Spiroplasma eriocheiris: SERIO_v1c08290
Help
Entry
SERIO_v1c08290 CDS
T03974
Name
(GenBank) ATP-dependent RNA helicase
KO
K18692
ATP-dependent RNA helicase CshB [EC:
5.6.2.7
]
Organism
seri
Spiroplasma eriocheiris
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
seri00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
seri03019
]
SERIO_v1c08290
03009 Ribosome biogenesis [BR:
seri03009
]
SERIO_v1c08290
Enzymes [BR:
seri01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.7 DEAD-box RNA helicase
SERIO_v1c08290
Messenger RNA biogenesis [BR:
seri03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Helicases
SERIO_v1c08290
Ribosome biogenesis [BR:
seri03009
]
Prokaryotic type
rRNA helicases
SERIO_v1c08290
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
Helicase_C
AAA_19
Flavi_DEAD
Cas3-like_C_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKM54389
UniProt:
A0A0H3XLI7
LinkDB
All DBs
Position
complement(900184..901554)
Genome browser
AA seq
456 aa
AA seq
DB search
MNNFTDFGLKKFLMTGITALGFNSPTPVQQQVIPYLLKYQNVICKSHTGTGKTHAFILPI
LNNLDYNNSALQSVIVAPTRELAKQIYENIRFFKTYNPALKTGYYIGGEDINRQIDQLTK
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SVFSATIAPGLRPFLLKYLTNPQLIEINDNLATNQNIEHILIPTKHQERSSVLLKLLATL
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GIEFQIMKWWGNDLVVANLSSMAKKSSSEPNHEINKIINKYPTKNNQKKVKPGYKKKRKA
EIAELKRKTRREHIKASIKKIKKQKAKERSLKLYDK
NT seq
1371 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system