KEGG   Shewanella decolorationis: D0436_18555
Entry
D0436_18555       CDS       T09167                                 
Name
(GenBank) PAS domain S-box protein
Organism
sdeo  Shewanella decolorationis
SSDB
Motif
Pfam: Response_reg PAS_3 PAS_9 HATPase_c PAS HisKA PAS_4 PAS_8 Hpt dCache_1 FleQ HAMP Afaf HATPase_c_5
Other DBs
NCBI-ProteinID: QDZ92295
UniProt: A0A5B8R0Y3
LinkDB
Position
complement(4060589..4065892)
AA seq 1767 aa
MDRSKLRTFRSKILSHIALPLILIMTAVYGINAWFNYLSAERKLYDSLAQESNHSAYRLQ
LLLEHAQANTQGVADFIGFISNKEGINDSEKIKRVLTNRIERNPDFYGSAVAFKPYTFPD
KKLFSPYVYRDGNNFHYLDIGAEGYDYTDGSWDWWSKAINQPGGYWSKAYFDEGAGNTLM
VTYSVPFGPENDYFGVATVDLALDKLPEQLGVQPSQLVVLDDQGRLIFHSDKEKVLAVTS
AEWLDRNTRRNSDFWTLLDKGLNGQARFIDDKSTVYLASVASVAKLKWRVIVMVPEQQLF
TTLLDDVASVVLNLSLLTLLLLLTCYIAAKRLTRPLEALESGILAFGQGKAQQLAIPKGA
VSEIVTLSSTFNQMAELLAEREQAILDSRGNRFARLIDGMSDKSFYCSLDPSGQLAQVSE
GVTKVLGISPELLKRKYQRLFTANPLNEKNWEYTDLALKGQNVPSHQVELLDASGHPRML
DLFMQPLVSDTGELMSVEMLFTDVTEQFSAATWSNAVLEAAPEAMLIVDQMGSIVFTNTR
CQILFGYDANSMLGLQVESLLPEAMRSNHARDRLQFLREGRDRPMANARHVRALKADGVE
FVAEIALSILPADHEGRRQVAASIRDMTQKLAVEQKIRDSELRFRGLVTNIPGAVYRTRI
GDVWVMEYVSDNIADITGFAASQFIENRQRTFASLILEEDRELCHQHIDRALAQQETFEV
EYRIRHRDGSIRWVHEKGKASYTEEGFPLWFDGSIDDITKSKLAIVELEASRLQLTNITE
SIPCTVYQLRWVSPTERAFTFLSGAAYHMLGLHRDDLLKDFNIIAERIFDEERPEVVRAL
AGKSDDQLQWIREFRYRHPNGSIRWIEAGASGHSADDGAIIWNGYVMDVTQRKSIEEELA
VSEAHFKALFDGATIGIVNVDSKGLILDCNDQFCEDMGLSREALRNTPIFEVLCQQDKEV
AKAQFKDLVEGKIDHYRGERSFVRPSGEPLWMTVNVSALLDSQKQFESAVVSMVDMTELK
LLSDELLVAKEEADAASKAKGDFLANMSHEIRTPMNAIIGMSQLCLQTDLDKKQKNYLEK
IERASQSLLSIINDILDFSKIEAGKLDIENVSFQLDTMLEDLSDMFSERAAQKQIELLFA
VAPNVPRHLLGDPLRLGQVLINLMNNAIKFTERGEVLLSLNLVEQQNDDVVLRFSVRDSG
IGLTKEQQAKLFKSFTQADTSTTRKYGGTGLGLAICKQLVELMGGTIGVESQLGHGSTFF
FTVKLQISSDQKLVVGQELEGMSVLVADDNATARDIMRTTLESMGFKVDTVRSGEEAITR
CTQQEYAVALIDWKMPNLDGIETAKQIKQLAQKTPRILMVSAHANQDFLTQIEQLELAGY
ISKPISASRLLDGIMNSLGRAGILPVRRHSERIDPKLLLPLKGKRILLVEDNEMNLEVAT
EFLEQVGIILSIATNGQIALDKLAQQSFDLVLMDCQMPVMDGYQATMALRQKPELANLPV
IAMTANAMAGDKEMCLRAGMNDHIAKPIEVNLLYETLLKYLGGKVPLDDGTEPTESSELS
PKSINLDAELVVKWPEHPELDIDRGLQLVQNSTRLYQRIFDRFVTSQRNVVEQITKALAN
NKRDDAVRMAHTLKGLAGNLSSTKLAELARQLEQHLSEHSESQLELEQIQMLVASICEAI
EQVSPQSTETVTPTSEPLSPEALLQALKRLRQSLDDADSDAVTQIDALKPQVSNKLWQQL
SPALTMINQYQFDEAMDLIDEVITALT
NT seq 5304 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggacagaagtaaactccgtacttttcgcagcaaaattctatcccatattgcgctgcct
ttaattcttatcatgacggccgtttacggcattaatgcttggtttaattatctttctgcc
gagcgaaagctatacgattccttagcccaggagtccaatcattccgcctatcgcctacag
ttgctactcgaacatgcgcaggcgaatacgcaaggtgttgccgattttattgggtttatc
tccaataaggagggcattaatgatagtgagaaaatcaaacgggtactcactaatcgcatc
