Spiroplasma eriocheiris: SERIO_v1c09860
Help
Entry
SERIO_v1c09860 CDS
T03974
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
seri
Spiroplasma eriocheiris
Pathway
seri03030
DNA replication
seri03430
Mismatch repair
seri03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
seri00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
SERIO_v1c09860 (dnaE)
03430 Mismatch repair
SERIO_v1c09860 (dnaE)
03440 Homologous recombination
SERIO_v1c09860 (dnaE)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
seri03032
]
SERIO_v1c09860 (dnaE)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
seri03400
]
SERIO_v1c09860 (dnaE)
Enzymes [BR:
seri01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
SERIO_v1c09860 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:
seri03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
SERIO_v1c09860 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:
seri03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
SERIO_v1c09860 (dnaE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
tRNA_anti-codon
RE_MamI
DUF6930
HROB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKM54544
UniProt:
A0A0H3XLU2
LinkDB
All DBs
Position
complement(1076529..1079573)
Genome browser
AA seq
1014 aa
AA seq
DB search
MGKMHLNVRTNYSLLSSLIAIDNYLAYGQTNGLSVLAICDNNMYGVYEFHEKCRTRNITP
VLGLNFYTYFNNQKYNLNLFAINQTGYFNLVKISSWIMTTNEKENVIDFSALITLINDNL
KIIINFEEANYDVVFYQKLLTSLNNSDNLYLGLNNNNLMLLSFFKELVPVNKIIWNNKVL
YFDKTDFNAYKIINAIKKQILFKESTVKDTFAFDNYSPEYEQYLDNINAFISNIQFYDLK
HQNIHDNLLKYPTPENVASRDFLRGICKKGMEYKLGTQVENKYLVRLKYELDIIDQMDFN
DYFLIVWDYVNFAKKNNIYVGPGRGSAAGSLVSYLLDITTIDPVQENLIFERFLNPERQG
MPDIDIDFQDDKREAVVEYLFEKYGQEHIAHIVTFQTIGMKMALRDVCRVFGISLEEADK
MSKAVRLEDNYNFTNAFTNNNVLDFYSKKYPQIFLYLPKIVGLPRQTGTHAAGVVLSQKP
LATVVPIREGYNGIYQTQYSMNYLEELGLLKMDLLGLRNLTILHNVIDNIYQEIKVKINL
QKIPLNDTKTFKLLSSGDTKGIFQLESPGMTKVLIEMQPDKLEDIVATSSLYRPGPQDNI
PLYIQRKNYHVKFSYLDERLKDILAPTYGIIVYQEQVMLIAQKVANFSLAKADILRRAMG
KKESSYMNELKTEFLNNAVKNHYTPEIANDIWNLIYKFAAYGFNRSHAVAYSLLGYQMAY
LKANYPSQFLASLLTNVIGDENKTADYIQLARKNNLGILPPSINLPLSTYVTRDNQICLP
LLVIKQIGYAFYNKIAQEYHAHGEFQDLYDIFIRLYKKGLNKKTYEALCYAGALDNLNFN
RTTLFNNYNLLANYVEVIKVSENNEQLIVDLHLAEKPEIVIFEDDIINNIKKEYEFLGFY
LSNHPLKYIRTLEGYEQKTTLISDLKLSQGTTNILVIIKRVKEIFDKNNKKMAFVDCYDE
SGAISITVFANQYQQYATLLKPNNVILLNIKLGSYQDKINGIMNRIKLITTEDK
NT seq
3045 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtaaaatgcatttaaatgttcggacaaattatagtttattatcatcgttaattgct
attgataattatctagcctacggacagacaaatggtttatcagttttagcaatttgtgat
aataatatgtatggtgtttatgagtttcatgaaaaatgccgtacgcgcaacattacgccc
gtgcttggtttaaacttttatacttattttaataatcaaaaatataatttaaacttgttt
gcgattaaccaaacgggctattttaaccttgttaaaatttcatcctgaattatgaccact
aatgaaaaagaaaatgttattgatttttcagctttgataacacttattaatgataattta
