Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana: CFSAN001992_09330
Help
Entry
CFSAN001992_09330 CDS
T02479
Name
(GenBank) putative autotransporter
Organism
senj
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
AC_1
Pertactin
ORF_2_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGF82174
LinkDB
All DBs
Position
complement(1840802..1843774)
Genome browser
AA seq
990 aa
AA seq
DB search
MHSWKKKLVVSQLALACTLAITSQANATTYDTWNYVDNPTTALDWTNMDAPGTVDGNYVN
YSGFVYYNNANGDFDQSFNSDTVNGTISTYYLNHDYATDSDNTLNITNSNIHGSITSKLP
FGYWSITPASIDPVTGSVIPRMYNGYTYDNGTTIADTNWYDGDVFTLNISNSTIDDDYEA
LYFTDSYLSGDDGTTTKTTNESFYTALGVAVNLNVESNINIANNSRVAGIALSQGDTTNT
AYTSEYHQWDNNISVSNSTVTSGSEIPLEDDYDGAEYFFGNSAEPSDYNGDSSVNDVALS
FSDNPDSNYSMKNNVYFDHSTLLGDVEFSSHWNNDGEFFYSTGYDSNGDGVKDTNGGWID
DGQNVDELNITLDNGSKWIGSANITADAIAPVNMYDVAYNSLTPGATIEANDWDRVIDNK
VFQSGVFNVALNNGSEWDTVNTSVIDTLAVNNGSQVNVTDSTLVSDTIGLTNGSSMNIGE
DGQVATDHLTIDSYSTVALNDDVTHYGDYSLYANTITVTNGGMLDVNVDQFDNGVFSTDK
LELTSGNTADHNGNVVSGVFNIHSSDYVLNADLVNDRTWDTTQANYGYGTIAMNSDGHLT
INGNGDINNGDELDNSSVDNVVAATGNYKVRIDNATGAGSVADYKGNELIYVNDVNTDAT
FSAANKADLGAYTYQAKQEGNTVVLEQMELTDYANMALSIPSANTNIWNLEQDTVGTRLT
NARHGLADNGGAWVSYFGGNFNGDNGTINYDQDVNGIMVGVDTKVDGNNAKWIVGAAAGF
AKGDLSDRTGQVDQDSQSAYIYSSARFANNIFVDGNLSYSHFNNDLSANMSDGTYVDGNT
SSDAWGFGLKLGYDLKLGDAGYVTPYGSVSGLFQSGDDYQLSNDMKVDGQSYDSMRYEIG
VDAGYTFTYSEDQALTPYFKLAYVYDDSNNDADVNGDSIDNGVEGSAVRVGLGTQFSFTK
NFSAYTDANYLGGGDVDQDWSANVGVKYTW
NT seq
2973 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcactcctggaaaaagaaacttgtagtctcacaattagcattggcttgcactctggca
atcacttctcaggcgaatgctactacttacgatacctggaattacgttgataaccctact
acggctcttgactggaccaatatggatgctccgggtacagtcgacggtaactatgtaaac
tatagcggctttgtttactacaacaacgctaatggtgatttcgatcagtcgttcaacagt
gacactgttaacggtacgatttctacctattatctgaaccatgattatgccactgattca
gataacactctgaacattacgaattcgaatatacatggttcaattacttcaaagctgcct
ttcggctactggagtattacaccagcttctattgaccctgtaactggatctgttatccct
cgtatgtataacggttatacctacgacaatggtactaccattgctgatacaaattggtat
gacggtgatgtatttacgctgaatatttcaaactctactattgatgatgattatgaagcg
ctttatttcactgactcttatttgagcggtgatgatggtactacaactaaaacgactaat
gagtcgttctatacggctttaggggttgcagtaaatctgaacgtagagagcaatatcaat
attgctaataattctcgtgttgcgggtattgctttgtctcagggggatacaaccaatact
gcgtatacatctgagtaccatcagtgggacaataatattagcgtctccaactctactgtg
acttctggttcagaaattccgttggaagatgactatgacggagcagaatacttctttggt
aactctgctgaacctagtgactataatggtgatagtagtgtaaatgatgtagcactgtct
ttctctgacaatcctgattctaattactccatgaagaacaatgtttacttcgaccattct
accttattgggcgatgtagagttttctagccactggaataatgatggtgaattcttctat
tcaacaggctatgacagcaacggcgatggtgttaaggataccaatggcggctggattgat
gacggtcagaatgttgatgagctgaatattactctggataatggtagtaaatggattggt
tcggctaatattactgccgatgctattgctccagttaatatgtacgatgttgcatataat
agccttacccctggtgcgactattgaagctaacgattgggatcgtgttattgacaacaaa
gtattccaaagtggagtatttaacgttgcattaaacaatggttctgagtgggatactgtc
aacacttccgttattgataccttagctgtaaataatggctctcaggtaaatgttacagac
tctaccctggtatcagacaccattggattgaccaacggttctagtatgaatatcggtgaa
gatggtcaggtagcaactgatcatctgactatcgatagctacagtactgttgcgctgaat
gatgatgtgactcattatggtgattattcactgtatgccaatactatcactgtaactaat
ggtggtatgttggatgttaacgttgatcagtttgataatggtgtattcagcactgataaa
ctggaactgaccagcggcaatactgctgatcacaacggtaatgttgtttctggtgtgttc
aatatccatagcagcgattatgttctgaacgctgacctggtgaacgaccgtacctgggat
accactcaggctaactatggttacggtactatcgcgatgaactctgacggtcacctgacc
atcaacggtaatggcgatatcaacaacggcgacgaactggataacagctctgttgacaat
gttgtagcggctaccggtaactataaagttcgcatcgacaacgctactggtgccggttct
gttgcggattacaaaggcaacgagctgatttatgtcaatgacgtaaacaccgatgcgacc
ttctctgcagcaaacaaagctgacctgggtgcttacacctatcaggctaagcaggaaggc
aacactgtcgtgctggaacagatggaactgaccgactacgctaacatggcgctgagcatt
ccttctgcgaacaccaatatctggaacctggaacaagacaccgttggtactcgtctgacc
aacgctcgtcatggcctggcggataacggcggcgcatgggtaagctacttcggcggtaac
ttcaacggcgacaacggcaccattaactacgatcaggatgttaatggcatcatggtcggt
gttgataccaaagttgacggtaacaacgctaagtggatcgttggtgcggcagcaggcttc
gcgaaaggcgatctgagcgatcgtaccggtcaggtggatcaggacagccagtctgcctac
atctactcttccgctcgtttcgcaaacaacatctttgttgatggtaacttgagctactct
cacttcaacaacgatttgtctgctaacatgagcgacggtacttacgttgacggcaacacc
tcttctgacgcctggggctttggcttgaaactgggttatgatctgaagctgggtgatgca
ggctacgtaacgccttacggcagcgtatccggtctgttccagtctggcgacgactaccag
ctgagcaacgacatgaaagttgacggtcagtcctacgacagcatgcgttatgaaatcggt
gtagatgcaggttataccttcacttacagcgaagatcaggcgctgacgccgtacttcaaa
ctggcttacgtttacgacgactccaacaacgatgctgacgtaaacggcgactctatcgac
aacggcgtagaaggttctgcggtacgtgttggtctgggtactcagttcagcttcacgaag
aacttcagcgcctacaccgatgctaactacctcggcggcggtgatgttgatcaagactgg
tctgcaaacgttggtgttaaatatacctggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
