Stegodyphus dumicola: 118203080
Help
Entry
118203080 CDS
T07385
Name
(RefSeq) endoribonuclease Dicer-like
KO
K11592
endoribonuclease Dicer [EC:3.1.26.-]
Organism
sdm
Stegodyphus dumicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sdm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
sdm03036
]
118203080
Chromosome and associated proteins [BR:
sdm03036
]
Eukaryotic type
Gene silencing
RISC (RNA-induced silencing complex)
118203080
microRNA pathway
RISC loading complex
118203080
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Dicer_platform
Ribonuclease_3
Dicer_dimer
Ribonucleas_3_3
PAZ
Helicase_C
Dicer_PBD
DEAD
ResIII
Cas3-like_C_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
118203080
NCBI-ProteinID:
XP_035231209
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1802 aa
AA seq
DB search
PLICQQAKVIRDCTDLTVGQYFGNELDNWSKESWLCEIERNQVIVLTPDLFKMILFHGFL
PLSVINLIIFDECHRAVGNHPYCEIMTCFDVCSFLNQPRILGLSACLINRKCQPSRIELE
IKRLETVLKASVETASELTALSKYGSKPKEYLVEFNSCLDDESVLVSVMSHIKSALVFLD
NVNIVNDIDNSLSHPCRQPRRYLIEIAHVITDLGPWCALKATQLFIEEINMTLQSIYSED
HIRFLILARTVLLIIEVQFQTILNDCDLLTQLINKAPPKLQELLKILKYYKPVSVPTIET
SSNVTSEESSFSNEQEKKICSTQIINSNMQSEDPPTSVQSLSSGKSENCNITCNKISKDD
IKEKRLSKNNLASEEGKSLCGLVFVHQRITAFLLSEWLSAVKEIHPDFSFLSPSYIIGHG
KNNRGLKTILMRFEKQEEVLQKFRTRMYNLVVATSVVEEGMDIPKCNLVVRFDPPENFRA
YIQSKGRARVNDSVYILMVKSSEKGSFIDTLCDFKAVEELLLIKCHKSDHGMEDPVLESN
VDELIEPYMPVKEDGCAKVTLSSAIALVNRYCAKLPSDTFTRLTPKWYINEDYSSGSTPQ
FQCVLKLPINSPVKKALVGPWMRSKQLAKMAVALKMCEELHKAGELDDNLLPTGKEAVKS
EDLTIEDTADEDIKKDEDPRKGPGRPGTTKRRLYYFKKVADALKNSIPVANSVSYLYVFD
MKLTCPIPEEQNTRGRKIHDPADTIRRFGILTSKVIPPICSFPVFTRSGEVTVSVKPASS
CHILNEDELECLSFFHHYTFADVLRLEKYPMIYRPSEAEASFYVVPVTIGVNTGEYIIDW
QFARLIHKEKNGKPVKVSEKDRENFKFVVEDYQDAVVMPWYRNLDKPQFFYVAEICTYLT
PKSDFPDMEYDTFEEYYRKKYNITIMNYEQPLLDVDHTSARLNLLTPRYVNRKGVTLPTS
SEQTKRTKRENLQQKQILVPELCTVHPFPAYLWRKAVCLPCILYRLNSLLLAEQLRLIVA
KSISIGMRDLPQDFEWPALDFGWTLADILSSQNVPKDAKQSKQTYHCNNYAVTQKIKNGY
VSPLNPVNFINDNTCNFEAENVNGSMDFEIDVFDPSKLNIPDDDALIEQELNEINFNMGG
SFFDSSCPVSFGSNFPTDQGTSFPLWQPVSDADGNSVQNESRIRYGSPSNFEDSGWDSEW
DTEDDDIPFLAVDFHGLGYISAPGIINMESLSMDLASCRDDDMWDSMEEDSFDSDDEKLP
AFSKSFDAMEQNNDLTSKLFKTNEEICESSWLTCPIIKDDAPSSLISNIVEDIDDTIISA
VDQLKESKKKEISFLYEKVNVESFYEEKSGIDLMFKIVEESEIQNIMPSCCGSEPEIECF
SSHEKTASCSIASEPTLAFGELLPNREHHQLYDDNMLRVNFDDCPDLYKHPGPSPSIILQ
ALTMSNANDGINLERLETVGDSFLKYAITVYLFCMYPNIHEGKLSYLRSKQISNYNLYKL
GKRKGLGELMVASKFEPYDNWLPPNYIVPKGLEEALIESGLPSGCWNLGNLSDLTQMSEA
EIRQSIIEKTDSKYIEKCAYLPMDTTNPYSLVPYNLLTQHSIPDKSIADCVEALIGAYLV
SCGSRGALLFMSWLGLRVLPIIKDNEMNNSEITYGYLQPPPSPILTREPESNLKLQKLLS
GYSAFEEKIGYNFNDKSCLLQAFTHASYYYNTLTDCYQRLEFLGDAVLDYLITRHLYEDP
KKHSPGTLTDLRSALVNNTFFASLAVKYDFHKFFKAISPGLFNVINKFVLLKEHNSDLAD
YL
NT seq
5408 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
tgcctctgatatgccaacaggctaaagtaattagagattgtacagatttaacagttggac
