Stegodyphus dumicola: 118189594
Help
Entry
118189594 CDS
T07385
Name
(RefSeq) fibrillin-1-like
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
sdm
Stegodyphus dumicola
Pathway
sdm04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sdm00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
118189594
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
sdm00536
]
118189594
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
sdm00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
118189594
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
TB
EGF
hEGF
EGF_3
FXa_inhibition
Plasmod_Pvs28
EGF_MSP1_1
MAAL_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
118189594
NCBI-ProteinID:
XP_035216115
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1709 aa
AA seq
DB search
MYLYRLLMHVIPILTALRHVTADETARAVSSAGPNVCGRGPRSHCCPGWTNRPGISSLCI
VPICRSSCGDGRCIRPNTCYCGNRQFAPTCGGGGITPGGGGGVPDTGPGSQQQLGLCQEP
CLNGGRCIGPDRCACVYGFTGRRCERDYRTGPCFRKVKNQFCAGQLTGVVCTRQLCCATV
GVAWGHPCEQCPSQLDCERGLITNIQSKSCHDVDECEAIPGICEKGKCVNSIGSFRCECD
HGYLYNEDVSACEDVNECEKNPDLCTHGRCVNTEGSFNCLCDYGYVPSQSQQACLDTRQG
NCYVDVMGGQCRNPLAVRLSKVECCCGENMGKGWGEQPCETCPLPGSKAHSQLCTAGNLT
INECDLRRDLCENGRCIDTPSSYRCDCNRGYRGQNNDKKCVDIDECQNATICQNGRCMNT
IGSFFCMCPPGYDLTSDGSRCTNQDECSITGMCANGVCVNVDGSFICRCNPGFQLSQTRQ
SCIDVDECQENGRICLRGRCENQPGSYSCHCQDGFILSPEGDFCLDRNECEEKGMCRNGM
CVNADGSFKCICGPGYQLSRDGHFCIDVNECTETPDSCVNGRCENTDGSFRCTCFDGFTM
GPNGRICQDTRRDYCFSNYKNGECSNPSSMIVTKSACCCANRGTMTPAWGTPCIQCPPLG
SQEFHRLCPKGPGSGQDDDINECIVFPNICPNGACENLKGSYRCVCNDGYQIDGTGKICS
DINECAVNLLYCENGQCRNTPGSFQCTCPTGTRHNVLTNICEDIDECKERGSEICIGGTC
FNTQGSYQCECEPGSALDASRNICIDNRRGSCWMTVREGRCENNIKFPMLKSECCGSVGK
AWGSPCQLCSEIESRCPKGFAMLDGSTCTDVNECEIFPDICQGGGLCVNAEGSYRCNCPP
GWTLDTTGTKCYDLREEICFMQYDKGRCLRPFDGLYRKMLCCCSLGRAWGHSCEPCPRQG
TEAFNELCVKGFGFAYDGRGRAEPGLITDINECVQFPSICQNGRCRNAIGTFTCNCNPGF
APDADGLNCTDINECAITHDICANGTCRNIPGSFRCDCNDGYEDVMMMQMCIDINECTRI
RGLCRGGSCLNTPGSFRCDCPPGHELTPDGRACKDVDECSRTSGICSNGVCENMMGSYQC
TCNDGYKQTSQHTSCEDIDECADRKGGCMTKCVNVAGSFRCDCDDGYKLMPDGTTCEDID
ECRDIPDICSGGKCTNYAGSHSCHCTGGLMPSPDGKSCTDIDECALNPNVCLNGRCVNNL
GSYICHCDFGYSVKDHEQGCTDDNECETGLSDCDEHADCINTLGSYQCNCLEGFKGDGFV
CRDVNECLRDNGGCHPDAACINTIGSFMCSCDEGYSGDGFTCRDMDECSLNPTLCENGQC
LNYPGGYKCECDLGFGPDNSATTCVDVDECAMFQNYCAFGRCENIFGMFRCICDPGFELD
STGGNCTDTNECENPQICQYGTCVNTPGSFTCECPPNYTLSPTVADCVDIREGQCFLDVT
RVFHGRGICSTEIGERLTKATCCCSVGKGWGPTCEVCPVFNSTEYQNLCPGGRGYSPNKI
TVKIGDIDECQELNGICKGGRCSNTFGSFMCMCPDGYTLDDTHRNCVDSDECSIWSDICG
AGTCMNTIGSYTCSCPSGYALVPGGTCVDMRKSNCFRQAYNTSTIPPRLVCEHPMMSNET
RMICCCSVGRAWGDPCEPCPIQNSGRFLV
NT seq
5130 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtatctctaccgcctgttgatgcacgtgatccccatcctcacggccctgcggcacgtg
