Spiroplasma eriocheiris: SERIO_v1c08670
Help
Entry
SERIO_v1c08670 CDS
T03974
Symbol
polC
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha (PolC)
KO
K03763
DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:
2.7.7.7
]
Organism
seri
Spiroplasma eriocheiris
Pathway
seri03030
DNA replication
seri03430
Mismatch repair
seri03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
seri00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
SERIO_v1c08670 (polC)
03430 Mismatch repair
SERIO_v1c08670 (polC)
03440 Homologous recombination
SERIO_v1c08670 (polC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
seri03032
]
SERIO_v1c08670 (polC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
seri03400
]
SERIO_v1c08670 (polC)
Enzymes [BR:
seri01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
SERIO_v1c08670 (polC)
DNA replication proteins [BR:
seri03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
SERIO_v1c08670 (polC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
seri03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
SERIO_v1c08670 (polC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
RNase_T
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
RNase_H_2
DNA_pol3_a_NII
tRNA_anti-codon
DNA_pol3_a_NI
HHH_3
Rv2179c-like
DEDDh_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKM54427
UniProt:
A0A0H3XMX2
LinkDB
All DBs
Position
complement(941174..945547)
Genome browser
AA seq
1457 aa
AA seq
DB search
MDQQLIKLFIANDLEVDNAYFQDAKVVKSEYSTTDSIFRIVIAVNELLPINILAHVESTL
RHNKKIPTKITLEINNLNYNISNIFEYIEYIRTHKSEVKQSYFNKLSADSFQLDDNNLIV
RVTSESERKLVNEHCLYYQNHLRRYGFKDLTLTVKVEAVENDILAINQEEIDKIRENVHR
QLSEQPQISPTALKRDSNNNGTKPRNFYGKVNLEVPTYNKIKDIDHDEPNVIIHGKIFAK
DRVATTTKKFIYVLTITDGSDSISIKYFTRDENPDENLETLNINDWISVYGDIRYDTYAS
EQVIFSKKIIKIEKEEITRLDNAPVKRVELHTHTKMSTMDGVVNVPDLFKLLSKWNHQAI
AITDHLNIQVFSEVYNTSLKYPDLKVIYGLEADVLDDVVWYVKNPQQHNLRTAKYVIFDL
ETTGLSNEYDEIIEFGAVIMDGISGERETINHLFKPSIKLSSFTTELTGITDDMLQDKPT
FLESVDKILDYFQDAILVAHNAEFDIGFIQSWIQKAGHPKINNTIIDTLQLSRALESGLK
NYRLGSIARRYNVIYNEEVAHRADYDAIVLADIYEHQLRKMINEFNVEIDDDLNKIHNNQ
VYQKMRAKHLTILAKNQSGILDLFTLVTKSHTDYFYSSPKLLKSVINQHRKNLLIGSSCV
NGKIFELARNKSNEELEEAMAFYDYIEVQPPSVYKHLVQLGDLTQERLLTVISNIIHIAK
KLNKLVVATGDVHYLNPEDKIFREVYIHSKGIGGKPHPLFDYKNRISEYPEQFLRTTNEM
LAEFNFLNDEKLAYEIVVENTNKIADQIEKVQIIKDKLYTPSIEGSDQLLKELCYKNAYA
KYGNPLPKIVAERLESELTAIIKHGFGVIYWIAHKLVDKSLRDGYLVGSRGSVGSSFVAT
MSAITEVNPLQPHYICANCRYSEFITDGSVRCGYDLVDKGCPQCQNIMHGEGHDIPFETF
LGFEADKVPDIDLNFSGEYQPVAHDFTKEMFGERSVYRAGTISTVAQKTAFGYVRGYFEA