gaacgcaatcccgatttttatggctcagccgttgcgtttaaaccctataccttccccgat
aaaaaactcttttccccctatgtttaccgcgatggcaacaacttccattacctagatatt
ggcgccgagggttatgactataccgatggctcctgggattggtggtcaaaggccattaat
caacccggaggctattggtctaaggcttattttgatgagggcgcaggaaacactttgatg
gtgacttattcggtgccttttggccctgaaaatgattactttggggtggcgaccgtcgat
ttggcgctcgataaattgcctgaacaacttggtgtgcagccaagccaattagtggtactc
gatgatcaagggcggctgattttccacagcgataaagagaaagtgctcgccgtgacttcc
gccgaatggctcgatagaaatactcgtcgaaacagtgacttttggacattattagacaag
gggctaaacggacaagcgcgctttatcgatgataagagcacagtgtatctcgccagtgtt
gcctcagtcgctaagctcaaatggcgcgtcattgtgatggtgcctgagcagcagttattt
acgacgttgctggatgatgtggcatctgtggtgctcaaccttagtttattaaccctattg
ttattactcacttgctacatcgccgctaaacgtttgactcggccacttgaggcgctggag
tcgggcattttggccttcggtcagggtaaagcccagcaattagcgatccctaaaggcgcg
gtgagtgagatagttaccttaagcagcacctttaaccagatggcggaactcctcgccgag
cgtgagcaggcgattttagattcccgcggtaaccgtttcgcccggctgatcgatggcatg
agtgataagtccttctattgctcgctcgacccttcagggcagttggcgcaggtgagtgag
ggcgtcactaaggtcttgggcatatcaccggagctactcaagcgtaagtatcaaagactg
tttactgccaatccgttaaatgaaaaaaattgggaatacacggatttagcgctgaaggga
cagaatgttccttcccatcaagtcgagctgctcgacgcgagtggccacccacgtatgctc
gacctctttatgcagcccttggtttcggatacgggcgagctgatgtcggtggagatgtta
ttcaccgatgtgaccgaacagttttctgctgctacttggtctaatgccgtactcgaagcg
gcgccagaggccatgctgatcgtcgatcagatgggctcgattgtgttcactaatacccgc
tgccaaattctctttggttacgatgccaacagcatgttggggctgcaggtggagtcactc
ttgcctgaagccatgcgcagcaaccatgcccgcgaccgcctgcaatttttgcgtgaaggc
cgcgatcgccccatggccaatgcgcgccatgttagggcgcttaaagccgatggcgtggag
tttgtcgccgaaatcgccctgagtattttacctgccgatcatgaaggtcgaagacaagtg
gcggcatcgattcgggatatgacccagaagttagccgtagagcaaaaaatccgtgacagt
gaactaaggttccgtggcctagtgaccaatattcctggcgccgtctatcgtacgcgcatc
ggcgatgtctgggtgatggaatatgttagtgacaacattgccgatattacgggttttgcg
gcgagccagtttattgaaaaccgtcaacgcacctttgcctcgctgatcttggaagaagat
cgtgagctatgccatcagcatatcgatagagcactcgcacagcaggaaacctttgaggtg
gaatatcgcattcgtcaccgtgacggtagcattcgttgggtgcatgaaaagggcaaggca
agttacaccgaagagggatttcccctgtggtttgacggcagtattgatgatatcaccaag
agtaaattagccatcgtcgagcttgaagcctcaaggctgcaattaaccaatatcaccgag
tctattccttgtactgtgtatcaattacgttgggtttcgccaacagagcgagcctttacg
ttcctttctggcgcggcgtatcacatgcttggcctgcatcgggatgatttactgaaagac
tttaatattattgctgagcgaatttttgatgaagagcgcccagaggtggtgcgcgcctta
gcaggtaagagtgatgaccagcttcaatggatacgcgagttccgttatcgccaccctaat
ggcagtattcgttggatagaagccggtgccagtggccacagtgctgatgatggcgccatt
atctggaacggttatgtcatggatgttactcaacgtaagtccattgaagaagaactcgca
gtcagtgaggctcattttaaagcattatttgatggcgcaacgattggtatcgtcaatgtc
gatagtaaagggcttatcctcgattgtaacgaccaattctgtgaagatatggggttaagc
