Staphylococcus delphini: NCTC12225_01021
Help
Entry
NCTC12225_01021 CDS
T06587
Symbol
lytM_4
Name
(GenBank) phage tail tape measure protein
Organism
sdp
Staphylococcus delphini
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Phage_lysozyme2
PhageMin_Tail
Peptidase_M23
Bac_luciferase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
VED62416
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(1073115..1081661)
Genome browser
AA seq
2848 aa
AA seq
DB search
MANGFNIGILSTLDVDSSSSRKQINETIKEIEKNINKVSVEFEARQTKGASNDLRKSANS
VIDSLNKSSQLRKVKVDLDVNLTQSKQNIKKAISTLSDSLSKNKIKVNIDANVDTNAAQK
AGKSISTNAQKGFGAVSSTTSKGQAQEIEKINNSMLQLQKTYSDVSKLSSELSNVRDNSL
RTEIKSIKDANGALQSYQVNLQRVSELGKTLGRESYNYKANDDGSLSLEKIANLNSQEKA
RKLTHDSMVKSMEQEVSALDRMVEKQKLSTSQAEKIKNAYSQLSHLAKENKVISPEQFTK
AKSEADILLKKYTLQNEQLKEQEKIQSAISKELERINKLEAQGKISKGQAKDATNNYTGL
KERINSGDVTKLSTEFNKVKQSADGLLLGYSQQNKLLNQQVSLLAQIDRAERRLTSTIDK
RATSQLKGQLQNLNSNGSGTFGKEAAFQMSQIQGQVRTITAEAERATRSQLGFVESFRQA
MIKFPVWMGATTLFFGAIRSGQNFLSIISDIDSKMVTLSKVMNDNADLESVFLRANDAAL
QYGQTISNVLDVYAEFARQGYDEADTTVFGNAALIASNVGEIDAKQASEYLTSMSAQWET
SATDAMRQVDSLNQISNEYATTVEKLAQGQAKAGSTAKSMGLTFDETNAIVGALTAKTKQ
SGDEIGNFLKAVLPKLYVGTGKNTITDLGINMKDSNGQLKSAITLLEEVSEKIKNVDKDQ
QAAVIRGLGGTYHYQRMQVLLDDLSKADSLYKQIKNTSENSAGSAIAENQKYLESVEAKV
NRAKVSIEQFAVAIGDAFVKSGMLDGLRLFTNLMTGLTRHVQELGSTSVLIGTLAGTMSL
FSKNVRGGFEDARLSIANFIAEANDLESVTQKMKKNDGTVIERMVLEGNKGRIKDNQVGA
VSQLVMDESLEKYDMAASKAKAASTSTLAFADSQKTLTTQALLTSSALNTNNIKTTATAT
VSKVATVAVNGFKAAMRGLASATLVGAAIAGISFVLEKVISKFDSASNAAENYKMQQDTL
KQTIESMGGTGEIDKLIDRYTELENKMRSGKSFDDTEAAQYKETVSQIKNIFPDLVSSEG
QYGATLSANSNTLKERVELMKQQLEIEKENARIKNEADLRKQYDDSVKEAKNINNGGFWG
LGKNPETKLRERAGSVGTPNGNNNEIYQLQTRIDKVKSLEEAEKRQAEAQKLLAEARKNG
DQESISSLDRIISALDTYKSKKAQATATDNAAIDAQARLFTSQIEQIKTANYSIGDSGKA
ILISLSTSVREFAKSGEDAKNTFSTLNGLLTQDAGFASKMQEYEAALNSFKNAKNETERA
DRLPVLQAAYTKVAQAILDAARAANFSKEEQNKLKQSLETNIETETGYAASISKSGQVSI
DTAKKIDANTNSVDKNTVAKEDNAEASEKQAEANKQLANSLRETGDTHELLNNSLKELSE
GDLSWNNLTSLVEKYGEEVLGVFNNHEALTEFIKSKQDEETENFNANLQKKLDNSEAYYK
SVAGKGTELADHLMQTYGIDASNYNTLTELKAGITDVYNHGSAKQQEKLVNQIAQHYGVD
LSNYGTLGKKKDALEKAILQALGKKWAAHINELRRIADEAFADIPEAPKDTNSAEYADYI
EKSWNAAKAATDSTVANLTYSWQIGQTIDGAIDSIVGGDKVFKQAADSAGKLGSVAKDLG
NGLDKTGKGGNKASKGLGKAGKAMDKASKEADKLEKEAASAGVSVEKLYKTFTVTTYVAD
ELQMALDKVNFQLEKQKLNTQKYAVWSQKYRDSLKAENKLIDEKTKKLNEQIKSMQEQIK
AGQVIEYGLVNSDYNVPYLKFTANGLDGGKTASIGAVGSTTQEKVWNYLRGKGLSEHAVA
GIMGNIERESRFLPNAKEPNGTGIGLVQWSFGRADNLRNFAKRRGKSWADLNTQLDFLWQ
