Spiroplasma diminutum: SDIMI_v3c00890
Help
Entry
SDIMI_v3c00890 CDS
T02741
Name
(GenBank) ribose/galactose ABC transporter permease
KO
K23535
general nucleoside transport system permease protein
Organism
sdi
Spiroplasma diminutum
Pathway
sdi02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sdi00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
SDIMI_v3c00890
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sdi02000
]
SDIMI_v3c00890
Transporters [BR:
sdi02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
Saccharide, polyol, and lipid transporters
General nucleoside transporter
SDIMI_v3c00890
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
BPD_transp_2
FliG_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
16853823
NCBI-ProteinID:
AGR41793
UniProt:
S5MDJ9
LinkDB
All DBs
Position
92902..94953
Genome browser
AA seq
683 aa
AA seq
DB search
MDFKLNRWLRNQKLKNNIISERTVSKLNYFKASSIAIILGLLAGSIIVFSQGYNGFAFIF
ESFGYSMDNATINRTLNYFTVYIFMGLALALGFKVGIFNMGGSGQAIIGMVLAIALIGSK
AQADGVAFSEVDKNFVIVIFILFILGGALISMISGLLKVFFNIHEVVTTVMMNWIVWYGA
RWILIDTKFGWQSSSHQTGYLTPELNPEWLSIGGNNWILGLTLALISVFSVWLILSFTTF
GYKFKVVGKQPQAAMYAGIKNRQFIILTTALQGVFIGMGAIFYWFNVKKSMLIGTEVLPS
IGFDAIPIALVAFNNVIAIIPVAFIWASLNAGAERARGLSFQGLSTETTSLFFGLIIYSS
AIYILFLNFKPIEKIKKWLFEMKCYVYIDFKNDTKQEIKKLKYEKKLILKKEDILKLKSE
IEIIKNKIKKLKNDTRSVDEIKSEKIELFKLEQLLKSEIDNYLSIYNSQIKMKKQEINQY
YDEQKLIYLNNSYKGIKRRVNKDFAEKYYGIMDQFVSLQIEQSELVEGIKKKIKNVNKNE
NIVKILNEIKENKNTLKKFSKNESAETSLIKGKIIDLKNNFKSIRNAEIKELKLKIENIK
NSYNQNAKKVLDEFILYKEEKTKKMNSAQQEAKTYLEQINEKYKIEFINLKENNSKHDYK
NQKLKININKYNEELEVMNKYGI
NT seq
2052 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattttaaattaaatagatgattaagaaatcaaaaattaaagaacaacataattagc
gaaagaactgtttctaaattaaattattttaaagcatcttctatagcaataattcttggt
cttttagctggctcaataatagtatttagtcaaggatataatgggtttgcatttattttt
gaatcttttgggtactcaatggataatgcaactataaatagaactttaaattattttaca
gtttatatttttatgggacttgctttagcattaggttttaaagttggtatttttaatatg
ggtggatcaggacaagcaataattggaatggttttagctatagcattaattggttcaaaa
gcacaagctgatggtgttgcatttagtgaggttgataaaaacttcgtaatcgtaattttt
attttatttatacttggtggagcattgatttcaatgatttctgggttattaaaggtattt
tttaatattcatgaagttgttacaactgtgatgatgaactgaatagtttgatatggagct
agatgaatattaattgacactaaatttggatgacaaagttcttcacatcaaactggatat
ttaactccagagttaaatcctgaatgattatctattggtggaaataattgaatacttggt
ttaacattagcattgatttcagtgttttcagtttgacttatattatcatttactacattt
ggttacaaatttaaagttgttggtaaacagccacaagctgctatgtatgcgggtattaaa
aatagacaatttataatacttacaacagcattacaaggggtatttataggaatgggagct
attttttactgatttaatgttaaaaaaagtatgttaattggtactgaggtattaccttca
attggatttgatgctataccaattgctcttgtggcttttaataatgttatagcaataata
cctgtggcttttatttgagcatcattaaatgcaggtgcggaaagagctagaggattaagt
tttcaaggtctttctactgaaacaacaagtttattttttggattaataatatattcttca
gcaatctatatattatttctgaattttaaaccaattgaaaaaattaaaaagtgattattt
gaaatgaaatgttatgtatatattgattttaaaaatgatacaaaacaagaaataaaaaaa
ttaaaatatgaaaaaaaattaattcttaaaaaagaagatattttaaaattaaaatcagaa
atagaaattattaaaaataaaattaaaaaactaaaaaatgatactagatctgttgatgaa
attaaatctgaaaaaatcgaattgtttaaattagagcagttattaaaatcagaaatagat
aattatttatcaatttataattctcaaattaaaatgaaaaagcaagaaataaatcaatat
tatgatgagcaaaagttaatttatttaaataattcttataaaggaattaaaagaagggtt
aataaagattttgcagaaaaatattatggaattatggatcaatttgtgtcattacaaatt
gagcaatcagaattagttgagggtattaaaaagaaaattaaaaacgtaaataaaaatgaa
aatattgtaaaaatattaaatgaaattaaggaaaataaaaatactcttaaaaaatttagt
aaaaatgaaagtgcagagacatccttaattaaaggaaaaattattgatttaaaaaataat
tttaaatcaattagaaatgcagaaataaaagaattaaaattgaaaattgaaaatattaaa
aattcttataatcaaaatgctaaaaaagttttagatgaatttattttatataaagaagaa
aagacaaaaaaaatgaattcagctcaacaagaagcaaaaacttatttagaacaaattaat
gagaaatataaaattgaatttataaacttaaaggaaaataattcaaaacatgattacaaa
aatcagaaacttaaaattaatattaataaatacaatgaggaattggaggtaatgaataaa
tatggtatctag
DBGET
integrated database retrieval system
