Shewanella frigidimarina: Sfri_1221
Help
Entry
Sfri_1221 CDS
T00395
Name
(GenBank) beta-ketoacyl synthase
Organism
sfr
Shewanella frigidimarina
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ketoacyl-synt
PP-binding
Ketoacyl-synt_C
Acyl_transf_1
KR
KAsynt_C_assoc
PKS_DH_N
adh_short
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABI71074
UniProt:
Q085J1
LinkDB
All DBs
Position
complement(1439246..1447108)
Genome browser
AA seq
2620 aa
AA seq
DB search
MSQSSNKDKRLNKRLKDMPIAIVGMASIFANSRYLNKFWDLISEKIDAIIDVPESHWNAE
DYYNADKSMADKSYCKRGGFLPEVDFNPMEFGLPPNILELTDTSQLLSLVVAKEVLADAG
IDAQYDTDRIGITLGVGGGQKINHSLSGRLQYPILKKVFKNSGLSDEDTEMLIKKFQDQY
IHWEENSFPGSLGNVIAGRIANRFDLGGMNCVVDAACAGSLAAMRMAITELVEGRSDMMI
TGGVCTDNSPSMYMSFSKTPAFTTNDTIQPFDIDSKGMMIGEGIGMMALKRLDDAERDGD
RIYAVIKGIGSSSDGKFKSIYAPRPEGQAKALRRAYDDAGFAPQTVGLIEAHGTGTAAGD
VAEFNGLKSVFADGNDTQQHIALGSVKSQVGHTKSTAGTAGVIKAALALHHKVLPPTINV
SKPNPNLNIQDSPFYLNTETRPWLPRADNTPRRAGISAFGFGGTNFHIVLEEYRQEHVRG
DKYRQRSVPQSLLIHAENKAALQAQLTALQTEIKAVDTTQQNRQEIVLADFGKRFALNTI
APNAARIGLVVASLADLTIQLTQALAQLSSNTADSWQLPSGTSYRAAALIHPEAASHKVA
ALFAGQGAQYLNMGADLACLYPEMRQQLMQADKVFAQHKQTPLSQIMYPNPAFEAEDIAA
QQAALTNTANAQSAIGAVSMGQYALLTQAGFKADMVAGHSFGELSALCAAGVISQADYYQ
LAFARGQAMAATPKDQDAGVMYAIIVPAQSVDNGVEKLEQCISAFEGVKVANYNAPTQLV
IAGPTASCTLAAQAITTELGFKAIALPVSGAFHTPLVAHAQQPFAAAINKIKFAKPKLSL
YANGTGKAHPNDAKAIQAVFSEHMLQSVRFSEQLNAMYDAGARVFVEFGPKNILHKLVEA
TLGNKAESVSVVSLNPNPKGNSDTQLRQAACQLAVLGVALTEVDPYQAPIAELAKVSPMN
VKLTASNYISPATQAKMQKSLQTGTVTSQTVEVPVEKVVEKIVEKEVIKTEYIEVPAAQA
QASAVAAPLAATTPVAKAQPVSLSVPASADSIGAFFAAQQQTAELHQQFLAIPQQYGDTF
AHLMTAQAQMASSGLAIPESLQRSMEMFHQHQAQTLQSHTQFLTQQAQANQAALAMLQGQ
TVTPSIQATVSVPAPSVQPAFVQPSQVAQATTTPSPVVAPVAQVQTTQAVQSQPTASKPV
QAPVAQQVSSAAVSAPTAGLTQQQVLDTMLNVVADKTGYPTEMLELGMDMEADLGIDSIK
RVEILGTVQDELPGLPELSPEDLAECRTLGEIVSYMQTKLPAANSVAAASTGSTSVVTAA
PASTGLTAENVQRTMLAVVADKTGYPTEMLELGMDMEADLGIDSIKRVEILGTVQDELPG
LPELSPEDLAECRTLGEIVSYMQTKLPAASTVAAAPIASAAPATGLSAESVQRTMLAVVA
DKTGYPTEMLELGMDMEADLGIDSIKRVEILGTVQDELPGLPELNPEDLAECRTLGEIVS
YMQTKLPAVSTLAPVAIVSAPATSGLSADTVLSTMMSVVADKTGYPAEMLELSMDMEADL
GIDSIKRVEILGTVQDELPGLPELNPEDLAECRTLGEIVSYMQTKLPATNTEAPVSAPAT
PGLSADTVLSTMMSVVADKTGYPAEMLELSMDMEADLGIDSIKRVEILGTVQDELPGLPE
LNPEDLAECRTLGEIVCYMQTKLPAANAIAPVAPTSTANKVDVNTAALPPHSEVALKKLP
