Spiroplasma diminutum: SDIMI_v3c01410
Help
Entry
SDIMI_v3c01410 CDS
T02741
Name
(GenBank) superfamily I DNA/RNA helicase
Organism
sdi
Spiroplasma diminutum
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_12
AAA_11
AAA_19
AAA_30
Viral_helicase1
SLFN-g3_helicase
PhoH
ResIII
PIF1
NPHP3_N
DEAD
T2SSE
AAA_22
IstB_IS21
AAA_5
AAA
Mg_chelatase
AAA_7
UvrD_C_2
TsaE
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
16853931
NCBI-ProteinID:
AGR41845
UniProt:
S5MIT8
LinkDB
All DBs
Position
162165..166025
Genome browser
AA seq
1286 aa
AA seq
DB search
MSNIIENNGTKEIILDFSFLQNVQFKENPATLDQIIEQLDIKGVKTCQEFQNFLKNSLAK
KSFICLLDDKTHQFSKKDKSKTAYNGIIRMELDSKNQSLLPEGTYLGFYVNIDTKNAGLT
ISSIFMTRLKSAAQEFETIIKESHILIIRNQGQIKDDEIIRRNVLNSSNIGEIGRLLSTF
EEEKEKWLNFLEFSENLLKLERKKSLPYLGVSILKVIKIDKIHFNNHLIQLEVKELKSKT
FKYLFSNSENILRSNDIPFEFSNIITLDLLVDDLEKVNKIKKTKELSLVPIKMNKNIITT
HDLIKNIHDIFDFNFERTNDFKNVINLGTMLGTSDEEMNFQTYWIKNNKTIFLGENKELE
YLLKKNPNEMQEWKIKKMSFEIEQDFDQAIFNLQNNIDSLATGYIAYTGIGEDVLIERYK
QVIKKISDGNTKNPYLVNYLFNTRLVELSELSDDISIEDKDFEFNLNSEQKEAVRKAINT
KDIFILQGPPGTGKTQVICEIINQLSKLNRKILLSSQNHEAIKNVVDRLPIDPNLNKIRL
TNQINLKTQVSNNYSPDRVLYNYYKAIGKRAFDDMKNDESSIKEFQDYKNNLEQLINANK
SFHQNNSQIREIQDKINNLNEKIVSLKQNNLDKIKHKNYLKEELINIENLIEALNTKEFE
AIINVSDKLLDCYKQSIEFDLNNFVYTYLNFEPSDFSNIYLLIKEIANEIYFKNNIFLEI
KDSKNNVNKYKRTAEFELAEKEESKILGLEQLLKTDLKLNELNKIFDFFTLSLKNLKLEI
EIDLQKENENQYSDVELSTFEIHKNELTVTKNNLSENAGSNSKELRELIKIVNNKFNLNL
GLTDIDLEEQVKVELSNLENKLKNSKERKENFSEIYTQLITYLNNNYKITSNFEEELASK
DFSGQMFKDSQRYIQTILDNLVNVYSMTLTSTNLFKFNKDNFASKLGLEELNLRNMDVDV
VIIDEASKATILEILMPLIYGKSLILVGDYRQLPPILKLQPGDVDEVNKYFNKDYNYNLM
YELLDESAFKKLISAKNKSITSILKTQYRSHEQIMEIVNKFYDGYLKVEPQVSDQKRHDL
VITNANHKEIINSRSSVYWVDSTYNTNDEINYEQGEDFSTSLFNELEISLTKKLLEKIDK
EVLNKKSKLRPSVAIISFYGLHVNKLKREIKISKFKNIDITINTVDDFQGKEADYVLVNM
VRNPEKLSTKSGRDFLKKYERINVAFSRARELLIIIGAQRAVTDITVKIPTIEDPNVSNS
HQVYADIISKLDFENCLLEAKEIMEE
NT seq
3861 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaaatattattgaaaataatggaacaaaagaaataattttagatttctccttttta
caaaatgtacaatttaaagaaaatccagccactttagatcaaataatagagcaacttgat
attaaaggagttaaaacttgccaagaatttcaaaattttttaaaaaactcattagccaaa
aaatctttcatttgcttattggatgataaaacacatcaattttctaaaaaagataaaagc
aaaactgcttataatggaattataagaatggaattagattcaaagaatcaatcattatta
ccagaaggaacctatttaggattttatgtaaatattgatacaaaaaatgcgggacttaca
attagttcaatttttatgactagattaaaaagtgctgctcaggaatttgaaacaattatt
aaagaatcacatatattgataataagaaatcagggacaaataaaagatgatgaaataatt
agaaggaatgtattaaactcttctaatataggagaaattggtagactactttcaacattt
gaagaagaaaaagaaaaatgactcaattttttggaatttagtgagaatttattaaaattg
gaaagaaaaaaatctcttccttatcttggagtaagtatcttaaaagttatcaaaatagat
aaaattcattttaataatcatcttattcaattagaagtaaaagaattaaaatcaaaaact
tttaaatatctattttcaaattcagaaaacatattgagaagtaacgatataccatttgaa
ttttcaaatattataactttagatttattagttgatgatttagaaaaagtaaacaaaatt
aaaaaaacaaaggaattatctttagttccaataaaaatgaataaaaacattattacaact
catgatttaattaaaaatattcatgatatttttgattttaattttgaaagaacaaacgat
tttaaaaatgtaataaatcttggaacaatgcttggcacaagtgatgaagaaatgaatttt
