Sedimentibacter sp. zth1: JYG23_08605
Help
Entry
JYG23_08605 CDS
T07110
Name
(GenBank) sigma 54-interacting transcriptional regulator
Organism
sedz
Sedimentibacter sp. zth1
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Sigma54_activat
Sigma54_activ_2
AAA_2
AAA_5
GAF_2
HTH_50
HTH_8
ATPase
nSTAND3
Mg_chelatase
PAS
HTH_7
PAS_8
SpoVT_C
AAA
HTH_29
HTH_22
DUF1492
AAA_16
HTH_Tnp_1_2
HTH_28
HTH_23
HTH_AraC
AAA_22
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QSX04767
UniProt:
A0A974X7W2
LinkDB
All DBs
Position
1728843..1730642
Genome browser
AA seq
599 aa
AA seq
DB search
MKLTNIQDNVQKNADAIASVLGVDVTVTDNNLFRIAGTGKYNNHIGEQVTNDGVFAHCLV
NCVPYVVRNPKEDKVCKSCSKKNCDEYAEIVSPIIYDKRVYGIIGLIAFNEEQKRVLLGN
EKNIIAFLNKMANLIVSQIIDKEKSNEIKLLISQLQTVINLMDSSVIITDSRGNINYYNK
KANNLFHISSYNHKHIDKILLNVDIDSVFKYKKKFTNKDFSYKNNDLYLRGIINSKIYYS
DANKNIESVVFFIEELSQFISSARNIISTNIVTEFDNIKYVSEKMQNVVNHAKKASRTDS
TVLITGESGTGKEVFARALHYDSNRKKEPFVAINCSAIPENLFESELFGYEEGAYTGALK
GGHPGKFELAHKGTLLLDEIGDMPLNLQPKLLRVLQDSKVMRIGGNRYIDVDVRIIASTN
CNLEKKVQNKEFREDLFYRLNVIPILLPPLRDRPEDITLLANFFTNKYSSKLNKSVMRIN
EDALDLIKKYPWYGNVRELENALEYAVNMSDKTYIDIDSLPIKIKNFSSFSCCSNHLYSE
NIYTIDELERNEIKKAIKIYGFSTNSVNIICKKLGISRATFYRKVKKYNIISNQILIND
NT seq
1800 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system
