KEGG   Spirosoma endbachense: GJR95_26875
Entry
GJR95_26875       CDS       T09865                                 
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
  KO
K21573  TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
senf  Spirosoma endbachense
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:senf00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:senf02000]
    GJR95_26875
Transporters [BR:senf02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   GJR95_26875
SSDB
Motif
Pfam: TonB_dep_Rec_b-barrel Plug CarbopepD_reg_2 CarboxypepD_reg Parecho_VpG TTR_TEN1-4
Other DBs
NCBI-ProteinID: QHV98397
UniProt: A0A6P1W311
LinkDB
Position
complement(6603125..6606190)
AA seq 1021 aa
MMDKSYTSSHFGGYVGQVGTTQPQLFARKTAFGFLSMLVMIMLLGNSVAWAQGRTVTGKV
TDPTGFGLPGVSVQLKGTQRGATTNGDGVYSLANVPDNATLVLSFIGYVTQEVAVGDRST
IDVKLVDDTKALQEVVVVGYGTQKVKDATGSVASLGTKDFNKGVISSPEQLLQGRVSGVQ
ITPSSGEPGAGINVSIRGAVSLRAGNNPLFVIDGVPLDGGDTGVTTDFGGGTSPPRNPLS
FLNPSDIENISVLKDASASAIYGARGANGVVLITTKKGRVGQSDLTFSASASVASAYKRY
DLLNAQQFLAGVTAAGGDLSQVDKKASTDWQDQILRTGVTQNYNVGFGGGNENTRYRFSV
GYQDQEGIVRNSGQKRITGRINASHDLFDHKVTLALNATTSNLQDQYVLNTTNAGAQGNL
IGAAIQANPTYPVTNPDGTFYQPGGDFRNPAAILAYDRDRGETNRTLANASLTWQILEGL
QFKANFGIDNATAVRRTELDSRLGGNFNLAISNNQVSVQGNGAAIINNKYRTSKLVEYTL
NYNTKIAGNSLEALAGFSYQKFNNQQNTALASYFGYNLDVISYTDNLGGANGLTYKAFGA
TSDHSQNDLQSYFGRVNYSIQDKYLITATLRADGSSRFGINNKYGYFPSLAGAWRLSQES
FVPKSIFDDLKLRVNYGVTGNQDFAGGVSKIIFTRNSDGSTVQDNNPNPNIKWEQNTTYG
AGLDFTVLKGRLSGSVDYFNKSTTNLLFQVFYAQPAPVTYKWVNLPGEVINKGVEVSLNF
QAVQKQKFSWEVAANATFLKPVVQGIGTSIPTGPIDGQGLSGAFGQTIRDGYAPFSFIMQ
TYTGLDANGLGTYADGGASKIQGDPFPRMRFGLTNNFTFGKFNASLFFNSQFGGYVYNNT
ANALFLKGSLKNGRNVTQDVASSSESPLNSGSVSTRFLEKSDFVRLANASVSYAFTLPQG
GFAKTLSLSLSGQNLLLITSYTGLDPEVNTIKTLNNIPSLAIDYTPFPSPRTVTLGLNVG
F
NT seq 3066 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgatggacaaatcctacactagtagccactttggtggttacgtaggtcaggttgggact
actcaaccccagctatttgcgcggaaaacggcttttggttttctgtcgatgctggtaatg
attatgctacttggtaattcggtagcatgggcgcagggacgtaccgtaacaggtaaagta
acagaccctactgggtttggtttaccaggggtaagcgttcagttaaaagggacacagcgg
ggagcaacaactaatggagatggtgtatactctttagcgaatgtaccagataatgccaca
cttgtattgagttttatcggttacgtaacgcaagaggtagcagtaggcgatcgttcaacc
atagatgtaaaactggttgacgataccaaagctcttcaggaagtggttgtagtcggctat
ggtacgcagaaagtaaaagatgctactggatcagtggcatcgttaggtaccaaagacttc
aataaaggggttatatcttcgccagaacaattattacaaggccgtgtgtcgggcgttcag
attaccccttccagtggtgaaccaggtgcaggtatcaatgtctcaattcggggtgcggtt
tctctgcgtgctggcaacaacccattgtttgttattgatggtgtgcctctcgatggtggt