AADKLVDCFSTDSCIVITDDGHSAGLLAEKLNAKGLTVAVIRNPQTITVAHSPLSSDIKS
YTLSSIDDAQIAQVIADIKADLGAEHAIAGFIHLQPQATANSSELMSCTVAAKAAVDNAF
LWAKHLHAEFAKPAQASRLCYFTVSRLDGGFGYLDNTQLATAELNQAALSGLSKTLSHEW
PQVFCRALDIANNIDTTSFADAIVAELFDIDGANASADRINEVGISNQGRVTLVAENASE
QFAPASLNKSDTILVTGGAKGVTFECALTLAKQCQSHFVLAGRSQHFGKDLPAWAQGKKA
SELKAAAIAYIQSQGNKPTPKQIDALVWPISSSLEIDAALNAFSKVGASAQYVSMDVSNA
TAVAASLNSLTNTKGDSLTINGIIHGAGVLADKHIQDKTLDELNRVYHTKVTGLASIINA
LDPQQIKLIALFSSAAGFYGNTGQSDYAMSNEILNKTALKLAHTLPQAKVMSFNWGPWDG
GMVSSALKKMFVERGVYVIPLQAGAELFAHSLLSQQGAQLLIGSDMQGSSEQDNAVKKLN
ADALLIAKGSLTFATNTLVTKAFTANAVTTEAVTTKSSATDIISQTVTRVLTPAEMPFVS
DHCIAGNPVLPTVCAMQWMRDAAETLCHVPVSIAEYKLLKGVIFDTNEPHLLQLALTQTD
AGISALISSRLLSDPSAAMKPQYQAQLVINKAILAADVAKPIIGDNSLAQWANMTPLYSG
AELYQNGTLFHGPRLQGIAQVLAFDDAQLLCRVQLPQINATDCQGFIPSSVLGGSQIFAE
DLLLQAMLVWARLKYDAASLPSTTGECVTAWPLANGDKGYIQLDVVKHSGRMLVANVSLY
HQDGRLSCQMLNAKVTISKSLNGAFIPHQASAELSHKDTV
NT seq
7863 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagccaatccagtaataaagataagcgtttaaacaaacgcttaaaagacatgcctatc
gcgattgtcggcatggcaagtatttttgctaactcacgttacctaaacaagttttgggat
ttaatcagcgaaaaaattgatgcgattatcgacgttccagaaagccattggaatgctgaa
gattactacaatgccgataaatcaatggccgataaaagctactgtaagcgcggtggtttt
ttaccggaagtcgatttcaatccaatggaatttggcctgccacctaatatcctcgaacta
acagacacctcacaactattatcgttagtggtcgccaaagaagtgctggcagatgcaggt
attgatgcacagtacgataccgatcgcatcggtattacattaggtgtcggcggtggtcaa
aaaatcaatcatagcctcagcggtcgcttacagtacccaatactcaaaaaagtatttaaa
aatagtggtctaagtgatgaagacactgagatgttgatcaaaaagtttcaggatcaatat
attcactgggaagaaaactcatttccaggttcactcggcaatgtaattgcagggcgtatc
gctaaccgctttgatctaggcggcatgaattgcgtggttgacgcagcttgtgccggttct
ttagcggcaatgcgcatggcgattacagaattagttgaaggccgcagtgacatgatgatc
accggtggtgtgtgtaccgataactcgccatctatgtacatgagcttttcaaaaacaccg
gcatttaccaccaacgacaccattcaaccttttgacattgattcaaaaggcatgatgata
ggtgaaggtattggcatgatggcgcttaaacgtcttgatgatgccgaacgtgatggtgac
cgaatttatgctgttattaaaggtattggctcatcatcagatggtaagtttaaaagtatt
tatgcaccgcgccctgaaggccaagctaaagcattaagacgcgcttatgatgatgcaggt
tttgcgccgcaaactgttggcttaattgaagcccatggtactggtactgcagcaggtgat
gttgcggagttcaatggcctaaagtcggtgtttgcagacggtaatgacactcaacagcat
attgctcttgggtctgttaaatcgcaagttggccacactaaatcaaccgcaggaaccgct
ggtgtgattaaagcggctctggctttgcatcataaagtgttgccaccgaccattaacgtc