acggcagatgagacggcaagggcagtgtccagtgcaggccctaatgtatgtgggagagga
ccgagaagtcactgttgcccgggttggacaaatagaccaggaatcagttcactttgcatt
gttcccatttgtcgttcatcctgcggtgatggccgttgcatccgacccaatacttgctac
tgtggaaacagacaatttgccccaacttgcggaggtggaggtatcacaccaggaggagga
ggtggagtacctgatactggacctggcagtcagcaacagctaggtttatgccaggaacct
tgtctcaatggcgggcgttgcattgggcctgatcgttgtgcctgtgtgtatggcttcacc
ggcaggcgatgtgaaagagattatcgtaccggcccatgttttaggaaggtaaagaatcag
ttctgtgctggtcaattaactggagtcgtatgcactagacaactgtgctgtgcaactgtg
ggagttgcttggggacatccatgtgagcagtgcccctcccaactggattgtgaaagaggc
ttaattactaacatacaatccaaatcctgccatgatgtggacgaatgcgaagccatccct
ggaatatgcgaaaaaggaaagtgcgtcaattccatagggtctttccgatgcgaatgcgac
catggttacttatacaacgaagacgtcagcgcctgtgaagatgtaaacgaatgtgagaaa
aacccggatttgtgtacacatggaagatgcgtcaacacagaaggtagcttcaattgcctt
tgtgactacggatacgtaccatcgcagagccagcaagcatgtttagacactcgacaaggt
aattgctatgtcgacgtcatgggaggacaatgcaggaatcctctggctgtgcggctatcc
aaagtagaatgttgctgtggtgagaacatgggtaaaggatggggcgaacaaccttgtgag
acatgccccttacctggatcaaaggcacacagccagctctgcacagccggtaacttgaca
atcaacgaatgtgatctgagaagagatctttgcgaaaatggccgttgcatcgatacacca
tcttcttacagatgtgattgcaacaggggttacagaggccagaataatgacaaaaaatgt
gttgatatcgatgaatgccagaatgcaacaatatgtcaaaatgggcgctgcatgaacact
ataggaagtttcttctgcatgtgccctcctggttacgacttgacatctgatggaagtaga
tgtactaatcaagacgagtgttctataacgggcatgtgtgcgaatggcgtctgtgtcaac
gtcgatggctctttcatatgtcgatgcaaccctggttttcagttgtcccaaacgagacaa
tcctgcattgatgtcgacgaatgtcaagaaaatggacggatatgcttgagaggccgatgt
gaaaaccagcccgggagctacagttgccactgtcaagatggtttcatcttgtcaccagag
ggcgatttctgcttagacagaaatgaatgtgaagagaaaggtatgtgcagaaacggcatg
tgtgttaacgccgacggaagcttcaaatgtatatgcggtcctgggtaccagctgtcacga
gatggacacttttgcattgatgtcaatgaatgcaccgaaactccggattcatgcgttaat
ggcagatgtgaaaatacagacggaagtttcagatgtacgtgctttgacggatttactatg
ggacccaatggaagaatttgccaagatacacgtcgagattattgcttttcaaactacaag
aatggggaatgcagcaatccttcttccatgattgttacaaaatccgcttgttgttgtgct
aaccggggaacaatgacaccagcatggggcactccttgtatacaatgtccccctctagga
tctcaggaattccatcggctgtgcccaaagggcccaggcagtggacaggatgatgatatt
aatgaatgcattgtgtttccaaacatctgtccgaatggagcctgcgaaaatctaaaaggc
agttacagatgtgtatgcaatgatggataccaaattgatggaacaggaaaaatttgttct
gacatcaatgaatgtgcagtcaatctgttgtattgcgaaaatggccagtgccggaacact
ccaggtagttttcaatgtacctgtccaacaggcacaagacataatgtacttaccaatatt
tgtgaagatattgatgaatgcaaagaacgaggatcagaaatatgtatcggcggtacatgt
tttaacactcaaggaagctatcagtgtgaatgtgaaccaggttctgctttggatgcttca
agaaatatctgcattgataacagaagaggttcatgctggatgacagtcagagaagggcgt
tgtgaaaataacataaaattcccaatgctgaagtctgaatgttgcggatcagttggaaaa
gcatggggtagtccctgtcaactctgttcggaaatagagagccgatgtccaaaaggcttt