cgcgaggcactccgtaacacgccaatcttcgaagtgctctgccagcaggacaaagaagtt
gctaaagcacaatttaaagacttagtcgaaggcaaaattgaccattaccgaggcgagaga
agttttgttcgtccctctggagaaccgttatggatgacggtaaacgtttcagccttatta
gacagccaaaaacagtttgagtctgccgtcgtcagcatggttgatatgactgagctaaaa
ctactttcggatgagttgctggtcgctaaagaagaggccgatgcggctagtaaagccaaa
ggggatttcttggcgaatatgtcccacgaaatccgcacgccaatgaatgccattatcggt
atgtcgcaactttgcttacagacagatctagacaaaaaacagaaaaattatctcgaaaaa
attgagcgggcgtcccaatctttattatcaatcattaacgatatccttgatttttctaag
attgaagcaggcaaactcgatatcgaaaatgtgtctttccaactcgataccatgcttgaa
gatttgagcgatatgttctccgaaagggcggcgcaaaagcagattgaattgctatttgct
gttgcgcctaatgttccgcgtcatttgcttggtgatccgctgagactggggcaagtgctg
attaacctaatgaataatgcaataaaatttaccgagcgaggggaagtattactatcactc
aacttagtcgagcagcaaaatgatgatgttgtcctgcgttttagtgtacgcgatagcgga
attggcctcactaaagagcaacaagccaaactgtttaaatcttttacccaagccgatact
tccacaacccgcaaatatggcggcaccggcctggggctcgcgatttgtaagcaacttgtc
gagctgatgggcggcactatcggcgtcgaaagccagttaggccatggcagtactttcttt
tttaccgtgaaattgcagatctccagtgatcaaaaattagttgttggtcaggagcttgag
ggcatgtcggtgttagttgccgatgataatgctactgcccgtgacattatgcggacgacc
ttggagagtatgggctttaaggtggatacagtgcgctcaggcgaagaagcgataacacgt
tgtacccagcaagaatatgccgtggcattaattgactggaaaatgccaaaccttgatggg
attgaaactgcaaaacagatcaaacaattggcacagaagaccccgcggattttaatggtc
tcagcccacgccaaccaagacttcttaacccagatcgaacaattagaattagctggttat
atcagcaagcctatcagtgcatcaagattactggatggcattatgaactcccttggtcgt
gcgggtattctccctgtgaggcggcatagtgagcgcatcgaccctaaattgttattgccg
cttaagggtaaacgtatcctcttggttgaagacaatgagatgaaccttgaggtagcgacc
gagtttctcgagcaggtgggaattatcttatctattgctactaacggtcagatagcattg
gataaattggcgcagcaaagctttgatcttgtgttgatggattgccaaatgccagtgatg
gatggttatcaagcaaccatggcgctaagacaaaaacctgaacttgctaacttacccgtt
attgccatgacggcaaatgccatggcaggcgataaggaaatgtgtttaagagcaggaatg
aacgaccatatcgctaagccgatagaggtaaatctactgtatgaaacgctgctgaaatac
ttaggtggcaaagtgccactggacgatggcaccgaacctactgaaagctcagagctttct
ccaaaatcaatcaacctagatgctgagcttgtcgtgaaatggccagaacacccagagctt
gatatcgatagaggtttgcagctagtgcaaaactctacccgtctgtaccaaagaattttc
gatcgttttgtgaccagccaacgtaatgtagtagaacagatcactaaagctctggcgaac
aacaagcgtgatgatgcagtacgaatggcgcataccttaaagggcctggctggcaattta
agctcaaccaagctagcggagttagcacggcaattagagcagcatttaagtgaacatagc
gagtctcagttagagttagaacaaattcaaatgctcgtagcatcaatctgtgaagcgatt
gaacaagtatcaccacagtctacagaaacagtcacaccaacgagtgagccattgtcacca
gaagcgctattgcaagcactaaagcggctacggcaaagcttggatgatgctgattctgat
gcggtaacacaaattgatgcgttaaaaccgcaggtgagtaacaagttatggcaacagcta
agtcctgcgctgactatgattaaccaataccagtttgatgaagccatggatttaatcgac
gaagtcatcacagcgttaacctag

DBGET integrated database retrieval system