Spirosoma endbachense: GJR95_18390
Help
Entry
GJR95_18390 CDS
T09865
Name
(GenBank) PKD domain-containing protein
Organism
senf
Spirosoma endbachense
Motif
Pfam:
Laminin_G_3
Sortilin-Vps10
PKD
PKD_4
BNR
BNR_2
CATSPERB_2nd
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QHV96856
LinkDB
All DBs
Position
complement(4574197..4578252)
Genome browser
AA seq
1351 aa
AA seq
DB search
MTEVFEKFSIIFIFLFFSTQLIAQKNKIFNIPKNIEEPDWVKKVDWNNPNVFVIDSLIKE
SKKVDLSSKKDDQKNEIDDEIDEEPYEVAFERWVSQNRAFIQSDGSVKIDIKLYKTLQSE
FEKNKAQARKGTSLPTNSGSWSLLGPVQTFSDNNRGLKNYQVNITRIAIAPSDSTILYAG
SSTGILFKSIDKGLNWYSINDNLLSGSIGAIAVSPGNANLVYAYSDNVGLLKTTDGGANW
TTLASFTQTSVNKILVQPNGNVIVAAQNNIYLSSNGGTSWKIPLFLTSPVPNNIPTGTKL
YDIVYNQKSPDILTAVGASSADTIKFFYSTDGGISFSEKPSPANTFSRGARLATTNSTTI
FPDIIYCITLQNDFPKLVKSTDFGQTWSVVTTFTGTGLSGRDTTNGMSNGQGFYDLAIMM
NPTNADHLIVGTTSAWKSTDGGVNFKPIGGYIGSFPLHPDMQSMVANGTDSYITTDGGVV
YSSDFFSETANLSIRHKGLSGSDYWGFDQGWAEDIVVGGRYHNGNGALYEPYGSGNTLSV
GGGENATGHVFPTPGKKGKVGFKDIGTKIIPQSLAGKIENADIQNQKWPSVANYGQFSSK
LIVHPNYSNIFYVGYNNSLWKSEDNGLTYYELKDFGANVWRYDMSKSNPNKIYLVTTTGL
WKTTDGGNTWSQLFLPSGVTFKYYNSDIVVNPDSEDIIWFCQKGGTASNKVFKSVDAGNT
WVNYTDTLLKNKNISFLVAQGGTNSGIYAIQNTPNARVYYRDNNLTEWVDYNSGLPQNFE
ARQGGIIFYRDNKLRLAGNRGIWESPLYSVSSPMANPMANKRIVSCEKDTITFTDYSILN
YSGASWKWAFPGASYVNDINAREPKVTYPGPGLYTVSLTVKNNRDSSSTRTVNNMINFNT
SLCLTDTLPGKALSVSGKRKEINIGIPNINSNSFSISCWIKPKGKQKSFSQILGEYMYPN
SNSGFGLGFSFNGYTDNLNLCYTDNIVTYRQKSKLIADSTQWNHVVLVYSPTNVKIYLNG
VAEIVNAGPMPVINLSTKPFFINPDIHNQGGNYQGEIDEVKFYNYALSQTEIREKKHLIL
REGTAENGLIKYIQFNQADPLNPRNIWELVSGKLITLTDSNYLIPSTAPIASGQSFSKDI
AVGGQHTFTGTGIDLFWPNIGTFPNGQVVAFRLNSAPDSNPDSISYTVPNKGYFIINNYG
SNATFTPLQKIRLSKLSLPENSKLANFNLYKRPSNSFDRTTWLTKLGNAIDFTYAANSES
SLEFSGETINSFSQFLISINNNICVNETLKSGNWNDPTVWSCSVVPGVGSLVKINRGHII
EVPNGVIAQPSFIELSGKIMIRVGGIVKLNN
NT seq
4056 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactgaagtatttgaaaaattttctataatatttatttttctatttttttcgacgcag
ctgattgctcaaaaaaataaaatctttaatattcccaaaaatattgaagagccagattgg
gttaaaaaagtagattggaacaatcccaatgtttttgtaattgactctttaattaaagaa
agcaaaaaagtggatttatcatctaaaaaagatgatcaaaaaaatgaaattgacgatgag
atagatgaagaaccatatgaagtggcatttgaacgatgggtaagccaaaatagagcattt
attcaaagtgacggttcagtgaaaatcgatataaagctttacaaaacactgcaaagtgag
tttgagaaaaataaagcccaggcaaggaaaggtacaagcttgccaacaaactcaggttca
tggtcgcttttagggccagtacaaacctttagcgacaataatagggggctcaaaaattac
caggttaacattaccagaattgcgatagcgcccagcgactccactatattatatgcaggc
tcttcgacgggtatactctttaaatcaatcgataaagggcttaattggtactcaattaat
gataacttattatccggttccattggtgcaatagctgtctcgccgggaaatgcaaatttg
gtttatgcatattctgataatgttggcttactgaaaacaaccgatggaggagcaaattgg
acaactttagcctcatttactcaaaccagtgtaaataaaattttagttcagcctaatggt
aatgttattgtggctgctcaaaataatatttacctgagcagcaacgggggtacaagttgg
aaaattccgctttttctgacgtcaccagttccaaacaatattccgacgggaactaaactt
tacgatatagtttacaaccaaaaatcaccggatattttaacggcggtgggtgcttcatca
gcagatacaataaaatttttttactcaacggatggaggtataagcttttcggaaaagcca
tcaccagccaataccttttcaagaggagccagattagcgactactaattccactacaatt
tttcctgatattatttattgcatcaccttgcaaaatgatttcccaaaactggtaaaaagt
