Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- CFSAN001921: CFSAN001921_24505
Help
Entry
CFSAN001921_24505 CDS
T02737
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
setc
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- CFSAN001921
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
AC_1
PATR
CFAP143
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGQ71194
LinkDB
All DBs
Position
unnamed:139578..143372
Genome browser
AA seq
1264 aa
AA seq
DB search
MAGSAGLAGAGGKGGNGGDVPIGSPTTRGKRGEDGAFGENGINGRVGNGGAGGTAINISA
DGVILLNQGKVLGGTPGSINAQPGEAIVVSGKNSHIINDIGGEIRSSGLNSKAVEYEAGA
DNGIFEMRTNSIVDGVVDATKISNSKLVLGGNTAKENSTFIASKIGNGRQYQGFSNYEVN
TSEGSTWNLIGETTALTPWTVTEGTLAIVSDHSLGSTDGALTLNGGVLQTVLNVNSDRRF
NLTAESLNGGILTDGDLTLTNVISGVGGLKKTGNATLILGGQNDYTGRTIISSGNLFLTG
EGGIEHSESVELSKGTSLNISSTTGGTMVNNLTGDEGSHVVLGDRFLTVNSLADSVFSGE
FGAEGETGGLLKTGAASFTLAGQNNYTGDTTVSAGKLSLSGDSNIEKSGNVRLNRDATLD
ISATTNGTMVNNLTGDEGSHVVLGDRLLTVNSLADSVFSGEISGNGSLIKKGQGDMTLDG
INSYQGITRIDQGNLRINSDQSLGGGNKNNSDLIMNGGGLKIFGSFASDRDVYFNADGDI
SVDKDMSSSWNKIHTGDYKFTKSGEGELIVRNGGDASEISLMNGALTLINLNMNSEKQDA
LLNVNNGVLNIIGGDVSAKNDLIYITGDSTINLDNVSIKSSGNGMRLSDNVQSTLSLRNQ
YTDMPILVEGKNSILNINAGDNTTLASNMHKSDESTINLNLMNNSSNWVISQRTDVDNVR
NSGNIIFSPLNKSEFNNLNIKGDYSGGNGTITLNTVLNKGGDKDQQLSDKVLIKGNVSGE
TVLKVVPQGNGDNTASAPGNIFSSRDGISLVQVGGDAADNAFKLDREYISTGTKSPYQYR
LFTYRGDQVDQQSNFLGDKPVNVDFRLQTAYLDSSGNVVPGVDPDYNNSNNENGNGTGND
NGTGNGNGTGNGTGNGTGNGTGNGTGNGTGNGTGNGTGNGNTGERKSRPLIVRQASSYLS
LPAALSNYSNFVLDNIDRRLGDIYSKNNNKQIKDFDFYYRFITSSDSYKSNLDLDNYGYD
FKQKNNAMSIGTNWTAFDYGNNKVFLGANYTFGDSRTNVTNSSQESSYMVVNANTFSLTG
TLINVNDYYIDGVLSYGLYNGHIYNNREKISRVKADSFDLSIEFGKRFDLVNSLEIEPQV
QLISRNLYINKVVDDNDLSVDINNQHPIIGRAGFKLSYLVPGTESWKPYFRADVINDFSN
SKNVKIEGVSFKTGKNGGKFNTVIGASGMLSPDLSLYGELSSYQRINGFGFDGQDFNIGI
RYSF
NT seq
3795 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtggccgggtctgctggtctggccggtgccggtggaaaaggaggaaatgggggggatgta
ccgattggatcaccaacgacacggggtaaacgaggtgaggatggtgcttttggtgaaaat
ggtattaatggccgagtcggtaatggaggtgccggggggacggcgataaatatatccgca
gatggggtgatactacttaaccaagggaaagttttgggcgggacgccggggtcaataaat
gcgcaacctggcgaagcaatagtggtaagcggtaaaaacagtcacattataaatgatata
gggggtgaaatacggtcatcaggtctaaacagtaaggcagtggagtatgaggccggagct
gataatggcatttttgaaatgagaactaacagcattgtagatggcgtcgttgatgcaacc
aaaattagcaatagtaaactagtattaggtggtaacacggctaaagaaaattcaacattc
attgcctcaaaaattggaaatggaagacagtatcaaggtttttcgaattacgaagtaaat
acttcagaggggagtacatggaatttaattggagaaacaactgcccttactccatggact
gtaactgaaggaacacttgcaatcgtgagtgatcactctctggggtctacagatggagca
ttaactctcaatggtggtgtgttacagacagtactcaacgtaaatagtgacagaaggttc
aatctgactgctgaatctctaaatggcggaatactaacggatggagatttaacattaaca
aatgttatttcaggagtgggcggattgaaaaaaacgggaaacgccacactgatacttgga
ggacagaatgattacacaggccgtactattatttcctcaggaaacctttttttgacggga
gaaggtgggattgagcatagtgaaagcgttgagttaagcaaaggtacttctctgaatatc
agttccacgaccggcggcaccatggtaaacaatcttacgggtgacgaaggaagccacgtt