aaaattattattaattttgaagaagctaattatgatgttgttttttaccaaaaactatta
acatcgcttaataactccgataatttatatttaggtcttaataataacaatttaatgtta
ttatctttttttaaagaattagttccggttaataaaattatttgaaataacaaagttctt
tattttgataaaacagattttaatgcttataaaattattaatgcaattaaaaaacaaatt
ttatttaaagaaagcacagttaaagatacctttgcttttgataattatagtccggaatat
gaacaatatttagataatattaatgcttttattagtaatattcaattttatgatttaaaa
catcaaaatattcatgataatttattaaagtatccaactccggagaatgttgctagtcgt
gatttcttacggggaatttgtaaaaagggaatggaatataaattaggaacccaagttgaa
aataaatatttagttcgtttaaaatatgaattagatattattgaccaaatggattttaat
gattattttttaattgtgtgggactatgttaattttgcaaaaaagaataatatttatgtt
ggccctgggcggggaagcgcggctggaagtttagttagttatttgttggatattaccaca
attgatccggtgcaagaaaatttaatttttgagcgttttttaaaccccgagcgccaagga
atgcccgatattgatattgactttcaagatgataaacgtgaagcagtggtggagtattta
tttgaaaaatatggtcaggaacatattgcccatattgtcacctttcaaacaattgggatg
aaaatggccttacgggatgtttgccgggtgtttggtattagtttagaagaagccgataaa
atgagtaaggctgttcgcttagaggataattataattttacgaatgcttttaccaataac
aatgtgttagatttttatagtaaaaaatatccccagatctttttatatctcccgaaaatt
gtgggcttacctcgtcaaactggaactcacgccgctggagtagtactatcgcaaaagcca
ttagcaactgtggtgcctattcgggaaggctataatggcatttatcaaacccaatactca
atgaattatttagaagaattagggttattaaaaatggacttattaggattgcggaattta
accattttgcataatgttattgataatatttatcaagaaataaaggtaaaaattaacctg
cagaaaattcccttgaatgataccaaaacttttaaattattatcctcgggagataccaag
ggaatttttcagttagagtcacccgggatgaccaaggttttaattgaaatgcaaccagat
aagttagaagatattgtcgccacctcttcgttatatcgtcctggaccccaagacaatatt
cccttgtatattcaacgtaaaaattaccatgtaaaattttcttatcttgatgaacgatta
aaagatatcttagctccgacatatgggattattgtttaccaagagcaagtaatgttaatt
gcccaaaaagttgctaatttctcactagccaaagcggatattttacgccgcgccatggga
aaaaaagaatcaagttatatgaatgaattaaaaacagagtttcttaataatgcggtaaaa
aatcattatactcccgaaattgccaatgatatttgaaatttaatttataaatttgcggct
tatggttttaaccgtagtcacgcggttgcttattcactcttgggctatcagatggcttat
ttaaaagccaattatccatcccaatttttagctagtttattaacaaatgtgattggggat
gaaaataaaacagccgattatatccaattagcaagaaaaaataatttagggattctacct
ccttcaattaatttacccctaagtacatatgtgaccagagataatcaaatttgtttacca
ttattagtaattaaacaaattggctatgcattttataataaaattgcccaagaataccac
gcacatggggagtttcaagatttatatgatatttttattcggttatataaaaaagggtta
aataaaaaaacctatgaagcattatgttatgccggagcattagataatcttaattttaac
cgtacgacattatttaataattataatttactggccaattatgttgaagttattaaagtt
tcagaaaataatgagcaattaatagttgatcttcatcttgctgaaaaaccagaaattgtt
atttttgaagatgatattattaataatattaaaaaagaatatgagtttttaggtttttac
ttatctaatcacccgctaaaatatattcggactttagaaggatatgaacaaaaaactact
ttgattagtgatttaaaattatcacaaggaacaaccaatattttagtaattattaagcgg
gtaaaagagatttttgataagaataataaaaaaatggcctttgttgattgttatgatgaa
agcggagcaattagtattactgtttttgctaatcaataccaacaatatgccactttgctt
aaacctaataatgtaattttgttaaatattaagttaggtagttaccaagataaaatcaac
ggaattatgaaccggattaaattaattaccacggaggataaataa
DBGET
integrated database retrieval system