Spiroplasma eriocheiris: SERIO_v1c03840
Help
Entry
SERIO_v1c03840 CDS
T03974
Name
(GenBank) conjugal transfer protein TraG
Organism
seri
Spiroplasma eriocheiris
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
T4SS-DNA_transf
TraG-D_C
TrwB_AAD_bind
DEAD
Cas5fv_helical
DHHC
DUF2189
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKM53964
UniProt:
A0A0H3XKL2
LinkDB
All DBs
Position
390959..392980
Genome browser
AA seq
673 aa
AA seq
DB search
MKEWFKKRKWMILFLSIGLWVFIFIMLLGYAVFYDLAHNKTVNFKDIEQILTTNQNNFLT
IYGAIVGGVYLIFALFLLIFKYHIRYEFVGKTHDKTYGSAEWLSVKHLNKNYDLVNLMHA
GDKYGVVANSFTGKNKNFMANIRKETHTMVVAGTRSGKTQGVVIPTLQLFAQSEVKPGVI
ISDPKGELFETNSKVFADNGYRVLKLDLRSPELSVGWNPLTLIYQAWVKGCELERKYKDS
NGTDQESSKYYYWQQKAQDYLSDICTTLYPWSDPKDRFWQESASGAVKGILLAILYDMRE
NNSFDEKKFNLASVIPIINNKDKLFNYFKKLDISHPARIAISGLLDGAKETTGSILQSIK
TGLEKFSDPILRTLISKNELDLQTLTNCPTAVFLVVPDDRTDRHIFASLFISQSYKILIE
QASLANRKLEKPFYYILDEFANIPKIPDMGAKISVSGGRNIWWVLIIQDKPQLVDKYGEN
MARTINNNCSMHIFLQTMDIETAKYYSEIIGERTIVSKSRSNQVLLEKKQASGTRSLSGV
SLIKPADLMQLPTGHAVVVYSKEKPLKAKLMPMWKSPCYAMGKVADEESVPLTDEIFGKD
YVYILAAENDDASSDSGGGGTNQTMELLLEKEKLIKVEGKAIEIEEILINEEIDPRISKS
LTEKIEEIYELTK
NT seq
2022 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagagtgatttaaaaaacgaaaatggatgattttatttcttagcattggtctatga
gtttttatctttataatgctactaggatatgcagtgttctatgatttagcacataataaa
actgttaattttaaggatattgagcaaattttaacaactaaccaaaataattttttaaca
atctatggtgcaattgttgggggagtatacttaatatttgccttatttttattaattttt
aaatatcatattcgttatgaatttgtcggaaaaacccatgataaaacatatgggtcggca
gaatgattgagtgtaaaacacttaaataaaaattatgatttggtaaatttaatgcatgct
ggtgataaatacggagttgtcgctaattctttcaccggtaaaaataaaaattttatggct
aatattcggaaagaaacccatacaatggttgttgcggggactcggagtgggaaaacacag
ggggttgttattccaaccttacaattatttgcacaatcagaggttaagccaggagttatt
atttctgatcccaaaggagaactatttgaaactaactctaaagtttttgccgataatggt
tatcgagttctaaagttagatttacgaagtccagaattatcagtcggttgaaatccccta
acattaatttatcaagcctgagtaaaagggtgtgaattagaacgcaagtataaagatagt
aatggaactgaccaagagtcatctaaatattattactggcaacaaaaagctcaagattac
ttatcagatatttgtaccactttatacccatgaagtgatcccaaggatcggttttgacaa
gaatcagcgagtggagctgtcaaagggattttgttagcaattttatatgatatgcgtgaa
aataacagttttgatgaaaaaaaatttaaccttgcttcagttattccaattattaataac
aaagataaattatttaattattttaaaaaattagatatttctcatcctgctcggattgca
atttcggggttattggatggggcgaaggaaacaactggttcaattttgcaaagtattaaa
acagggttagaaaaatttagtgacccaatcttaagaactctaattagtaaaaatgaatta
gatttacaaactttaactaattgtccaactgctgttttcttagtggttcccgatgaccgg
acagatcgtcatatctttgccagtctttttatttctcaatcatataaaattttgattgaa
caagctagtttagcgaaccgaaaattagaaaaaccattttattatattttagatgaattt
gctaatattccgaaaattcctgatatgggggcaaaaatttcagtgtctggggggcgaaat
atctgatgagtattaattattcaagataaaccccagttagttgataaatatggtgaaaat
atggcccggacaattaataataactgtagtatgcatattttcttacaaacaatggacatt
gaaacagcaaaatattattcagaaattattggggaacgcacaattgtttcaaaatcacgg
agcaaccaagttttattagaaaaaaaacaagcaagtggaactcgctccttatcaggagtt
agtttaattaaaccagctgatttaatgcaactaccaacaggccatgcggttgtggtatat
tctaaagaaaaaccattaaaagccaaattaatgccaatgtgaaaatctccgtgttatgca
atgggaaaagttgctgatgaggaatctgttcccttgacagatgaaatttttgggaaagat
tatgtttatatcttagcagccgaaaatgatgacgcttctagtgatagtggcggtggagga
actaaccaaaccatggaattattactagaaaaagaaaaacttattaaagtcgaaggaaaa
gcaattgagattgaagaaattttaattaatgaagaaattgatcctcgaatatcaaaaagt
ttaacggaaaaaattgaagaaatttatgaattaactaagtag
DBGET
integrated database retrieval system
