Stegodyphus dumicola: 118194234
Help
Entry
118194234 CDS
T07385
Name
(RefSeq) spatacsin-like isoform X1
KO
K19026
spatacsin
Organism
sdm
Stegodyphus dumicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sdm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
sdm03400
]
118194234
DNA repair and recombination proteins [BR:
sdm03400
]
Eukaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
Other HR factors
118194234
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Spatacsin_C
EME1-MUS81_C
DUF8004
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
118194234
NCBI-ProteinID:
XP_035221339
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2379 aa
AA seq
DB search
MALEILLIKELSYKFENVQSVTTTSDSKLLAIHDTNLNLSITLINTHCNHLQIHKVKSFA
WQEDNYNENEYRFFIVDIQNNIYYYAVTVTCTENCISSLTKSFSSIWNLENIFSYFQELK
KCLADLSSVEILKFEAREAVFLFNKRTVVSFFPSTDGDPQIMSISDLSESSLSHRKVLLM
KEMLFALNDSGTKLSVYSFSTNAKIFEYQFSDNTFKFTENEIVQNFTVNLRLDTLIFVTE
NQQVYSMPLDLSSQTLENSTSQTSSGITAFTKQFPSVRRLDDGLRRFSAFYGSIQPVTFT
CDTKDLVLKDFVILENKLFFIYHGVHDFLVGIHILCADEPTVCKSLSHPPYLITSGCEEV
PYPVLLLTENKISLLLYDIEQDKLVNELMIYPSDGVVEELALLNNWSNIHMDIEVLKLGL
SNRQLYTVEFFLKTLFEGFCQQWNAPLSPKWYEKMQKECNIWDTVLNLVSENVCKNLTES
LSCQYAEQLLYVTINMVIQILSVIEQKNADDRTFLKKDKDVLLSKFSGFILNMRKLLREQ
DSSSTDISENESENSTEQCFSCDILKLWTDWKERPNDEIIKESLLNGTIPLAQAYFSCCC
KNDFKSSYQEFEKNCDCFVIDYLRQGQIPEALITMSNMGIDINIKLKDIFKRTPEKDIRM
AILKELHMRDLLSNSDSNSLQFILLLEKLYPCTSFDHARVLLDEKQSFYDSDVCCVAPES
DATLTVGDFIDFTEDNSENGAYCRIVMNWLSTWDDDVKRRILASHFLKNSPVLDFFMKEE
NSNIVLNPLSVWYYLLENGILPYLMNWIDTWLGKYPQTSESSLFNKWPLNAEMINAVSRK
ATFHVSETILNELARHGVFCEEELEDISLFLARIGKAQCNINDIMLFTSEKAAISFSDLC
HRLAHYCLKHNLVSFLYSFVSHNYSKFSSWPSCQSCDVPLLYLTKAFFLWSQDHENVLLA
YDAIVGTAQYLFNLENPSNTELLMKVPLSLSLAVLLFKSQPLNEVMNDILKRPCAPASYL
KEKFQSYPLLCKYLFKTPEERFHPDVTVYELLKGSIIFDTCQLFGWQSANSLKSEDAQTE
LPHFSLKSLSEQYGLKKDLTYLYYLMEGRPNYAYLKFIAQEVVLETGLSISRVRSTCKDV
MDYALLNYRSADICAASISFIELLGQDSLPLRCCLNAANILHENQAFNEEANEKSFPEIG
WKFKQAFVNKDSAANLITEIENIFLKKWNPYSTEPRAVFKDTVLWMPVMTLSHLYEVEAG
NSYLNECAKQNNWFKFLVFSQIFQIPKEQVLKAVSRFSNSCISYHISHALNRRSALLYDV
AYKTKSSTVLKSEERDMRKSLYSRIGVKQGTSPVELKKTPEQDEDKSSIATEETSSSSSD
VDLRSFVLKDLFSQLLLAHSSDTPWEYLLHTSFEIKNPALAILAASYHDSPLESCFFMWL
YTNLHRNERVKKELDTAFSQIRVTNCSADDVKKLFVVAVQNHKILTLWQGVLFFLSSTPL
LPLMDFLRSFMVYKKFDASVELFQNHLWDYPQNRESLSELHSLLWIENTSVCILKEAVIA
CATNYQRLILLRHFSHTRLEKSFSKEVSVPQFMKVCQMIQCLGSIEDFDVKSFLLPENDV
NYKHSCWETLKKLLENHLYDDARTFTTAAKLPVKEMILLQINHESEEARKSSQWNNLTHR
IDFWHHILDTLNQNAIPLEATIEFLDNQCEVSDIYGEKYFLIYSMVNILSDANKHSSLPD
ATVFDLEGLKRKMWWLCLKAEVNKQLLPEIFDVKPVHEFDALDLSFDTKSMFNVHSIENE
EERIAIQSIIGQFLRKKDVQNAFQLAKSFNYECQDLKIVKICLEIATSDIDLNAIDISSP
DCAPEVSSSRFIRSLLLWINNGYSGITTAHKDKIKLMEKLSRKSIVSVAVCHQILVHYTV