aatactttggaaatgaactggataactggtcaaaagaaagttggctgtgtgaaatagaaa
gaaatcaagttattgttttgactcccgatctttttaaaatgattcttttccatggatttt
tgcctctttctgtgataaatctcataatatttgatgaatgccacagagcagttgggaatc
acccatactgtgaaataatgacgtgctttgatgtttgctcttttttaaatcagcctcgga
ttttaggtcttagtgcctgtttgataaataggaagtgtcagccttcaagaatagagcttg
aaataaagcgccttgaaacagtattaaaagcatctgttgaaacagctagtgaattgactg
ctttaagtaaatatggttctaaacctaaagagtatttagtggagttcaacagttgtttag
atgatgaatcagttttagtatctgtgatgtcacatattaaatctgcattagtatttctag
ataatgtaaatattgtaaatgatattgataattctctttctcatccatgcagacaaccta
gacgatatttaatagaaatagctcatgtcattactgatcttggtccttggtgtgctctaa
aagctacacaacttttcattgaagaaattaatatgaccttacagtctatatattcagaag
atcatatacgtttccttatacttgctaggacagtgttattgattattgaagtgcagtttc
aaactattttaaatgactgtgatttacttactcagctaattaataaggctcctcctaaat
tacaagaattacttaaaattttaaaatactataaacctgtaagtgtgcctaccatagaaa
catcatctaatgttacatcagaagaatcttctttttctaacgagcaagaaaagaaaatat
gtagtactcaaattattaattccaatatgcaaagtgaagatcctccaacttctgtacaaa
gtttatcgtctggaaagagtgaaaattgtaacattacatgcaataaaatcagcaaagatg
atatcaaagaaaagaggttatcaaaaaataatcttgcatcagaggagggcaaatctcttt
gtggtttagtttttgtgcatcaacgtattactgcttttttgttaagtgaatggttatcag
cagtaaaagaaatccatcctgacttcagtttcttgtcaccaagttatattattggacatg
gaaagaataatagaggtttaaagactattttaatgagatttgaaaaacaggaggaagtat
tacagaagttcaggactagaatgtataatcttgtagttgccacctcagtggttgaagaag
gcatggacataccgaaatgtaatttagtcgttcgatttgatccaccggaaaattttcgag
cttacatccaatcaaaaggaagggcaagggttaatgattcagtatatatactaatggtaa
agtctagtgaaaaagggtcatttatagatacactttgtgatttcaaagctgttgaagaac
tgcttttaataaagtgtcataaatcagatcatggtatggaagatcctgtactggagagta
atgttgatgagctgattgagccatacatgccagttaaagaagatggatgtgcaaaagtta
cactttcatctgcaatagctttagttaacaggtattgtgctaaacttcctagtgacacat
ttacaagactaacaccaaagtggtatataaatgaagactattcttctggctctacacctc
agttccagtgtgttttgaaactgccaatcaattccccagtgaaaaaagctttagttggtc
cttggatgagaagcaaacagcttgcaaaaatggcagttgctctaaaaatgtgtgaagaat
tgcataaagctggtgaattagatgataatcttttgccaactggaaaagaagccgttaaat
ctgaagatttaacaattgaagatactgctgatgaagacataaaaaaggatgaggatccaa
gaaaaggacctgggcggcctggtaccactaaacgaaggctttactattttaaaaaagttg
ctgatgcattaaagaatagtattcctgttgccaattcagtcagctatttgtatgtttttg
atatgaaacttacttgtcccataccagaagagcagaataccagaggtaggaaaattcatg
atcctgctgatacaatcagaagatttggtattttaactagtaaagtgataccaccaattt
gtagttttccagtatttacaagatcgggtgaagtgactgtaagtgtaaaacctgcatcta
gctgtcacatcttaaatgaagatgaactagaatgtttatcattttttcatcattatacat
ttgctgatgtacttaggcttgaaaagtatcctatgatttaccgtccatcagaagctgaag
cctctttttatgttgttcctgttacaataggtgttaatactggtgaatatattattgatt
ggcagtttgcaagattaatacataaagagaaaaatgggaaacctgttaaagtatctgaaa
aagatagggaaaactttaaatttgtggtagaggactatcaagatgctgtagtcatgcctt
ggtatcgcaatctggacaaaccacaattcttttatgtagctgaaatctgtacatatttaa
ctccaaaaagtgactttcctgacatggaatatgatacatttgaagaatattataggaaaa
