Shewanella frigidimarina: Sfri_1300
Help
Entry
Sfri_1300 CDS
T00395
Name
(GenBank) SNF2-related protein
Organism
sfr
Shewanella frigidimarina
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
DEAD
SWIM
ERCC3_RAD25_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABI71153
UniProt:
Q085B2
LinkDB
All DBs
Position
1542734..1545946
Genome browser
AA seq
1070 aa
AA seq
DB search
MSAKLFNLPIKLSLEMIAKLFSATQIQKAQNYLIQGRVLEVTASSNNHDIEAYVEGSAAE
PYRQEITLVNVNHKIVMRSHCTCPVRTNCKHVAAAMLALVDKKPVEEQRIHQWLRQLDEQ
KTVAEFEEEDEEKDRIIYVLSNDPHGIFVEFKRSKLNKKGQYNKGSKLALADIRYSMPWW
IDPEDKQIISLLLSSNNHGSKIYIEGEISFLALTKMLTAEVCFWEENRIPLTWAKSVVPE
FVWCEIDKKHTQMQMRMPGLDNWEFIATEPPLYVELDYLHLGRIETDLPVKKLSLLQHMP
PVPLAQVDAISHKMLQHFSPKTVPVPSEIDFCEITDSLLTRLTFTRELIANNPILQPVIR
VDHCYGEITFNASTKPERISLVKKNQVQYQVHRHVEQELAALQSLADIGLVTLEPDATLA
SSQQPYYVSVGLLPESIFEWSELTENGLDALTALGMEIHFDDDFDLQITDAQLDVDLVDD
DESGWFSLSLSADIDGQSVPLLALVARWLQQNGEPADDDELLLPGPNGGFIKIKAKTIKP
LISIIQELFNRHSGDVISIPRNRAHILNDLSASDVRLLNGERVRNLAAKLAEFKGVVPVE
LPDGLNATLRDYQKQGFDWLCFLKEYQLGGILADDMGLGKTVQALAFLLKAKQDATERRT
SLIVCPTSLVGNWLKEANKFAPSLNVVVIHGNKRQPLLDQINQFDVVVTTYPLMLRDEAI
YCEYVFEHIILDEAQQIKNAQAKVTQVIKTLRGRFRLCLSGTPLENHLGELKSLMDFCLP
GLLGQHTYFNKQFRGPIEKQADVEKSQLLSQRIAPFMLRRTKKEVVSELPEKTVIIQTLE
LERDQRNLYESIRLVMEKKLRELFAKKGVSSSHIEFLDALLKLRQACCDPRLVKLEQAQQ
VKDNAKMTWLIQNLPEMIEEGRKILIFSQFTGMLALIEDELKRLTISYSKLTGQTRDRQT
QIDAFQEGDNSVFLISLKAGGTGLNLTAADTVIHFDPWWNPAAERQATDRAHRIGQLNPV
FVYKLIAQGTVEEKIQEMQQHKQGLADSILSDGTQGPWQGSANDLLALLS
NT seq
3213 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcggcgaaactgtttaatctccccattaagctttcattagagatgattgcgaaactg
ttttcggccacccaaattcaaaaagcgcaaaactatttgatccaaggtcgagttctagaa
gttactgccagcagtaataatcatgatattgaggcctatgtagaaggctctgctgctgaa
ccctatcgtcaagaaatcactctggttaatgttaatcacaaaattgtgatgcgttcacat
tgtacttgccctgttagaacaaactgcaaacacgtagctgctgcgatgctggcactggtc
gataaaaaaccggttgaagagcaacgtatccaccaatggttacgccaacttgacgagcaa
aaaacggttgccgaatttgaggaagaggacgaagaaaaagatcgcattatttatgtgtta
tccaatgatcctcatggtatttttgtcgaatttaaacgcagtaaattaaataaaaaaggc
caatacaataaaggcagcaagctggcattagccgatattcgctatagtatgccgtggtgg
atagaccctgaagataaacagattatcagcttgttactgtcatcaaataatcatggctct
aaaatttatattgaaggtgagatttcatttttagcactgactaaaatgctcacagccgaa
gtgtgtttttgggaagaaaaccgtattcccctgacatgggctaaatctgttgtacctgaa
tttgtctggtgtgaaattgataaaaaacatacccaaatgcaaatgcgcatgcctgggctg
gataattgggagtttattgctaccgagccacctttgtatgttgaattagactatttgcat
ctaggtagaatagaaactgatttaccagttaaaaagttaagtttattgcaacacatgccg
