Spiroplasma diminutum: SDIMI_v3c05750
Help
Entry
SDIMI_v3c05750 CDS
T02741
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
sdi
Spiroplasma diminutum
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Big_2
Big_3_5
T2SS-T3SS_pil_N
Big_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
16854271
NCBI-ProteinID:
AGR42279
UniProt:
S5LWW7
LinkDB
All DBs
Position
complement(633626..636793)
Genome browser
AA seq
1055 aa
AA seq
DB search
MFFINIVDGMYCVINSYTSLIIAKFARLIDATSYIQTAQGINISPLEQNWRQFFNYQLPL
HYHNSCLCSSNNNNNNNNNNNNHTCGNSCLNNNNNNNNNHTCGNSCLNNNNHTCGNSCLN
NNNHTCGNSCLNNNNDNKYSNNNYEINNSIKNQIKELNKKISSVLEDKEEILEEINILKS
IVLKERGSLNKKVSLKKETRNYDDSKNESRITESNLNNKGENDSYDTFDDDQFEKEKVNK
ELLYLDKKETKVKKEIKKKNKRGLKIFLISALTISLLAGVGVGGYFAYTKLFANANPIKK
QENQVIILGSGINKINMSIKKFDNKLEVTTKSSDESIATVKVSDDDKTIIEINPIKEGTT
TITYTYGKYERQFDVIVKAPIIKEIEDQIVQAGNNIDLEVEIQNSLNEIWVTAESNQTDI
VTVVANNNKLQITGVKVGTAEITLKYRGASDLKFTVRVTESIPDPVIIAPSTQQVEEDKS
INVSITIQNTVEGIKLNAKPENSNIASVEVTEDNNITINGIKAGSTQITLQYAGAIDVNF
IVTVTEKIPDPIIRNPGSQSIEVDDTISVEIEVQNPIDNVQLEAASSDLTIATVSVADNI
VTISGIKIGTAEITLSYTGATSIKFNANVFINVPDPIINPVESKEVEVEDTLDVNITIQN
PVDGTVLQAVSKNPNIATVSVANNTVTITGVTAGTTEITLSYTGANDVEFSVTVNEKIPN
PVIESVGSKEVEVEDTLDVNVTIQHPVNGVELQAVSDNSNIATVSVANNTVTITGVEAGT
AEITLSYTGANDVKFSVSVTEKVPNPVIESIESKEVEVEDTLDVNVTIQHPVDGVELQAV
SNNSEIASISVTDNTVTITGVTAGIAEITLSYTGANDVKFSVTVNEKIPDPVIDIVEAKE
VQVGDTLDVNITIQNPVDGVELQAVSSDPEIATVNVNNYKISITGIKAGVSLITLKYAGA
NDINFIITVNPRPAPVIISPGDQQIRMETVEIEIKIENPVDGVELQAVSSDPEIASVSVN
NNILTITGNISRQSVQITLTYQGATNIKFRVWVTA
NT seq
3168 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttttttataaatatcgtagatggtatgtactgtgttattaattcatacactagttta
ataatagccaaatttgcacgcttaattgatgcaacttcatacattcagacagcacaagga
attaacatatcaccattagaacaaaactgaagacaattttttaattatcaattaccatta
cattatcataatagttgtttatgttcttcaaataataataataataataataataataat
aataatcatacatgtggaaactcatgtttaaataataataataataataataataatcat
acatgtggaaactcatgtttaaataataataatcatacatgtggaaactcatgtttaaat
aataataatcatacatgtggaaactcatgtttaaataataataatgataataaatattca
aacaataattatgaaattaataactctattaaaaatcaaataaaggaattgaacaaaaaa
atatcatcagtattagaagataaagaagaaatattagaagaaattaatattttaaaatca
attgttttaaaagaaagaggaagtttaaataaaaaagtttctttaaaaaaagaaactcga
aactatgacgatagcaaaaatgaatcaagaataactgaatcaaatttaaataataaaggt
gaaaatgattcatacgatacttttgatgatgatcaatttgaaaaagaaaaagtaaataag
gaacttctatatttagataaaaaggaaactaaagtaaaaaaagaaataaagaaaaaaaat
aaaagaggattaaaaatatttttaatttctgctcttacaatctcacttttagctggagtt
