KEGG   Shewanella dokdonensis: KHX94_17630
Entry
KHX94_17630       CDS       T07469                                 
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
  KO
K02014  iron complex outermembrane recepter protein
Organism
sdk  Shewanella dokdonensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:sdk00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:sdk02000]
    KHX94_17630
Transporters [BR:sdk02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   KHX94_17630
SSDB
Motif
Pfam: TonB_dep_Rec_b-barrel Plug
Other DBs
NCBI-ProteinID: QVK22955
UniProt: A0ABX8DEZ1
LinkDB
Position
3673283..3675886
AA seq 867 aa
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NT seq 2604 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
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DBGET integrated database retrieval system