Streptomyces explomaris: SLV14_002992
Help
Entry
SLV14_002992 CDS
T11122
Name
(GenBank) Ig-like domain-containing protein
Organism
sexp Streptomyces explomaris
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Big_3_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UYB40375
LinkDB
All DBs
Position
complement(3489551..3496285)
Genome browser
AA seq
2244 aa
AA seq
DB search
MAPTFTLAFAAPNPAVFGQPVTLTATVIPLGLGTPTGTVTFVVSGGPTLTAPLVGGTATV
TTSSIPIGFHTFTANYNGSPLFSPSSGFGSINVIKASTTTVVTSSPDPSNFGQTVSITAT
VTPVAPGSGTPTGTVTFVIAGGGGGTLTAPLSGGSATVTTSSLSPGTHLITATYSGSAQF
NASSDTDTHTVLQVLAPTTTTVTSSPDPSVFGQPVTFTATVAPVPPGSGTPTGTVTFVIS
GGPTLTATLSGGTASVTTSGLSVGPHTVTATYSGSGSFASSSGTDTQTVNKASTTTTVTS
APDPSAVGQPVTFTATVAPVAPGAGTPTGTVTFVITGGPTLTATLSGGTASVTTSALSAG
THAVTATYSGDGNFNSSVGTDSHTVGQASTTTTVTSAPDPSVVGQTVTFTATVAPVPPGA
GTPTGTVTFVISGGPTLTGTLSGGVASVSTSALGAGTHTVTATYSGDANFTSSVGTDTQT
VNQASTTTTVTSSPDPSVVGQSVTFTATVAPVPPGAGTPTGTVTFVISGGPTLTGTLSGG
TASVSTSALSAGTHTVTATYSGDANFTSSVGTDTQTVNQASTTTTVTSFPDPSVTGQTVN
FTAFVGPVFPGGGVPTGTVGFVITNGVTTVTLSGTLDGAGVATVSTNGLVTAGTYTVTAT
YSGDANYTGSSDTDTQTVNPASTNTVVTSSPDPSVVGQPVTFTATVTPAAPGAGTPTGTV
TFVISGGPTLTGTLSGGTASVTTSALGAGTHTVTATYSGDANFSGSVGTDTQTVNQASTT
TTVSSSPDPSVVGQSVTFTATVAPVAPGAGTPTGTVTFVISGGPTLVGTLSGGTASVSTS
ALGAGTHTVTATYSGDANFAGSTGTDTQTVNQASTTTSVISAPDPSVVGEPVTFTATVAP
VSPGAGVPTGTVTFVATDGVTTVTLTGTLVGGTTSVVTTGLVTAGLYTVTATYSGDASFT
GSVGTDTQTVGQAATTTSVISAPDPSVFGEPVTFTATVSPVLPGAGTPTGTVTFVISGGP
TLVGTLSGGTASVTTSALAVGTHTVTATYSGDPNFTGSVGADTQTVVLALTTTAVSTTPD
PSVVGESVTFSATVAPVAPGAGVPTGTVTFVATDGVTTVTLTGTLAGGTTSVTTNGLVTA
GTYAVTATYGGDGNFTGSIGTDTQTVGQAATTTSVISAPDPSVFGEPVTFTATVAPVSPG
AGTPTGTVTFAISGGPTLVGTLSGGTASVTTSALSVGSHTVTATYSGDPNFTGSVGTDTQ
TVNQASTTTSVISAPDPSVVGEPVTFTATVAPVSPGAGVPTGTVTFVATDGVTTVTLTGT
LSGGTTSVTTNGLVTAGLYTVTGTYSGDADFSGSAGTDTQTVGQASTTTSVSSAPDPSVF
GEPVTFTATVAPVAPGAGTPTGTVTFVISGGPTLVGTLSGGTASVTTSALAVGTHSVTAT
YSGDPNFTASSGTDTQTVILAATTTAVSSSPDPSVVGEPVTFTATVAPVSPGAGTPTGTV
TFLATDGVTTVTLTGTLSGGTTSVTTSGLVTAGVYAVTATYSGDAGFSGSVGADTQTVGQ
ASTTTALSSAPDPSVVGEPVTFTATVTPVAPGTGTPTGVVTFVITGGPTLVGTLAGGTAS
VTTSALGAGTHTATATYSGDLNFTGSSDTDTQTVNQASTSTAVSTAPDPSVVGESVTFSA
TVAPVAPGAGTPTGAVTFVATDGVTTVTLTGTLSGGTTSVTTNGLVTAGLYTVTGTYSGD
ADFSGSAGTDTQTVGQSSTTTAVSSAPDPSVVGEPVTFTATVSPVAPGVGTPTGTVTFVI
TGGPTLTATLSGGTASVTTSALSAGTHTVTATYSGDSNFTTSSGTDTQTVNPALTTTAVS
TTPDPSVVGESVTFSATVAPVAPGAGTPTGTVTFVATDGVTTVTLTGTLSGGTTSVTTSG
LVTAGAYVVTGTYSGDADFTGSTGVDTQTVGQALTTTALSSAPDPSVVGEPVTFTATVAP