ELQTTERGALNALKASGSVIGAADAFQRKFERAGVVAQGQRNSAANRYYNQFKGTNGGSA
VKVSNAGQSIVAGWKKTAPFGHYYGTNTPHYGVDYASSVGSPIKASRGGIVLSSGWSNYG
GGNQVVIYNPKLNKTFTYMHMLSDLRVKKGQQVVAGQMIGRMGNTGNSTGPHLHFQVNEG
KGFTAAGTSFTGWNRAINPEPYLRIAGDNGKFDFRSTGNLDIPAGELSQAMVDSYNQAQE
QMLAEIEAGINEHNESEKMKQKVDELRKKLMDTQLELVRNMQAKKENLFNIHKSNIASFD
HSRELQAAKSAKYEYELNKIEFEQGRNSKEWRKKNEQLQTSKELEKGWEQDKIKYIDKVI
KQNKGGILGKQTAYRDELEKVKREAQQNVRDIASGIMRARGEIIASLIDQIIEDYTKDTE
KIQRSIDSIGKKKGHLDPANVDQAKTLVDLTTQQHKEATKLAEKTKFYITQLETQAKKVK
KNAELKKRLTNQIKDMKTAYDDATLSAHEFLKEAADVAIERQLTINARRLKEFQAELRKA
EYKNAFVNSEFQIDLFRDGQEKMLNGYAKEQQALEKNKKELEEQLKLYKKLPAQSEKIKD
SIEEITNALQENNKSLHNLRFELANSIINSMKSVYQKQLEVATKAYDDEYKEYEKLINKK
LKLIDEEAQQETFQKDVKEKTENLNKIRDEIAQRLGDDSLANQKKLKDLREQLRQGEEEY
EAYLRNKNREDRKQALQDELQDKNDQLTQQKEDLNKAFTDLLEDTRRFNSIQEELMAGQI
DKYKSMVEDLTKFVSDNMKDIGNSVGQNIIDGIDETFKNLLEVAQLLQKQDKGGNPVPNS
NLKPKPLSEATAAAIKQINAVAPSAILNGLQIKDIVKPKDIGKSTNVTTNNNTQAKSLVN
IENFNGSKKEVDDLVGTLENALRKKGTI
NT seq
8547 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggcaaatggatttaatattggaattttgtcaaccttagacgttgattcaagctcctct
cgtaagcaaataaacgaaacgattaaagaaatcgaaaagaatataaacaaggtttctgtt
gaatttgaagccagacaaactaaaggtgcttcaaatgatttaagaaaaagtgccaatagt
gttatagacagtttaaacaaatcaagtcaattgaggaaagttaaagttgacttagatgta
aacttaactcaaagtaagcaaaatattaaaaaagctatttcaacgctatctgatagctta
tcaaagaataaaattaaagttaatattgatgcaaatgtggatactaatgccgctcaaaaa
gctggtaagtcaatatcaacaaatgcacaaaaaggttttggcgcagtatcctccacgact
tctaaagggcaagctcaagaaattgaaaaaataaataattcgatgctacaactgcaaaaa
acttactcagatgtaagcaaattaagtagcgagctttctaacgtaagagataattcttta
cgtactgaaattaagtctatcaaagacgctaacggtgcattacaatcataccaagtcaat
ttacaaagagtaagcgaattaggaaaaacattaggcagagaaagctacaactacaaagca
aacgacgacggttcgttaagtttagaaaaaatagctaacttaaactctcaagaaaaagca
cgaaaattaactcatgattctatggttaaatctatggagcaagaagtaagtgctttagac
agaatggttgaaaaacaaaagttatctacttctcaagccgaaaagattaaaaatgcatat
agccagctaagccatttggctaaagaaaataaagtgattagcccagaacaattcactaaa
gctaaatctgaagcagacatattgcttaagaagtatacattacaaaacgagcaattgaaa
gagcaagaaaagattcaatcagcaatttcaaaagaacttgaaagaattaataaattagag
gctcaaggtaaaattagcaaaggtcaagcaaaggacgctactaataattatactgggcta
aaagaaagaataaatagtggcgacgttacaaaattatcaaccgagttcaacaaagtaaaa
caaagcgcagatggcttattacttggttattctcaacaaaataaattattaaatcaacaa
gtttcattgttagcacaaattgatagagcagaacgtcgtttaacaagtacgattgataaa
cgtgctacttcacagttaaaaggtcaactacaaaaccttaactcaaatggtagtggtaca
tttggaaaagaagcagcttttcaaatgtctcaaattcaaggacaagtcagaactattacg
gcagaagctgaacgtgctacaaggtcacagctaggttttgttgagtcgtttagacaagca