KNILHLKRKSEIERITKACEGVKRTTGQHPGGIVVIPNEYQVEAFTPVNFPADDTTSSWL
TTHFDFHAIHDNVLKLDILGHVDPTVLKMLQDLTGVDPKTIPTNDPAVLSLFQNLDSLKI
SPEDINNEKTGAIGIPEFGTGFVRKMLLDTKPSSFADLVQVSGLSHGTDVWIGNAQDLIK
NHNITISQVIGCRDDIMVNLIYKGLPAKSAFKIMEDVRKGRGLTPEHVELMKEHNVEQWY
IDSCNKIKYMFPKAHATAYVLMAWRIAWFKINYPVEYYATYFSTRTDVFDIKTILKGKAT
IQNVLRDIQTRLESKDFNMLNKPSQKEKDLIPVYEVALEMYARGIKMKNIDLQTSDIKNF
KVIVENGEKIILPPFATIDGLGEAVGESIVSARNTKQFISINDLQKRTNITKAHMQAFEE
LGILNHLSEDDQITFNF
NT seq
4374 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatcaacaattaattaaactttttattgctaatgatttggaagttgataatgcatat
tttcaagatgccaaagtagttaaaagtgaatatagtactactgatagtatttttcggatt
gttattgctgttaatgagttactaccaattaatattttagcgcatgtggaatcaacatta
cgacataataaaaaaatccccactaaaattacattagaaattaataatttaaattataat
attagtaatatttttgaatatattgagtatattcgtacccataaatcggaagttaaacaa
agttattttaataagttaagcgctgatagttttcaattagatgataataatttaattgtt
cgagttacttcggaaagcgaacgcaaattagttaatgaacattgtttatattaccaaaat
catttacgtcgctatggttttaaagatttaactttaactgtcaaagttgaagcggttgaa
aatgatattttagcaattaaccaagaagagattgataaaattagagaaaatgttcatcgc
cagttaagtgagcaaccccagatttcaccaaccgcccttaaaagagacagtaataataat
ggaacaaaaccccggaatttttatggcaaagttaatttagaagttcccacttataataag
attaaagacattgaccatgatgaacctaatgttattattcatgggaaaatctttgcgaag
gatcgtgtcgctacaacgaccaaaaaatttatttatgttctaacaattactgatggtagt
gattcaatttcaattaagtattttacccgcgatgaaaatcccgatgaaaatttagagact
cttaatattaatgattgaattagtgtgtatggtgatattcgttatgatacttatgctagt
gagcaggttattttttcaaaaaaaattattaaaattgaaaaagaagaaattacacgcctt
gataatgctccagtcaaacgtgttgaacttcatacccacaccaaaatgagtacgatggat
ggggttgtgaatgttcctgatttgtttaaattattatcaaaatgaaatcaccaagcaatt
gctattactgatcacttaaatattcaagttttctccgaggtttataacactagtttaaaa
tatccggatttgaaggttatttatggattagaggcggatgtgttagatgatgtagtttgg
tatgttaaaaacccgcaacagcataatttacgaacagcaaaatatgttatttttgacttg
gaaacaacggggttaagtaatgaatatgatgaaattattgaatttggagcagttattatg
gatgggattagtggtgaacgagaaactattaatcacttatttaaaccaagtataaaatta
tcttcgttcaccaccgaactaaccggaattactgatgatatgttacaagataaaccaact
ttcttagaatcagtagataagattttagactattttcaagatgcaattttagtggcccat
aatgctgagtttgatattgggtttattcaatcctgaattcaaaaagcagggcatccaaaa
atcaataatacaataattgatactttgcaattatctcgagctttagaaagtggattaaaa
aattatcggttaggaagtattgctcgccgctataatgttatttataatgaagaagttgcg
caccgcgcggattatgatgctattgtcttagctgatatttatgaacatcaacttcgtaaa
atgattaacgaatttaatgttgaaattgatgacgacttaaataaaattcataataaccaa
gtttatcaaaaaatgcgggctaaacatttaactattttagcaaaaaaccagtctgggatt
ttagatttgtttaccttagttaccaaatcacatactgattacttttattcttcaccaaaa
ttattaaaaagtgttattaatcaacaccgcaaaaatttattaattggttcttcttgtgtg
