Sediminibacterium planctonicum: TEGAF0_25780
Help
Entry
TEGAF0_25780 CDS
T08564
Symbol
wbpM
Name
(GenBank) polysaccharide biosynthesis protein CapD
Organism
sedt
Sediminibacterium planctonicum
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Polysacc_synt_2
Epimerase
GDP_Man_Dehyd
RmlD_sub_bind
3Beta_HSD
C2185-like_N
CoA_binding_3
adh_short
NAD_binding_4
CoA_binding
NAD_binding_10
KR
Oxidored_nitro
UDPG_MGDP_dh_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDQ13361
LinkDB
All DBs
Position
2923713..2925674
Genome browser
AA seq
653 aa
AA seq
DB search
MSLLFKRYKLRKIKNLSIIPRWVIFILDMLVSLFCFLLAYLIKNEFDFSFIEKGQFTQNL
MILLAFNVSLFSLFKVYSGIIRFTGLQDAFRIFFVVFFANVGYYLLDLFMQQWYQFKLIP
TSVLVINMLLSFVALSSYRVFVKYFFSYITTFNVTKKRVAIFGAGDVGISTKRALEHDMT
ANIQMVLFIEDDQRKVGKNIDGIKIYSSTQLESLLKQYLVDELIIATTKLASKRKNEIVD
YCLDNKIEVFTVPPLKSWINGQLSTKQLQNVKIEDLLEREQIKIYNEILFKQLNNKIVLV
TGAAGSIGSEIVRQLLGYKPKLLVLNDHAETPLHDLKLELEELGCSNFKLALGDIRNELF
IDKIFLDWKPDFVYHAAAYKHVPMMEDSPLEAICTNVGGTKLLADLSIKYGVERFVMIST
DKAVNPTNVMGASKRIAEMYVQSLYQNQEIQFQKDLNTTRTKFITTRFGNVLGSNGSVIP
RFKKQIEAGGPVTVTHPDITRYFMTIPEACQLVLEAGSMGNGGEIFVFDMGQPVKIADLA
RKMIRLSGLEPEDDIKIEYSGLRPGEKLYEELLNNAENTMATYHEKILIAKTRTLEYESL
SLQIEALIRPAKNQESVVEVVAAMKALVPEFISNNSEFEKLDAPRVINMNKAG
NT seq
1962 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcattattgttcaaaaggtataagctaagaaaaataaaaaatttatctatcattcct
agatgggttatttttattttagatatgttagtaagtttattttgttttttgcttgcatat
ttaataaaaaatgaatttgattttagcttcatagagaaaggccaatttactcagaactta
atgatattactagcttttaatgtctctctattttcacttttcaaggtctattcaggaatt
atacgttttacaggactgcaggatgccttcagaattttttttgttgtcttttttgctaat
gtaggttattatttgttggatctctttatgcaacaatggtatcaatttaaattgataccc
acttcagttttagttattaacatgttactttcttttgttgctttaagtagctatagagtt
tttgtaaaatattttttctcttatattactacttttaatgtaactaaaaagagggttgca
atttttggagccggcgacgtgggtatatctaccaaacgggcattagaacatgatatgaca
gccaatattcaaatggtcctctttatcgaagatgatcagcgtaaagtgggtaagaatatt
gatggaataaagatttattcatcaacccagcttgaaagtttattaaaacaatatttggta
gatgagttaattattgcaacaactaaattggcttccaagcggaagaatgaaattgtagat
tattgtctggataataaaattgaagtttttacagttccccccttaaaaagctggataaat
ggtcaactaagtaccaagcaattacagaatgttaaaattgaagatttactcgaaagggaa
cagattaaaatttataatgaaatattgtttaagcaattaaacaataaaatagttttggtg
acgggggctgctggttctataggcagtgaaattgtacgccagttgctgggatacaaacca
aagttattagtgttaaatgaccatgctgaaacaccattgcacgatttgaaattagaattg
gaagaattggggtgtagtaattttaaattagcgttgggtgatattcgaaacgaattattt
attgataagattttcttagattggaaacctgattttgtgtatcatgctgcagcatataag
catgtacctatgatggaagatagcccattagaagctatttgcaccaatgtaggaggaacg
aaattattggcggatttatctattaaatatggagtggagaggtttgttatgatctctact
gataaagcggtgaatcctacaaatgtgatgggggcttccaaaaggattgcggaaatgtat
gttcagagtttatatcaaaatcaagaaattcaatttcagaaggatttaaatacaaccaga
actaaattcatcactacccgtttcggaaatgttctaggctccaatggctccgtaattcct
cgttttaaaaagcaaattgaagctggtggcccagtcacggttacacatcccgatatcact
cgttatttcatgaccatacccgaagcctgtcagttggtattggaagccggttctatgggt
aatgggggagaaatcttcgtatttgatatggggcagcctgtaaaaatcgcagatttagct
cgtaaaatgatcaggctatctggattagagcctgaggatgatatcaaaattgaatacagt
ggccttcgtccaggtgaaaaactctatgaagagttattgaataatgctgagaatacaatg
gcgacttatcatgaaaaaattctaattgcaaagactagaaccttagagtatgaaagtttg
tccttacaaattgaagcattgatcaggccagctaaaaatcaggagtcagtagttgaagtt
gtggcagctatgaaagcactagtacctgaatttattagcaataattctgaatttgaaaaa
ttagatgcccctagagtgataaatatgaacaaagcgggctaa
DBGET
integrated database retrieval system