atgattaaattccctgtttggatgggtgctactactctgttttttggtgcgattagaagt
ggtcaaaacttcttatcaatcatctcagatattgactctaaaatggttactttatcaaaa
gtaatgaatgataatgctgatttagaatctgtattcttacgagctaatgatgcagcttta
caatatggtcaaactattagtaacgttttagatgtatatgcggagttcgctagacaaggt
tatgacgaagctgataccacagtatttggtaatgcagccttaatagcttccaatgttggt
gaaattgatgcaaaacaagcatcagaatatttaacgtcgatgtcggctcagtgggaaaca
tcagctactgacgctatgagacaagtcgactcgctcaaccaaatctcgaatgaatatgcg
actactgttgaaaaattagcacaaggtcaagcaaaagctggttctactgctaaatcaatg
gggctaacttttgacgagactaacgccattgttggtgctttaactgcaaagactaagcaa
tctggtgacgaaattggtaacttcttaaaagctgtattacctaaactttatgtaggcaca
ggtaaaaacactattactgatttgggaatcaatatgaaagattccaacggacagctgaaa
agtgcaattaccttattagaagaagtatcagaaaaaattaaaaatgttgataaagaccaa
caagctgctgtaatacgtggacttggtggaacgtaccattaccaacgtatgcaagtatta
ttagacgacttgtcgaaagcagactcactatacaaacagattaaaaacacatcagaaaac
tctgcgggttccgctattgccgagaaccagaaatatttagagtctgttgaagctaaggtc
aatagagctaaagtttcaattgaacaatttgcagttgctatcggcgatgcttttgttaaa
tctggaatgttagacggactaagattattcactaatttaatgactggtttaacaagacat
gtgcaagaattaggttcaacctcagtattaattggtacactagcaggaacgatgtcacta
ttctctaagaatgttagaggtggttttgaagacgccagacttagtattgctaacttcatt
gcagaagctaacgacttagagtcagttactcaaaaaatgaagaaaaatgatggcacagtt
attgagagaatggtgcttgaaggcaataaaggtagaattaaagataatcaagttggagca
gtgtctcaattagtgatggacgaatcacttgagaaatatgacatggcagcttctaaagca
aaagcagctagtacatctaccctagcttttgcggattcacaaaaaacattaaccacacaa
gccctactaacttcaagtgcattaaatactaacaatattaagacgacagctactgcaaca
gttagtaaagtagcaactgttgcggtgaatggatttaaagcagctatgcgtggattagct
tcagccactttagtcggtgcagcaattgctggtatatcgtttgtactggaaaaggttatc
tccaaatttgatagtgcttcaaatgccgctgagaattataaaatgcaacaagatacgctc
aaacagactatcgaaagtatgggcggtactggtgaaattgataaattaattgatagatat
acagaacttgagaacaaaatgcgttcgggtaaatcgtttgatgatactgaagcagctcaa
tataaagaaactgtatctcaaattaagaatatttttccggatttagtatcttctgaaggt
caatatggtgctactctatcagctaatagtaatacattaaaagagcgtgtcgagctcatg
aaacagcaacttgagattgagaaagaaaacgctcgtattaaaaatgaagctgatttacgt
aaacagtatgatgattcagttaaagaagctaagaatataaataatggcggtttttggggg
ctaggaaagaatccagaaacaaaattaagagaacgtgctggttcagtcgggacaccaaac
ggtaataataacgagatttatcaattacaaactagaatcgataaagttaaatctctagaa
gaagcagaaaaaagacaggcagaagcccaaaaacttttagctgaagcaagaaaaaatgga
gaccaagaaagtatttcttctcttgatagaattatcagtgctcttgatacgtataaaagt
aaaaaagctcaagctactgctactgacaatgcagcaattgacgcacaagctagactattt
acctctcaaatcgaacaaattaagacagctaattattctattggtgattctggaaaagca