VSPGAGTPTGVVTFVITGGPTLVGVLSGGTATVSTNVLGVGTFPVTATYSGDLNFTGSSD
TDTQTVAQASTTTAVSSLPDPSVIGQPVTFTATVAPVSPGAGVPTGTVTFVIDGGGGGTL
TGTVAGGVVTVTTSTLDAGLHNVTATYNGDANFSTSSGTDTQTVNQASTLTTVSSFPDPS
VSGGTVTIFAFVVAQPPGSGVPTGTVTFTVTDGVTTVTLTGTVDGTGVAAVSTPLTTGNY
TITGVYSGDTNFTGSSDTDTQTVI
NT seq
6735 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcacccacctttactttggcgttcgcagcgccaaatccggctgtcttcggacagccg
gtcactttgaccgccacagtcatcccgctaggtctgggaacacccaccggcaccgtgacc
ttcgtcgtctccggcgggcccactctgaccgccccgctcgtgggtggcaccgcgaccgtc
accacgagcagtatccccatcggtttccataccttcaccgcgaactacaacggcagcccc
ctgttctcgccgtccagcggcttcgggtccatcaatgtgatcaaggcgtcgaccaccacc
gtggtcacctcgtcgccggacccgtcgaacttcgggcagacggtctccatcaccgccacc
gtcacaccggtcgcgcccggttcgggcaccccgaccggcacggtcaccttcgtcatcgcc
ggtggcgggggcggcacactgaccgccccactctccggcggttcggcgaccgtcaccacc
agcagtctcagtcccggcacccatctcatcaccgcgacgtacagcggcagtgcgcagttc
aatgcgtcgtccgacaccgatacacacacggtgctgcaggtcttggcaccgacgaccacc
acggtcacctcgtcccccgacccctcggtcttcgggcagccggtgaccttcacggccacc
gtcgcccccgtcccgcccggttcgggtaccccgaccggcacggtgaccttcgtcatcagc
ggcggcccgacgctgaccgcaacgctctcgggcggtacggcgagcgtcaccaccagcggt
ctcagcgtggggccacacaccgtgaccgcgacctacagcggcagcggcagcttcgcgtcg
tcgagcggtacggacacccagacggtcaacaaggcctcgacgaccaccacggtcacctcg
gcgccggacccgtcggcggtcggccagccggtgaccttcacggccacggtcgcgccggtg
gcaccgggcgcgggcaccccgaccggcacggtcaccttcgtcatcacgggcggcccgacg
ctgaccgccacgctctccggcggtacggcgagcgtcaccaccagtgccctgtccgccggt
acgcatgcggtcaccgcgacctacagcggtgacggcaacttcaactcctccgtcggcacg
gacagtcacacggtggggcaggcctcgacaacgaccacggtcacctcggcgccggacccg
tcggtggtcggccagacggtgaccttcacggcgacggtcgctccggtgccgccgggtgcg
ggtacgccgaccggcacggtcaccttcgtcatctccggtggcccgacgctgaccgggaca
ctgtccggaggggtggcgagcgtcagcaccagcgcgctgggcgccggcacgcacacggtg
accgcgacgtacagcggtgacgcgaacttcacgtcgtcggtcggtacggacacccagacg
gtgaaccaggcgtcgacgaccacgacggtcacttcgtcgccggacccgtcggtggtcggt
cagtcggtgacgttcacggcgacggttgctccggtgccgccgggtgcgggtacgccgacc
ggcacggtcaccttcgtcatctccggcggcccgacgctgaccggcacgctgtccggtggg
acggcgagcgtcagcaccagcgccttgagcgccggcacgcacacggtcacggcgacctac
agcggtgacgcgaacttcacgtcgtcggtcggtacggacacccagaccgtcaaccaggcc
tcgaccaccaccacggtcacctcgttccccgacccctccgtgacgggccagacggtcaac
ttcaccgcctttgtgggaccggtgttccccggtggcggagtcccgaccggaaccgtcggc
ttcgtcatcaccaacggggttaccacggtgaccctcagcggcaccctcgacggcgccggc
gtcgcgaccgtcagtaccaacggactggtcacggccggcacttacaccgtcaccgcgacc
tacagcggagacgcgaactacaccggctccagtgacaccgacacccagacggtgaacccg
