Staphylococcus epidermidis PM221: SEB_02046
Help
Entry
SEB_02046 CDS
T03289
Name
(GenBank) DNA/RNA helicase of DEAD/DEAH box family
Organism
sepp
Staphylococcus epidermidis PM221
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF3427
ResIII
Helicase_C
PLDc_2
SWI2_SNF2
DEAD
SNF2-rel_dom
SLFN-g3_helicase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CDM14581
LinkDB
All DBs
Position
complement(2081584..2084442)
Genome browser
AA seq
952 aa
AA seq
DB search
MSNLIQDIKQSLYKGFIDKDSSHKGNFVPRLLVNNKEENVLSTIIDQLHNCQSFCISVAF
ITESGLASLKSHFYDLSKKGVKGRIITSNYLGFNSPKMFEELLKLENVEVKLTNIEGFHA
KGYIFEHHNHTSFIIGSSNLTSNALKLNYEHNLFLSTHKNGDLVNNIKYKFDELWDSSFS
LTNEWINEYKQSFEYQTLQKVFDNTVVQNSDIKKFNESKLIKPNLMQEHALKSLESLRNV
GEEKGLIISATGTGKTILCALDVRAYSPDKFLFIVHNEGILNRAIEEFKKVFPYEDESDF
GLLTGKRKDHDAKFLFATIQTLSKKENYKLFNSNHFDYIVFDEAHRTAASSYQKIFNYFK
PNFLLGMTATPERTDELNIFELFNYNIAYEIRLQEALESNILCPFHYFGVTDYIQNEMSQ
EDAFNLKYLASNERVEHIIKKTNYYGYSGDVLKGLIFVSSRGEAYQLANQLSKRGISSVG
LTGKDSIAYRAETIQQLKEGSINYIITVDLFNEGIDIPEINQVVMLRPTKSSIIFIQQLG
RGLRKSTNKEFVTVIDFIGNYKTNYMIPIALSGNKSQNKDNYRKFLTDTTVLNGVSTINF
EEVAKNKIYNSLDSVKLNQPKLIKEAFNNVKDRIGKLPLLMDFINNDSIDPSVIFSRFKN
YYEFLIKNKIIENELSINEFKNLTFLSRQLTPGLKKVDIDVLKEIIQNDVTYENLTKKML
NINNDISEYDINTSLSILDFTFFKKTIGKTYGLPLIQYKDNLICLANEFKEALNKPLFNT
FVHDLIDLANYNNDRYQNKKNSLILYNKYSREDFVKLLNWDKDESGTINGYRMKHRTLPL
FITYDKHENISDNTKYDDEFLSQDELKWYTRSNRKLTSPEVQNILKHEENNTDMYIFVKK
RDDEGKYFYYLGKAKYIKGTEKQDYMPNGNSVVTMHLSMNTSIRDDIYRYIT
NT seq
2859 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgagtaatttgatacaagatattaagcaatctttatataagggatttatagataaagat
agttcccataaaggcaattttgttccaagattactagtaaataacaaagaagaaaatgta
ctttctactattatagatcagctgcataattgccaatcattttgtatttcggttgcattt
ataaccgagagtggtttagcaagtctaaaatcacatttttatgatttaagtaagaaaggc
gtaaaaggaaggataataacatcaaattacttaggttttaatagtccgaaaatgtttgag
gaattattaaaattagagaatgtagaggttaaattaacaaacattgaggggttccatgct
aaggggtacatatttgaacatcataaccacacttcttttattatagggagttcgaattta
acttctaatgcattgaaattgaattatgaacataatttatttttatctactcataaaaat
ggagatcttgttaacaatattaaatataaatttgatgaactttgggattctagcttttct
ttaactaatgaatggataaatgaatataaacagtcttttgaatatcaaacattgcaaaaa
gtatttgataacactgttgttcaaaattcagatattaaaaagtttaatgaatcaaaactt
ataaaacccaatttaatgcaagaacacgcattaaagtcattagagtctttgagaaatgtg
ggagaagaaaaggggttaattatatctgcgacagggactggaaaaactattttatgcgca
cttgatgtaagagcttattctccagataaatttctatttattgttcataatgaaggtata
ttaaatagagctatagaagaatttaagaaagtatttccatatgaggatgaaagtgatttt
ggattattaacaggaaagcgaaaggatcatgatgctaaattcctttttgcaacaattcaa
acactttctaaaaaggaaaattataaattgtttaactctaatcattttgactacatcgtt
tttgacgaggctcatcgaactgctgcatctagttatcagaaaatatttaattattttaaa
cctaactttttgctaggaatgactgcaacaccagaaagaactgatgaattaaatattttt
gaattgtttaattataatattgcttatgaaattcgtttacaagaggctttagagagtaat
attttatgtccttttcattattttggagttacagattatattcaaaatgaaatgagtcaa
gaagatgcatttaatctaaaatatttagcatctaatgaacgtgttgaacatatcataaaa
aagactaattattatggttattcaggtgacgttttaaagggtttaatatttgttagtagt
aggggtgaggcgtatcaattagcaaaccaattaagtaaacgtggtatatcatcggttggt
ttgacaggaaaagattctatagcttatagagctgaaacaattcaacaactaaaagaagga
tctattaattatataattactgtagatttgtttaacgaaggaatcgatattcctgaaata
aatcaagttgtaatgttaagacctactaaatcaagtattatatttattcaacagcttggt
agaggattaagaaaaagtactaataaagaatttgttactgttattgattttatcggtaat
tataaaactaactatatgatcccaatagccttatctggaaataaatctcaaaataaggat
aattacagaaaattcttaacagatactacggttttaaacggtgtttcaacaataaatttt
gaagaagtagctaaaaataaaatttataattcactagattctgttaaattaaatcaacca
aaattaattaaagaagcttttaacaatgtaaaagaccgtataggtaaattacctttactt
atggactttataaataacgattcgatagatccaagtgtaattttctcacgttttaaaaat
tattatgagtttttaataaaaaataaaattattgagaatgaattaagtattaatgaattt
aaaaatttaacatttttatcaagacaattaacacctggacttaaaaaagtagatattgat
gtattgaaagaaattatacaaaatgacgtaacttatgaaaatttaacaaaaaaaatgtta
aacattaataacgatatttcggaatatgatattaacacttcattaagcattttagatttt
acttttttcaaaaagactataggtaaaacttacggattacctttaatacaatataaggat
aatcttatttgtctagcaaatgaatttaaagaggctttaaataaaccactatttaacaca
tttgttcatgatttaattgatcttgctaattataataatgacagatatcaaaataagaaa
aacagtttaattctatataacaaatattctagggaagattttgttaagttattaaactgg
gataaagatgaatctggaacaatcaatggttatcgtatgaaacatcgtacacttccttta
tttatcacttatgataaacatgagaatatcagtgataatactaagtacgacgatgaattt
ttgagccaagacgaattgaaatggtacacgcggtccaatcgtaaattaacttcaccagaa
gtacaaaatattttaaagcatgaagaaaataatacagatatgtatatatttgtaaaaaaa
agagatgatgaagggaaatatttctactatttaggtaaagccaaatatattaaaggaact
gagaagcaagattatatgcctaatggaaatagcgtagtaactatgcatttatcaatgaat
acgtccattcgagatgatatttatagatacatcacttaa
DBGET
integrated database retrieval system