agtaaaccgaatcccaatttaaacattcaagattcgccattttatttaaacaccgaaacc
cgcccttggttacctcgtgcagacaatacgccgcgccgcgcgggtattagtgcatttggt
tttggtggcaccaacttccacattgtgttggaagaatatcgccaagaacatgttcgaggc
gataagtatcgtcaacgctcagtaccacaaagtctattgatccatgctgaaaataaagct
gcattacaggctcaattaaccgccctgcaaactgaaattaaggctgttgataccacacag
caaaatcgccaagaaattgtattagccgattttggtaaacgttttgccttaaataccatc
gcccctaatgcggcacgtataggcttagtggttgcttcattagcagacttaaccattcag
ctgactcaggcgcttgcgcagttaagctcaaatactgccgacagctggcaattgccttct
ggtaccagttatcgcgcagcagcattgattcatcctgaagcggcaagccataaagtggca
gcactatttgctgggcaaggggcacaatatctgaacatgggcgccgatttagcctgtttg
tatccagaaatgcgtcaacaactgatgcaagcagacaaggtgtttgcgcaacataaacaa
acgccactatcgcaaattatgtacccaaaccctgcttttgaagccgaagatattgccgca
caacaggcagcattaaccaatacagccaatgcccagagtgctattggcgcggtcagcatg
ggccaatatgcattattgactcaagcaggttttaaagccgatatggttgctggccatagt
tttggtgaactgtcagcattatgtgctgcaggcgtcattagccaagctgattattaccaa
ttggccttcgctcgtggccaagcaatggcggcaacacctaaagatcaagacgctggcgta
atgtacgccattattgtcccagctcaatctgttgacaacggagttgaaaagcttgaacag
tgcattagtgcatttgaaggcgtcaaggtggctaattacaatgcaccaacccaactggtt
attgcaggcccaacagcgtcatgtaccttagcggcacaagctatcaccaccgaacttggt
tttaaagcaatagccctgccggtttctggtgcgttccacactccattagtggcacatgcg
cagcagccgtttgctgcggcaatcaataagattaaatttgctaagccaaaactaagcctt
tatgccaatggcacaggtaaagcacatcctaacgatgctaaagcaatccaagcagtattt
agtgaacatatgttgcaatcggttcgttttagcgagcaactaaatgccatgtatgatgct
ggtgctcgtgtatttgttgagtttggtcctaagaatatcctccacaagttggttgaagcg
accctaggcaacaaagcagagtcagtaagtgtagtgagcttgaacccaaatcctaaaggc
aatagtgacactcaactacgccaagcggcttgtcagcttgcagtattaggtgttgcatta
accgaggttgatccatatcaagcgcctatcgctgagcttgcaaaagtgtcaccgatgaac
gttaagttaaccgcgagtaattatattagtcccgccactcaagccaaaatgcaaaaatca
ttgcaaactggcaccgttaccagccagacagtggaagtgcctgtcgaaaaagttgtggaa
aagattgtggaaaaagaagtcattaaaactgaatatattgaagtgcctgcagcacaagct
caagcctctgcagtcgccgcacctttagcggcaacgactcctgtagctaaagctcaaccg
gttagcttaagtgtaccagcgtcggccgatagtatcggtgcattttttgctgcgcagcaa
caaacagctgaattacatcagcagtttttagccataccacagcaatatggcgacaccttt
gctcacctgatgacagcccaagcacaaatggcgtcatcgggattagccattccagaaagc
ttgcaacgttcgatggagatgttccaccagcatcaagcacaaacattgcaaagtcatacc
caatttttaacgcagcaagcacaagcaaaccaagccgcattagccatgttgcaagggcaa
acggtaacaccttcaatacaagcaacagtatctgtacctgctccatcagtacagcctgca
