Staphylococcus edaphicus: MNY58_00405
Help
Entry
MNY58_00405 CDS
T09108
Name
(GenBank) Ig-like domain-containing protein
Organism
seda
Staphylococcus edaphicus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_8
YSIRK_signal
Gram_pos_anchor
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UQW81621
LinkDB
All DBs
Position
91667..98329
Genome browser
AA seq
2220 aa
AA seq
DB search
MKRLDFLNNRKNRYSIRRFTVGTASILIGALLFLGQPSEEVEAEEQKSDHLNHIEQINNQ
TDTSQEDITTNENNGATDSHTQQMQESDSEVAKESDDSQANTSVNKENNNSESNSEVEDS
YNEQKDETQQDEIDYHARPDEEKQSEIDNSDKPEATKQSETENNTTNHQQQDIKESTASN
QENEAVKKEQDTNEQRDDETKQTNDSEDKESAAKYVDKNTSPNNDAKYNTEENDNGNNQD
RKSIDQTQNTDEQQLRNASDVQNKVNTPTDSNRSTTVDKSNSSDSKVVEDAFKETDLSPK
EQAQIKQDLPSNIDELSESEVKEAIVYAALKNMKDTELPKTTARSLVNTNTRFRSVVTRA
AINTSKNVNNLVTASNLRTEVKNPDGSTAAVKPTYGGTLVLKGNYTVDDKVKAGDTFTVD
FGKNIVPGALYQEDGRAAPAILSPSGETIAVGKYNASTNSFDYIFNDYVNKYNNVKGSFE
FSMSPNRKTAPSNGTYNNAISFAGEQLNHNYTVDYKNYSNEKNITRSAITSFSPVDGSYT
RVSYVNPQLSKAGAGAFTATLTQTNATLDNVKIYKVPSNMKSAFTDSFVPNLTGLQDVTS
QITRLNLDANTTQLKFTTANNRQNTGYIIVTEGTGSKDGNIQLTTIAGKSVSNTINWVKS
SANGYGDFSSVSESASISSSESLSTSKSLSTSESLSTSQSLSESESHSISQSLSESESLS
TSESISESESLSASESISESESLSTSESVSESESLSTSESISESESLSTSESISESESLS
TSESISESESLSTSESISESESQSTSESISESESLSASESISESESLSTSESISESESLS
TSESISESESLSTSESISESESLSTSESISESESLSTSESISESESLSTSESISESESLS
TSESISESESLSTSESISESESLSASESISESESLSTSESISESESLSTSESISESESLS
TSESISESESLSTSESISESESLSTSESISESESLSTSESISESESLSTSESMSESESLS
TSESISESESLSTSESISESESLSTSESISESESLNTSESISESESLSTSESISESESLS
TSESISESESLSTSESISESESLSTSESISESESLSTSESISESELLSTSESISESESLS
TSESISESESLSTSESVSESESLSTSESISESESLSTSESISESESLSTSESISESESLS
TSESISESETLSTSESISESESLSTSESISESESLSTSESVSESESQSTSESISESESIS
ESESLSTSESISESESLSTSESISESESLSTSESISESESLSTSESISESESLSTSESIS
ESESLSTSESISESESQSTSESISESESLSTSESISESESLSTSESVSESESQSTSESIS
ESESLSSSESVSESESLSESESISESESLSTSESISESESQSTSESISESESLSTSESIS
ESESLSTSESVSESESESLSTSESLSTSESISESESLSTSESISESESLSTSESISESES
LSTSESISESESLSTSESISESESLSTSESVSESESLSTSESISESESLSTSESISESES
QSTSESISESESLSTSESISESESLSTSESISESESLSTSESISESESLSTSESESLSTS
ESISESESLSTSESISESESLSTSESISESESLSTSESISESESLSTSESISESESLSTS
ESISESESLSTSESISESESLSTSESVSESESLSTSESVSESESLSTSESVSENESLSTS
ESISESELLSTSESISESESLSTSESISESESLSTSESISESESLSTSESISESESLSTS
ESISESESLRASKSISESESLSTSESISESESLSTSESVSESESQSTSESISESESLSTS
ESISESESLSTSESISESESLSTSESISESESLSTSESISESESQSTSESISESESLSTS
ESISESESLSTSESISESESLSTSESISESKSLSTSESINESESLSTSESISESESLSTS
