KEGG   Shewanella eurypsychrophilus: FM038_002615
Entry
FM038_002615      CDS       T07746                                 
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
Organism
seur  Shewanella eurypsychrophilus
SSDB
Motif
Pfam: CarboxypepD_reg TonB_dep_Rec CarbopepD_reg_2 SdrD_B Plug fn3_3 SpaA
Other DBs
NCBI-ProteinID: QPG56435
UniProt: A0A550ABR1
LinkDB
Position
628299..631307
AA seq 1002 aa
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NT seq 3009 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
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DBGET integrated database retrieval system