Shewanella eurypsychrophilus: FM038_015345
Help
Entry
FM038_015345 CDS
T07746
Name
(GenBank) PAS domain S-box protein
Organism
seur
Shewanella eurypsychrophilus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Response_reg
PAS_9
PAS
HATPase_c
HisKA
PAS_8
PAS_4
Diguanyl_cycl_sensor
Hpt
HAMP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QPG58635
LinkDB
All DBs
Position
complement(3658914..3662483)
Genome browser
AA seq
1189 aa
AA seq
DB search
MTFRLKTVLGIALIEGVLLMLLVYTSVDYLKSSNQAEIEKRARSVVTLFAAAAKDAVIST
DVSTLQELSSELLDNTQVLYVEIYDRSDLLVRAGEPGLKNAQDPRNLNENTDQFVLQGSG
ASAVSSFVGVEDGVLDVTANIVESGYTFGRVELGISVSEFDQFLASATKRFTSIAGLEMV
LVALFSWLLGSYLTKNLSQLKRASKRILNGETGIQIPVNSNDEIGQTTRAFNQMIEKIEM
NTNELESANTRLSTILEAAVDGFIIINTKGIIVQVNPAVGQLFGYDNDELIGKNVAIFMP
SHERHMQSDFLLGFVNSKKDVAQGRGKELVAQHKSGKLFPIELSVSKMSIEGQIMLLGLV
KDLSDVKRKEADAKRTESILLATLEASQDALITIDITGRIQEFNDAASLLFGHSREAALG
EILEDLIFVDIERKAFKEGLETFRQTGSGPAIRKSIELMSMRADGSNFPVEMKLIPVQLG
DEILLTAFIHDVSERLQYETQLKQAKEQAELGSKAKSRFLATMSHEIRSPLNAVLGGVEL
MLDSKLNKDQRIYAHTAKEAGTALLSTINDILDFSKIEAGQMVLENMSFSPAKMVAQVMQ
ILAPKAHEKGVNLATFINRNVPDLVKGDAQRLRQVIHNLVDNAIKFSSGGCVSVEMWIPD
SHHQEVQLFCAVTDEGIGISLPAQKKLFKEFSQVHDEHNTIYKGTGLGLAISSELITMMG
GKIELSSRLGHGSCFRFDVRLQLVEQTANHLNHIPAHARVLLVHPDKTFSHLVRKQYSQY
GVNTINVGKVSDILKLEEVRGRFNLILFDDSCMSDLNVKLVNQLKRDFIFDEGMVAALMS
GLNPDMPGVLADIGLEQVINKPLSREMMLGLLSGESPCEYEIGDVETVLPELTARNKRLL
LAEDSPSNRVIAGAMLAKSGFEVEYAHNGREAVIMSAENSYGLILMDMRMPEMDGVEATK
EILLSRPDTIILAMTANVQKEDVESCLNAGMKDFVAKPVNQVELVKAINKWLPEMKVIEE
PNIYRLHSGKNVEKSCEESCEESAQELSLNQQPTIDDVMNAKIEDSKVVEIKVISIEKIF
DELVLSELYEALGQESLEGMFKVYLQETRERLATLESLTLSMNFDEIDDQAHTLKSSSGS
FGAQALYEVAKCLENSAREKDLKEVESYLAEVKEVGEQTIKAFSKRFAA
NT seq
3570 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacgtttagattaaaaacggtattgggcatcgctttaatcgaaggggtgctgttaatg
ctattggtgtataccagtgttgactacctgaaaagctctaatcaggccgagatagagaaa
cgtgcgcgttctgtggtcacgctttttgccgctgccgcgaaagatgcggtaataagtaca
gatgtatccactctacaagagttgtcgagtgaattgctcgacaacactcaggtgttgtat
gtggagatttatgataggagcgatctgttagttagagcgggagagcctgggcttaaaaat
gcccaagacccaaggaaccttaatgaaaatactgatcagtttgttttgcaaggaagcggg
gcgtctgctgtctctagtttcgttggcgtagaagatggcgtgctagatgtgacggctaac
atcgtcgagtctggctacacctttggccgagttgaacttggcataagtgtgagtgaattt
gatcaattccttgctagcgccacaaaacggtttacatcaattgccggactcgagatggtt
ttggttgccctgttttcatggttattaggcagctatctaaccaaaaatttaagccagtta
aagcgagcgtcgaaacgaattcttaacggtgagactggcattcagatccctgttaacagt
aatgatgaaattggccagacgacccgggcttttaatcaaatgattgaaaaaatagaaatg
aataccaatgagctagagagtgccaatactcgactgagtaccattttagaagcggcagtg
gatggttttattatcattaataccaaggggatcattgttcaagtcaaccctgcggttggc
cagctgttcggttatgacaacgatgagttaattgggaaaaatgtggctatttttatgcct
agtcatgagcgtcatatgcagagtgactttctgctgggatttgttaactcaaagaaagat