ESISESELLSTSESISESESLSISESISESESLSISESISESESLSTSESISESESLSTS
ESISESESLSTSESISESESLSTSESVSESESLSTSESISESESLSTSESISESESLSTS
ESISESESLSTSESISESESLSTSESISESESLSTSESMSESESQSTSEPMSESESANID
DQMNEDLNKDKETAKDKSSDKKALPNTGNDDANKGLIAGLFGLSGLALLRRRRINGDSKE
NT seq
6663 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagattagattttttgaataacagaaaaaatagatattctatcagacgttttact
gtgggaacagcatctattttaataggagcgcttttgtttttagggcagccgtcggaagaa
gttgaagcagaagaacaaaaaagtgaccacttaaatcacattgaacaaattaacaatcaa
acggataccagtcaagaagacataacaactaatgaaaataacggagctaccgattcacat
actcaacaaatgcaagagtcagatagtgaggtagctaaggaatcagatgattcacaagca
aatacatctgtaaataaagaaaacaataattcagaatcaaatagtgaagtagaagacagt
tataatgagcagaaagatgaaacgcaacaagatgaaatcgattatcatgctagacctgat
gaagagaaacaaagtgaaattgataatagtgataaacctgaagcaacaaagcaaagcgaa
acagagaataacacgactaatcatcaacaacaggatataaaagaatcaactgcaagcaat
caggaaaatgaagctgttaaaaaagagcaagatacgaatgaacaacgtgacgatgaaaca
aagcaaacgaatgattctgaggataaagaatcggcagcgaagtatgttgacaagaacaca
tcaccgaataatgatgcaaagtacaatacggaagaaaatgataatggcaataatcaagat
agaaaaagcattgatcagacacaaaatactgatgaacagcaattacgtaacgcatcggac
gttcaaaataaagtaaacacgcctaccgatagtaatcgttctactacagtagacaaatca
aattcaagtgatagtaaagttgttgaggatgcttttaaagaaacagatttaagtccgaaa
gaacaagcacaaatcaaacaggacttgccatcaaatatcgatgaattatctgaatcagaa
gtaaaggaagcgatagtttacgctgcattaaaaaatatgaaagatactgaactaccaaaa
acaacggcgaggagtttagtaaataccaacactagatttagaagtgttgttacaagagct
gctataaatacaagtaaaaatgtaaacaatcttgtcacagcatctaatctcagaacagaa
gttaaaaaccctgatggaagcactgcagcagttaagcctacatacggtggtacattagta
ttaaaaggtaactacacagttgatgataaggtgaaagcaggagacacgtttaccgttgat
ttcggaaagaatattgtaccaggtgctttatatcaagaagatggtagagcagcaccggct
attttaagtcctagtggggaaacgattgccgttggtaagtataatgcttctacaaatagc
tttgattatatatttaatgactatgtcaacaaatataataacgttaaaggttcatttgaa
ttctctatgtcacccaatagaaagactgcaccatcaaatggtacatataataatgcaatt
agttttgcaggtgaacaattaaatcacaactatactgttgattataagaattatagtaat
gaaaaaaacataacaaggtcagcgattacttcttttagtccggttgatggtagttacaca
cgtgtttcatatgttaatccacaattaagtaaagcgggtgcaggagcttttacagcaacg
ctaactcagacgaatgcaacgttagataatgtgaagatatataaagtgccaagtaatatg
aaaagcgcttttacagattcattcgtaccgaatttaaccggtttacaagatgttactagc
caaataacacgccttaatttagatgctaatactacacaattaaaattcactacagcaaat
aatagacaaaatactggctatattattgttacagaaggaactggatcaaaagatggtaat
atacaattaacaacaattgccggcaaatcagtgagtaatacaataaattgggtgaaaagt
tccgcaaatggttatggagatttttcatccgtaagtgaaagtgcatcgattagttcttcg
