Scytonema sp. HK-05: SAMD_56210 Help Entry SAMD_56210        CDS       T09974                                  Name (GenBank) hypothetical protein   KO K09800   translocation and assembly module TamB Organism scyt  Scytonema sp. HK-05 Brite KEGG Orthology (KO) [BR:scyt00001]  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    02000 Transporters [BR:scyt02000]     SAMD_56210 Transporters [BR:scyt02000]  Other transporters   Pores ion channels [TC:1]    SAMD_56210 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  TamB DUF748 Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  BAY48002 LinkDB All DBs Position 6528385..6534093 Genome browser AA seq 1902 aa AA seqDB search MTRSPKSGNEQEPSNRRLWLLLLGRTSLAVGVILLAGIAGGVWWARNYVYKDLAPFVESN LQQLLGRPVKLGAVERFSLSSLRFGALSVPATPNDPDRVAAKAVDVQFSPLRLLFNRTLA LNVTLVQPDVYLEQDKQGRWVTTQLKTGEGKGFIQTELQTIRLQNGDVVLVPNPTPNKPK GSVALDQVNGTARILSQNQGISYDLGAQPTTGGTVKIVGETQLKTLQTNVKLQAQNLEAA NVSRLIELPIALQSGRVDADLAVQLQPDQQQANQQEIAINGTAIANKVTAQIQNVPQKFI NSNGRLTFQGQTVGVENLSTNYGTVPVLANGALNLQTGYNISAQVKAVSAKNLLDTLNAK LPVPVAGEVQSKIQLQGPIQQPILSGTASNIKPVQVDRVLFNGLSTGFRLSLSKAGSQVA VSNLQLIPAAGGQITGNGQIQLGSKPQQGGVKFNLQAEGVSADALASAYGLTLPTSIGNV SAKAEVSGSPGGGTQPLTLNISSVKATPPAGGEITANGRVQLVPQGNVALNVQAQGIPAN AIAQGYGVSVPINIGGVSANATVSGRLGAQPLTVNVARVQATPEVGGQITANGQVQLAPR GRVSFNVQAQNLPGDAIAKAYKTSPPITIGNVSANARIFGSLGNLQTVAQVSAPTATYPT SGQVVVNQQGNSVLFRDAVVKVAGSTIRGRGQLAQGRWQAFVNAQQLQLSRFAQVPPQLQ AGVLSSQLNLSGSTASFQPSTIQASGQASLRNVAGGTVNVRNISLDNGRWQALANVSQVQ LNRFSQQLQGRLNSNLQLAGTTESFALSNIRAAGQVGLSQGLSLLAQPITAQVQWNGQQI ILQNATSPGLSANGVVAVQVPETGTPQVSGFNLNVQARNYNLQKASSNLPGNIALAGRLN FTGQLTGTPTTPNAVGNIRLENLNVSGLAFDPVLAGNVKYQGGQGGQLQVAGRQDQIAVN IDANNRPSSFLFRRDQAVATGRTEGENLLVNVRDFPVAILSGFVPNNTLKPLAGQASGDL VVNLNNYSAAGEVAIAKPRVGRVTADEFRGNISYADGAASLTNGQLRIAESSIALSGNVQ TGNNPQFQFQANFDQTRIDRLLQAFNVFDFGDFAGGLQGPDLAGAEVLQTQPRSLPNADL LSQLKYFSQIATRVVEEQAQQKEPTTLPTLAELQGALSGGIEVAGSLQSGLNASFNFQGN NWQWGKYSINDVIARGTFANGVVTLLPLRVDLNPGSLAFTGQLGTEQLSGQLRVASLPLS LLQPFIERYPVDVTGNVNAVATLGGDLKDPRAIGELTLVDGTINKQAVQTGQVSFNYNNA RLNFGSTVLVTGTQPVQIAGSVPFGLPFASVQPDSNQISINARVQDEGLALLNLFTNQQV TWVNGQGQVNVDVQGTLNQPIINGVATVNNATFQAQALPDPLTNVTGTLQFNGDTLTVES LQGQYNKGAVTAAGVLPIFARQAAQAEAATNPLTVSVNNLNLNVQGLYQGGVSGDVLIGG TALSPDIGGTIQLNNGQVLIGQSNTAGAKPSGTQNGNATDNATTIFRAQPTNTQGTSTPD GATTTFGAQPTNTGGTSTPDGATTTFGLEQPGTQGGNATATATRPNLPIEFDGLRLILGN NVRVSTAPILGGFVPGGELSPSLLTFDAKGNLTINGTLAKPLPQGVIRLTGGQVNLFTAQ FTLDRGYEQTAEFTPSRGLDPVLDVRLVALVPETTGGTSGRTLRSPFSSEISDVSAIDFG TLRTVRVQARATGPASQLSDNLELTSQPSRSEAEIISLLGGSIINSLNQADATVGIATLA GSTIFGSLQGSITALGQAIGFSEFRIYPTSISNQESASVLGLAAEGVFDISRNLSVSLSA VFLGDQPFNYNLLYRVNDDILVRGSTNLADESRLLFEYETRF NT seq 5709 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgacgcgctctccaaagtcaggaaatgaacaggagccttctaaccgtcgtctgtggctt ctcctcttaggacgtactagtcttgctgtgggagtgattttgctagctggaattgcaggt ggtgtttggtgggctaggaactatgtttataaagatttagcaccatttgtggagagcaat