gtgctcggtgaccggttcctgacagtgaacagcctggccgactctgttttttccggtgaa
ttcggcgctgaaggtgaaacaggaggcctgctaaagacaggggcggcctcattcacactg
gcaggccagaacaattacacgggcgacacaactgtttctgccggtaaattgtccctgtct
ggtgacagtaacattgagaaaagcggaaatgtcagacttaacagggatgcaacgttagac
atcagtgcgacgaccaacggcaccatggtaaacaatcttacgggtgacgaaggaagccac
gttgtgctcggtgaccggctcctgacagtgaacagcctggccgactctgttttttccggt
gaaattagtggtaacggttctttaataaagaaaggacaaggtgatatgactttggatggt
attaattcataccagggaatcactcggattgatcaggggaatctgcggattaattcagac
caaagtctcgggggggggaataaaaacaattctgacttaataatgaatggaggagggcta
aaaatatttggttcatttgcatcagacagggatgtatattttaatgctgatggtgacatc
tctgtcgataaggacatgagttcttcttggaataaaattcacaccggggattacaaattt
accaagagtggagagggtgagttgattgttaggaatggcggtgatgcaagtgagataagt
ttaatgaatggcgcattaacacttatcaatttgaatatgaactcggaaaagcaagatgcc
ttgttgaatgttaataatggcgtattaaacataattggaggggacgtttctgcaaaaaat
gatttaatctatatcactggggatagtacgataaatctggacaatgtaagtattaaatcc
tcaggcaatggtatgagattgtctgacaatgttcaatcaactttgtcgttaagaaatcag
tacaccgatatgccaattcttgttgagggtaagaatagtattcttaatatcaatgcaggc
gacaatacgacgttagccagtaacatgcataaatctgacgaatctactattaacttaaac
ctgatgaataactccagtaattgggtgatatctcaacgtacagatgttgacaatgttaga
aatagcgggaatattattttttcaccacttaataaaagtgaatttaataacttaaatatt
aaaggtgattatagtggaggaaatggtactataactttaaatactgttctgaataagggc
ggagataaagatcagcagctcagtgataaagttcttattaagggtaatgtctctggtgaa
actgtactcaaagtagttccgcaaggtaacggagataatacagcatctgctcctggtaat
atttttagcagcagggatggtatttctttagttcaggttgggggcgatgcagcagataat
gcatttaagttagatcgtgagtatatatccaccgggactaaaagcccttatcagtacagg
ctttttacatatagaggcgatcaggtcgatcaacaaagtaattttctgggggataagcct
gtaaatgtagattttagactacaaaccgcatatctggatagctctggaaatgtggtgcca
ggagttgatcctgattataataattcaaacaatgaaaacggtaatggcacagggaatgat
aatggtacagggaatggaaatggtacgggaaatggtacaggaaatggtacaggaaatggt
acaggaaatggtacaggaaatggtacaggaaatggtacagggaatggtacagggaatgga
aatacgggggagaggaaatcacgcccgctcatagtcaggcaagcaagctcatatttaagt
ttaccagcagcacttagcaattacagtaactttgttctggacaatatagatcgccgactg
ggggatatttattctaaaaataataataagcagatcaaagattttgatttctattataga
tttattacgagttcagacagttacaaaagtaatctggatttagataactatggatatgat
tttaagcaaaaaaataatgccatgtctataggtacaaactggacggcatttgattatggt
aataataaggtatttttaggagcgaattatacatttggagacagtagaactaacgttaca
aattccagtcaagaatccagttatatggttgtcaatgccaatactttttcgttgactggt
acgctaattaatgtaaatgattattatattgacggagtgttatcatatgggctatataat
ggacatatctacaataatcgagaaaaaatttctcgggttaaagctgatagttttgattta
tctatagagtttggtaagaggtttgatcttgttaactcattagaaattgagccacaagtt
cagcttatatccagaaacttatatataaataaggttgttgatgataatgatcttagtgtg
gacatcaataaccaacatccaattataggacgagcaggatttaaattgtcttatcttgtg
cctggtacagaaagctggaagccgtatttcagagcggatgttattaatgatttcagtaat
tcgaaaaatgtgaaaattgaaggggtcagttttaaaacagggaaaaatggtgggaaattt
aatactgtaatcggagccagtggaatgttaagtccagatctttcgctgtatggtgaactc
tcgtcttatcaaagaattaatggttttggctttgatggacaagattttaatattggaatt
cgttacagtttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