gctatgctagatggatctacctgcacagatgtgaatgaatgtgaaatcttccctgatatt
tgtcaaggtggaggactatgtgtgaatgctgaaggttcttacagatgcaactgtccacct
ggttggactttggacactacgggcacgaaatgctacgatttaagggaagaaatctgtttt
atgcagtacgacaagggtcgttgtctcagacctttcgatggcctttatagaaagatgctg
tgctgctgctcattaggccgtgcttggggtcattcttgtgaaccatgtccacgtcaagga
acagaggctttcaacgagctttgtgtgaaaggatttggatttgcttatgatggccgtggt
cgagctgaacctggacttataactgatatcaacgaatgtgtgcagtttccgtctatttgc
cagaatggaaggtgtagaaacgcaataggaacctttacttgcaactgcaatccaggattt
gctccagatgcggacggtttgaactgtactgatatcaacgagtgtgccataacacacgat
atttgtgccaacggtacttgcagaaatattcctggttctttccgctgtgattgcaacgac
ggatacgaggatgttatgatgatgcaaatgtgtatagatatcaatgaatgtactaggatc
agaggactgtgtcgaggtggatcgtgcctcaataccccaggctctttcagatgtgactgt
cctcctggccacgaactcactcctgatggaagagcttgcaaagatgtggatgaatgtagt
cgaacaagtggtatttgttcgaacggagtgtgtgaaaatatgatgggctcataccaatgt
acatgcaatgatggatacaaacaaacatctcagcacaccagttgtgaagatattgacgaa
tgtgccgatagaaaaggtggatgcatgaccaaatgtgtgaatgtggcaggaagctttcga
tgtgactgtgatgacggttacaaactgatgcctgatggaaccacttgtgaagatattgat
gaatgtagagatattcctgacatttgcagtggcggtaaatgcacaaattatgctggttct
cattcctgtcattgcaccggtggattgatgccatcaccagatggcaaatcttgcacagat
attgacgaatgtgctttaaatccaaatgtttgcctcaacggtcgctgtgtaaataacctt
ggatcgtacatctgccattgtgatttcggatattcagtcaaagatcatgagcaaggatgt
acagatgataatgaatgtgaaacaggactaagcgactgtgatgaacatgctgattgcatc
aatacgcttggatcttatcagtgcaattgtctggaaggattcaaaggagatggctttgtt
tgcagagatgtcaatgaatgcttgagggacaatggcggttgccatcctgatgctgcgtgc
atcaacaccattggatcttttatgtgttcatgcgatgaaggatattcaggagatggattc
acttgtcgagatatggatgaatgcagtttgaacccaactctatgtgaaaacggccaatgt
ctgaattaccctggagggtacaaatgcgagtgtgatttgggttttggcccagacaacagt
gcaacaacatgcgtggacgtcgatgaatgcgccatgtttcagaactattgtgcttttgga
agatgcgaaaacattttcggaatgtttcgatgcatctgtgatcctggttttgaactagac
tctaccggagggaactgtacagataccaatgaatgcgaaaatcctcagatttgtcagtat
ggaacatgtgttaacactcctgggtccttcacttgcgagtgtcccccaaattatacacta
tctccaactgtcgcagattgtgtggatatcagggaaggacaatgttttctcgatgtaacc
cgtgttttccatggtcgcgggatctgcagcacagaaattggagaaaggcttacgaaagct
acttgttgttgctctgttggtaaaggatggggtcccacttgtgaagtttgtccagttttt
aattcaacggaatatcaaaatctgtgtcctggaggaagaggatatagccctaataaaatc
accgttaaaataggagacattgatgaatgccaagagcttaatggtatctgcaaaggcgga
agatgctcgaatacatttggaagtttcatgtgcatgtgtcccgatggctatacattagat
gatacccacagaaattgcgttgattctgatgagtgttctatatggtctgacatctgtgga
gctggaacttgcatgaacacaataggaagttatacttgctcttgtccatcgggttatgct
ttagtacctggaggaacgtgtgttgatatgcggaaatcaaactgcttccggcaagcttac
aatacttcaacgattccaccccgcctggtatgtgaacatccaatgatgtcaaatgaaact
cgtatgatttgttgctgctcagtcggccgtgcttggggagatccatgtgaaccttgtccg
attcaaaactcaggtaggttcctagtttaa
DBGET
integrated database retrieval system