KEGG   Scleropages formosus (Asian bonytongue): 108928208
Entry
108928208         CDS       T04919                                 
Name
(RefSeq) collagen alpha-1(I) chain-like
  KO
K06236  collagen type I alpha
Organism
sfm  Scleropages formosus (Asian bonytongue)
Pathway
sfm04510  Focal adhesion
sfm04512  ECM-receptor interaction
sfm04820  Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:sfm00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    108928208
 09140 Cellular Processes
  09144 Cellular community - eukaryotes
   04510 Focal adhesion
    108928208
  09142 Cell motility
   04820 Cytoskeleton in muscle cells
    108928208
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:sfm00536]
    108928208
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:sfm00536]
 Heparan sulfate / Heparin
  Extracellular matrix molecules
   108928208
SSDB
Motif
Pfam: Collagen COLFI VWC
Other DBs
NCBI-GeneID: 108928208
NCBI-ProteinID: XP_018597555
LinkDB
Position
25:complement(5480172..5503462)
AA seq 1448 aa
MFSFVDIRLALLLAATALLARGQGEDDKSNSVCSWQGQEYNDKDVWKPEPCQICVCDSGS
VMCDDVICEDIDCPNPEIPFGECCPICPEDNGPLQPEGPKGDPGPKGDRGVPGPPGNDGI
PGQPGLPGPPGPPGPPGLGGNLSPQMSYGYDEKSAGGPAVPGPMGPMGPRGLPGPPGPSG
PQGFTGPPGEPGEPGAAGPMGSRGPPGPPGKNGEDGEAGKSGRPGERGPAGPQGARGFPG
TPGLPGIKGHRGFSGLDGAKGDTGPAGPKGEAGASGENGAPGTMGPRGLPGERGRPGPSG
PSGARGNDGASGAAGPPGPTGPAGPPGFPGGAGPKGETGPAGSRGSEGPQGARGEPGNPG
PAGSAGPAGNPGSDGAPGSKGAPGAAGIAGAPGFPGPRGPSGPQGPAGGPGAKGNNGDTG
APGSRGEPGAKGEPGPVGGQGPPGPAGEEGKRGGRGEPGGAGPRGPPGERGGPGARGFPG
SDGAAGPKGAPGERGPTGAVGPQGASGEPGRPGEPGMPGSKGMTGSPGSPGPDGKVGPAG
APGQDGRAGPPGPAGARGQPGVMGFPGPKGAAGDAGKPGERGVMGPSGAVGAPGKDGDVG
APGAPGPAGPAGDRGEQGPSGPSGFQGLPGPQGAAGESGKSGEQGAPGEVGGPGPAGPRG
ERGFPGERGAPGPVGPVGVRGSPGASGNDGAKGEPGAAGAPGGQGPPGLQGMPGERGAGG
LPGLRGDRGDAGPKGGDGAPGKDGIRGMTGPIGPPGPAGAPGEKGESGPVGPSGPTGSRG
SPGERGEAGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEGGDSGPKGDAGAPGPSGPAGPPGPQGPAG
VTGPKGARGAPGPPGAAGFPGAAGRVGPPGPAGNSGPPGPPGPGGKEGQRGNRGETGAAG
RSGEPGPAGPAGPSGEKGSPGADGPSGAPGIPGPQGIAGQRGIVGLPGQRGERGFPGLPG
PGGEPGKQGSGGPVGERGPPGPMGPPGLAGAPGEPGREGSPGAEGTSGRDGPPGPKGDRG
ESGVAGAPGAPGPPGAPGPVGPSGKTGDRGEGGPAGPAGPAGPAGARGALGPAGPRGDKG
EAGEAGERGMKGHRGFTGLQGLPGPAGPPGEAGPAGATGPAGPRGPSGGAGSPGKDGISG
LPGPIGPPGPRGRVGEIGPAGPPGPPGPPGPPGPPGGGFDLGYIAQPSQEKAPDPYRSGY
RADDANMMRDRDMEVDTTLKSLSQKIENIRSPDGTKKNPARTCRDLKMCHPDWKSGEYWI
