggaactgctgatactgttagtaatattgaaccaaaa
ggaactatttttataaataagggcaatgtagattggctctctagtaactttactttagtg
cgtaatcgccaaaatactgctgtgtttactcccgaagcaggattcttaaatccttatctt
gatgttcagatgaaaacagaagtttctaatttgaataatttgcgacaattagaaccagat
agaaatgaaatttctgatgatatttcccaggtaggaagaacagaggtaattactgttaat
ttgataattgatggagaagccgaagaattattacccactttgggtcaaactgctagtaac
tgcaatgttcgtcctgataatgttcctcctagtggagaagtcaactatagtcaaacggaa
ctaaaccaacttgctacttgtattaatgttgctgctttaaatggacaaagagaccgcaat
ctacttaattctcctgctgttcagcttactagcactcctactcgtagtcaaggagaaatt
gttaatttgttgggtaatcaatttttatcttttgcagaggagcttcaaaatagtaatgca
gaagaattattaaattttggtgtggctcaatttgtgattactcccatccaacgtagactt
ttttatagagtagaagattttgtcgttggtgttggtcaaaatattgggttagattatctg
cgagtttatccttatttagaaggtatttatgaaattaaaaacgatgcttcggttagggca
acttatgattatgttttaaatgaaggcagaatagagtatcaattgagattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
