KEGG   Shewanella denitrificans: Sden_2228
Entry
Sden_2228         CDS       T00344                                 
Name
(GenBank) SNF2-related
Organism
sdn  Shewanella denitrificans
SSDB
Motif
Pfam: SNF2-rel_dom Helicase_C ResIII SWIM
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABE55508
UniProt: Q12M18
LinkDB
Position
complement(2646613..2649879)
AA seq 1088 aa
MSAKIFNLPIKMTSALVAKLFPANVLQKAQNYVIQGRVLDVTASSDNHNIESFVAGSHPE
PYRQDITLVNINHKILMNAHCTCPVRSNCKHVAAALLTLVDKKPVEEQRLSQWLMQLDEQ
ATSGSADELPEQEKDRVIFVLSSDHQGVFVELKRSKLNKKGQFNRGSKLALTEVKYHIPW
WISKEDAQIVSLLMSVLAANHHASKIYLEGEICALALNKMLNLDTCFWEDSRFPIMRTQA
ITPEFIWLELDRKHTQMQMQLPTLENWEFIATVPPMFVDLDYLRIGLLDTELTTAKLKLL
QQMPPVPLTQVDSISHKMLQHFSPRNVPVPADIEFHEVDSPLKVRLTLTMVKLSDAMGAG
KQPALRLEFLYGEICFSGKAKREAISLIKKDKVQYQVKRDLEGETRAADALSTLKFSFLN
PLDVASSETLHCFATLGILPDAIYAWSQFVNTQDAVDNDSASTKQALTKLGYELIEAEDF
DLNIVAAELDIDLNDDEDNGWFSLSLNADIDGQSVPLLALVARWLQQHGEPDDEQFLLLP
SPNGGFIQVKAKTIKPLVSIIKELFDRHGEDKLQVPRSRAHLLNELTASEIRLLNGERIQ
ALAAKLGEFKGIVSVSLPAGLNATLRDYQKQGLDWLCFLKEYQLGGILADDMGLGKTIQT
LAFLLKAKEQRGDKTAKTSLIICPTSLIGNWLKETQKFAPSLKVLVIHGNKRKDLLAQIE
QHDLVITTYPLILRDELIYSQIHFEHLILDEAQLIKNAQAKVTQLVKTLRGRFRLCLSGT
PLENHLGELKSLMDFCLPGLLGQHTHFLKEFRNPIEKQADKEKLIQLSTRISPFMLRRTK
QEVAAELPEKTEIISSLTLEKDQRNLYESIRLVMEKKLRELFAQKGVSSSHIEFLDALLK
LRQACCDPRLVKLEQAQNVKSNAKLTWLTENLTEMVEEGRKILIFSQFTGMLSLIEEELQ
RLNIDYSLLTGKTRSRQTQIDDFQEGRKPVFLISLKAGGTGLNLTTADTVIHFDPWWNPA
AERQATDRAHRIGQLNPVFVYKLIAQGTVEEKIHEMQQHKQGLADSILSDKEQGPWQGSA
EDLLALLS
NT seq 3267 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcggctaaaatttttaatctgccaatcaagatgacctcagccttagtggctaagttg
ttccctgccaatgtgttacaaaaagcacagaattacgtgatccaaggtcgggtactggat
gtgactgccagtagcgacaatcataatattgaatcctttgtggctggcagtcacccagag
ccttatcgtcaagacatcaccttagtgaacattaatcataaaattttgatgaatgctcat
tgcacctgtcccgtgagaagcaattgtaaacatgtggcggcggcgttattaaccttagtg
gataaaaagccagtagaagagcagcgcttatctcaatggttgatgcaactggatgaacaa
gccacttcaggtagcgcagatgagttgcccgagcaagaaaaggaccgcgtgattttcgtg
ttgtcgagcgatcatcaaggggtatttgttgagcttaaaagaagcaagctcaacaagaaa
ggccagtttaatcgaggcagtaaactggcactcaccgaagtgaaatatcatattccttgg
tggatatccaaggaagatgcgcaaattgtcagcttactgatgtcagtgctggcggctaat
catcatgcctctaaaatttaccttgaaggtgagatttgtgccctggcactcaataaaatg
ctcaatctggatacctgtttctgggaagatagccgtttccctatcatgcgaacacaagcc
atcacccctgagtttatttggcttgagttggatagaaaacacacccaaatgcaaatgcag
ttgccaacactggaaaactgggaatttatcgccactgtgccgcccatgtttgtggattta
gactacttacgaattggtttactagacactgaactcaccacagccaagcttaaattactg