DPNQGCTLDAIKVHCNLETGETCVYPAQTDIPKKNWYTSKNPKEKKHVWFSEAMTEGFQF
QYGSEGSDPEDVNIQLTFLRLMSNEASQNLTYHCKNSIAYMDQQAGNLKKALLLQGSNDI
EIRAEGNSRFTYSVSEDGCTSHTGAWGKTVIDYKTTKTSRLPIIDIAPMDVGAPNQEFGI
EVGPVCFL
NT seq 4347 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgttcagctttgtggatattcggttagcgctgttgctcgcagcgacagcacttttggca
agaggtcaaggcgaggacgacaaatcaaattcagtctgttcgtggcaaggacaggagtac
aacgacaaagatgtgtggaaacctgagccctgccagatctgcgtatgtgacagtggctct
gtcatgtgcgacgatgtgatctgcgaagacattgactgccccaatccagaaatcccattc
ggtgaatgctgccccatttgcccggaagataacggtcccctgcagcccgagggacccaag
ggtgaccctggacctaaaggtgacaggggtgtccctgggcctcctggcaatgatggcatc
cccggacaaccaggcctccctgggcctcctggacctcctggaccccctggccttggcgga
aacctttctccccaaatgtcttatggctacgatgagaaatctgctggtggacctgcagtt
cctggccccatgggtcctatgggtccccgtggtctccctggtcctcctggaccttctgga
ccccaaggtttcactggcccccctggtgagcctggtgagcccggtgctgctggtccaatg
ggttcccgcggcccacctggcccccctggcaagaacggagaggatggtgaggctggcaaa
tctggtcgccctggtgagcgtggtccagctggcccacagggtgctcgcggattccccgga
acccctggactccccggaatcaagggacacagaggcttcagcggtctagatggagctaag
ggagacactggccctgctggacccaaaggagaggctggtgcctctggtgagaatggagct
cctggtacaatgggtcctcgcggtctccctggtgagagaggtcgtcctggtccttctggc
ccttctggtgctcgtggtaacgatggtgcttctggagctgctggacctcctggacccact
ggcccagctggtccccctggattccccggaggtgctggacctaagggagaaactggtcct
gctggatctcgtggttctgagggacctcagggagcccgtggtgagcccggtaatcctgga
cctgctggctctgctggccctgctggcaaccccggttctgatggtgctccaggttccaag
ggtgctcctggtgctgctggtattgctggtgcccctggcttccctggaccccgtggtccc
tctggaccacaaggccctgctggaggtcctggtgctaagggtaacaatggtgatacaggt
gcccctggttccaggggagagcctggtgccaagggagagccaggccccgttggaggacaa
ggacctcctggccctgctggagaggagggcaagagaggaggtcgtggtgagcctggtggc
gctggacctcgtggaccccctggagagcgcggtgggcctggtgctcgtggtttccctggt
tctgatggagctgctggccccaagggtgcccctggtgagcgtggtcccactggagctgtc
ggaccccagggtgcatctggtgagcctggacgccctggtgagcctggtatgcctggatcc
aagggtatgactggcagccccggtagccctggccctgatggcaaggttggccctgctggt
gcccctggacaagatggccgcgctggacccccaggcccagctggagccagaggtcagcct
ggtgtcatgggattcccaggacccaagggagctgctggtgatgctggcaagcctggtgag
agaggtgttatgggaccttctggtgctgttggtgcccctggcaaagatggtgatgttggt
gctcccggtgcccctggccctgctggacctgctggagacagaggtgaacagggaccttct
ggtccatctggattccagggtctgcctggacctcaaggtgctgctggtgagtctggcaag
tccggagagcagggtgcacctggtgaagttggaggaccaggacctgctggacccagaggc
gaaagaggtttccctggtgagcgtggtgcccctggcccagttggccctgtaggtgttcgc
ggatctcctggtgcttctggtaacgatggtgcaaagggtgagcccggtgctgctggtgcc
