Spiroplasma diminutum: SDIMI_v3c02740
Help
Entry
SDIMI_v3c02740 CDS
T02741
Name
(GenBank) ABC transporter ATP-binding protein/permease
KO
K06147
ATP-binding cassette, subfamily B, bacterial
Organism
sdi
Spiroplasma diminutum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sdi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sdi02000
]
SDIMI_v3c02740
Transporters [BR:
sdi02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
SDIMI_v3c02740
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
AAA_22
DEAD
Zeta_toxin
AAA_29
DUF87
AAA_16
AAA_23
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
16854643
NCBI-ProteinID:
AGR41978
UniProt:
S5ME27
LinkDB
All DBs
Position
300131..302047
Genome browser
AA seq
638 aa
AA seq
DB search
MSNEIKMDNTQEVNLKNDNKNTTPEFKTKRSGKAFLSIIFHYLKRHPIVGIFLVLLTLAS
SATSVLSPKIIQNIMTILMAPAAHKLGQDTMGAFQLSTGEWATSLFGFALTWQHWIYVQL
ILFACLAIFTFASNYIAGIMGKNIEIELRNKTLERLVKQDMSYYSDKKIGEILTKIVSDT
QIIGDQAQQIPVTMMGAAFTFFGALIMMFTINIYLTVVVIITMAIIVTSIFSTFGIVKKS
AFKTRDSITAINGDVTDRIATVRLIKASGTENYETERFKEIHKDYFKKSSSLIKLQSTVI
TVLVAGVSSIQMIIVIAAAIKWHNDPATLSIVLTSFISSVGTMVGPIMQVARLQAGLIQA
STSAVRIDEILSAKSKIDPHYNPEEGIHIDNIDKSIIFKDVEFRYPEKPEKVIIPEFSFT
FEHGKSYAFVGETGSGKSTIARLLLRFYDPYKGQVLINETNDLKDVNLASYLDKVGYVEQ
EPQILFGDVLDNIKYGRFNATDEEAIEAAKLAELHELVMTWPDGYKTILGERGFMLSGGQ
KQRLVIARMFLKDPQLLILDEATSALDNIVEKEIQAKLDSLMKGRTTVTIAHRLSTIKNV
DTIIVLAPEKGIAQVGTFNELKNKEGHFKKLYDAGLMG
NT seq
1917 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctaacgagatcaaaatggataatacacaagaagttaatctaaaaaatgataataaa
aatactacccctgaatttaaaacaaaaagaagtggaaaagcttttttatcaattattttt
cattacttaaaaagacacccaatagttgggatatttttagttttattaacattggcttca
tcagctacaagtgttttaagtcctaaaattatacaaaatattatgacaattttaatggcc
ccagcagcacataaattaggacaagatacaatgggagcatttcaattgtcaacaggtgaa
tgagcaacttcattatttggatttgctttaacatgacaacattgaatatatgttcaatta
attttatttgcttgtcttgcaatatttacgtttgcatcaaactatatagcaggaattatg
ggtaaaaatattgaaattgaattaagaaacaagactttagaaagacttgtaaaacaagat
atgagttattattcagataaaaaaattggagaaattttaactaaaatagtatctgatact
caaattattggagatcaagcacaacaaataccagtaacaatgatgggagcagcatttaca
ttctttggtgctctaataatgatgtttacaattaatatttatttaactgtagtggttata
ataacaatggcaataatagttacatcaattttttcaacatttggaattgttaaaaaatct
gcatttaaaacaagagattcaattacagcaataaatggagatgtaactgatagaattgca
actgtaagattaattaaagcttcaggaacagaaaattatgaaactgaaagatttaaagaa
attcataaagattactttaaaaaatcaagcagtttaattaaattacaatcaacagttatt
actgttttagtagctggagtaagttcaattcaaatgattattgtaattgcagcagcaatt
aaatgacataatgatccagccactttatcaatagttttaacatcattcatttcatctgtt
ggaacaatggttggaccaattatgcaagttgctagattacaagctggattaattcaagct
tctacttctgctgtaagaattgatgaaattctaagtgcaaaatcaaaaattgatcctcat
tataatccagaagaaggaattcatattgataacattgataaatcaattatttttaaagat
gttgaatttagatatcctgaaaaaccagaaaaagttattattccagaattttcatttaca
tttgaacatggaaaatcatatgcatttgttggtgaaacaggtagtggtaaatcaacaata
gcaagactattattaagattctatgatccttataaaggtcaagtattaataaatgaaaca
aatgatttgaaagatgtaaatttagcaagttatttagataaagtgggttatgttgaacaa
gaacctcaaattttatttggagatgttttagataatattaaatatggtagatttaatgca
acagatgaagaagcaattgaagctgcaaaattagcagaattacatgaattagttatgact
tgaccagatggatataaaacaattcttggtgaaagaggatttatgttatctggtggacaa
aaacaaagacttgttattgcaagaatgttcttaaaagaccctcaattgttaattttagat
gaagcaacaagtgctttagataatattgttgaaaaagaaattcaagcaaaattagattca
ttgatgaaaggtagaacaactgttactatcgctcatagattaagtacaattaaaaatgta
gatacaataattgtattggctcctgaaaaaggaattgctcaggtaggtacttttaatgaa
cttaaaaataaagaaggtcactttaaaaaactatatgatgcaggactaatgggataa
DBGET
integrated database retrieval system