atcctaatttctttaagcacatctgtacgagagtttgctaaatcgggtgaagatgcaaag
aacacattttctacattaaacggtttattaacacaagatgccggttttgcgagcaaaatg
caagaatatgaagctgcattaaatagttttaaaaatgccaaaaatgagacagaacgagca
gatagattgccagtattgcaagctgcttataccaaggtagcacaagcaatcttagacgct
gctagagctgccaatttttcaaaagaagagcaaaataagttaaaacaaagtttagaaact
aatattgaaactgagacgggttatgccgcatcaataagcaaatctggtcaagtttctatt
gacactgcaaagaaaattgatgctaatacaaattcggtggacaagaacacagttgcgaaa
gaagataatgcagaggctagtgagaagcaagcagaggctaataaacagcttgctaattca
ctaagagaaaccggagacactcatgagcttttaaataattcacttaaagaattatctgaa
ggcgatttgtcgtggaataatttaactagcttggttgaaaaatatggtgaagaagtttta
ggtgtatttaacaaccatgaagcattaactgagtttattaaatcaaagcaagatgaagaa
actgaaaatttcaatgctaacttacaaaagaagttggacaatagtgaagcgtattataag
tctgtagctggaaaaggtacagaactagctgaccatttaatgcaaacttacggaattgat
gcaagtaattataatactttaactgaattaaaagctggaattactgatgtatacaaccac
ggctctgcaaaacaacaagaaaaattagttaatcaaattgctcaacattacggcgtcgat
ttatcgaactacggaactttaggaaagaaaaaagacgctttagaaaaagctattttacaa
gctctaggtaagaaatgggcagcacatattaatgaattgcgtaggattgctgacgaagca
ttcgctgatattcctgaagcccctaaagatactaactccgcagaatacgctgattatatt
gaaaagagttggaatgctgctaaagccgctactgactcaacagttgctaacttaacttat
tcatggcaaattggacagactattgatggcgctattgatagtatagttggaggagacaaa
gtttttaaacaagcagctgactcagctggtaaattaggctcggtagcaaaagatttaggt
aatggtcttgataaaactggtaaaggtggaaacaaagcctccaaaggcttaggtaaagcc
ggaaaagcaatggacaaagcgtctaaagaagcagataagctcgaaaaagaagcagcttct
gccggtgtaagtgttgagaaactatacaagactttcactgttactacatatgtcgctgat
gaattgcaaatggctttagataaggtgaacttccaattagagaaacagaagctaaataca
caaaaatatgctgtttggtctcaaaaatatcgtgactcattgaaagcagaaaataagtta
attgacgagaaaactaagaaacttaatgaacaaatcaaatccatgcaagagcaaattaaa
gctggtcaagttattgagtatggactggtgaatagtgattacaatgtaccatatttgaaa
tttacagctaacggtttagatggtggtaaaacagcttcaattggcgctgttggctcaacc
actcaagagaaagtttggaattatttacgtggtaaaggattatctgaacatgcggttgcc
ggtattatgggtaacattgagcgtgagtcaagattcctacctaatgctaaagaacctaat
ggtacaggtatcggtttagtacaatggtcgtttggtcgtgctgataacctcagaaacttt
gcaaaaagacgtggtaaatcttgggctgacttgaatacacaattagatttcttatggcaa
gaattacaaacaacagaacgtggagcactaaatgcgttaaaagcatcaggttcggtcatt
ggcgctgccgatgcattccaacgtaaatttgaacgtgctggcgttgttgctcaaggacaa
cgtaattcggcggctaataggtactataatcagtttaaaggcactaatggtggaagtgct
gttaaagtttctaatgcaggacaaagcatagtcgctggttggaaaaaaacggcaccattc
ggacattattatggaactaatacacctcactacggtgtcgattatgcatctagtgtcggc
tcacctattaaagcctcacgtggtggtatagtgttatcatctggttggagtaactatggt
ggaggtaaccaagtagttatttataatcctaaattaaacaaaacttttacgtatatgcat