SAVLIAKYWVIAKEKNHFKILKDILVKKLYDEHILAKCFIIVHDLADVDVARFLSEEIWH
SLKILCPLNITLLPENKSAFSENVIYDPLRVSEGFQLIVKLCQDPSVLGNLLMDIFSTYA
CELSSKSSDKDFSITVELCICAHECFTAACDVDGISKILHNSQMLVSLLEEAEKFATMVH
LLTGLGRYSEMMYVFDTLKSHDKLSLLFEKNMEDVPNLRLALLDYLKRCSPADSDSLFYA
VASGFGMYREKAEILEMSVQKQLSQLCKKNIDADLSDELENALQVLSEAAKSYCKADCLH
QAQHCTRLAQLIALQIHFLPSGIWIIGLDDSSISRFITQHDNFSQALIVAEEYRKHQLWA
QAVLHNVVLRGDREYLREFQAHFGLSASLISDVAKRFKKVPTKNDSALRNMKLLLSLCSN
IKVKYCLANDLSFGDMASELLMGEGSSYLQDLIANNIIK
NT seq
7140 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctttagaaattctcctgatcaaagaactttcatataagtttgaaaatgtccaatct
gttaccacaacttcggactcaaaattacttgccatacacgatacaaatttgaatctttca
attaccttaataaacacgcattgtaatcatttgcaaatacacaaagtgaaatcatttgct
tggcaagaagataattacaatgaaaatgaatacaggtttttcattgttgatattcaaaat
aatatttattattatgcagttacagttacatgtacagaaaactgcatatcctctttgaca
aaatcattttcatccatatggaatctggaaaatattttttcctattttcaagaactcaaa
aaatgtcttgcagatttgtcttcagttgagattctgaaatttgaagctagagaagcagtt
ttcctgttcaacaaaagaactgtggtttccttctttccatcaactgatggtgacccacag
attatgtccatttcagatctttctgaaagtagtttgtcacatcggaaagttctccttatg
aaagagatgctttttgctttaaatgactcaggaacaaaactttctgtttattctttttca
actaatgcaaaaatatttgaatatcagttttcggataatacctttaagttcacagaaaat
gaaattgtacaaaattttactgtgaatttgaggttagacactttgatatttgttacagaa
aaccagcaggtatattccatgccattagacctatctagtcaaacattagagaattccact
tctcagacttccagtggtatcacagcatttacaaaacagtttccctcggtcaggagattg
gatgatggtctaagaagattttctgctttttatggctctattcaaccagtgacttttaca
tgtgatactaaagacctcgttttaaaagattttgttattcttgaaaataaattgttcttt
atatatcatggtgttcatgacttcttagtcgggattcacattctgtgtgcagatgagccc
actgtatgtaaaagcctttcccatcctccgtacctgattacaagtggatgtgaagaagtt
ccttatcctgttttattattaactgaaaataaaatatctttgctgttatatgacattgaa
caggacaagcttgttaatgaacttatgatttatccaagtgatggtgttgttgaagaactt
gcattattaaataactggagcaatattcatatggatattgaagttcttaaacttggactt
agtaatcgacaattatatactgtggaatttttcttgaaaacactctttgaaggattttgt
cagcaatggaatgcacccttatcaccaaagtggtatgagaaaatgcaaaaagaatgtaat
atatgggatacagttttgaatttggtttctgagaatgtatgcaaaaacctgactgagagt
ctttcttgtcaatatgctgaacaactactttatgtcacaattaatatggtaatacaaata
ctaagtgtaattgagcagaagaatgcagatgatagaacatttttaaagaaagataaagat
gttttgctgtcaaagttttctggatttattttaaatatgagaaaattacttcgtgagcaa
gattcttcgagtacagatatttcagaaaatgaatccgaaaacagcacagaacaatgtttt
agctgtgatattttaaaattatggacagattggaaggaacgtcctaatgatgaaatcatt
aaagaatctcttctaaatgggacaattccacttgctcaagcatacttttcttgttgctgc
aaaaatgattttaagagttcataccaagaatttgaaaaaaattgtgactgttttgtcatt
gattatttaagacaagggcaaattcctgaagctcttattactatgtcaaatatgggcatt
gatataaatatcaaactgaaagacatatttaagcgtacccctgagaaagacatcagaatg
gccatcttgaaggagctacacatgagagatttattatccaatagtgattcaaattcattg
