KEGG   Shewanella denitrificans: Sden_2708
Entry
Sden_2708         CDS       T00344                                 
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
  KO
K02014  iron complex outermembrane recepter protein
Organism
sdn  Shewanella denitrificans
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:sdn00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:sdn02000]
    Sden_2708
Transporters [BR:sdn02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   Sden_2708
SSDB
Motif
Pfam: TonB_dep_Rec_b-barrel Plug
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABE55987
UniProt: Q12KN9
LinkDB
Position
complement(3243546..3246194)
AA seq 882 aa
MRPSTFKKNVLATNIAFLLGSAVSMGAIAAENPVDEANMEKIEVRGMRASNKANINEKRF
SNAVVDAVTAEDIGKFPDSDVGQALGRVPGVSVGRAFGQGSSVSIRGTDPLMTLTTLNGQ
NVASTGWYDQMNTDRSFNYSMLPSELVGGMEVYKSSQANLVEGGIGGTVIVKTRKPLDME
ANSIFGSVKGEYGSVNEDWAPETSGLYSWKNESESFGILVAGSYIDRDYLRTGTEADLDW
GGRSSIQPSSFLQEQERTAVDATIQFRPTDNLEFGAHILSMKLGADSIGANMYINTDTNW
GAGDSNCHKFNAAGVCVVSVTPESAPTDVFFQNWARQGEMTSDSFELNADYQGDGFKLSA
VAGNTKAEGGTQMSANFGYGWWGDNFGQVKWAGNVDATGKQIDINGRDMSFTQDQLDTTV
GTSQWTGVQGPNRDEENYVQFDADFDLDMGILTKFETGIRYTQHEFEKSENKAVYDPTKT
NSFNTSDLYSGTMKLGYDGWNVPKPNLNAMIDSTISLVDEFVYNRAAYGLIEEDNLSLYG
MFSFDGEDFRGNFGVRYINTDVTSSGHVIDNSPADKLAVNSGWSEEIHSVSDDYSDILPS
FNISYNVTQDVIARFAAAQAITRPNYDNLFLSSVSGYPDDRKGNEEITYGNPGLKPMKSS
QFDISLEYYYGDGNLVSATYFTKDISNFIVATTDYNQSIGVINNDLDTPADDWTVNNFVN
ANDGKIDGIELQLLHAWDNGFGVNANYTFANGTAPAEVYTDSIGVFTESSEHTANLVGYW
ENDDFSARAAYNWRSEYMVREYGKYYGNRMHDAFGTLDVTLGWNITENIGLQLEIVNLTE
EDDVQYGAASAGTKVKPALQDDFPTWSFKGETTYKLGASFRF
NT seq 2649 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcgaccatctacctttaaaaaaaatgtactcgcgacgaatatcgcattcttactgggc
agcgccgtatccatgggtgccattgctgctgaaaacccagttgatgaagccaatatggaa
aaaattgaagtccgtggtatgcgggcttcaaataaagcaaatattaatgaaaagcgattt
tctaatgccgtggttgatgcagtaacagcagaagatattgggaaatttcctgattctgac
gtaggccaagcccttggacgtgtgcctggtgtgagcgttggtcgtgcatttggtcaaggt
agctcggtttctatccgtggtacagatccattaatgacactaacgacgttaaatggtcaa
aatgtggcttcaactggttggtatgatcagatgaatacagatcgttctttcaactattct
atgctgccatctgaattggttggtggaatggaagtttataagtcaagccaagctaatctc
gttgaaggtggtattggcggtactgttattgttaaaacacgtaaacctttagatatggag
gctaattcaatatttggctctgtaaaaggtgagtacggttctgtcaatgaagattgggca
cctgaaacctctggcttatatagctggaaaaatgaatccgaatcgtttggtattttagtt
gcaggctcctatattgatcgtgattatcttagaacgggtactgaagcggatttagattgg
ggtggacgctcttcaattcagccatcgagttttcttcaagaacaagagcgtaccgctgtt
gatgccacgattcaatttaggccaacagataaccttgagtttggtgcgcacatactgtca
atgaagttaggcgctgatagtatcggcgctaacatgtacataaataccgatacaaactgg
ggggctggtgattccaattgccacaagtttaatgccgccggagtgtgtgttgtcagcgta
acccctgaaagtgctccaaccgatgtgtttttccagaattgggctcgtcaaggtgaaatg
acttcagatagctttgagctgaatgccgattatcaaggtgatggctttaaattatcggca
gtggcgggtaatactaaggcagaaggggggactcaaatgagtgctaacttcggctatggt
tggtggggtgataactttggtcaggttaagtgggccggtaatgttgatgccacaggtaaa
cagattgatatcaacggccgtgatatgagcttcactcaagatcagctcgatactaccgtt
ggcacgtctcagtggacgggggtacaaggtcctaatcgtgatgaagaaaactatgtccag
ttcgatgctgattttgatttagacatggggatcttaactaagtttgaaacgggtattcgc
tatactcaacatgagtttgagaagtcagaaaataaagctgtttatgaccccactaaaact
aactcgtttaatacctcagatctttatagcggcacaatgaagttaggttatgacggttgg
aatgtgccaaaacccaatctaaatgccatgattgatagcacaatttcattggttgatgag
tttgtttataatcgagctgcctacggtttaatcgaagaagataacttatctctttatggt
atgtttagtttcgatggtgaagactttcgtggtaacttcggcgtgagatatatcaacaca
gatgtcacatcaagtggccatgttattgataattctccagccgataaattagcggttaat
tctggttggagtgaagagatacacagtgttagtgatgattatagcgatattttaccaagc
tttaatatttcttataacgtcactcaagacgtcattgcgcgttttgcagcagcccaagcc
attaccagacctaattacgacaacctgtttttatctagcgtgtcaggctacccagatgac
cgtaaaggcaatgaagagatcacttacggtaatccaggcttaaagccaatgaaatcttca
caatttgatattagtcttgaatactattacggtgacggtaatttagtctcagcaacttac
ttcactaaagatatcagtaactttattgttgcaacaacggattacaatcaaagcattggc
gttatcaacaatgacttagatacaccggcagacgattggacggttaataatttcgtcaat
gctaatgatggcaaaattgatggtattgagcttcagctgcttcatgcatgggataatggc
ttcggtgttaatgctaactatacgtttgcaaatggcactgcgcctgccgaagtatacaca
gatagcataggtgtctttactgagtcatccgagcataccgctaacttagtgggttattgg
gaaaatgatgatttctctgctcgcgccgcttacaactggcgttctgagtacatggtccgt
gaatatggtaagtattatggaaaccgtatgcatgatgcctttggtaccttagacgtcacc
ttgggctggaatattactgaaaatatcggtctacagctcgaaattgttaacttaacagaa
gaggatgatgtccaatacggtgcagcatcagcaggtactaaagttaaacctgcgcttcag
gatgattttccaacgtggtctttcaaaggcgaaacaacttataagttaggtgcaagtttc
cgcttttaa

DBGET integrated database retrieval system