atgttaagtgatttacgtgttaaaaaaggtcaacaagttgtagctggtcaaatgattggt
agaatgggaaatactggtaattctacaggtccccacttgcacttccaagtcaacgaaggc
aaaggttttactgcagctggcacctcatttactggttggaacagagcaattaatccggag
ccgtatctaagaattgctggagacaacggaaaatttgattttagaagcactggtaatcta
gatatacctgctggcgagttatcacaagctatggtcgatagttataaccaagcgcaagaa
caaatgttagctgaaattgaagccggcattaacgaacataacgagtctgaaaaaatgaag
caaaaagttgatgagttacgtaaaaaactcatggatacacaacttgaattagtaagaaat
atgcaagccaaaaaagagaacttgtttaatattcataaatctaatattgcctctttcgac
cattctagagaactacaagcagctaaatcagctaaatatgaatatgagcttaacaaaatt
gagtttgaacaaggtcgcaacagtaaagaatggcgtaaaaagaatgagcaacttcaaact
tctaaagaattagaaaaaggttgggaacaagataagattaaatatatcgacaaagttatt
aaacagaataaaggcggtatattaggtaaacagacagcttacagagacgaattggagaaa
gttaaacgagaagctcagcaaaacgtaagagatattgcttcaggtatcatgcgtgcccgt
ggtgaaattattgcttcattaattgaccaaattattgaggattacactaaagatacggaa
aagatacaaagaagtattgactcaattggtaagaagaaaggtcatcttgacccagctaac
gtagaccaagccaaaactttagttgatttaaccactcaacaacacaaagaagcaactaaa
cttgctgagaaaacaaaattctacataactcaactggaaacacaagctaagaaagttaag
aaaaatgcagaacttaagaaacgtttaactaatcaaatcaaagatatgaagacagcttat
gatgacgctaccctctcggctcatgagttcttaaaagaagcagctgacgtagcaatcgag
cgccaattaactatcaatgctcgtaggttaaaagaatttcaagctgaactaagaaaagct
gaatataaaaatgcatttgtaaactcagagttccaaattgatttatttagagacggtcaa
gaaaaaatgcttaacggctatgccaaagagcaacaagcattagagaagaacaaaaaggaa
ctcgaggaacaattaaagttgtacaagaagttaccagctcagtctgaaaagattaaagat
tcaattgaagaaattactaatgctcttcaagagaacaataagtcattacacaacctaaga
tttgagttagcaaacagtattatcaactcaatgaaatctgtttatcaaaaacaattagaa
gttgctaccaaagcgtatgatgacgagtataaagaatacgaaaaattaattaataagaaa
ttaaaattaattgatgaagaagcacaacaagaaacattccaaaaagatgttaaggagaaa
acagaaaatctcaacaaaattagagatgagattgcacaacgtcttggtgatgatagttta
gctaaccagaagaaacttaaagacttacgtgaacaactcagacaaggtgaagaagaatat
gaagcctatttgagaaacaagaatcgagaagaccgcaaacaagcgttgcaagatgaactt
caagacaaaaacgaccaattaacacagcagaaagaagatttaaataaagcgtttactgac
ttattagaagacacaagaagattcaatagtatacaagaagagcttatggctggtcagatt
gataagtataaatcaatggttgaagatttaactaaatttgtttctgacaatatgaaagat
attggtaattcagtgggacaaaatattatcgatggtattgatgagacgtttaaaaacttg
ttggaagttgcacaattactacaaaaacaagataaaggcggcaatccagtacctaattca
aaccttaaacctaagcctttaagtgaagctactgccgcagctatcaagcaaattaacgca
gtagcgccttcagcaatcctcaatggactacagattaaagatattgttaaacctaaagac
attgggaaatcaactaatgttactacaaacaataatactcaagccaagtcattagttaat
atcgagaacttcaatggaagcaaaaaagaagttgatgatttagtaggcacattagaaaac
gcattaagaaaaaaaggaacgatttaa
DBGET
integrated database retrieval system