aatgggaaaatttttgaattagcgcggaataaatcaaatgaagagttagaagaagcaatg
gcattttatgattatattgaagtccaaccaccaagtgtttataaacacttagtacaacta
ggagatttaacccaggagcggttgctaaccgtcattagtaatattattcacattgctaaa
aaattaaataaactagtagttgcaacaggggatgtccactatttaaatcccgaagacaaa
atcttccgtgaagtttatattcattcaaaaggaattgggggaaaaccgcaccctttattt
gactataaaaatcggattagcgagtatcctgagcaatttttacgaacaaccaatgaaatg
cttgcagagtttaatttcttaaatgatgaaaaattagcatatgaaattgtggttgaaaat
actaataagattgctgatcaaattgaaaaagttcaaattattaaagataaactatatact
ccatcaattgaaggtagtgaccagttattaaaagaattatgttataaaaatgcttatgca
aaatatgggaacccgctgccaaaaattgttgctgagcgtttagaaagtgaattaactgca
attattaaacatgggtttggggttatttattgaattgcccataaactagttgataaatca
ttacgtgatggttatttagttggatcacggggaagtgtgggaagtagttttgttgccact
atgagtgcgattaccgaagttaaccctttacaaccccattatatttgtgcgaactgccgt
tatagtgaatttattacagatggaagtgtgcggtgtggttatgacttagttgacaaggga
tgcccccaatgtcaaaatattatgcacggagaaggtcatgacattccgttcgaaacattc
cttggttttgaagcagacaaggtccctgatattgatttaaacttttctggagaataccaa
ccagtggcccatgattttaccaaagaaatgtttggggaacgcagtgtttatcgtgctgga
acaatttctacagtggcccaaaaaacagcatttggttatgttcgaggatattttgaagcc
aaaaatattctacatttaaaacgaaaaagtgaaattgagcggattactaaagcttgtgaa
ggggttaaaagaactaccggtcaacacccgggtggaattgttgttattcccaatgagtac
caagtggaagcttttacgccggttaactttcccgctgatgatacgacatctagttggcta
actacccactttgattttcacgctattcatgataacgtcttaaaacttgatattttagga
catgtcgaccccactgttctaaaaatgttacaagatttaactggggttgatcctaaaaca
attccgacaaatgatcccgcggtgttaagtctctttcaaaatttagatagtttaaaaatt
agtccggaagatattaataatgaaaaaacgggagcgattggaatccccgaatttgggact
ggttttgttcgcaagatgttattagacacgaaaccatcatcatttgctgatttagtccaa
gtttcggggttatcgcacggaactgatgtttgaattgggaacgcccaagatctaattaaa
aaccataatattacaatttcccaagttattggttgtcgagatgacattatggttaactta
atttataaagggttacctgctaaaagtgcttttaaaattatggaagatgtccgtaaagga
cgaggattaactcctgagcatgttgagctaatgaaagaacataatgttgaacaatgatat
attgattcatgtaacaaaattaaatatatgttccccaaagcgcatgccactgcttatgtt
ttaatggcgtgaagaattgcttggtttaaaattaattacccggttgaatattatgccaca
tatttttcaacccgcactgatgtgtttgacattaaaacaatcttaaaagggaaagcgacc
atccaaaatgttttacgtgacattcaaactcgtttagaatcaaaagactttaatatgctt
aataaaccttcgcaaaaagaaaaagacctaattcctgtttacgaagttgcgttagaaatg
tatgcccgtggaattaaaatgaaaaatattgatttgcaaactagtgatataaagaatttt
aaagttattgttgaaaatggtgaaaaaataattttaccaccatttgcgacgattgatggt
ttgggcgaagcagtcggggaaagtattgtctcagcacggaatactaaacaatttatttca
attaatgatttacaaaaaagaactaatattaccaaagcacatatgcaagcttttgaagaa
ttaggaattctaaatcatctttctgaggatgatcaaataacatttaatttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
