Spiroplasma eriocheiris: SERIO_v1c00040
Help
Entry
SERIO_v1c00040 CDS
T03974
Symbol
gyrA
Name
(GenBank) DNA gyrase subunit A
KO
K02469
DNA gyrase subunit A [EC:
5.6.2.2
]
Organism
seri
Spiroplasma eriocheiris
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
seri00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
seri03032
]
SERIO_v1c00040 (gyrA)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
seri03400
]
SERIO_v1c00040 (gyrA)
Enzymes [BR:
seri01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.2 DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
SERIO_v1c00040 (gyrA)
DNA replication proteins [BR:
seri03032
]
Prokaryotic type
DNA Topoisomerases
SERIO_v1c00040 (gyrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
seri03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
Facilitator
SERIO_v1c00040 (gyrA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_topoisoIV
DNA_gyraseA_C
NTase_sub_bind
Y_phosphatase2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKM53612
UniProt:
A0A0H3XLG0
LinkDB
All DBs
Position
4761..7238
Genome browser
AA seq
825 aa
AA seq
DB search
MSAEDNKNYDGEIKVIDIADEMKTSFLDYAMSVIVSRAIPDVRDGLKPVHRRILYAMWDL
NMTHDKQHKKSARIVGEVIGKYHPHGDTSVYEAMVRMAQDFSYRYPLIDGHGNFGSLDGD
EPAAMRYTEARMSKIAGELIKDIEKETVDFNDNYDGSEREPSYLTGYFPNLLINGASGIA
VGMATNIPPHNLNEIINGVIAITRNKDITTAQLMQIIKGPDFPTGALITAGNSLLKAYET
GNGSITIRAKINIEEKNNWKSIIISEIPYQVNKARLVEKIAELIREKIINGIADLRDESN
RDGVRIVIELKRDAQETLILNKLYKMTPLQTNFSLNILALHKNQPKIMGLKQILNYFIEH
QVEIIIKRSIYELNKITSRLLILKGLKIALDNIDEVVEIIKKSDSSQIAIAALMQRFELV
VEQAKAILEMRLQRLLGLEVQKINDEIIEIEKRIIELNNFINSREKQLELMITELEVIKT
KYGDERRSMIIKEELTEIDPEELIKREEILIMLTKDGYVKRVSNDTFKPQNRGGKGVTGL
SNSEDVLSKIISANSIDSLLIFTDAGRVYKLRAYQIESYSRQARGIPIINLISIDKKENI
KSILAVNELDESTDNLFFVTKRGIIKKTKLLEFNQIRNTGKVAIELKANDEVVDVILTKG
NDDIIIANSEGKVIRFNENEIRAMNRQSVGVKGISNGPNSEVIGICSGRDAKYILSITTN
GFAKKTLLEEYRITGRGTKGVKSMALTEKKGDLKFVKSVVGDEDILLATKHGNVIRIALD
QIPVSGRTTTGIKIIKLENDDVLEASELIRKNDQENDEGNKQGDN
NT seq
2478 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtgcagaagataataaaaattatgatggtgagattaaagtaattgatattgctgat
gaaatgaaaactagttttttagattatgcaatgtctgtcattgtttcacgtgcaattcct
gatgttcgtgatgggttaaaaccagttcatcgtcgcattctttatgccatgtgggattta
aatatgacccatgataaacaacataaaaaatcagcgcggattgtgggggaagttattggt
aaataccaccctcatggtgatacttctgtttatgaagcaatggttagaatggcccaggat
ttttcttaccgttatcctttaattgatggacatggtaattttggatcattagatggtgat
gaaccagcggcgatgcgttatacagaagcacggatgagtaaaattgccggagaattaatt
aaagatattgaaaaagaaactgttgatttcaatgataactatgatggtagtgaaagggaa
ccttcctatttaacaggatattttcctaaccttttaataaatggtgcaagtggaattgcg
gttgggatggctactaatattccacctcataacttaaatgaaattattaatggtgtgatt
gctattacaagaaataaagatattaccaccgctcaattaatgcaaattataaagggacct
gattttccaacaggagcattaataacagcagggaatagtttattaaaagcttatgagact
gggaatggttcaattactattcgtgctaaaataaatattgaagaaaaaaataattgaaaa
agtataataatatcagaaattccttaccaagttaacaaagcacgattagtagaaaaaatt
gctgaattaattcgggaaaaaataattaatggaattgctgatttaagagatgaatcaaac
cgggacggagtgcgcattgttattgaactaaaacgtgatgcacaagaaactttaatttta
aataagttatataagatgactccgttgcaaactaatttctcattaaatattttagcttta
cataagaaccaaccaaaaattatgggtttaaaacagatcctaaattattttattgaacac
caagttgagattataattaaacgaagtatttatgaattaaataaaattactagtcgatta
ttaattttaaaaggtttaaaaatcgcgttagataatattgatgaagttgtggaaataatt
aaaaaatccgatagttcacaaatagcaattgcagcgttaatgcaacgttttgaattagtt
gttgaacaagcgaaagctattttggaaatgcgtttgcaaagattattaggattagaagtt
caaaaaattaatgatgaaataattgaaatagaaaaaagaattattgaacttaataatttt
attaatagtcgcgaaaaacaattagagttaatgattacagaattagaagttattaaaaca
aaatatggtgatgaacgccgtagtatgattattaaggaagagttaactgaaattgatcct
gaagaattaattaaacgagaagaaattttaatcatgttaacaaaagatggttatgtaaaa
agagtctcaaatgatactttcaaaccacagaatcgcggcggtaaaggagtaaccggatta
tctaattcagaagatgtcttaagcaaaattataagtgctaatagtattgattctttatta
atttttacggatgcgggaagagtttataaattacgagcataccaaattgaatcttattct
cgacaagcacgaggaattccaattatcaatttaatttcaattgataagaaagaaaatatt
aagtctattttagctgttaatgaattagatgaaagtactgataatttattctttgtaact
aaaagaggaattattaaaaaaactaaactattagaatttaaccaaattcgaaatactgga
aaggttgcaattgaattaaaagcaaatgatgaagtagttgatgttatcttaacaaaagga
aatgatgatattattattgcaaatagtgaaggaaaagtaattcgctttaatgaaaacgaa
attcgcgctatgaatcgccaatcagttggggtaaaaggaatatcaaatggtcctaatagt
gaagttataggaatttgctctggtcgtgatgcaaagtatattttatcaattactactaat
ggttttgcgaaaaaaacattattggaagaatatcggatcaccggacgcggtactaaaggg
gttaaatcaatggctttaactgaaaaaaaaggagatttaaaatttgttaaatcagttgtt
ggagatgaagatattttattagcaacaaaacatggtaacgtaattagaattgcactagac
caaattccagtttctgggcgaactacaactggaattaaaattattaaattagaaaatgat
gatgttttagaagctagtgagttaattagaaaaaatgatcaagaaaatgatgaaggaaat
aagcaaggagataattaa
DBGET
integrated database retrieval system
