Shewanella denitrificans: Sden_2708
Help
Entry
Sden_2708 CDS
T00344
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
sdn
Shewanella denitrificans
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sdn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sdn02000
]
Sden_2708
Transporters [BR:
sdn02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Sden_2708
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABE55987
UniProt:
Q12KN9
LinkDB
All DBs
Position
complement(3243546..3246194)
Genome browser
AA seq
882 aa
AA seq
DB search
MRPSTFKKNVLATNIAFLLGSAVSMGAIAAENPVDEANMEKIEVRGMRASNKANINEKRF
SNAVVDAVTAEDIGKFPDSDVGQALGRVPGVSVGRAFGQGSSVSIRGTDPLMTLTTLNGQ
NVASTGWYDQMNTDRSFNYSMLPSELVGGMEVYKSSQANLVEGGIGGTVIVKTRKPLDME
ANSIFGSVKGEYGSVNEDWAPETSGLYSWKNESESFGILVAGSYIDRDYLRTGTEADLDW
GGRSSIQPSSFLQEQERTAVDATIQFRPTDNLEFGAHILSMKLGADSIGANMYINTDTNW
GAGDSNCHKFNAAGVCVVSVTPESAPTDVFFQNWARQGEMTSDSFELNADYQGDGFKLSA
VAGNTKAEGGTQMSANFGYGWWGDNFGQVKWAGNVDATGKQIDINGRDMSFTQDQLDTTV
GTSQWTGVQGPNRDEENYVQFDADFDLDMGILTKFETGIRYTQHEFEKSENKAVYDPTKT
NSFNTSDLYSGTMKLGYDGWNVPKPNLNAMIDSTISLVDEFVYNRAAYGLIEEDNLSLYG
MFSFDGEDFRGNFGVRYINTDVTSSGHVIDNSPADKLAVNSGWSEEIHSVSDDYSDILPS
FNISYNVTQDVIARFAAAQAITRPNYDNLFLSSVSGYPDDRKGNEEITYGNPGLKPMKSS
QFDISLEYYYGDGNLVSATYFTKDISNFIVATTDYNQSIGVINNDLDTPADDWTVNNFVN
ANDGKIDGIELQLLHAWDNGFGVNANYTFANGTAPAEVYTDSIGVFTESSEHTANLVGYW
ENDDFSARAAYNWRSEYMVREYGKYYGNRMHDAFGTLDVTLGWNITENIGLQLEIVNLTE
EDDVQYGAASAGTKVKPALQDDFPTWSFKGETTYKLGASFRF
NT seq
2649 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgaccatctacctttaaaaaaaatgtactcgcgacgaatatcgcattcttactgggc
agcgccgtatccatgggtgccattgctgctgaaaacccagttgatgaagccaatatggaa
aaaattgaagtccgtggtatgcgggcttcaaataaagcaaatattaatgaaaagcgattt
tctaatgccgtggttgatgcagtaacagcagaagatattgggaaatttcctgattctgac
gtaggccaagcccttggacgtgtgcctggtgtgagcgttggtcgtgcatttggtcaaggt
agctcggtttctatccgtggtacagatccattaatgacactaacgacgttaaatggtcaa
aatgtggcttcaactggttggtatgatcagatgaatacagatcgttctttcaactattct
atgctgccatctgaattggttggtggaatggaagtttataagtcaagccaagctaatctc
gttgaaggtggtattggcggtactgttattgttaaaacacgtaaacctttagatatggag
gctaattcaatatttggctctgtaaaaggtgagtacggttctgtcaatgaagattgggca
cctgaaacctctggcttatatagctggaaaaatgaatccgaatcgtttggtattttagtt
gcaggctcctatattgatcgtgattatcttagaacgggtactgaagcggatttagattgg
ggtggacgctcttcaattcagccatcgagttttcttcaagaacaagagcgtaccgctgtt
gatgccacgattcaatttaggccaacagataaccttgagtttggtgcgcacatactgtca
atgaagttaggcgctgatagtatcggcgctaacatgtacataaataccgatacaaactgg
ggggctggtgattccaattgccacaagtttaatgccgccggagtgtgtgttgtcagcgta
acccctgaaagtgctccaaccgatgtgtttttccagaattgggctcgtcaaggtgaaatg
acttcagatagctttgagctgaatgccgattatcaaggtgatggctttaaattatcggca
gtggcgggtaatactaaggcagaaggggggactcaaatgagtgctaacttcggctatggt
tggtggggtgataactttggtcaggttaagtgggccggtaatgttgatgccacaggtaaa
cagattgatatcaacggccgtgatatgagcttcactcaagatcagctcgatactaccgtt
ggcacgtctcagtggacgggggtacaaggtcctaatcgtgatgaagaaaactatgtccag
ttcgatgctgattttgatttagacatggggatcttaactaagtttgaaacgggtattcgc
tatactcaacatgagtttgagaagtcagaaaataaagctgtttatgaccccactaaaact
aactcgtttaatacctcagatctttatagcggcacaatgaagttaggttatgacggttgg
aatgtgccaaaacccaatctaaatgccatgattgatagcacaatttcattggttgatgag
tttgtttataatcgagctgcctacggtttaatcgaagaagataacttatctctttatggt
atgtttagtttcgatggtgaagactttcgtggtaacttcggcgtgagatatatcaacaca
gatgtcacatcaagtggccatgttattgataattctccagccgataaattagcggttaat
tctggttggagtgaagagatacacagtgttagtgatgattatagcgatattttaccaagc
tttaatatttcttataacgtcactcaagacgtcattgcgcgttttgcagcagcccaagcc
attaccagacctaattacgacaacctgtttttatctagcgtgtcaggctacccagatgac
cgtaaaggcaatgaagagatcacttacggtaatccaggcttaaagccaatgaaatcttca
caatttgatattagtcttgaatactattacggtgacggtaatttagtctcagcaacttac
ttcactaaagatatcagtaactttattgttgcaacaacggattacaatcaaagcattggc
gttatcaacaatgacttagatacaccggcagacgattggacggttaataatttcgtcaat
gctaatgatggcaaaattgatggtattgagcttcagctgcttcatgcatgggataatggc
ttcggtgttaatgctaactatacgtttgcaaatggcactgcgcctgccgaagtatacaca
gatagcataggtgtctttactgagtcatccgagcataccgctaacttagtgggttattgg
gaaaatgatgatttctctgctcgcgccgcttacaactggcgttctgagtacatggtccgt
gaatatggtaagtattatggaaaccgtatgcatgatgcctttggtaccttagacgtcacc
ttgggctggaatattactgaaaatatcggtctacagctcgaaattgttaacttaacagaa
gaggatgatgtccaatacggtgcagcatcagcaggtactaaagttaaacctgcgcttcag
gatgattttccaacgtggtctttcaaaggcgaaacaacttataagttaggtgcaagtttc
cgcttttaa
DBGET
integrated database retrieval system