Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis GGS_124: SDEG_0401
Help
Entry
SDEG_0401 CDS
T00932
Symbol
snf
Name
(GenBank) SWF/SNF family helicase
Organism
sds
Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis GGS_124
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2_assoc
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
SWIM
AAA_14
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAH80903
LinkDB
All DBs
Position
1:376615..379713
Genome browser
AA seq
1032 aa
AA seq
DB search
MDMARLIPGRIRNEGIELYEQGLVRILDDHEGLLQAEVGPYHVQYGADDEDVTCQCDVFE
ARQYCKHIAAVEYFLKNDEEGKRFSEQLSDQTEHKAETQKMTSFGSLFLDSLAMNDDDTI
KYRLSTLGSRSPFSSDYWWSLKINRLPDDRSYVIRDIKGFLQLVKKEGFYQIGKNYFEQL
SWLQFDQPSQELIDFLWRLSSDTDKGEQDNVFPNHGRHLRLPSGFFEEGIHLLTGLYDFS
FEGPSQTYHHLFVRPLDAEAGLYHFKVEVHRQSIELQITEKNVQYFFDNAYLLYQDTFYH
LSLKQAKMVQAIRSLPINADLAKHIHFHLDDQAKLAASLLEFKQIGSVEAPKSFTIRDFD
VTFQFDLVGQDEISCQLLFDYGHYQVTDKATLDQLPFASNYKKEEKINRSLRAFGFSPQF
YSKKRLSSKAELYAFFTEMVPYVERIGTVVLSSSLEGLRSKERPQIAIERKGGLLDISFD
FSTIVEDDIDDALTALFQNNSYFVSQSGQLVVFDEETQKVSHSLRELRAKHLKNGHMQLD
GIAALQVSQLFEGMSSVHLSKELEELVHHLQHPETFAIKPLSVQAQVRDYQRQGIQWLSM
LDHYGFGGILADDMGLGKTLQTIAFLSSQLKPDSKVLILSPSSLIYNWLDECQKFTPQLD
AVVSYGLKQVRDHLIEEGHQITITSYSSFRQDFETYQAFEYDYLILDEAQVIKNAQTKIA
QCLRAFNAKNCFALSGTPIENKLLEIWSIFQIVLPGLLPAKKEFLKMTAKQVSRYIKPFI
MRRKKEDVLPELPNLIEMTYPNEMTDSQKAIYLAQLRQMQDQIRTASDADINRRKIEILS
GITRLRQICDTPSLFMDYDGESGKLESLRTLLLQIKENGHRALIFSQFRGMLDLAKQEMD
ALGLTAYQMTGSTPANERQEMTRAFNNGSKDAFLISLKAGGVGLNLTGADTVVLIDLWWN
PAVEMQAISRAHRIGQEDNVEVYRLITRGTIEEKILELQESKRNLVTTVLDGNESRANMS
IEEIKEILGLEI
NT seq
3099 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatatggctagattaattccaggacggatacggaatgaaggtatagagctctatgaa
caaggtttagtcagaatactagacgatcatgagggacttctacaagctgaagtagggccc
tatcacgttcaatatggggctgatgatgaggacgtaacttgccaatgtgatgtgtttgag
gcgagacagtattgtaaacatattgcagcagtggagtactttttaaaaaatgatgaggaa
ggcaaacgattttcagagcaactgagtgatcaaaccgaacataaggcagagacgcaaaaa
atgacctcttttggaagtctctttttggatagtctagcaatgaacgacgatgataccatt
aaataccgcttatcaaccttaggaagtcgtagtcctttttcgtcagattactggtggagt
ttgaaaattaaccgtttgccagatgaccgttcttatgtgattcgagacatcaaaggcttt
ttgcaattggtcaaaaaggaagggttttatcagattggtaaaaactattttgaacagctg
tcttggttacaatttgatcagccaagtcaagaattaatcgactttttatggcggttgtct
tctgatacagataaaggggagcaagataatgtctttcctaatcatggaagacatttacgc
ctacctagtggcttttttgaggaaggtatccacctactaacaggtctttacgatttcagt
tttgagggaccttctcaaacctatcatcatctgtttgttcgtcctttagatgcagaagca