gatacgggcgtaacgacggattttggtggtggtacatcgcccccacgtaaccccttgagc
ttcctgaatccatctgatatcgaaaatatttcggtacttaaagatgcttcagcttccgcg
atttatggcgctcgaggtgccaatggtgtggtgttgattacaacaaaaaaaggaagagtt
ggtcagagcgaccttacattctcggcctcggccagtgtagcctcggcctacaagcggtat
gatcttctgaatgcacagcaatttctggctggtgtaacagcggctggtggtgatcttagc
caggttgacaaaaaagcctctacggattggcaggaccagattttacggacgggtgttacc
cagaactataacgtcggttttggcggtggtaacgaaaatacccgctatcggttctctgtt
ggttatcaggaccaggaaggtatagtcagaaattcgggtcagaagcggataaccggccgt
atcaatgccagtcatgacttgtttgatcacaaagtaacgctggcattaaatgcaacgact
tcgaaccttcaggaccagtatgttctgaataccacgaatgcgggtgctcaggggaatttg
attggagcagccattcaggctaacccaacctatccggttaccaaccctgatgggacattc
tatcaacctggtggtgacttccgtaatccggctgctattcttgcctatgatcgcgaccgg
ggcgaaaccaaccggacgctggcaaacgcgagtttaacctggcagatcctggaaggatta
cagttcaaagctaactttggtattgataatgcaaccgcagtacgtcgtacggaactcgat
tcgcgtctgggaggtaactttaacctggcgatcagtaataaccaggtttccgttcagggc
aatggggctgctattatcaataataagtaccgcacctcaaagctggttgaatacacactg
aattataatacgaagatagctggaaatagcctggaagctctggctggcttttcatatcag
aaattcaacaaccagcaaaacacagccctggctagctattttggctataacctggatgta
attagctatacagacaatctgggcggagcgaacggactaacctataaggcatttggtgca
acatccgatcactcgcagaatgatctccagtcctattttggccgtgttaactatagcatt
caggataaatacctgataaccgctacgttacgggctgatggttcgtcccggtttgggata
aataataaatatgggtatttcccctcactggcaggagcgtggcgtttgtcgcaggaaagc
tttgtgccaaagagtatttttgatgacctcaaactacgggttaactacggtgttacgggg
aatcaggactttgcagggggcgtatcgaagatcatctttacccggaactcagatgggtca
actgtgcaggataacaacccgaaccccaatatcaagtgggagcagaatacaacctatggc
gctggtcttgatttcaccgtgttgaaaggtcggttaagtggttctgtcgattatttcaac
aaatcgactaccaacctgctatttcaggtgttttatgcacagccggctcctgttacttac
aaatgggtgaacctgcccggtgaagttatcaacaagggagttgaagtttcgctgaatttc
caggccgttcaaaaacaaaagttcagctgggaagtcgcagcgaatgctacattcctgaaa
cctgttgtgcaggggattggcacatctataccaacagggccaattgacggacagggcctt
tcgggtgcttttgggcagaccattcgggacggctatgcgccattctcgttcattatgcag
acctatactggcctcgatgccaatgggctgggtacgtatgctgatggtggtgcatcgaaa
attcagggtgatccatttccccggatgcggtttggcttaacgaacaattttacgtttggc
aaattcaacgccagtctgttcttcaacagccagtttgggggctatgtttataacaatacc
gcaaacgcgctcttcctgaaaggatctctgaaaaacggccgcaatgtaacgcaggatgta
gccagcagtagcgaaagtcccttgaactcaggttcagtatcgactcgtttccttgaaaag
agcgattttgttcggttagccaatgcctcggttagctatgcgtttacgttgccacagggt
ggttttgcaaaaacattgagcctgtcgctgtctgggcaaaatttgttgcttattacgagc
tacacaggccttgatccagaggtgaacacgatcaaaacgctcaataatattccgtcgctg
gcgattgactacacacctttcccatcgccacgtacagttacgctgggattaaatgttgga
ttttaa

DBGET integrated database retrieval system