actgactttgggcaaacgtggtctgtggttactacttttaccggaacgggtttaagcggc
cgtgatacaacgaacggtatgtcgaacgggcagggattttatgacctggccataatgatg
aacccaactaacgccgatcatctaatcgttggaacgacctcggcttggaaatcaacagat
ggaggtgtcaatttcaaaccgattggcggatatattggatcatttcctttgcacccagat
atgcaaagtatggtagcaaatggaacggactcctacatcaccactgatggtggggtggtt
tactcaagtgattttttttcagaaactgcaaatttgtcgattcggcataaaggactttct
gggtcagattattggggttttgatcaaggctgggccgaggatatagttgtagggggaagg
tatcataatggaaatggagccttgtatgaaccatatggatctggaaatacgctttcggtt
ggcgggggagaaaatgctacaggtcatgtattcccaacaccaggtaaaaagggtaaagtg
ggttttaaggatataggcactaaaattattcctcaatcgcttgctggaaagatcgaaaat
gccgacatccagaatcaaaaatggccttctgttgccaattatgggcaattcagtagcaag
ttgatagtacatccaaattatagcaatattttttatgttggttacaacaatagcttgtgg
aaatcagaggacaatggacttacttattatgagcttaaagattttggtgcaaatgtttgg
cgatacgatatgtcaaaaagcaaccctaataagatctacctggttacaactacaggacta
tggaaaactacggatggtggtaatacatggtcgcaactgtttttgccaagtggcgtgaca
tttaaatactacaacagtgatattgtagtgaatcctgacagcgaagatataatatggttt
tgccaaaaaggtggaactgcgtccaataaagtatttaaatcggttgacgcaggcaatacc
tgggttaactatacagatacattacttaagaataaaaatattagctttttagttgcccag
ggaggcactaacagtggaatctatgcgatacaaaatacaccgaatgccagggtttactat
cgagataataatttaactgaatgggtagattataattcaggattgcctcaaaattttgaa
gcaaggcaaggtggaattattttttatagggataataaattgagactggctggtaatagg
ggtatttgggaaagtccattatattctgtcagtagccctatggctaatccaatggcaaat
aaaagaattgtaagctgtgaaaaagatacgattacatttaccgattattcaattcttaat
tattcgggggcaagctggaaatgggcttttcctggagcgtcttatgtaaatgatattaat
gccagagagcctaaagttacttatcctggtccgggcctttatactgtttcattaacggta
aaaaataaccgggatagttcatcgaccagaacggtgaacaatatgattaatttcaatact
agtctatgcttgaccgacacactaccaggcaaagcacttagtgtatcgggtaaacgtaaa
gaaattaatattggcattcctaacattaattctaattcgttttctataagttgctggata
aagcctaagggcaagcaaaaaagctttagccagatacttggggaatatatgtatccaaat
tcgaattctggctttggtttgggtttttcatttaatgggtatactgataacttgaattta
tgttatacggataacattgttacctatcgacaaaaaagtaagttaatcgctgattcaacg
caatggaatcatgtcgtacttgtttactcaccaacgaatgtcaaaatttatttaaatgga
gtggccgaaattgtaaacgccggaccaatgccagtcattaacctttcaacaaaacccttt
tttattaatcctgatattcataatcaaggcggaaattaccagggcgagattgatgaggtg
aaattttataattatgccttgtctcaaactgaaattcgagagaaaaaacatctgatacta
agagaaggtactgccgaaaatggcttgattaaatatattcaatttaatcaagctgaccct
ctaaatcctcgtaatatttgggagttagtttctggtaaactgattacgttgaccgattcg
aactatttaataccatctacggctccaatagcttctggtcaaagctttagtaaagatata
gctgttggcggtcagcatacatttaccggaaccggaatcgatcttttttggccaaatatc
ggcacatttcctaatggtcaggtagttgcatttagattgaacagcgcaccagatagcaat
ccagattcaatctcttatacagtacctaacaaaggctattttatcatcaacaattatggt
tcaaatgccacatttacgcctttacaaaaaattagattaagcaaattgtcgctaccggaa
aatagtaaactagctaattttaacctatacaaacggccatcgaattcatttgatagaaca
acatggcttactaaactgggcaatgcaattgattttacttacgctgcaaatagcgaaagt
tctttagagttctcgggtgaaactattaactcttttagccaatttttaatctcaatcaac
aataatatctgtgttaatgagacgctaaaatcaggtaattggaacgatcccactgtttgg
tcctgctcagtagtaccaggcgtcggtagcctggtaaaaataaatagagggcatataatt
gaggttcctaacggtgtaatcgctcaaccgagttttatagagctttcaggaaagattatg
attcgggttggagggattgttaaactaaataattag
DBGET
integrated database retrieval system