caaacttattgaataaaaaataataaaactatttttttaggagaaaataaagaacttgaa
tatttattaaaaaagaatccaaatgagatgcaggaatgaaaaattaaaaaaatgagtttt
gaaattgaacaagattttgatcaagcaattttcaacttgcaaaataatattgattctctt
gcaactggatatattgcatatacaggaataggtgaagatgttctaattgaaagatataaa
caagttataaaaaaaatatcagatggtaatacaaaaaatccgtacttagtaaattattta
tttaatacaagacttgttgaactctctgaactctcagatgatatttcaattgaagataaa
gattttgaatttaatttaaattcagaacaaaaagaggcagttagaaaagctattaataca
aaagatatttttattttacaaggtccaccaggtactggtaagacacaagtaatttgtgaa
attattaatcaattatcaaaactgaatagaaaaattttattatcaagtcaaaatcacgaa
gctattaaaaatgttgttgatagattaccaatagatcctaatttaaataaaattagatta
acaaatcaaattaatttaaaaactcaagtttcaaataattattcacctgatagagtactt
tacaattattataaagcaattggtaaaagagcatttgatgatatgaaaaatgatgaaagt
tctatcaaagaattccaagattataaaaataatttagagcagcttattaatgctaataaa
agttttcatcaaaacaatagtcaaataagagaaattcaagataaaattaataatcttaat
gaaaaaattgtttcattaaaacaaaacaatctggataaaataaaacataaaaattattta
aaagaagaattaataaatattgaaaacttaattgaagcattaaacacaaaggaatttgaa
gcgattataaatgtatctgataaactattagattgctataaacaatctattgaatttgat
ttaaacaattttgtatatacatatttaaactttgaaccaagtgatttttcaaatatatat
cttttaattaaagaaattgctaatgaaatttattttaaaaataatatatttttagaaata
aaagactcaaaaaataatgtaaataaatataaaagaactgctgaatttgaattagcagaa
aaagaagaaagtaaaattttaggtttggagcaattactcaaaacagatttgaaattgaat
gaacttaataaaatttttgactttttcactttaagtttaaagaatttgaagttagaaatt
gaaattgatttacaaaaagaaaatgaaaatcaatattctgatgtagaactttcaactttt
gaaattcataaaaatgaattgactgttacaaaaaacaatttaagtgaaaatgctggatct
aattcaaaagaattaagagagcttataaaaattgtgaataataaatttaatttaaattta
ggattaactgatattgatttagaagaacaagtgaaagtagaattaagtaatcttgaaaat
aaattaaaaaatagtaaagaaagaaaagaaaacttttctgaaatatatactcaattaatt
acctatttgaataataattataagattacaagcaattttgaagaagaattagcatcaaaa
gatttttcaggacaaatgtttaaagatagtcaaagatatatccaaactattttagataat
ttagttaatgtctattctatgactttaacttctacaaatttatttaagtttaataaagat
aactttgcatcaaaattaggattagaagaattgaatcttagaaatatggatgtagatgta
gtaattattgacgaagcttcaaaagcaacaatacttgaaatcttgatgccactaatttat
ggaaaatctctaattcttgtgggggactatagacaacttccaccaattttaaaattacaa
cctggagatgttgatgaagtaaataaatattttaacaaagattataattataatttaatg
tatgaacttttagatgaatctgcatttaaaaaattaatttctgcaaaaaataaatccatt
acttctatattaaaaactcaatacagaagtcacgaacaaataatggaaatcgttaataaa
ttttatgatggttatttaaaagttgaaccacaagtaagtgatcaaaagagacatgatctt
gttattacaaatgctaatcataaagaaataattaactcaagaagttcagtctactgagta
gactcaacatataatacaaatgacgaaattaattatgagcaaggtgaagatttttcaact
agtttatttaatgaattagaaattagtttaacaaaaaaacttttagaaaaaattgacaaa
gaggttttaaataaaaaatcaaaactaagaccaagtgttgcaataataagtttttatgga
ttacatgttaataaattaaaaagagaaattaaaatcagtaaattcaaaaatatagatatt
acaataaatacagttgatgattttcaaggtaaagaagcagattacgtgctagttaatatg
gtgagaaatccagaaaaactttcaacaaaatcagggagagattttctaaaaaaatatgaa
agaataaatgttgctttttcaagagctagagaattattaataataattggtgctcaaaga
gctgttacagatataacagtaaaaataccaactattgaagatcctaatgtttcaaatagt
catcaagtatatgctgatataatttcaaaattagattttgagaattgtttattggaagca
aaagaaataatggaggaataa
DBGET
integrated database retrieval system