tttgtgcagccaagccaagttgctcaagccacaacgacaccttcacctgtcgtagctcct
gttgctcaggttcaaacaactcaagcggttcaatcacaaccaacagccagtaaacctgtc
caggctcctgtcgctcagcaagttagctcagcagcggtttctgcaccaacagccggacta
acacagcaacaagtgttagacactatgctcaatgtagttgctgacaaaactggttaccca
acagaaatgcttgaacttggcatggacatggaagcagaccttggtatcgactcaatcaag
cgggtcgaaatcttaggcacagtacaagatgagcttccaggcttaccagaactgagccca
gaagatctagccgagtgtcgcaccttgggcgaaatcgttagctacatgcaaaccaaatta
ccagcggccaactcggttgctgcagcgtcaacgggatcaacatcggtagttactgcagca
ccagcatcaacaggcttaacggctgaaaacgtccaacgtaccatgttagctgtggttgcc
gataaaaccggttacccaactgaaatgcttgaactgggcatggacatggaagcagacctt
ggtatcgactccatcaagcgtgtggaaattttaggcacagtacaagatgagcttccaggt
ttacctgaactgagcccagaagatttagctgagtgtcgcaccttgggtgaaatcgttagc
tacatgcaaactaaactgcctgctgccagcacagtggctgcagcaccaattgcatctgca
gcgccagcaacaggcttaagtgcagaaagcgttcagcgtactatgttagctgtggttgcc
gataaaaccggttacccaactgaaatgcttgaactgggcatggacatggaagccgacctt
ggtatcgactcaattaaacgcgttgaaattctcggcacagtgcaagacgagctccctggt
ttgcctgaactgaatccagaagatttagccgagtgtcgcaccttaggcgaaatcgtcagc
tacatgcaaactaaattacctgctgtcagcacattggctccagtagcaattgtatctgca
cctgcaacttcgggcttgagtgctgatacagtattaagcaccatgatgtcagtagtagcc
gacaaaaccggttaccctgctgaaatgcttgaactgagcatggacatggaagccgacctt
ggtatcgattcaatcaaacgtgttgaaattctaggcacagtgcaagacgaactaccaggt
ttacctgagctgaacccagaagatttagccgagtgtcgtaccttgggcgaaatagttagc
tacatgcaaaccaaattgcctgcaaccaacactgaggccccagtatctgctccagcaaca
ccaggattaagtgctgataccgttttaagcaccatgatgtcagtggtagccgacaaaaca
ggttaccctgcagaaatgcttgaactgagcatggacatggaagccgatttaggtatcgac
tcaatcaaacgcgtcgagattttaggtactgtgcaagatgagcttccaggcttacctgag
ttgaacccagaagatttagccgaatgtcgcaccctaggtgaaatcgtttgttacatgcaa
accaaattgcctgcagcaaacgcgattgcgccggtcgcaccaacatcaactgcaaacaag
gttgacgttaacaccgcagcattacctccacacagcgaggtagcgctaaaaaagttacca
gcggcggataaactcgtagattgcttttcaacagactcttgtattgtcatcacagacgat
ggccacagtgcaggtttactagcagaaaagctaaatgcaaagggattaaccgtcgccgtt
attcgtaacccacaaaccattaccgtggcacattcacccttaagcagtgatattaaaagc
tacacgttgagcagcattgatgatgcccaaattgcacaagtgattgccgatattaaggcc
gacttgggcgctgaacatgccattgcgggctttattcatttacagccgcaagctaccgct
aacagcagcgaattaatgtcgtgcactgttgcagcaaaagccgctgtcgacaacgcgttt
ttgtgggctaagcatcttcacgctgagtttgcaaaaccagctcaagcttcgcgtttatgc
tactttaccgtgagccgtttagacggtggatttggttatcttgataatactcagctcgca