gagtcgttgagcacatcaaaatcattaagtacaagtgaatcgttgagtacatcgcaatca
ttaagtgaaagtgagtcacatagcatatcgcagtcattaagcgaaagtgagtcactaagc
acttcagagtcaatcagcgagagcgaatcattaagcgcttctgaatcaatcagcgagagc
gaatcactaagtacatcagaatcagtaagtgagagcgaatcattgagtacttctgaatca
atcagtgagagtgaatcattgagcacttctgaatcaatcagcgagtcagaatcattgagc
acatcggaatcaattagtgaaagtgaatcattgagcacatctgaatctattagtgagtca
gaatcacaaagtacatcagagtcaatcagtgagagtgaatcattgagcgcttctgaatct
attagtgaaagtgagtcattaagcacttcggaatcgattagtgagagcgaatcattaagc
acttcagagtcaatcagcgaaagcgaatcactaagtacatcagaatcaattagcgaaagc
gaatcattgagtacttctgaatctattagtgaaagtgagtcactaagtacttcagaatca
atcagtgagtcagagtctctaagcacatcagaatcaatcagtgaaagtgagtcactaagt
acttctgagtcaatcagtgagagcgaatcattaagtacttctgagtcaatcagcgagagc
gaatcattaagcgcttctgaatcaatcagcgagagcgaatcattaagtacttcagaatct
atcagcgagtcagagtcattgagcacttcggaatcaataagtgaatcagaatcattaagc
acatccgaatcaatcagtgagagcgaatcattgagtacatcagagtcaataagtgaaagc
gagtcactaagtacatcagagtcaataagtgaaagtgagtcattaagcacatccgaatca
atcagtgagagcgaatcattgagtacatcagagtcaatgagtgaaagcgagtcattaagt
acatcagaatccatcagtgaaagcgaatcattaagcacttcggaatcgattagtgagagt
gaatcattgagtacatcagagtctattagtgagagcgagtcattaaacacttcggaatcg
attagtgagagtgaatcattaagcacatcagagtctattagcgaatcagagtcattaagc
acgtccgaatcgattagtgagagtgaatcattaagtacatccgaatcaatcagtgaaagc
gaatcattgagcacatccgaatcaataagtgaaagtgaatcattaagcacgtccgaatcg
attagtgagagtgagttactaagtacatccgaatcaatcagtgagagcgaatcattgagc
acatccgagtcaatcagtgagagcgaatcgttaagtacatctgaatcagtaagtgagagt
gaatcattgagcacatccgaatcaatcagtgaaagtgaatcattgagtacatcagagtct
attagtgagagtgagtcattaagcacatccgagtcaatcagtgagagcgaatcattaagc
acttctgaatcaatcagtgaaagtgagacattaagcacttcggaatcgattagtgagagt
gaatcattgagtacatcagaatctattagtgaaagtgagtcactaagcacatcagaatca
gttagtgagtcagaatcacaaagtacttcggaatcaatcagcgagagtgaatcaattagc
gaatcagaatcgttaagcacatcagaatcaatcagtgaaagtgagtcattaagcacttcg
gaatcgattagtgagagtgaatcactaagcacatcagaatcaatcagtgaaagtgaatca
ttaagcacatccgagtcaatcagtgagagcgaatcgttaagtacatcagagtcaatcagc
gaaagcgaatcattaagtacgtcagaatcgattagtgagagcgaatcacaaagtacatca
gagtcaattagcgaaagtgaatcattgagtacatcagaatctattagtgaaagtgagtca
ctaagcacatcagaatcagttagtgagtcagaatcacaaagtacatctgaatcaatcagc
gagagtgaatcattaagttcttctgaatcagtaagtgaaagcgaatcattaagtgaatca
gagtcaatcagtgagagtgaatcgttaagcacgtcagaatcgattagtgagagtgaatca
caaagcacatctgaatcaattagcgaatcagaatcgttaagtacttcagagtcaatcagt
gaaagtgagtcactaagtacctcagaatcagtaagtgagagcgaatcagaatcgttaagt