gggctttaccattttaaggtagaagtgcatcgacaatcgattgagttgcaaattaccgaa
aaaaatgtgcaatattttttcgacaatgcttatctgctttaccaagatactttctatcac
ctatctttaaaacaagcgaaaatggttcaagctattcgtagtctaccaattaatgctgat
ttggcaaaacacattcattttcacttagatgaccaggctaaactggctgctagtttatta
gagtttaagcaaattggaagtgtagaggctcctaagagttttaccattcgtgattttgac
gtgactttccagtttgacttagttggacaggatgaaataagttgtcaactgctcttcgac
tacgggcattaccaggtgactgataaggcaactttggatcagcttccctttgctagtaat
tacaaaaaagaagagaaaatcaatcgttctttgagggcctttggcttttccccgcagttt
tattctaaaaaacggttatctagtaaagcagaactttatgcctttttcacggaaatggtt
ccatatgttgaacgtatagggacagtagtgttaagttcatcattagaaggattaaggtct
aaggaaaggcctcagattgctattgagcgcaagggaggattattggatatttcctttgat
ttttcgacaatcgtggaagatgatatcgatgatgccctaactgccctttttcaaaataat
tcttatttcgtgagccaatcggggcagctcgttgtttttgatgaggagacgcaaaaggtt
agtcacagtttacgagaattaagagcaaaacatctcaaaaatgggcatatgcaactggat
ggcattgctgccttacaagtgtcacaactttttgaagggatgtcttcagtacacctttcg
aaagagttagaagaattggtgcatcatttgcaacatccggaaacgtttgctatcaaaccg
ctatcggtacaagctcaggtaagagattaccaaagacaagggattcagtggttatcgatg
ttagaccattatggatttggaggcatcttagccgatgatatgggacttggaaaaacctta
caaaccatagctttcttatctagtcagctgaaaccagatagtaaagtattgattctatcg
ccttcaagccttatttataattggttggatgaatgccaaaaattcactcctcagttagac
gctgtggtttcctatggcttgaagcaagtcagagatcaccttattgaagaaggccaccag
attacgattacaagctattcttcttttagacaagactttgagacttatcaagccttcgag
tacgattatttgattttggatgaagcgcaagtgattaagaatgctcagacaaaaattgcg
caatgtttgcgtgcttttaatgccaaaaattgctttgctttatcagggacaccgattgaa
aataaattgctggaaatttggtccatttttcaaattgttttaccaggtcttcttcctgcc
aaaaaagagtttttaaaaatgacggccaagcaggtatcgcgatatatcaagccctttatt
atgcgtcgtaaaaaagaagacgtcttaccagaattacctaacctgattgaaatgacttat
ccaaatgaaatgacggatagccaaaaagcaatctacttagcacagctaaggcaaatgcag
gatcagattcgaactgccagcgatgcagatattaaccgtcgtaaaattgaaattttgtca
gggattacgcgattgaggcagatttgtgatactccaagtctctttatggattacgatggg
gaaagtggtaagttagagagtttgcgaactttgttactacaaatcaaggaaaacgggcac
cgcgccttgattttctctcaatttaggggaatgttggacttagctaagcaggagatggat
gctttaggtctcacggcctaccaaatgacaggatcaacccctgctaatgagcgccaagaa
atgacaagagcctttaataacggttctaaagatgcctttttgatttctcttaaagcagga
ggggttggactcaatttaacaggagcagacacagtggtgttaattgacctatggtggaat
cctgccgttgaaatgcaagctatcagtcgcgcacatcggattgggcaagaagataacgta
gaagtttatcgcctaatcactcgaggtaccattgaagaaaagatcttagaattacaagaa
agcaaacgcaatctggtaacaactgtcttggatgggaatgaaagccgtgcaaacatgtct
attgaagaaattaaagagattctaggtttagaaatctag
DBGET
integrated database retrieval system