Shewanella frigidimarina: Sfri_1278
Help
Entry
Sfri_1278 CDS
T00395
Name
(GenBank) surface antigen (D15)
KO
K07277
outer membrane protein insertion porin family
Organism
sfr
Shewanella frigidimarina
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sfr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03029 Mitochondrial biogenesis [BR:
sfr03029
]
Sfri_1278
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sfr02000
]
Sfri_1278
Mitochondrial biogenesis [BR:
sfr03029
]
Mitochondrial protein import machinery
Outer membrane
TOB/SAM complex
Sfri_1278
Transporters [BR:
sfr02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Sfri_1278
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Omp85
POTRA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABI71131
UniProt:
Q085D4
LinkDB
All DBs
Position
1511821..1514304
Genome browser
AA seq
827 aa
AA seq
DB search
MRFNKIFASMLFVGASFSGNGWAESFQPFEVTDIQVEGLQRVALGAALLSLPVKVGDTVD
EVKLQQAIKSLYGSTNFENISVSHEDGILYVTVKERPTISIISFDGNKDIKDEQLQESLD
GSGVKAGESLDRTMLSGIEKGLQDFYYGVGKYGAKVEAQIINLPRNRVELKFKFTEGLAA
EIRQINVVGNTVFSDSELISMLELKDYVAWWDLFGERRYQKQKLQADLETIKTYYHNQGY
IRFEVTSTQVAMTPDRKGLYITINVNEGEKYKVKEVNLIGDLMGREELMRSILPIKAGNM
YNGADVTFTEEMYSKYLGRFGYAYPEVKTYPEIDDETKEVVLNINVKPGKRVYVRSINFT
GNTVTKDEVMRRELRQMEGAWLNSAQIEQSKLRLNRLGYFETVDAETIQVPGSDDLVDVA
VTVKEQPSGSFNAGVGYGTESGVSLQFGVEQNNFLGTGNQAGFSVNTNKYSKSANLSYTD
PYFTKDGVSLGGSVYWNEFDANEANLERYKNKSYGVALNSGFPINEYNRLNGGIGYRHNT
ISEISAYEQALRFYNVYRETDDPNSDLSFDNFELNAGWYRSTLNRGTFPTDGSSQRLSGK
MTVPGSDLQYFKTDFDTNFYFPLTPQHGFVLLARARLGYSNGYGQFNDNDQILPFWENYY
SGGSSSLRGFKSNSVGPRSFYLYRGSEQCAPDVSGDGCSLPGDPNTIQVSSGRSIGGNAI
ATASFEMIVPTPFLDEAYTNSVRTSFFVDAGNVWDTEFDYDSYRTLPADQFSKLEDYSDP
ERLRASWGMSVQWLSPMGPMVFSLAWPLKEYEDDETEIFSFNIGKTF
NT seq
2484 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagatttaataaaatttttgcctcgatgttattcgtcggcgcgtctttttcagggaat
ggttgggcagagtctttccaaccttttgaagtgaccgacatccaagtagaaggtttgcaa
cgagttgctctcggtgcagcactattgagtttacctgtgaaagtaggtgatacagtagat
gaagttaaattacagcaagcgattaagagcctttacggttcaaccaattttgaaaacatc
agtgtcagtcatgaagacggtatactctatgtaacggttaaagaacgtccaactatcagt
attatctcgtttgacggtaataaagatatcaaagacgagcagttacaagaaagtcttgac
ggttctggtgttaaagctggcgaatcacttgatagaaccatgttgtctggcattgaaaaa
ggcctgcaagatttctattacggtgtgggtaaatacggtgccaaagttgaagcgcaaatc
atcaacttacctcgtaaccgtgttgagcttaaatttaagtttaccgaaggtttagcggct
gaaatccgccaaattaacgtggttggtaatactgtattctcagattctgagctcatcagt
atgcttgagcttaaagactatgtggcatggtgggatttgtttggtgagcgtcgctaccaa
aagcaaaagctacaagctgacttagaaaccattaaaacctattaccacaatcaaggctat
attcgctttgaagtgacttcaacacaagtggcgatgacaccagaccgtaaaggtttgtac
atcactattaacgtgaatgaaggtgaaaagtacaaggtgaaagaagttaacttaattggt
gacctaatgggccgagaagagttaatgagatctattttgccaattaaagcgggcaatatg
tacaacggtgcggatgtgacattcaccgaagaaatgtacagcaaataccttggccgcttt
ggttatgcttatcctgaagtaaaaacctatcctgaaattgatgatgaaaccaaagaagtg
gtactcaacatcaatgttaaaccgggtaagcgcgtgtatgttcgctcaattaacttcacc
ggtaacacagttactaaagatgaagttatgcgccgcgaattacgccaaatggaaggtgca
tggttgaattctgctcaaattgaacagtctaagctacgccttaaccgtttaggttatttc
gaaacggttgatgctgaaaccattcaagtaccaggcagtgacgatttagttgatgtcgca
gtaactgtgaaagagcaaccgtcaggttcgttcaacgcaggtgtcggttatggtactgaa
tctggtgtgagcttacagtttggcgttgaacaaaataacttccttggtactggtaaccaa
gctggttttagtgtcaacactaacaaatactcaaaaagtgccaacttgtcttataccgac
ccatacttcactaaagacggtgtcagtttaggtggtagcgtttactggaatgagtttgat
gctaatgaggctaaccttgagcgttataagaataaatcttatggtgttgcattaaactca
ggattcccgattaacgaatataaccgtttgaacggtggtattggttatcgtcataatact
atttcagaaatctctgcttatgaacaagcattgcgtttctacaatgtgtatcgtgaaacg
gatgatcctaattcagacttaagttttgataactttgaattgaatgccggttggtaccgc
agcacacttaaccgtggtacgttcccgacagatggttcgtcgcaacgtttaagcggtaaa
atgaccgtgccaggttctgacttacagtactttaaaacggattttgacaccaacttctac
ttcccactgacacctcagcatgggtttgtattattggctcgcgcccgtttaggttattca
aacggttatggtcagtttaacgacaacgatcaaatcttaccgttctgggaaaactattat
tctggtggtagcagttcgttacgtggctttaagtctaattcagtaggccctcgttcgttc
tatttataccgtggtagtgagcaatgtgcgcctgatgtttcaggtgatggttgtagtttg
ccaggtgacccaaataccattcaggtgagttcaggccgttcaattggtggtaacgccatt
gcaacagcaagctttgaaatgattgttccgacaccattcctcgatgaagcttacactaac
tcagtgcgaacaagtttcttcgttgatgcaggtaacgtatgggatactgagtttgattat
gactcatatcggactttacccgcggatcagttctctaagttagaagactatagcgatcca
gagcgcttacgtgcctcatggggtatgagcgtgcagtggctatcgccaatggggcctatg
gtattcagcttagcttggccactgaaagaatatgaagatgacgagacagagattttctcg
ttcaatattggcaaaacgttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
