Spiroplasma diminutum: SDIMI_v3c08540
Help
Entry
SDIMI_v3c08540 CDS
T02741
Symbol
trmE
Name
(GenBank) tRNA modification GTPase TrmE
KO
K03650
tRNA modification GTPase [EC:3.6.-.-]
Organism
sdi
Spiroplasma diminutum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sdi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
sdi03016
]
SDIMI_v3c08540 (trmE)
Transfer RNA biogenesis [BR:
sdi03016
]
Eukaryotic type
tRNA modification factors
Other tRNA modification factors
SDIMI_v3c08540 (trmE)
Prokaryotic type
Methyltransferases
SDIMI_v3c08540 (trmE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MnmE_helical
TrmE_N
MMR_HSR1
FeoB_N
Dynamin_N
RsgA_GTPase
AIG1
Roc
Ras
AAA_29
AAA_24
FtsK_SpoIIIE
ABC_tran
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
16854079
NCBI-ProteinID:
AGR42558
UniProt:
S5MFI3
LinkDB
All DBs
Position
complement(941388..942740)
Genome browser
AA seq
450 aa
AA seq
DB search
MKINLNDTIVACSTKIARQAISIIRLSGEQALEITNKIISKKLENNNKMQIRKIYDGNDI
IDESLILTFVNGKSFTGENIVEIHCHGGILLTKKIISLLISYGARPALPGEFSQRAYLNG
KINLIQAESINNLIDSKNELALKISAMNLEGKNNRALQEMKIKLIDIISKIQTSIDYPDY
DDVEGSSAEEIKTDLQILKNDTLKILEVSKRFNILNHGINTLILGETNVGKSSLLNSLIS
EEKAIVTDFEGTTRDIVEGQLNFDNFTLNLIDTAGIRNTNDKVEQIGIEKSISLIESSNL
ILFVINKSKINYELYEKIKNKKHIVVLNKAELLNMNEIEDIKGKFNNIVAVSALNSDIKN
LIQWIENEFDNGDLLEIEVPILSNSFHIEMFKNILKLLSNSEENINQGFTTDLINVDLYE
ILKIINNLLGIYDADEEVIDNIFRKYCLGK
NT seq
1353 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaataaacttaaatgacacaattgttgcttgttcaacaaaaattgcaagacaagca
atatcaataataagattatctggagaacaagcattagaaataactaataaaattatttct
aaaaaattggaaaataataataaaatgcaaataagaaaaatttatgatggtaatgatatt
attgacgagtctttaatattaacttttgtaaatggtaaatcgtttacaggagaaaacatt
gttgaaattcactgtcatggaggaattttattaactaaaaaaataatttctttactaatt
tcatatggtgcaagaccagcactcccaggagagttttcccaaagagcgtatttaaatgga
aagataaatttaattcaagccgaatcaataaataatttaattgattcaaaaaatgaatta
gcacttaaaattagtgcaatgaatctagaaggaaaaaataatagagcattgcaagaaatg
aaaataaaactaattgatattatttcaaaaattcaaacctcaattgattatccagattat
gatgatgttgaaggatcaagtgctgaagaaattaaaacagatttacaaattttaaaaaat
gatactttaaaaattcttgaggttagtaaaagatttaatattttaaatcatgggattaat
acattaattttaggggaaacaaatgttggtaaatcttcattattaaattctctaatttct
gaagaaaaagctatagtaacagattttgaaggaactacaagagatatagtagaaggacaa
ttaaattttgataactttactttaaatttaattgatactgcaggaattagaaatactaat
gataaggttgaacaaattggtattgaaaagagtatatctctaattgaaagttcaaatctt
attttatttgtaataaataagagtaaaattaattatgaattatatgaaaaaataaaaaat
aaaaaacatatagttgttttaaataaagcagagttattaaatatgaatgaaatcgaagat
attaaaggaaaatttaataatattgttgctgtttctgcactaaattcagatataaaaaat
cttattcaatgaatagagaatgaatttgataatggtgatcttttagagattgaggttcct
atattatcaaactcatttcatattgaaatgtttaaaaacattttaaaattattaagtaat
tctgaggaaaatataaatcaaggttttacaacagatttaataaatgttgatttatatgaa
atattaaaaataataaataatttattaggaatttatgatgcagatgaagaagttattgac
aatatatttagaaaatattgcttaggaaagtag
DBGET
integrated database retrieval system
