KEGG   Sedimentibacter sp. zth1: JYG23_11080
Entry
JYG23_11080       CDS       T07110                                 
Name
(GenBank) SNF2 helicase associated domain-containing protein
Organism
sedz  Sedimentibacter sp. zth1
SSDB
Motif
Pfam: SNF2_assoc SNF2-rel_dom Helicase_C DEAD ERCC3_RAD25_C SWIM
Other DBs
NCBI-ProteinID: QSX05217
LinkDB
Position
complement(2293270..2296581)
AA seq 1103 aa
MVKKIKNNFLFNMKINFNLSSIKLRAFDSNEFMRGLELFDSAHVSNMSIFKIFDDESLED
IIKIKAKVKNQDLDNQIVEIKIDMHGDIIKYGCGCQNHLQHKYTFCKHIIAVLLFLYNNN
KSADIRNKPLYNLIESDYINLVKLYEEKLSNKSYIDNNNSTISLIPKIYTNSQGFLELSF
NISKDDKAYVVKDVFALAENIKSSSSYRYGKSFVINHNIDNFDELSKSLAKFIVNLCYDY
LDMYGYNTENIPSKKNIKIPNSQLDLLFDLLENKSVIFIHNNESNKIKFLNQNPVVNFYL
EKNSKTNKYDFCIENFFENKIFIYKFLNKAYIIHDEFFYKCDSTFIDNVLPAIEKIKATN
NLSIPILQDNLSKFYSTVLSTLNKFTSVRIPEDISDMLIINPLVAKIYLDTNTSNAIILD
YVFNYDNVDINPFVENIKKNTKEIIIRDLKGELNITSFIKNCGFVQKNKKYILTNENSIY
NFVTDGVNKLIKMCEVNVSESFGKIKVKTPKTISMGVKLANNLIELDLNNLEFSLSDLKN
ILSQYKVKKKYFRLKDGSFLNLDDDYFDTIQSLSDDLDIINSKHDDNTVLLPKFRSINIE
DLLSKNEIINAHKNSDFVNIVKNLGAHKDFDFEIPNSLENILRNYQKTGFKWLKTLAFYG
LGGILADDMGLGKTLQIIALLLSEKNNNLPSIVVCPTSLIYNWINEVDKFAPEISTIAIV
GAKSQRVELLKNIEGINLIITSYDLLKRDINIYKDFDFNYCILDEAQYIKNSYTLNAESV
KCIKSNVRFALTGTPIENSLSDLWSIFDFIMPNFLLSYNNFKNKYETPIIKNNDINTLDK
LHSIIEPFILRRLKRDVLKDLPDKMEISSYTKMEDKQRKLYMAEVVKINKEYNLEINTQG
FEKSQIKILSMLTRLRQICCHPSLYIDNYNGESAKLNLCMQIVTDSIQSNHKILIFSQFT
SMLDIIAENLKLKNIPYFLLTGSTKAKTRMELIDKFNINNTPIFLISLKAGGTGLNLTGA
DIVIHFDPWWNNSAQNQATDRAHRIGQKNKVQVFKLITKDTIEEKIERLQNRKQNLVDSV
ITEKEILFNSLTKEEIQSLFDVN
NT seq 3312 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggtaaaaaaaataaaaaataattttttgttcaatatgaaaataaattttaacttgtct
tctattaaacttagagcgtttgattctaatgaatttatgcgcggtcttgagttgtttgat
agcgcacatgtctcaaatatgtcaatatttaaaatatttgatgatgaatccttagaagac
attataaaaataaaggcaaaagtaaaaaatcaagatttagataatcaaatagttgaaatt
aaaatagatatgcatggtgatataattaaatacggatgtggctgtcaaaaccatttgcaa
cataaatatactttttgcaagcatattatagctgtacttttgtttttatacaacaataat
aaatctgcagatattaggaataaaccactttataatttgattgaatctgattatataaat
ttagttaagctgtatgaagaaaaactaagtaacaaaagctacattgataataataattca
actatatctttaattccaaaaatatatacaaattcgcaaggatttttggagttatcattt
aatatatcaaaagatgacaaagcttatgttgtaaaagatgtttttgctttggctgagaat
ataaaatcatctagtagttatcgttatggtaaaagttttgttattaaccacaatattgat
aattttgatgaactgtcaaaatcacttgcaaaatttatagttaatttgtgttatgattat
ttagatatgtacggatataatacagaaaatatcccatcgaaaaaaaatataaaaatacca
aattcacaacttgatttgttatttgatttactggaaaataaaagtgttattttcattcat
aacaatgaaagtaataaaataaaatttttaaatcaaaatccagttgttaatttctactta
