Shewanella eurypsychrophilus: FM038_012985
Help
Entry
FM038_012985 CDS
T07746
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase
Organism
seur
Shewanella eurypsychrophilus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
DEAD
ERCC3_RAD25_C
AAA_14
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QPG58256
LinkDB
All DBs
Position
complement(3056656..3059958)
Genome browser
AA seq
1100 aa
AA seq
DB search
MVHLEEIFSQSVIFDALGILLGTHLKHDYQGSILLAEFSAVSADIEGEQLDCDSRTLDSI
SNRTTPSNSIFAQLDWAAGPIIASKNTHCSQCVGSTFSCIHIAAIAIDYLARQTPIMPYP
SEKKRADTAQRLLRTELNQRFDPYPNMARHRIVYLLSRKGDQLQLDVHKGYVGKTGKHSL
KNDLGFEVLHRSSQPKFVTQTDLWILNQLRPLLTAIDPKLSKEQEEKISLSIDSICDNEF
ITMLVLTQRCFWQSCDQQPLKFEQHYLNDFIDTGYFYKVSQDAYIDFSSMSMINTRSAAA
FSNAKCSDQLLALMADDDRDWLPKLTISRHINGSDIDNNQLDLDLVSFSFISDHHEVNLE
QVFALSSELPHFLTLAAELNVQLINFPLLSSQFEATVWHQFAVGTRLLPQLSALQMIMFR
RLMLAGWLIDLQLKNRYSLVKPQAWYGELGHQVANKNWFELELGVELDGKKINILPYLVK
AIRKGLLQNLSDSESVLMELDSGQRLSLPAKRVKQILDVLVELYETKPLTETETLTLPMH
QLTRLAELTLLTQGDNKEWQWQGSSWLKNKAEQVYRYLGSGTDNSVTSVKGLNAELRDYQ
HVGLNWLQFLKRHEFSGILADDMGLGKTIQTLSSILVDKDSGKLTKPCLIVAPTSLLANW
YHEAQNFAPELRLLLWTGPKRHKLKEQVNDSDLIITSYGTLQQDAESWSDQHFHLIILDE
AQTIKNVRSRISRVVASLSGSHKLCLTGTPLENHLGELWSLFNFLMPGFLGTYAQFQRHY
QVPIERDKDDERRIALVQRITPFMLRRMKADVASELPEKTIINEYINLTEAQGDLYETIR
LTMSEEVRKAVSVSGVKRNRLAISNALLKLRQVCCHPDLLKLDLASKDTPVDSQINPAEV
ELNKSQHPKVNLDNSAETLTDINPFHTSSGKLNWLVDKLPTMLEDGRRILIFSSFTSMLS
LISALLEQLKIGYIELTGKSRNRGELVNRFQQGEVPVFLISLKAGGAGLNLTAADVVIHT
DPWWNPAAEQQASDRAHRIGQDKSVFVYKLICKDTVEERIQLLQESKQDLANSIYLQEST
KVSDMTGDDWLDLLKPIELD
NT seq
3303 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggtccatttagaagagatttttagtcagtcggtgatattcgacgcgttaggcatattg
ctgggtacacatttaaagcatgattaccaagggtctatacttttggctgaattttcagct
gtgagtgctgacattgagggtgaacagcttgattgtgactcgcggactttggattcgatt
agtaatagaaccactccatcaaactcgatttttgcgcagttagattgggctgctggcccc
attatcgcgtctaaaaatacgcattgtagccagtgtgtcggcagtacgttttcatgcatt
catatcgccgctattgcgatcgattatctcgccagacaaacacctatcatgccgtatccc
agtgaaaagaagcgggccgatacggcacaaagactacttagaactgaactgaatcagagg
tttgatccctacccaaatatggctcgccatagaattgtgtatctgctaagtcgcaaggga
gatcagctgcaactggatgttcataaaggttatgtgggtaaaacgggaaagcattcgcta
aaaaacgacttaggttttgaggtattacatagaagcagccaacctaagtttgtcactcag
acggatctctggatattgaatcaattacgaccattgttaacagcgatagatcccaaatta
tcaaaggaacaagaggaaaaaatctcactcagtatcgattcgatttgcgataacgagttt
atcaccatgcttgttcttacccagagatgcttctggcagagttgcgaccaacagccgctc
aaattcgaacaacattatttaaatgacttcattgatactggctacttttataaagtcagc
caggatgcttatattgatttttccagtatgagcatgataaacacaaggtctgcggctgcc