aatataacataactataatgaattatgagcagcctcttctagatgttgatcacacttcag
ctaggcttaatctgctaacacctaggtatgtgaatcgtaagggtgttactttgccaacta
gtagtgaacagacaaaacgaaccaagcgtgaaaatttgcagcaaaaacagattcttgttc
ctgaactctgtactgttcatcctttccctgcttatttgtggaggaaagcagtttgtttac
cttgcattttgtatcgtttgaattctttactcttggctgaacagttgcgcttaattgttg
ctaaaagcatatctattgggatgagagatctacctcaggactttgagtggcctgctttag
attttggttggacgcttgctgatatattaagttctcagaatgtgccaaaagatgctaagc
agtccaaacaaacctaccattgcaataattatgcagttactcaaaaaatcaaaaatggat
atgtcagtcctttaaatcctgtaaatttcatcaatgataacacatgtaactttgaagcag
aaaatgttaatggttcaatggattttgaaattgatgtgtttgatccaagcaagttaaata
tccctgatgatgatgctcttattgaacaagaactgaatgagattaattttaatatgggag
gatctttttttgactcaagttgtccagtctcttttggaagcaattttccaactgatcaag
gtacctcttttccactgtggcagccagtttcagatgcagatggaaattctgttcaaaatg
agtctcgaattcgatatggatctccaagtaattttgaagattctggttgggactctgaat
gggatactgaggatgatgacatccctttcttagcagttgatttccatggtttaggttaca
tatctgctccaggtattataaatatggaaagtctttcaatggatttagcctcatgccgag
atgatgatatgtgggatagcatggaggaagattcttttgacagtgatgatgagaaactcc
ctgcattttcaaaatcatttgatgctatggaacaaaataatgatttgacttcaaaactat
ttaaaaccaatgaagaaatttgtgaatctagttggttaacttgtcctatcattaaagatg
atgcacccagctctttaatcagcaatattgtggaagatattgatgatacaataatatctg
cagtagaccaacttaaagagtcaaagaaaaaagaaataagtttcttatacgaaaaggtaa
atgttgagtcattttatgaggaaaaatctggcattgatttaatgttcaaaattgttgaag
aaagtgaaatacagaatataatgccatcctgttgtggtagcgaaccagaaatagagtgct
tctcctcacatgagaaaactgcttcttgcagcatagcttcagagccaacactggcatttg
gagaattactaccaaacagagaacatcatcagttgtatgatgataatatgcttcgtgtta
atttcgatgattgtccagatctatataaacatcctggacctagtcctagtattatacttc
aagcactcactatgtcaaatgcaaatgatggcatcaatttagagcgcttagaaactgttg
gagattcattccttaaatatgcaataacagtttatcttttttgtatgtatcccaatatcc
atgagggcaaattgtcttatttgagaagtaaacaaattagcaattataatctgtacaagc
ttggtaaaagaaaaggcttaggagaattgatggtagcttcaaaatttgagccctatgaca
actggctaccaccaaattacattgtaccaaaaggtttagaggaagcgttaatagaatcag
gattaccttctggttgttggaatttagggaatttaagtgatttaacgcagatgagtgaag
cagaaattcgtcagtcgattattgagaaaactgattccaaatacattgaaaaatgtgctt
atctacctatggatacaacaaatccttattctttggtaccatataatttgcttacacaac
atagtatacctgataaaagtattgcagattgtgttgaagcattaattggtgcctatttag
tatcctgtggctcaaggggagcattattatttatgtcatggttaggccttagggttttac
ctataattaaagataatgaaatgaataatagtgaaattacttatggttatttacagcctc
ctccttctcctattttgacaagagaacctgaatcaaatcttaaacttcagaaactgcttt
caggctattctgcttttgaggaaaaaattggttacaactttaatgataaatcatgcttgt
tacaagcatttacccatgcttcttattattacaatacattaacagactgttaccagaggt
tagaatttttaggagatgcagttcttgattaccttataactcgtcatttatatgaagatc
caaagaaacattctccaggaacattaacagatttgcgctctgcattagtaaacaatacat
ttttcgcttcccttgctgtaaaatatgattttcataaattttttaaagctatctcaccag
gtctcttcaatgtcatcaacaagtttgttctgttgaaagagcacaattcggatctggcag
attatctg
DBGET
integrated database retrieval system