ccagtgcccttggctcaagtagatgccattagtcataaaatgctccagcatttttcacct
aaaacggtgcctgttcctagtgaaattgatttttgcgagataacagactcactgttaaca
cgcttaacctttacgcgtgagctcattgccaacaacccgattctgcaaccggttattcgt
gttgatcattgttacggtgaaattacctttaatgcatcgactaaacccgaacgcataagc
ttagtcaaaaaaaatcaagttcaatatcaagtgcatagacatgtcgagcaagaactcgcg
gcattacagtcattagcggatataggcttagtgacgcttgagccagacgctacgctggcc
agttcacaacaaccctattatgtcagtgtcgggttattacccgagtcgatttttgaatgg
tctgaattgaccgaaaatggtcttgatgcattaactgccctggggatggagattcatttt
gatgatgacttcgacttacaaattaccgatgcacagttagatgtcgacttagttgacgat
gatgagtctggctggttttcattatcgctcagtgccgacatcgatggccaaagtgtaccg
ttattagccttagttgcccgttggttgcagcaaaatggtgagccggcagacgatgatgaa
ttgttattacctggccctaacggtggttttattaaaataaaagccaaaaccattaagccg
ctgattagtattatccaagaattatttaatcgtcattctggtgatgtcatttcgatacca
cgcaaccgtgcgcatattttgaatgatttatctgccagtgacgtgcgtttgcttaatggc
gaacgtgtgcgcaatttagccgccaaactcgcagagtttaaaggggtggttccggttgag
ttacctgatggcctaaatgcgacattacgtgattatcaaaaacaaggttttgactggttg
tgttttcttaaggaatatcaactaggtggtattttagccgatgacatgggcttaggtaaa
accgtacaagcgttggcatttttactcaaagccaagcaagacgctaccgagcgtcgcacc
agtttaattgtttgccccactagcttagtggggaactggttaaaagaagccaataagttt
gctccgtcgctgaatgtggtggtgatccacggcaataaacgccaacctttattagatcaa
attaatcagtttgatgtggtcgtgacaacctatccattaatgttacgtgatgaagccatt
tattgtgaatatgtgtttgagcatattattttggatgaagcacaacaaattaagaatgcc
caagcaaaagtcacccaagtgattaaaactctaagaggtcgattccgcttatgtttatcg
ggtacgccgcttgaaaaccatttaggcgaattaaaatcattgatggatttttgtttgcca
ggtttattaggtcagcatacctactttaataagcagttccgtggtccgattgagaagcag
gccgatgttgaaaagtcgcagttactgagtcagcgtattgctccctttatgctgcgccgc
actaaaaaagaagtggtgtctgaattacctgaaaaaaccgtgattattcaaactctggaa
cttgaaagagatcaacgtaatttgtatgagtctatccgtttagtgatggagaaaaaattg
cgtgaactgtttgccaagaaaggggtgtcgagcagtcatattgagtttttagatgcattg
ttgaaattacgtcaagcctgttgcgacccacgtttagtgaagcttgaacaagctcaacaa
gttaaagacaacgcaaaaatgacctggttaatccaaaacctgcctgaaatgattgaagaa
ggtcgtaaaatccttatcttcagccaatttactggcatgttagcgttgattgaagacgaa
ctaaaacgcttaacaattagctacagtaaattaacgggacaaactcgcgaccgtcaaacc
cagattgatgcttttcaagagggggataactcggtgtttttgatcagtttaaaagcgggt
ggaaccgggcttaacctcactgccgcagacacggttattcattttgacccgtggtggaac
cctgcagcggagcgccaagcgaccgatcgtgctcatcgtattggccagttaaacccggtg
tttgtttataaactgattgcccagggcaccgttgaagagaagattcaagaaatgcagcag
cacaaacaaggtttggctgacagtattttatctgatgggactcaaggtccatggcagggc
agtgcgaacgatttattagcattgttgagttaa
DBGET
integrated database retrieval system