cctggtggtcagggccctccaggtctgcaaggtatgcccggagagcgtggtgctggtggt
cttccagggctcaggggtgacagaggtgatgctggacctaagggtggtgatggtgctcct
ggcaaagatggaatccgtggcatgactggtcccattggtcctcctggccctgctggtgca
cctggtgagaagggtgagagtggacctgttggcccttctggtcctactggttctcgtggt
tcccctggtgagcgcggtgaggctggtcccccaggacctgctgggtttgctggacctcct
ggtgctgatggccagcctggtgctaagggagagggtggagactctggtcctaagggtgat
gctggtgcccctggcccttctggacctgctggccctcctggacctcagggtcctgctggt
gttactggacctaaaggtgctcgtggtgctcctggtcctcctggtgctgctggattccct
ggtgctgctggtagagttgggcctcccggtcctgctggtaacagcggcccccctggaccc
cctggacctggaggaaaggaaggacagagaggtaaccgtggtgagactggtgctgctggc
cgctccggtgagcctggtcctgctggacctgctggaccttctggagaaaagggatctcct
ggtgctgatggcccatctggtgctcctggtatccccggacctcagggtattgctggacag
cgtggtattgtgggtctgcccggacagagaggcgagcgtggtttccctggtctcccaggt
ccaggtggagagcctggcaagcagggatctggtggccctgttggtgaacgtggacctcct
ggccctatgggaccccctggtctggctggtgctcctggtgaacctggtcgtgagggttct
cctggtgctgagggtacttctggtcgtgatggacctcctggccctaagggagaccgtggt
gagtctggtgttgctggagctcctggtgcccccggacctcctggtgcccctggtcccgtt
ggcccatctggcaagactggtgatcgtggagagggtggccctgctggtcctgctggcccc
gctggtcctgctggcgctcgtggtgctcttggtcctgctggtccccgcggtgacaagggt
gaggctggagaagctggtgagagaggcatgaagggacacagaggtttcactggactccag
ggtctgcctggacctgctggacctcctggagaggcaggacctgctggagccactggccct
gctggacctaggggaccttctggtggtgctggctctcctggtaaagatggtattagtggc
ctgcctggtcccattggaccacctggaccccgcggtcgcgttggtgaaattggacctgct
ggacctcctggacctcctggaccccctggacctcctggacctcctggtggtggattcgac
cttggttacattgcccaaccttcccaggagaaggcccctgatccttaccgcagtggctac
agagctgatgatgctaacatgatgcgtgaccgtgatatggaggttgacaccaccctcaag
tccctaagccagaagattgagaacatccgcagccctgatggcaccaagaagaacccagcc
cgcacctgccgtgaccttaagatgtgccaccctgactggaagagcggtgaatactggatt
gatcccaaccagggatgcactctggatgccatcaaggtccactgcaacctcgagaccggc
gagacctgcgtctacccagctcagactgacattcccaagaagaactggtacacaagcaag
aaccccaaggagaagaagcatgtctggttcagcgaggcaatgaccgagggcttccagttc
cagtatggcagcgagggctccgatcctgaggatgtcaacatccagctcaccttcctgcgc
ctgatgtccaacgaagcctctcagaaccttacataccactgcaagaacagcatcgcttac
atggaccagcaggccggcaacctgaagaaggccctgctgctgcaaggctccaatgacatc
gagatcagagctgagggcaacagccgcttcacatacagcgtcagcgaggatggctgcacg
tcacacactggcgcatggggcaagacagtcatcgactacaagacaacgaaaacatctcgt
ctgcctattattgacatcgctcctatggacgttggtgcacccaatcaggaatttggcatt
gaagtcggcccagtctgcttcttgtaa

DBGET integrated database retrieval system