acagctgagcttaaccaagcagccttatctggtctgagtaaaaccctaagccatgaatgg
ccacaggtgttttgccgcgcattagacattgccaacaatattgatactacaagctttgcc
gatgccatcgttgctgagttatttgatatcgatggtgccaatgctagcgcggatcgcatt
aatgaagtggggatcagtaatcaaggtcgagtcactttagttgccgaaaatgccagcgag
cagtttgcaccagcaagcctaaacaaaagtgacactattttggtcaccggcggcgcaaaa
ggcgtaacgtttgaatgcgccctcaccttagccaaacaatgccaatcacattttgtgtta
gcgggtcgtagccaacattttggcaaagacttaccagcttgggcacaaggcaaaaaagcc
tctgagttaaaagccgcagccatcgcttatattcaatctcaaggcaataaaccaacgcca
aaacagattgatgcactcgtatggccaataagcagcagcctagaaatagatgctgcgtta
aacgcattcagcaaggttggtgccagtgctcaatatgtctcgatggatgtcagcaatgcc
accgcggtagctgccagccttaatagcctgactaataccaagggcgactcattaaccatt
aatgggattattcacggtgctggcgtgttagccgataagcacattcaagataaaaccttg
gatgaacttaaccgcgtataccacaccaaagtgactgggcttgctagcattattaatgca
ctcgacccacagcagattaagcttattgcactgttttcatcggcggccggtttttacggt
aataccggacagagtgattacgctatgtcgaatgaaatcctcaataaaaccgcactgaaa
ctagcgcacactttaccgcaagctaaagtgatgagttttaattggggcccttgggatggc
ggtatggtcagttcagcattaaagaaaatgtttgttgaacgtggcgtttacgttattcca
ctacaagcaggtgccgagttatttgcccacagtttattaagccaacaaggggcacaactg
cttattggctctgatatgcaaggttcatcagagcaggacaacgctgtaaaaaagcttaat
gcggacgctttgcttattgctaagggttcgctgacatttgctactaatacacttgtgact
aaagcatttacggctaacgcagttacgactgaggcagttacgactaagtcatcggctact
gatattatcagtcagacggtgacacgagtattaaccccagctgaaatgccttttgttagc
gatcattgtattgctggcaatccggtattacccacggtatgcgccatgcaatggatgcgt
gatgcggcagaaacgttatgtcatgtgcctgtcagtattgctgaatacaaattgcttaaa
ggggttatttttgacaccaatgagccacatttgttgcaactggcactaacgcaaactgac
gcggggatcagcgcgctgatctcctctcgtttgttaagcgatccaagcgccgccatgaaa
ccgcaataccaagctcaattggtgatcaataaggcgatattggcagctgatgttgctaaa
ccgattattggcgacaacagtttggctcaatgggccaacatgacgccattgtattcaggc
gctgaactgtaccaaaacggaaccttatttcatggcccacgtttgcaaggcattgctcaa
gtgttggcatttgatgatgctcagctactgtgccgagtgcaattgccgcagattaatgcc
acagactgccaaggttttatcccgtcatcggtattaggtggtagccaaattttcgctgaa
gatttgctactacaagccatgctggtatgggcaagactgaaatacgatgctgcaagttta
ccgtcaacaaccggtgagtgtgttactgcttggccattggcaaatggtgataaaggttat
attcaacttgatgtagttaagcacagcggcagaatgctcgtggctaacgtgagtttatat
catcaagacggccgcctgagttgccaaatgctcaatgctaaagtaaccattagtaagagt
ttgaatggggcatttattccacatcaagcttctgcagaactatcacacaaggacaccgtg
tga
DBGET
integrated database retrieval system