gtggctcaagggcgaggtaaagagttagtggcccaacataagagcggtaagctatttcca
atagagttatcagtttctaagatgtcgatagaaggtcaaataatgctacttggcttagtg
aaagacttaagtgatgtcaaacgtaaagaggctgatgctaaacgcaccgagtcaattttg
ttggctactctggaagcgagtcaagacgcattaataaccatagatataaccggtagaatt
caagagtttaacgacgctgccagtttgttgtttggccattcaagggaagcggcattgggt
gaaatcttagaggatctcatatttgtcgatatcgaaagaaaggctttcaaggaagggtta
gaaacgttcagacaaactggtagtggcccggctatcaggaagagtattgaactgatgtct
atgagagcagatggttcaaacttccctgtagagatgaagttgatcccagtgcagctcgga
gacgagatcttgttgaccgcctttatacacgatgtatccgagcggctacagtatgaaacg
caattaaaacaagcaaaagagcaagctgaattgggcagtaaagccaaatcaagatttctt
gcaaccatgagtcatgaaattcgttctccactaaatgctgtgcttgggggagtggaattg
atgctagattcaaaattgaataaagatcagcggatatacgcgcacaccgccaaggaagct
ggcacagctctgttaagtaccattaatgatattttggatttctctaaaattgaagcgggt
caaatggtacttgaaaacatgagtttctctcctgccaaaatggtggctcaggtcatgcaa
atcttagcgccaaaagcccatgaaaagggagttaatctggcgacgtttattaatcgaaat
gtacccgacttagttaaaggtgatgctcaaagattacgtcaggtgatacataacttagtc
gataatgcgattaagttttcaagtggtggctgtgtgtctgtagagatgtggatcccagat
agtcatcatcaggaggtgcaactattttgtgctgtcaccgatgaagggattgggattagc
ctaccggctcaaaagaagctgtttaaggagttcagtcaagttcatgatgaacacaatact
atctataaaggcactggactcggtttagccatcagttctgagttgatcactatgatggga
ggaaagatagagctcagtagtcgcctcggccatgggagttgctttaggtttgatgtgcgt
ttgcagttagtagaacaaacggctaaccatcttaatcatattcccgcccatgctagagtg
ctactggttcatccggataagacattttcacacttagtgagaaagcaatatagccagtat
ggtgtcaatacaatcaatgtgggcaaagtatcggacatcttaaagctagaagaggtaaga
ggtcgctttaatctgatcctgtttgatgatagctgcatgtcagatttgaacgtaaagtta
gtcaaccagttaaaacgggattttatttttgatgagggcatggtcgctgcactgatgtca
ggattgaatcctgacatgccaggtgtgctcgccgatattggtctggagcaagtgatcaat
aaacctttgagccgggagatgatgttaggcctgctcagtggcgagagcccttgtgaatat
gaaattggagacgttgagactgtattaccggaattaacggcaagaaataaacgcttatta
ctcgctgaagatagcccatctaatcgggtgattgctggagccatgctcgcaaaatcaggt
tttgaagttgaatatgcgcataatggcagggaagctgtgatcatgtcagccgaaaacagt
tatggtttgatattgatggatatgcgtatgccagagatggatggtgtcgaagcaaccaaa
gaaattttattaagccggcccgacactatcattcttgccatgacggccaatgtacaaaaa
gaagacgtagagtcgtgccttaacgctgggatgaaagactttgtggctaaacccgttaat
caagttgaacttgttaaggccattaataagtggcttcctgagatgaaggtaatagaagaa
cccaatatttatcgacttcatagtggaaaaaatgtggagaaaagttgtgaagaaagttgt
gaagaaagtgctcaggaattaagcttgaatcaacagcctacaatagatgatgttatgaat
gctaaaatagaagattcgaaagttgtcgaaataaaagtcatatctatcgaaaaaatattt
gatgaattagtgctttcagaactctatgaagcacttggacaggaatctttggaggggatg
tttaaggtctatcttcaagagactcgtgagcgattagccacacttgagtcattaactttg
tctatgaattttgatgaaatcgatgatcaagctcatacgttaaaaagcagttcggggagt
tttggtgctcaagccctttatgaagtggccaagtgtcttgaaaatagcgcacgtgaaaaa
gatttgaaagaagttgaatcatatttagctgaagtcaaagaggttggagagcaaacaatc
aaagcgtttagcaaacggttcgcggcttga
DBGET
integrated database retrieval system
