Spiroplasma eriocheiris: SERIO_v1c05080
Help
Entry
SERIO_v1c05080 CDS
T03974
Symbol
secDF
Name
(GenBank) preprotein translocase subunit SecD
KO
K12257
SecD/SecF fusion protein
Organism
seri
Spiroplasma eriocheiris
Pathway
seri02024
Quorum sensing
seri03060
Protein export
seri03070
Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
seri00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03060 Protein export
SERIO_v1c05080 (secDF)
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
03070 Bacterial secretion system
SERIO_v1c05080 (secDF)
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
SERIO_v1c05080 (secDF)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
seri02044
]
SERIO_v1c05080 (secDF)
Secretion system [BR:
seri02044
]
Sec (secretion) system
Prokaryotic Sec-SRP core components
SERIO_v1c05080 (secDF)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SecD_SecF_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKM54083
UniProt:
A0A0H3XHD7
LinkDB
All DBs
Position
540077..543211
Genome browser
AA seq
1044 aa
AA seq
DB search
MKEKQQVKTIKKPVNRKVLTKLIVRIFVLLILTCAMIVGAVFSGEIFSYSYKLGIAYSGG
YQVQINVFDTTVENPDGTPNGDNKKGLDLLRNKLDPLNNSNLYLQTLGHNGLELIAGKDL
FKSYADLKTDIQRLGAIYLMKGDGTDLLVSDKERTPLSDVISGAEAGIDKTRHPIINLNI
KDQAKWDAIIKSLTPSQGSPEPLYIWTDIGQFIDELRHDTDNIQAIATNFNVNILPNLSG
TDNINVRSIFDVSYKDAGQGGIIVYRNLLDLATSGMSHPELVKVMQEDSFRFTTVSLDKL
VIDPNDKKAIKNQYIDPLRKYLTGIINYTPQLKDKYKKYIINYNAINKGTTPGLNSNQIA
TSTDTEARTISNLVNGGLSGLKFVVRGHTTIPPVVSRNILNVSMIVLGIIAAAICVYLLI
YYRLFGFVAILTLAFTIILTLYFSSLLGVQISPESIAAVIIAFGIALEGNLLLFSRYKRE
RYQNGLPYEPAMKIANKQTVAVFVDALVVLLVLGLSLFWAGTNNIKSFATILLVALIISL
VMVFAVARIMYWIIIKLRWQEKVTWLDIPRFSLLTYFQQKKHPHQVVNGEAQLLSDRFFA
LPTTDANEAAPNVPDQSKKPHKLRFKPKFSLYNITKYSPIVGIILIIIALIIGFAGKANI
DSTIKPGTNITVASDIWRHRDDATAEIQEMTQELKHLQATRGYNFSFNLYVIKADDMSMG
QQLLVISTNISGSNFARELLSSIAGYYGLTPEDPVFNLEKTSPVMETYILKTAGISLAIG
IACIFVYTLFRLDWAQFIGILCAAVFTLAVSVSIVVIAHILLTFEMSIAFIAIFGFAWAM
GAIVMARAKQNKKLVNIKEYETFFTYMSEHRAQVRRLRRAKKVYMQEEIKKLMIANPNLK
QKEVKKEFAEHLKTQWKIAKDLAAKNKKEIKLINKEFRKYNYTHNFLQKIANLTIKQMLR
HCLTLGAIFAIILIILAAFSGSVFGFNITVFIGLAIGMFSVLFLAIPIWVALEKYRALNK
IRVKNYLDSQRVEIDEQIVAGVND
NT seq
3135 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaaagaaaaacaacaagtaaagacaataaaaaaaccagttaatagaaaggttttaaca
aaattaattgttagaatttttgtcttattaattttaacgtgtgcgatgatcgtaggcgcc
gttttttcaggtgaaattttttcttattcttataaattaggaattgcttattcgggaggt
tatcaagttcaaattaatgtttttgatactactgttgaaaaccccgatggaacccccaac
ggagataataaaaaaggcctagacttattacgtaacaaacttgacccgttaaataattct
aacttatatttgcaaacattagggcataatgggttagaattaattgccgggaaggattta
tttaagtcttatgctgatttaaaaaccgatattcaacggttaggagccatttatttaatg
aaaggggatggcactgacttactggttagtgataaagaacgtacaccgttaagcgatgtt
atctcgggagcggaagctgggattgataaaactcgccacccaattattaatttaaatatt
