Saccharophagus degradans: Sde_0649
Help
Entry
Sde_0649 CDS
T00335
Symbol
cel9B
Name
(GenBank) cellulose 1,4-beta-cellobiosidase
KO
K01179
endoglucanase [EC:
3.2.1.4
]
Organism
sde
Saccharophagus degradans
Pathway
sde00500
Starch and sucrose metabolism
sde01100
Metabolic pathways
sde02020
Two-component system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sde00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00500 Starch and sucrose metabolism
Sde_0649 (cel9B)
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
02020 Two-component system
Sde_0649 (cel9B)
Enzymes [BR:
sde01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.4 cellulase
Sde_0649 (cel9B)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_9
CBM_2
CelD_N
CBM_10
CBM49
Alginate_lyase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABD79911
UniProt:
Q21N18
LinkDB
All DBs
Position
818612..821215
Genome browser
AA seq
867 aa
AA seq
DB search
MNLTSIMFEQSVKKVAKSAIAVAVASAVTLSAAQAEVGNPRVNQVGYIPNGAKVASYVAP
SNTAQTWQLLRNGSVVASGTTTPKGTDAASGDNIHHIDFSAVSATGEGFSLLVGGDESYP
FEISADAFTPVLYDSIRYFYHNRSGIAIETQYTGGGNGSYAANAQWARPAGHINQNANQG
DNAVPCWSGSGCNYALDVTKGWYDAGDHGKYVVNGGISVWKLLNMYERALHISGSQNKYA
DGTLNIPESGNGVADILDEARWQMEFLLAMQVPEGEAKAGMVHHKMHDVGWTGLPLAPHE
DNRERALVPPSVTATLNVAATGAQCARLFDEIDASFAASCLTAAERAWDAALQNPNDVYT
GGYDNGGGGYGDEVADDEFFWAAAELYITTGDSKYLSTINNYNVTRIDWGWPDTELPALM
SLAVVPANHTANLRATARAKIVEIADTHVATSNAAGYLTPSSALDYYWGSNNGVANKIAL
LGLAYDFTGDDVYAKTVSKAVNYLFGNNTLSFSYISGHGENALQQPHHRFWAGALNGSYP
WLPPGALSGGPNAGLEDGVAAAALSACVSTPAKCYMDDIESWSTNEITINWNGALVWAMA
FYDDYADSGSGSSSSSSSSSSSSSSSSSSSTSSSSSSSSSSSSSGSSSSSSSSTSSSSSS
SSSGGECVEMCKWYQDAPRPLCNNQNSGWGWENQQSCIGRTTCESQSGNGGVINSCGTSS
SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSTSSSSSSSSSSSSSSTSSSSSSSSGGVAGVACAVTKMN
HWGSGYQLDVTVSNNGAAAVSGWSIELDFGESPQLTGSWNAAVSASGNTVSATNISWNGN
LSAGQSTSFGMQGNSDGSLSTPSCLVK
NT seq
2604 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatcttacttcaatcatgtttgaacaatcagtaaaaaaagtcgctaagtcagccatt
gccgtggcagttgcttcggcggttaccttaagtgcggcgcaggccgaggtgggtaaccca
cgtgttaaccaagtaggctatatacccaatggtgccaaagttgccagttatgttgcgcca
tcaaatacggcacaaacgtggcagttactgcgtaatggcagtgtggttgcaagtggcact
acaaccccaaagggtacagatgcagcctcgggtgacaatattcaccatatcgatttttct
gcggtgagtgcaaccggcgaaggttttagtttgcttgtgggcggcgatgaaagttacccc
tttgaaatttctgccgacgcatttacaccggttttatacgattccatccgttacttttat
cacaaccgttcgggtatcgcgattgaaacgcagtacaccggtggcggtaacggtagctac
gcggcgaatgctcagtgggctaggcccgcaggtcacattaatcaaaatgctaaccaaggc
gataatgcggtgccgtgttggtcgggcagtggttgcaactacgccttagacgtaactaaa
ggttggtacgatgccggtgaccacggtaaatatgttgtaaacggtggcatttccgtatgg
aagctattaaacatgtacgagcgtgccttgcacattagtggcagccaaaataaatacgcc
gacggtacattaaatattcctgaaagcggcaatggcgtggcggatattttggatgaagct
cgctggcaaatggagtttttattagccatgcaagtgccagagggcgaagcgaaagctggc
atggtgcaccacaaaatgcacgatgtgggttggacaggcttgccactagcaccccatgaa
gataatcgcgagcgcgcgcttgtgccgccttcggttactgcaacccttaacgttgcggcc
acaggcgcgcagtgtgcgcgtttatttgacgaaatagatgcgagttttgcagcaagttgt
ttaactgccgcagagcgcgcatgggatgcagccctgcaaaaccctaacgatgtttacact
ggcggctacgataatggcggcggtggttacggcgatgaagtggcggacgacgagtttttc
tgggctgctgctgagttatacattaccactggcgatagcaaatatctttcaaccattaac
aactacaatgtaacgcgcattgattggggctggccagataccgagttgcctgcgttgatg
tcgttagcggttgtgcctgctaatcacaccgcaaatttgcgtgcgactgctcgtgcaaaa
attgtagaaattgcagatacccatgtcgctaccagtaatgctgccggctatttaacacca
tcgtccgcgctggattactactggggttctaacaatggcgtagccaataaaattgcgtta
cttggtttggcatacgattttactggcgatgacgtttacgcgaaaacggtgtcgaaagca
gttaactatttatttggtaataataccttatcgttttcttatatttctgggcatggcgaa
aatgctttgcaacagccgcatcaccgcttttgggctggggcattaaatggaagttaccca
tggttgccgcctggtgcgctttctggtggccctaacgcagggttagaagatggcgttgcc
gccgccgcgctaagtgcttgtgtttcaacgcctgccaaatgctatatggatgatattgaa
tcttggtcgaccaacgaaattactattaactggaatggtgcattggtttgggcaatggcg
ttttatgatgactacgccgattcgggtagcggttctagctcgtcaagttcttctagctca
tctagctcttcgtcaagttcttccagttcgacttctagctcgtcgtcttctagtagtagc
tcttcgtcgagcggctcgagttcttctagcagctcttccacatccagttccagctcttcg
agttcatcgggtggggagtgtgtagaaatgtgtaagtggtatcaagatgcaccgcgccct
ctatgcaataaccaaaacagcggttggggatgggagaaccagcagagttgtattggtaga
acaacttgcgaaagtcaaagtggcaatggtggagtgattaattcgtgcggcacgtctagc
tcgagctcttcatctagctctagcagtagctcttcgagttcatccagctcttctagcagt
tcttccacatcaagctcgtcgagtagttcgtcttctagctcttctagttcgacttcaagt
tcttcgtcgagcagttcagggggcgttgcaggtgtggcttgtgcggtaaccaaaatgaac
cattggggcagcggatatcaattagatgtaacagtttctaataatggtgctgcagcggta
agtggttggagtattgaactcgattttggtgaatcgccacagcttactggtagttggaat
gctgctgtatcggcatctggtaatactgtatcggctactaacattagttggaacggtaat
ttaagcgctgggcaatctacctcttttggtatgcagggtaattcagatggttcgctgagc
acgccaagctgtttagttaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
