Shewanella denitrificans: Sden_3124
Help
Entry
Sden_3124 CDS
T00344
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K16087
hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor protein
Organism
sdn
Shewanella denitrificans
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sdn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sdn02000
]
Sden_3124
Transporters [BR:
sdn02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Sden_3124
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABE56401
UniProt:
Q12JH5
LinkDB
All DBs
Position
complement(3752955..3755330)
Genome browser
AA seq
791 aa
AA seq
DB search
MRMPLYSSAYSAKASTNKVNFTSPKLIGSKLIMPGSVRVRLAKALRTGSLLGLASLIFTP
LLSFSIAAEEQVSSQDTAKVQLKSPNEQDKNHSTLEVIQVIGTRLNLRQKALEVPRSMTV
VTDKYIQDTQATELTDVLVQTPSISVSDNDRPLMGNISIRGFGNERINLEVDGVSYKQFS
DGSNANGYISPLDLDPSIVRGVEITRGADGIGSGSGAIGGQVKVVTKGAWDYTSGAAGSG
VLVRTGMDDATHMRRGGVTGYVATDELALVLHANRRTFGDIKLNPRDSEGSLRGQTQTLK
NDGQSDDLRLKVNWDSAHGQLDSDTFYTASEVAELPFGNNTRWIDQALTESETGERLSQS
LAYHYASDSQWLDLRAKAYYQDYQRVREQDGKIVLGKNEYPFNKQDSFEDQSFGLSLSNS
INHQMNDWKGELQLFASVDRSQFEDTVTDRLTNTQATYYGHSQGDMFALGVRHESDYSSW
LSTEAGIRLDSFSNQSDNFTEYGENSDEQWSSNLGVTIRPTEWLRFYGRYNESFRGANLR
ELYKKDEWVCHRPSKHCYSEPQPGLKPESSSNYEFGFGLVFKDIAFSDQLLFKLNWFDTQ
VDNYIDTAPYMYKLVDGQKVAASPKEATHRDYSSKNIGKLYSKGIEAELTYQYQDLDIFA
NYSRVRMDVEGMPNFYLGTIEQVRQPYTRAPQDRINLGLSWQLVSELRLSWVSSFAMDMK
RLPELYLENEMDAEGYQVHSLYITYQASWLSGFELRAGVENLLDEAYSVWPDDEDTSLPG
RNAKLALSYHF
NT seq
2376 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaatgcctctctattcttcagcttactcagctaaggcaagtactaacaaagttaac
ttcactagccctaagttaattggctctaagttaattatgccgggttcggtcagggtaagg
ttagctaaagcattgcgtacaggttcactgcttggcttagcgtcattgatcttcacgcca
ttattgtctttctcaattgcggctgaagagcaagttagcagccaagacactgccaaagta
caacttaaaagcccgaatgaacaagataagaatcacagtacacttgaagttattcaggtg
ataggtacaaggctgaatttacgtcaaaaagccttagaagtcccaaggtcgatgacagta
gtgactgacaaatatattcaagatacccaagccaccgagcttaccgatgtactggtgcag
actccgagtattagcgttagcgataatgacagacctttgatggggaatattagtattcgc
ggctttggtaatgagcgcattaatctagaagtcgacggtgtgagttataaacaatttagt
gacggcagcaatgctaatggctatatcagtccattagatttggaccctagcatagtacgg
ggtgttgaaattacccgtggtgcagatggtattggcagtggtagtggcgccattggcggc
caagttaaagtggtcactaaaggcgcttgggattatacctctggggcggcgggttcaggc
gtattagtgcgaactgggatggatgatgcaactcatatgcgccgcggcggggttacgggt
tatgttgcaaccgatgagctggctttagtgctgcatgctaatcgacgcaccttcggggac
attaagcttaaccctagggacagtgaaggttcgcttcgaggccaaactcagacccttaaa
aatgatggtcaaagcgatgatttgcgccttaaagtaaattgggatagtgctcacggtcag
ttagattcagataccttttacaccgccagtgaagtggctgagttgccttttggtaataat
actcgatggatagatcaagccttaactgaaagtgaaaccggtgaacgtttaagccagtct
ttagcttatcattatgccagtgactcacagtggttggatttacgtgctaaggcgtattat
caagattatcaaagagtacgtgaacaagatggcaaaatagtcttaggcaagaatgagtat
ccgtttaataagcaggacagctttgaagatcaaagttttggtttatcgttaagtaatagc
attaaccatcaaatgaatgactggaagggagagttacagttatttgcgagtgtcgatcgc
agtcagtttgaagatacagtaacggatcgactcaccaacacccaagcgacttattatggg
cacagtcagggagatatgttcgccttaggtgttaggcatgaatcggattactcgagctgg
ttgagtaccgaggctggcattaggctcgactcgtttagcaatcaatcggataattttact
gaatacggtgaaaatagcgatgagcagtggtcttccaatctaggcgttactattagacca
actgaatggttgagattttatggtcgatataatgagagctttcgcggcgccaatttaaga
gagctatataagaaagatgaatgggtgtgtcatcgtcctagcaagcattgctacagcgag
ccacaaccaggactaaagccagagagcagcagcaactacgagtttggttttggtttagta
ttcaaggatatcgcctttagtgatcaattgttattcaaattgaattggttcgatactcaa
gttgataattacatagatacagcaccttacatgtacaagctggtggatggtcaaaaagtg
gctgcatcgccaaaagaggccactcacagagactactccagtaaaaatatcggtaaattg
tattccaaagggatagaggctgagctgacgtatcaatatcaagacttagatatatttgct
aattacagtcgagtgagaatggatgtagaaggcatgcctaatttctatttaggcacgata
gagcaagttcgccagccgtacacgcgagcgcctcaagataggattaaccttggcctaagt
tggcaattagtcagtgaactgaggctgtcttgggtatcaagttttgccatggatatgaag
cgtctgcctgaattgtacctagagaacgagatggacgcagaaggataccaagtgcatagc
ctttatatcacttatcaagcttcatggttaagtggttttgagctacgtgctggagtcgaa
aacctgctggatgaggcctattcggtttggccagatgatgaagacactagccttcctggt
cgcaatgcaaagcttgccttgagctatcacttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