aaagaccaggctaaatgagatgctattattaaaagtttaactccaagtcaaggttcaccc
gaaccattatatatttgaacggatattggccaatttattgatgaattacgccatgatacg
gataatattcaagcgatagccactaattttaatgttaatattttacccaacctaagtgga
actgataatatcaatgttcgtagtatttttgatgttagttataaagatgctggacaaggg
ggaattattgtctatcgaaacttactagatttagcaactagtggaatgagtcatcctgaa
ttagttaaagtaatgcaagaagatagtttccgttttaccactgtttccttagacaaacta
gtaattgatcccaatgataaaaaagcaattaaaaatcaatacattgacccgttacgaaaa
tatttaactggaattattaactataccccacaattaaaagataaatataaaaaatacatt
attaactataatgctattaataaaggaacaacaccaggcttaaattccaaccaaattgcg
acttcgactgatactgaagcacgaacaattagtaacttggtgaatgggggcttaagtggg
ttaaaatttgttgttcgtggtcatactacaattccgccagttgtttcacgtaacatttta
aatgtttcaatgattgtattaggaattattgccgcggcgatttgtgtttatttattaatt
tactatcgcttgtttgggtttgtcgcaattctaaccttagcctttactattattttaact
ttatacttctcatctttattaggagtccaaatttctccggaaagtatcgccgctgttatt
atcgcctttggcatcgccttagaaggaaatcttttgttattttcgcgttataagcgtgag
cgttatcaaaatggtttaccttatgaaccagcgatgaaaattgccaataaacaaacggtt
gctgtttttgtggatgccttagttgtcttattagtattaggattatcattattctgagca
gggactaacaatattaaatcatttgccacaatcttgctagttgctttaataatatcgtta
gtaatggtctttgctgtggctcgtattatgtactggattattattaaacttcgttgacaa
gaaaaagtaacatggttagatattccccgcttttcattgttgacttatttccaacaaaaa
aaacatccccaccaagttgtaaatggggaagcccagttactaagtgatcgcttttttgcc
ttaccaacaacggatgctaacgaagcagccccaaatgtaccagaccaatcaaaaaaaccg
cacaagttacggttcaaaccaaaattttcattatataatattactaaatattcaccaatt
gtgggaatcatcttaattatcattgctttaattattggttttgctggcaaagcaaatatt
gatagtacgattaaaccaggaactaatattaccgtggctagtgatatttgacgtcatcgc
gatgatgccaccgcggaaattcaagagatgacccaagaattaaaacatttacaagcaacg
cgtggttataattttagttttaatttatatgttattaaagccgatgatatgtcaatgggt
caacaattattagttattagtactaatatttctggaagtaattttgcccgtgaattgtta
tcatcaattgcaggatattatggcctaacccccgaggatccagtctttaacttagaaaaa
acatcaccggtaatggaaacctacatcttaaaaacagcgggaattagtttagcaattgga
attgcctgcatctttgtttatacattattccgattagactgagcacaatttattggaatt
ttatgtgcggctgtctttaccttagcagttagtgtttcaattgtggtcattgctcatatt
cttttaacctttgaaatgagtattgcctttattgcaatctttggttttgcgtgagcaatg
ggagcgattgtaatggctcgggcaaaacaaaataaaaaactggttaatattaaagaatat
gaaactttctttacatatatgagtgaacaccgtgctcaagttcgtcgtttacgccgtgca
aaaaaagtttatatgcaagaagaaattaaaaaattaatgattgccaacccaaatttaaaa
caaaaagaagtgaagaaagaatttgctgaacatttaaaaacccaatgaaaaattgcaaaa
gatttagcagctaaaaataaaaaagaaattaaattaattaacaaagaatttcgtaagtat
aattatacgcataactttttacaaaaaattgctaatttaacaattaaacaaatgctacgc
cattgtttaaccctaggggccatctttgcaattattttaattatcttagcagccttttca
ggaagtgtctttggctttaacattactgtcttcattggtttagcaattggaatgtttagt
gtgttattcttggcgattcctatttgagtagcgttagaaaaataccgggcattaaataaa
attcgggttaaaaattatttggattcacagcgagttgaaattgatgaacagattgttgct
ggtgttaatgactag
DBGET
integrated database retrieval system