caacagatgccgcctgtgccactgactcaagtggacagtattagtcacaaaatgctgcag
catttctcgccgcgcaatgtgcctgtgcctgccgatattgagtttcatgaagtcgatagc
ccgctgaaggtgcgccttactttaactatggtcaaattgtctgatgccatgggcgctggc
aagcagccggcattaaggcttgaatttctctatggggagatctgctttagcggtaaggca
aagcgtgaagccatcagcttaattaaaaaagataaggtgcagtatcaagtcaagcgagat
ttggagggcgaaacccgcgccgccgatgcgttatcgacgctcaagtttagcttcctaaac
cctttagatgtcgcaagcagtgaaacattgcactgttttgctactttgggcatcttgcct
gatgccatctatgcctggtcgcagtttgtaaacactcaagatgccgtagacaatgacagt
gcgagcactaagcaagcgttaactaagctaggttatgagttgattgaggccgaggatttt
gaccttaatattgtcgccgcggaactagatatcgatcttaatgacgatgaagataatggc
tggttttcgttgtcgttaaatgccgatatcgatggccagagtgtgcccttgttagcctta
gtggcacgctggctgcaacaacatggggagccagatgatgagcagttcctgttgctgcca
tcccctaatgggggctttattcaagtcaaagccaaaaccattaaacccttagtgtccatt
attaaggaactgtttgaccgtcacggcgaagataagctgcaagtgcctcgcagtcgagct
catttgctcaatgaattaaccgccagcgaaattcgcctgcttaatggcgagcggatccaa
gcattggcggccaagctcggtgagtttaaaggcatagtgtcggtgagcttgcctgcgggc
cttaatgccaccttaagggattatcagaaacaagggctggactggttatgcttcttaaaa
gagtatcagcttggcggtatattggccgatgatatgggcctaggtaaaaccattcagacc
ttggcatttttactaaaggcgaaagaacagcgcggcgacaaaacggctaaaaccagcctt
atcatctgtccaactagcttgattggcaactggttaaaagagacccaaaagtttgcccca
agccttaaggtattggtgatacatggtaataaacgcaaagacttgttggcgcaaattgag
cagcatgacttagtgatcaccacctatccgcttatcttgcgggacgagcttatctatagt
cagatccattttgaacaccttattttagatgaagctcagctgattaaaaatgcccaggcc
aaggtgactcagttggttaaaactttgcggggccgttttcgcttgtgcctgtcgggtacc
ccccttgaaaaccacttaggcgagctcaaatccttgatggacttttgtttgccaggtctc
ttaggtcaacatacgcactttttaaaagaatttagaaatccaatagaaaaacaagcggat
aaagagaagttaattcagctttctacgcgaatttccccctttatgctgcgccgtactaag
caagaagtggccgcggaattaccggagaaaactgagattatctcttcactcaccttggag
aaagatcagcgtaacttgtatgaaagtattcgtttagtgatggagaaaaaactgcgggaa
ttgttcgcccaaaaaggcgtgtctagcagtcatatcgagtttttagacgccttgcttaaa
ttgcgccaagcctgctgcgatcctcgtctggtgaagcttgaacaagcgcaaaacgttaag
agtaacgccaagcttacctggcttacggaaaacttaactgaaatggtggaagaggggcgt
aaaatccttattttcagtcagttcactggcatgttatccctaatcgaagaagagctgcaa
cgcctcaatattgactacagtttgctgactggtaagactcgctcaaggcaaacacagata
gatgacttccaggaaggccgtaagcctgtgttcctaatcagcctaaaagcgggtggcact
gggcttaacttaacgaccgcagacacagtaatccatttcgatccttggtggaacccagcc
gccgaacgccaagccacagacagagcccacagaattggacaactgaacccagtatttgtc
tataaattgatagcccaaggcacggtggaagaaaaaatccatgagatgcagcagcataag
cagggccttgcggacagcatcttgtcagacaaagagcaaggcccatggcagggaagtgca
gaagacttgttagccctgctaagttaa

DBGET integrated database retrieval system