ttttcaaatgcaaaatgcagtgatcaacttttggcattgatggcggatgatgatagagat
tggctgcctaagttaaccatctctcgtcacatcaatggatctgatatcgataataaccaa
cttgatcttgatttagtcagcttttcatttatcagtgatcatcatgaagtcaatttagaa
caggtttttgcattgagtagtgaactgccacacttcttgacacttgctgccgagctcaat
gttcagcttattaattttcctctcttgtcgtcacagtttgaagctacagtttggcatcag
tttgctgtaggtacgcgtttgttaccacagctttcagcgctgcagatgatcatgttcaga
cgcttgatgcttgctggttggcttatcgatttacagcttaaaaatcgctatagccttgtt
aagccacaagcttggtatggggaactgggtcaccaagttgccaataaaaactggttcgag
cttgagcttggcgtagaacttgatggcaaaaagattaatattttaccttatctggttaaa
gccattaggaaagggttactacagaacttgagcgattcggaatctgtgttgatggagctt
gattccggtcaaaggctttctttacctgctaaacgggttaaacagatcctagatgtattg
gtagagctttatgaaacaaagcctttaactgaaactgaaacattaaccttgcctatgcat
cagctaacgcgccttgctgaactgactttgttaactcaaggagataataaagaatggcag
tggcagggcagcagttggcttaaaaataaagctgagcaagtatatcggtatcttggaagt
ggaaccgataacagtgtgaccagtgttaaagggctcaatgctgagttgagggattatcag
catgtaggtctaaactggctacaatttctaaaacgtcatgaattttctggtattttggct
gatgacatggggctggggaagaccattcaaaccttgagttcgatattggtggataaagat
tccggcaagttaaccaaaccttgtttaatcgttgccccgacaagcttattagcaaattgg
tatcacgaagcccagaattttgcgcctgaattaagactgcttttatggactgggcctaag
agacataaattaaaagagcaggtgaatgatagcgatttaatcattacaagttatggcacg
cttcaacaagatgctgaatcttggtcagatcaacactttcatctgatcattctcgatgaa
gcgcaaaccatcaagaatgtacgtagccgtattagtcgggtagttgcgagtttatcaggg
tctcacaaattgtgtttgactggcaccccacttgaaaatcatcttggtgaattgtggtct
ctgtttaattttctgatgccaggttttctgggcacttatgctcagtttcagcgccattat
caagtgccgatagagcgtgataaagatgatgagcgacgcatcgcgctggtgcaaagaatc
accccttttatgcttcgtcgcatgaaagcagatgttgctagtgaattgcctgagaaaacc
atcattaatgaatacattaatctgactgaggctcagggtgatttatacgagactattcga
cttaccatgtcagaagaggtgagaaaagctgtatcagtttctggtgtgaagcgtaatcga
ttagcgatcagtaatgccttattaaaactgagacaagtctgctgtcatcctgatctgttg
aagcttgatcttgcctcaaaggatacacctgttgactctcaaataaacccagctgaagta
gagctaaataagagtcagcacccaaaggtcaaccttgataatagcgctgagacattaacc
gacattaacccttttcatacctcttcaggtaaactaaattggttggtggataagctaccg
actatgcttgaagacggaagacgaattctgatcttctcttcttttaccagcatgttaagt
ttaatttcagcgttacttgagcaattgaaaattggctatattgaactcactggtaagagt
cgcaatcgtggagaattggttaatcgttttcagcaaggtgaggtgccggtatttttgatc
agcttaaaagctggcggtgctggcctgaacttaacggcggctgatgtcgttattcacacc
gatccatggtggaatcccgccgccgagcaacaggcaagtgatagggctcatcgaataggt
caagacaagtcggtttttgtttataagttaatctgtaaagataccgtagaagaacggatc
cagttattacaggaatcaaagcaagatctcgctaacagtatttacctgcaggagagcacc
aaggtatccgatatgacaggtgatgactggctcgatttacttaaaccaatagaactcgat
tag
DBGET
integrated database retrieval system