cttcagcagttgcttggaagaccagtaaaattaggggcagttgagcgattttcgctttct agtttgagattcggagcgttatcggtaccagcaactcccaatgatccagatagagttgca gcaaaagctgtggatgtacagttttcccctttgcggctcctttttaaccggacattggca ttaaatgttactctagttcagcctgatgtgtatcttgaacaagataaacagggacgctgg gtaacaactcaactgaagacgggagaaggaaaaggttttattcaaactgagctgcagaca atacggcttcagaatggagatgtggtgttggtgccaaatccgacaccaaacaaacctaaa ggttcagttgcgttagatcaggtaaatggtacagcgcgaattctgtctcaaaatcaagga attagctatgatctcggtgctcaaccaaccacgggaggaacagtcaaaatagttggtgag acacaactgaaaacactacaaactaacgtcaagctgcaagcgcaaaatctggaagcagcc aatgttagtcgattaattgagctaccaattgctttgcaatcaggtcgtgtagatgctgac ttagcggttcaattacagcctgatcagcaacaagccaatcagcaggaaattgcgattaat ggaacggcgatcgccaataaagtcactgctcaaattcaaaacgttccccaaaagtttatc aattccaatggcagattaacgttccaaggtcagacagttggtgtagaaaatctgagtacg aactatggcacagttcccgttctggcaaatggagctctcaatctccaaacaggttacaac atttctgctcaggtaaaggcggttagtgccaaaaatcttctagacacgctgaatgcgaaa ttgccagttccggttgctggagaagtacaatcaaaaattcagttgcaaggaccaattcaa caacccattctcagcggaaccgcaagcaacatcaaacctgttcaagttgaccgcgtttta ttcaatggtcttagcactggctttcggttaagtctatctaaagccggatctcaagtagcc gtttctaacctgcaattaatcccagccgcaggtggacaaattacagggaacggtcaaatt caactcggatctaaacctcaacaaggtggagtgaagtttaatctgcaagctgaaggtgtg tcagcagatgcacttgctagtgcttacggcttgactctccccaccagtattgggaatgtg tcagccaaagccgaagtttctggttcacccggaggcggcacacagccattgacgcttaac atatctagcgttaaagcgacaccgccagcgggaggagaaatcacagcaaacggtcgagtt caacttgtcccccaaggtaacgttgcgttaaatgttcaagctcaaggtataccagcaaat gcgatcgcccaaggttacggcgtttcagttcccatcaacattggtggtgtatccgctaac gccacagtgtctggaagactaggtgcgcaacctttaacagtgaatgttgcgagagttcag gcgactccagaagtaggaggacaaatcacggcaaacggtcaagttcagcttgcacctcgg ggtagagtttcatttaatgtgcaagctcagaatttacccggcgatgctattgccaaagct tacaagacttcacctccgattacaattggcaatgtatcagcaaacgccaggatttttggc tcacttggcaatttgcaaacagtcgcgcaggtttcagcacccacagccacttatcccacg agtggacaagttgttgtcaatcaacaaggtaatagtgttctcttccgagatgctgttgtc aaagtagcaggtagtacaattagaggcaggggtcaacttgcacaaggtcgctggcaggct tttgttaatgcccagcaactacaattgagccgttttgcacaggtaccaccccagcttcaa gcgggagtcttaagcagtcagttgaatttgtcaggaagtactgcatcgttccaaccgtca accattcaagcttcaggacaggcaagtctgcgtaatgtggcaggaggtacagttaacgtt aggaatattagccttgataatggtcgctggcaagcccttgctaatgtttcccaagttcaa ctcaaccgtttttcacaacaactgcaaggacgactcaatagcaacttgcagttagcagga acaaccgaatcttttgcgctttcaaatattcgcgccgcaggacaagtaggcttgtcacaa gggttatcactgcttgcacaaccaatcacagcacaagttcagtggaatgggcaacagatt attctgcaaaacgcaacttcccccgggctgagtgctaacggtgttgttgcagttcaagtc cccgaaactggcacacctcaagtcagtggttttaatctcaatgtgcaagcacgcaattat aacctgcaaaaagcgagttccaatcttcctggtaacatagcgttagcggggcgacttaat ttcacaggacaactcacaggtacgccaacgactcctaatgctgtgggaaacatccggcta gagaatttgaatgtcagtggtttggcgtttgacccggtattagctgggaatgtaaaatat cagggcgggcaaggtggacaactgcaagttgccggtagacaagaccaaattgcagttaat attgatgcaaacaatcgcccaagttcatttttgttccgacgtgatcaagcagttgccact