gcatcgacgaacacggtggtgacgtcgtcgccggacccgtcggtggtcgggcagccggtg
accttcaccgccacggtcacgccggccgcgccgggcgcggggacgccgaccggcaccgtc
acgttcgtcatcagtggtggcccgacgctgaccggcaccctttccgggggtacggcgagc
gtcacgaccagtgcgctgggcgccggtacgcacacggtgacggcgacctacagcggtgat
gccaacttcagcggttcggtcggtacggacacccagacggtcaaccaggcgtcgaccacc
actacggtcagctcgtcgccggatccgtcggtggtcggtcagtccgtgaccttcacggcc
acggtcgcgcccgtggcgccgggggcgggtacacccacggggacggtgacgttcgtcatc
agtgggggcccgacgctggtcggcacgctctccgggggtacggcgagcgtcagcaccagt
gcgctgggcgccggtacgcatacggtgaccgcgacctacagcggtgatgcgaacttcgcc
ggctcgaccggtacggacacccagacggtgaaccaggcatcgacgaccacctcggtcatc
tccgcgccggacccgtccgtggtcggtgagccggtgacgttcacggctacggtcgcaccg
gtctcgccgggtgcgggtgtcccgaccgggacggtgacgttcgtcgcgacggatggggtc
actacggtgacgctgaccggcaccctcgtcggcggcaccaccagtgtcgtgaccaccggc
ctggtgacggcgggcctttacaccgtcaccgccacctacagcggcgacgccagtttcacc
ggttcggtcggtacggacacccagacggtgggccaggcggctacgaccacctcggtcatc
tcggcgccggacccgtcggtgttcggagagccggtgacctttacggccaccgtctcaccg
gtcctgccgggtgcgggcaccccgaccgggacggtcaccttcgtgatttccggcggtccc
actctcgtcgggacgctctcgggcggtacggcgagcgtcaccaccagcgccttggccgtg
ggcacgcacacggtcaccgccacctacagcggtgaccccaacttcaccggttccgtcggt
gcggacacccagaccgtggttctggcgttgacgaccaccgcggtgagcacgacaccggat
ccgtccgtggtgggcgagtcggtgaccttctcggccaccgtggcgccggtcgcgcccggt
gcgggtgtcccgaccgggacggtgacgttcgtcgcgacggatggggtcactacggtgacg
ctgaccggcaccctcgccggcggtaccaccagtgtcaccaccaacgggctggtgacggcg
ggcacttacgccgtcacggcgacctatggaggtgacggcaacttcaccggctccatcggt
acggacacccagacggtgggccaggcggctacgaccacctcggtcatctcggcgccggac
ccgtcggtgttcggagagccggtgaccttcacggccacggtcgcgccggtctcgccgggg
gcaggtaccccgaccggcacggtcaccttcgccatcagtgggggcccgacgctggtcggc
acgctctcgggcggcacggcgagcgtcaccaccagcgccttgagcgtcggcagccacacg
gtcaccgcgacctacagcggcgaccccaacttcaccggttccgtcggtacggacacccag
acggtgaaccaggcatcgacgaccacctcggtcatctccgcgccggacccgtccgtggtc
ggtgagccggtgacgttcaccgccaccgtcgccccggtctcgccgggcgcgggtgtcccg
acgggcacggtcaccttcgttgcgaccgacggggtcaccacggtgacgctgaccggcacg
ctcagtgggggcaccaccagtgtcaccaccaacgggctggtgacggcggggctttacacc
gtcaccgggacctacagcggtgacgccgacttcagtggttcggccggtacggacacccag
acggtgggccaggcctcgacgaccacctcggtctcctcggcgccggacccgtcggtgttc
ggagagccggtgaccttcacggcgacggtcgcgccggtcgcaccgggtgcgggcacgccg
accgggacggtcaccttcgtgatttccggtggtcccactctcgtcgggacgctctcgggc
ggcacggcgagcgtcaccaccagcgcgttggccgtgggcacgcactcggtcaccgcgacc
tacagcggtgaccccaacttcacggcatcgagcggtacggacacccagacggtgatcctg
gcggcgacgaccaccgcggtctcgtcgtccccggacccgtccgtggtcggtgagccggtg