cagtttattttgttgttagagaagttatacccatgcacttcttttgatcatgcacgtgtg
ttgctggatgaaaaacaatcattttatgacagtgatgtctgttgtgttgcccctgaaagt
gatgcaacattaacagttggggattttattgactttactgaagataacagtgaaaatggt
gcatattgccgcatcgttatgaattggctttcaacgtgggatgatgatgtaaaaagacga
atattggcatcacattttctgaagaattctcctgttctggatttctttatgaaagaagaa
aattcaaacattgtactgaatccattatcagtatggtattacttgcttgaaaatggcatt
ctgccatatcttatgaactggattgacacttggttgggcaagtatcctcaaacatctgag
agttctcttttcaataaatggccattgaatgcagaaatgataaatgctgtatccagaaaa
gccacatttcatgtgtctgagactattttaaatgaattagcgaggcatggtgtattttgt
gaagaagagctggaggacatttcattatttttagctcgaattggtaaagctcagtgcaac
ataaatgatattatgttatttacttctgaaaaagcagcaatatcattttctgacctatgt
cacaggctggctcactattgtctgaaacataacttagtctcctttttatattcttttgtg
tcacataactacagcaaattttctagttggccatcttgtcagtcatgtgatgttccactt
ctatatctgacaaaggcattctttttatggtctcaagatcatgagaatgttctgctagca
tatgatgctattgttggcacagctcagtatctttttaacttggaaaacccttctaatact
gaattgcttatgaaagtgccactctctttgagccttgcagttttactttttaaatcacag
cctttaaatgaagttatgaatgacattctaaaaagaccatgtgcaccagcatcatatttg
aaagaaaaatttcagtcttatcctttgttatgtaaatatttattcaaaactccagaagaa
aggttccaccctgatgtcactgtttatgagttgttaaagggtagcattatatttgatact
tgtcaactgtttggatggcagtcagcaaactctctgaaatctgaagatgctcaaactgaa
cttcctcatttttctcttaaaagtctttctgaacaatatggcttgaagaaagatctaact
tacctatattatttaatggaaggacggccaaattatgcatatctgaaatttatagctcag
gaggttgttttagaaacaggattatcaatttccagagtacgttctacatgtaaagatgtg
atggattatgctttgttaaattacagaagtgctgatatttgtgcagcatctatttcattc
atagaacttttaggacaggattcattacctttaaggtgttgtttgaatgctgcaaatata
ttgcatgaaaatcaagcttttaatgaagaagcaaatgaaaaaagtttccctgaaattggc
tggaaatttaaacaagcctttgtaaataaagattctgctgcaaatttaataactgaaatt
gaaaatatttttttgaagaaatggaatccttacagtactgaaccaagggctgtttttaaa
gatactgttttgtggatgccagtaatgactcttagtcatctatatgaagttgaagctggg
aattcatatttgaatgaatgtgcaaagcagaacaattggtttaaatttcttgtattttca
caaatcttccagattcctaaagagcaggttctaaaagcagtgtctaggttttctaattct
tgtatatcatatcacatttcccatgcacttaacagaagatcagctttgctctatgatgtt
gcatataagacaaaatctagtactgttttgaaatcagaggagagagacatgagaaaatct
ttatactcccgtattggtgtaaaacaaggaacatctcccgtagagctgaagaaaactcct
gaacaggatgaggacaaaagctccattgctactgaagaaacttcttcttcttcatcagat
gtagatttaaggtcatttgttttgaaagatctgttcagtcaattgttattagctcacagt
tcagacacaccatgggagtatctcttacacacaagttttgaaatcaaaaatccagccctg
gctatccttgctgcctcctaccatgattcacctctggagagttgttttttcatgtggctg
tatactaatcttcaccgtaatgagagagtaaaaaaagagcttgacactgctttttcccag
atcagagttactaattgcagtgctgatgatgtaaagaaactttttgtagtagctgttcaa
aatcataagattttaactctgtggcaaggtgttcttttttttctatcttctaccccactt
ttaccattgatggacttcttaagaagtttcatggtttacaagaaatttgatgccagtgtt
gaacttttccagaatcatttgtgggattatccccaaaatcgtgaatcattgtcagagcta