gaaaaaaattctaagactaataaatatgatttttgcattgaaaacttttttgaaaataaa
atttttatatataaatttttgaacaaagcttatataatacatgatgaatttttttataaa
tgtgatagtacatttatagataatgttttgcctgcaattgaaaaaataaaggcgactaat
aatttatctataccaatactgcaagataatttatcaaaattttattctaccgttttatct
acattaaataagtttacaagtgttagaattcctgaagacatttcggatatgctaataatt
aatccattagttgcaaaaatatatttagatactaatacatctaatgcaataattttggat
tatgtatttaactacgacaatgttgatattaatccttttgttgaaaatataaaaaaaaat
actaaagaaataattattagagatttaaaaggcgaattaaatattacttcttttattaaa
aattgtggtttcgttcaaaaaaacaaaaaatacattttaacaaatgaaaattctatatac
aattttgttactgatggtgtaaataaattaattaaaatgtgtgaagtaaatgttagcgaa
agctttggaaaaataaaagtcaaaactcctaaaactatttcaatgggtgttaaattagct
aataatttaattgaattggatttaaataatttagaatttagcctctcggatttaaaaaac
atacttagccaatataaggttaagaaaaaatattttagattaaaagatggttctttttta
aatttagatgatgattattttgatactattcaatctctatctgacgacttagatataata
aactcaaaacatgatgataatacagttttacttccaaaattcaggtcgattaacatagaa
gacctactaagtaaaaatgaaataattaatgcacataaaaactctgattttgtaaatatt
gttaagaacttaggtgcacataaagattttgattttgaaattcctaattcattggaaaat
atattaagaaattaccaaaaaacaggttttaaatggttaaaaacattagctttttatggg
cttggtggaatactggcagatgatatgggacttggtaagacattgcaaattatagcttta
ttgctatcagaaaagaataataatttaccatcaattgttgtttgccctacgtctttgata
tacaactggattaacgaggttgacaaatttgctcctgaaatttctacaatagcaattgtc
ggagcaaaatcccaaagagttgaattactaaaaaatattgagggcataaatttaattata
acatcttacgatttactcaaaagagatattaatatatataaagattttgattttaattac
tgcatacttgatgaagctcaatatatcaaaaattcatatactttaaatgctgaatcggtt
aaatgtataaaaagcaatgtgcgatttgcattaaccggtactcctattgaaaactcattg
tccgatttatggtctatttttgattttattatgcctaattttttattatcatacaataat
ttcaagaataaatatgaaacacctattattaagaataatgatattaacacattagataaa
ctgcatagcataattgaaccatttatattgagaagattaaaacgtgatgtattgaaggac
ttaccagataaaatggaaatatcaagctatacaaaaatggaagataaacaacgaaaactt
tatatggctgaggttgttaaaattaataaagagtataatttagaaataaatacacaaggt
tttgaaaaaagtcaaataaaaattctatcaatgctaactagacttagacaaatttgttgt
catccttctttatatattgataattataacggtgaaagcgcaaaattaaatttgtgtatg
caaattgttactgatagtatacaaagtaatcataaaatacttattttttctcaatttact
tcaatgcttgatattattgcagaaaatttaaaacttaaaaacattccttactttttattg
acaggaagcacaaaagcgaaaacaagaatggaacttattgataagtttaatatcaataat
actccaattttcttgatatctttaaaagctggtggaacaggacttaatttaactggagct
gacatagttatacactttgatccttggtggaataatagcgctcaaaatcaagcaacagat
agagcccataggattggtcaaaaaaacaaagttcaagtttttaaacttatcacaaaagat
actatagaggaaaaaattgaaagactccaaaatagaaagcaaaatttagttgattcagtt
ataactgaaaaagagatcttatttaactctttaactaaggaagaaatacaaagcttattt
gatgttaattaa

DBGET integrated database retrieval system