ggtgttggtggatattttgcatacactaaattatttgcaaatgcaaatccaattaaaaaa
caagaaaatcaagtaattatattaggttctggtattaataaaataaatatgtcaattaaa
aaatttgataataagttagaagtaactactaaatcaagtgatgaaagtatagcaactgta
aaagtatcagatgatgataaaactataattgaaattaaccctataaaagaggggacaaca
actattacttatacttatggtaaatatgaaagacaatttgatgttattgttaaagcacca
ataataaaagaaattgaagatcaaatagttcaagctggcaataatattgatttagaagtt
gaaattcaaaattcattaaatgaaatttgagtaacagcagaatcaaatcaaacagatatt
gtaacagtggttgcaaataataataaattacaaattacaggagttaaagtaggaactgct
gaaataactttaaagtatagaggagcatctgatcttaaatttacagttagagttacagaa
tcaataccagatcctgtaattattgcgccaagcactcaacaagtagaagaagataaatca
attaatgtaagtattacaatccaaaatacagttgaaggtataaaattaaatgcaaaacca
gaaaattcaaatattgctagtgttgaagttacagaagataataatataactataaatgga
attaaagcaggaagtactcaaattactttacaatatgctggagcaattgatgttaatttt
attgttactgttactgaaaaaataccagatcctataataagaaatcctggatctcaaagt
atagaagttgatgatactattagtgtagaaattgaagttcaaaatccaattgataatgtt
caactagaagcagcatcaagtgatttaactatagctacagttagtgttgctgataatata
gtaactatttctggaattaaaataggaactgctgaaataactttaagttatactggagca
acaagtattaaatttaacgcaaatgtttttattaatgttcctgaccctataattaatcca
gttgaatctaaagaagttgaagttgaagacactttagatgtaaatattacaattcaaaat
ccagtagatggtactgtgttacaagcagtgtcaaagaatccaaatatagctacagttagt
gttgctaataatacagtaactataactggagttactgcaggaactactgaaataacttta
agttacacaggggcaaatgatgttgaattctctgttactgttaatgaaaaaataccaaat
cctgttattgaatcagttggatctaaagaagttgaagttgaagacactttagatgtaaat
gttacaattcaacacccagtaaatggtgttgaattacaagcagtatcagacaattcaaat
atagctacagttagtgttgctaataatacagtaactataactggagttgaagcaggaact
gccgaaataactttaagttacacaggggcaaatgatgttaaattctctgttagtgttact
gaaaaagtaccaaatcctgttattgaatcaattgaatctaaagaagttgaagttgaagac
actttagatgtaaatgttacaattcaacacccagtagatggtgttgaattacaagcagta
tcaaacaattcagagatagcttctataagtgttactgataatacagtaactataactgga
gttacagcgggaattgctgaaataactttaagttacacaggggcaaatgatgttaaattc
tctgttactgttaatgaaaaaataccagaccctgttattgacatagttgaagctaaagaa
gttcaagttggagatactttagatgtaaacattacaattcaaaacccagtagatggtgtt
gaattacaagcagtatcatcagatccagaaatagctacagttaatgttaacaattataaa
attagcataactggaattaaagcaggagtttctttaattactttaaaatatgctggagca
aatgatattaattttattattactgttaatccaagaccagctcctgtaataatttctcct
ggtgatcaacaaattagaatggaaactgttgaaatagaaattaagatagaaaacccagta
gatggtgttgaattacaagcagtatcatcagatccagaaatagcttcagttagtgttaat
aataatatactaacgataacgggtaatatttctagacaaagtgtccaaattactttgact
tatcaaggagcaactaatataaaatttagagtatgagttacagcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