accttcaccgccaccgtcgccccggtctcgccgggcgcgggcaccccgaccggcaccgtg
acgttcctcgccaccgatggggtcaccacggtgacgctgaccggcacgctcagtgggggc
accaccagtgtcaccaccagcgggctggtgacggcgggcgtttacgccgtcacggcgacc
tacagcggcgacgccggcttcagcggctccgtcggtgcggacacccagacggtgggccag
gcctcgacgaccacggcgctgagttcggcgccggacccgtccgtggtcggtgagccggtg
acctttacggccaccgtcacgccggtcgcgccggggacaggtacccccaccggggtggtc
accttcgtgatcaccggtggtcccactctcgtcgggacactggcgggcggtacggcgagc
gtcaccaccagtgcgctgggcgccggcacccacaccgctacggcgacctacagcggtgac
ctcaacttcaccggctccagcgacacggacacccagacggtgaatcaggcgtcgacctcc
actgcggtgagtacggcgccggacccgtccgtggtgggcgagtcggtgacgttctcggcc
accgtggcgccggtcgcgcccggtgcgggcactccgaccggggcggtgacgttcgtcgcc
accgatggggtcaccacggtgacgctgaccggcacgctcagtgggggcaccaccagtgtc
accaccaacgggctggtgacggcggggctttacaccgtcaccgggacctacagcggtgac
gccgacttcagtggttcggccggtacggacacccagacggtgggccagtcgtcgaccacc
accgcggtgagctcggcgccggacccgtccgtggtcggtgagccggtgaccttcacagcc
accgtctccccggtcgcgccgggtgtggggaccccgaccggcacggtcaccttcgtgatc
actggtggtcccacgctcaccgcgacgctctcgggcggtacggcgagcgtcaccaccagc
gccttgagcgccggtacgcacacggtcacggcgacatacagcggtgactccaacttcacg
acatcgagcggcaccgacacccagacggtgaacccggcgttgacgaccaccgcggtgagc
acgacaccggatccgtccgtggtgggcgagtcggtgacgttctcggccaccgtggcgccg
gtcgcgcccggtgcgggcactccgaccgggacggtgaccttcgtcgccaccgatggggtc
accacggtgacgctgaccggcacgctcagtgggggcaccaccagtgtcaccaccagtggg
ctggtgacggcgggcgcgtacgtcgtcaccgggacctacagcggcgacgccgacttcacc
ggatccaccggtgtggacacccagacggtgggccaggccttgacgaccacggcgctgagt
tcggcgccggacccgtcggtggtcggtgagccggtgacgttcacggccacggtcgcgccg
gtctcgccgggggcaggtaccccgaccggggtggtcaccttcgtgatcaccggcggtccg
acgctggtcggcgtcctctccgggggcacggccaccgtctcgaccaacgtactcggagtc
ggcaccttcccggtgaccgcgacctacagcggtgacctgaacttcaccggctccagcgac
accgacacccagaccgtggcccaggcatccacgaccaccgcggtctcctcgttgccggac
ccgtcggtgatcgggcagccggtgaccttcacggccacggtcgccccggtctcaccgggt
gcgggcgtcccaaccggcacggtcaccttcgtcatcgacggtggcgggggcggcacgctg
accggcaccgtcgccggaggcgtggtcaccgtcaccaccagcaccctcgacgcggggctg
cacaacgtcaccgcgacctacaacggtgacgccaacttcagcacctccagcggaaccgac
acccagaccgtcaaccaggcatccaccctcaccaccgtcagctcgttccccgacccgtcc
gtctccggcggtacggtcacgatcttcgcgttcgtggtggcgcagcctccgggcagcggc
gtcccgaccgggacggtcaccttcaccgtcaccgatggcgtgaccacggtgaccctgacc
ggaacggtcgacggcaccggtgtagccgccgtcagcaccccgctgaccaccggcaactac
accatcaccggggtctactccggtgacaccaacttcaccggctccagcgacaccgacacc
cagaccgtcatctga
DBGET
integrated database retrieval system