acatctgaatcgttaagtacttcggaatcaatcagtgagagtgagtcattgagtacctca
gagtcaatcagcgaaagtgagtcactaagcacatcagaatcaataagcgaatcagaatca
ttgagcacttctgaatcaatcagtgaaagtgagtcgttgagcacttctgaatcaatcagt
gaaagtgagtcgttgagcacatcagaatcagtaagtgagagtgaatcactaagcacttca
gagtcaatcagtgagagtgaatcattaagtacatcagagtctattagtgagagtgaatca
caaagtacatcagaatcgatcagtgaaagcgagtcgttaagtacatcagagtcaattagc
gaaagtgaatcattgagcacatcagaatcaattagcgaaagcgaatcattaagcacttct
gaatctatcagcgagtcagaatcattgagcacatcagagtcagaatcattgagcacatca
gaatctattagtgagtcagaatcgttaagtacatctgaatcaatcagtgagagcgaatca
ttgagtacttcggaatccataagtgaaagtgaatcattgagtacctcagagtctattagt
gagagcgaatcattaagtacttcagaatcaatcagcgagtcagagtcattaagcacatcc
gaatctattagtgagagtgagtcactaagcacttctgaatcaataagtgaaagtgagtca
ttaagtacttctgaatcagtaagtgaaagtgaatcattgagcacatctgaatcagtaagt
gagagtgaatcattgagcacatccgaatcagtaagtgagaacgaatcattaagcacgtcc
gaatcaataagtgaaagtgagttattaagcacttcggaatcgattagtgagagtgaatcg
ttaagtacttctgagtcaatcagtgagagcgaatcgttgagcacatcagaatccataagt
gaaagtgaatcattgagtacatcagaatcaatcagtgagagcgaatcattaagtacttcg
gaatcaatcagtgagagtgagtcattaagagcttctaaatcaataagtgaaagtgaatcg
ttaagtacttctgagtcaatcagcgagagtgagtcactaagtacttcagaatcagtaagc
gaaagtgaatcacaaagtacgtctgaatcgatcagtgaaagcgagtcattaagtacatca
gagtcaatcagcgagagcgaatcattaagtacatccgaatcaatcagcgaaagcgaatca
ctaagtacttcggaatcgatcagtgagagcgaatcattgagtacttcagaatcaatcagc
gaatcagaatcacaaagtacatcagaatcaatcagtgaaagtgaatcattgagtacatca
gagtctattagtgagagcgaatcattaagcacatccgaatcaatcagtgagtcagaatca
ctaagtacttcggaatcgattagtgagagtaagtcattaagcacttcggaatctatcaac
gagtcagaatcattgagcacatcagaatcaatcagtgaaagtgagtcactaagtacatca
gagtcaatcagtgaaagtgagttattgagcacttcagagtcaatcagtgagagcgaatca
ttaagcatttcagagtcaatcagtgagagcgaatcattaagcatttcagagtcaattagc
gagagcgaatcactaagcacatcagagtcaatcagtgagtcagaatcattgagtacatca
gaatcaattagcgagtcagaatcattgagcacatcagaatcgattagcgagagtgaatca
ttaagtacatccgaatcagtaagtgaaagcgagtcattgagtacttcagagtcaatcagc
gagagcgaatcgttaagtacgtctgaatcaattagcgaaagtgaatcattgagcacatca
gaatcaataagtgagagcgaatcattaagcacatcagagtcaatcagcgaaagcgaatca
cttagtacttcagaatcaataagtgagagcgaatcgttaagtacatcagagtcaatgagc
gagagtgaatcacaaagtacttctgaacctatgagtgaatcagaatcagctaatattgat
gaccagatgaatgaggatcttaataaagacaaagaaactgcaaaagataaatcatcagac
aagaaagctttacctaatacaggtaatgatgatgcgaataaaggcttaatagcaggatta
tttggactgagtggcttagctttattaagaagacgtagaattaacggtgattctaaagag
taa
DBGET
integrated database retrieval system