ggcagaactgaaggagaaaacttgcttgtcaacgtgcgagattttcctgtagctattctg agtgggtttgttcctaataatacactgaaacctcttgcagggcaagcatccggcgattta gtcgttaatctgaataactatagcgctgcgggagaagtggcgatcgccaaacctcgcgtt ggtagagtcacagcagatgaatttcggggtaacatcagttatgccgatggtgctgctagc ttaacgaatggtcaattgcggatagcagaaagcagcatcgccctgagtggaaatgtgcaa acagggaacaacccgcaatttcaattccaagctaattttgaccaaaccagaatcgacaga cttctacaagcattcaatgtctttgattttggggattttgctggagggttgcagggtccg gatttggcaggagcagaggtacttcaaactcagcctcggagtttgccaaacgcagatttg ttatcacagctaaagtatttctcacaaattgcaacccgagtcgtagaagaacaagcacag caaaaagaaccaacgactttacccacacttgcagaattacagggtgccttgagcggagga attgaagtggctggctcattacagtcagggttaaatgccagctttaattttcagggcaat aactggcaatggggtaaatactcgattaatgatgtcatagctagaggcacttttgcaaat ggtgttgtgacactgttgccattgcgtgtagatttgaatccaggctccctggcatttaca ggacagttaggaactgaacaactgtctggacagttgcgtgtcgcaagtttacctttatca cttctacagccttttatagaaagatatccagtcgatgtcacagggaatgtgaatgctgtc gctactttaggtggtgatttaaaagaccccagagcgatcggtgaactgacgctggtggat ggtactatcaacaaacaagcagtgcagactgggcaagtgagtttcaattataacaatgct cgtctcaattttggcagtaccgtgttggtgactgggacacagccagttcagattgcaggt agcgtaccttttgggttgccttttgcttcagttcaaccagatagcaatcaaatcagcatc aacgccagagtgcaggatgaaggcttggcgctgttaaacttgtttaccaatcagcaagtc acttgggtgaatggtcaagggcaagtgaatgtagatgttcaagggactttaaaccagccg attatcaacggagtcgccacagttaataatgcaacttttcaggctcaagctttacctgac cccttgacaaatgtcacaggaacactccaatttaacggcgatacgctgactgttgagagc cttcaagggcaatacaataagggtgcagtgactgctgcgggagtccttcccatttttgca cgtcaagcagcacaagccgaagccgcaacaaatcccctcaccgtatcagtaaacaatctg aatttgaatgttcaagggctgtatcaaggaggtgtcagtggtgatgtcctcattggtgga acagcgctatcccctgacattggcggaacgattcagctcaacaatggtcaggtgttgatt ggacaatccaatacagctggtgcaaaaccatcaggtacacaaaacgggaacgcaacagat aacgcaacaactattttcagggcacaaccaacaaatacgcaaggaactagcacaccggat ggcgcaacaacgactttcggcgcacaaccaacaaatacgggaggaactagcacacctgat ggcgcaacaacgactttcggcttagaacaaccaggtacacaaggaggtaacgcaacggct actgcgactcgacctaatttacctatagagtttgatggtttaaggctgattctaggtaac aatgttcgtgtctccactgcgcccatactcggcggctttgtaccaggaggcgagttgagt ccatctctactcacctttgacgcaaaaggcaatttgactattaatggtacgttagcgaag cctctgccccaaggagtcattcgtcttacaggaggacaggttaacttatttacagctcag tttaccttagatcggggctatgaacaaactgcggagtttactcccagtcgaggactcgac cccgtcctagatgttcggcttgtagcacttgtaccggagacaacgggaggaacaagtggt cgcactttgagatctcctttttctagcgaaatcagtgatgtttctgcaattgactttggg actttacgtaccgttcgcgttcaagccagagcaacaggaccagcgagtcaattatctgat aatctagaattgaccagccaacccagccgtagtgaagcagaaattatttccctgttgggc ggttctattattaatagcttgaatcaagcagacgcaacagttggaattgccaccctagct ggttctacaatattcggtagtttgcaaggaagcattactgcgctaggacaggcgattggc tttagtgagtttcgtatctatcctacctctatctcgaaccaagaatcagcttcagttctc ggcttagcagcagaaggtgtgtttgatattagtaggaatttatctgtttctctatcggca gttttcttgggtgatcagcctttcaattacaacctcttatatagagttaatgacgatatt ctggtgcgaggctcaactaatttagcagacgaaagtcgtctcctatttgagtacgagaca cgattttag

DBGET integrated database retrieval system