cattctttgttatggattgaaaatacgtcagtctgtatattaaaagaagctgtaattgca
tgtgcaactaactatcaaaggctcattttgcttcgacatttttctcacacaagattagaa
aaatcattttccaaagaagtttctgttccacagtttatgaaagtatgccaaatgattcaa
tgccttgggtcaatagaagattttgatgtaaagagttttcttcttcctgaaaatgatgtg
aactacaagcatagttgttgggaaactttgaaaaagttgcttgaaaatcacctttatgat
gatgcccgtacattcactactgctgccaaacttcctgtcaaagaaatgattttattgcag
attaaccatgaatcggaagaagctcggaaaagtagccaatggaataatttgactcatcgt
attgatttttggcaccatattttagacacacttaatcaaaatgctattcctttagaagca
actattgaatttttagataatcagtgtgaagtttctgatatatacggagaaaaatatttc
ttgatatattccatggttaacattctaagtgatgcaaataaacatagtagtttgcctgat
gctacagtatttgatttggaaggcttaaaaagaaaaatgtggtggttgtgtcttaaagct
gaagtaaataaacagctgttgccagaaatatttgatgtgaagccagttcatgaatttgat
gctcttgatctgtcatttgacacaaaaagcatgtttaatgttcatagcattgaaaatgaa
gaggaaagaattgctattcagtctatcataggtcagtttcttcggaaaaaagatgtgcag
aatgcatttcaactagcaaaatcattcaattatgagtgtcaggatttaaaaattgtaaaa
atatgtcttgaaattgcaacaagtgatatagatctgaatgctatagatatttcatcacct
gactgtgcacctgaagtttcatcttctagatttataagatcccttttactttggattaat
aatggctattcaggcataactactgcacataaagacaagatcaaacttatggaaaaattg
agcagaaaaagcattgtttctgttgcagtttgtcatcaaatattagttcattacacagtt
tctgctgttttgatagcaaagtattgggttattgctaaggaaaagaatcacttcaagata
ttgaaggatatactagttaaaaaattatatgatgaacatatactggccaaatgtttcatt
attgttcatgaccttgccgatgttgatgttgctaggtttttaagtgaagaaatctggcac
tctctgaaaattttgtgcccactaaatataaccttattaccagagaataaaagtgcattt
tctgagaatgtcatatatgatccattgcgggtgagtgaaggttttcaattaatagtgaaa
ttatgtcaagatccttctgtattaggtaatctcctcatggatatattttccacatatgct
tgtgaactctcatctaaaagctcagataaagatttctctataactgttgaactctgcatt
tgtgctcatgaatgcttcactgctgcatgtgatgtggatggtatttcaaaaattcttcat
aattctcagatgttagtcagtcttttagaagaggctgagaaatttgcaacaatggtccat
cttttgactggcttggggagatatagtgaaatgatgtatgtgtttgacacattaaagtca
catgataagctcagtcttctttttgagaagaatatggaagatgtacctaatctacgatta
gctttactagattacctgaagagatgctctcctgcagacagtgacagtttgttttatgct
gttgcaagtggttttggcatgtatagggaaaaggctgaaattctggaaatgtccgtgcag
aaacaactgtcacaactgtgcaaaaaaaacatagatgctgatttaagtgatgaattagaa
aatgctttgcaagttctgtcagaagcagcaaaaagttattgcaaggctgattgtctgcat
caggctcagcattgcacccgtctggcacaattaattgcactacagatacattttctacca
tcaggaatttggataattggtttagatgattcatcaatatcaagatttattactcagcat
gacaacttttctcaagctttaattgttgctgaagagtacaggaagcatcagctatgggct
caagctgtgcttcataatgttgtattaagaggggacagagagtatttaagagaatttcaa
gcacattttggtctatctgcttctttaatttctgatgtagcaaaaaggtttaaaaaagtg
cctactaaaaatgacagtgctttgagaaacatgaaacttcttttatcgctatgttcaaac
ataaaagtcaagtactgcttggcaaacgatttaagttttggtgatatggcatcagaattg
ttaatgggagaaggctcatcttacctacaagatttaatagcaaataatattataaaataa
DBGET
integrated database retrieval system