KEGG   Shewanella frigidimarina: Sfri_2471
Entry
Sfri_2471         CDS       T00395                                 
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
  KO
K02014  iron complex outermembrane recepter protein
Organism
sfr  Shewanella frigidimarina
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:sfr00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:sfr02000]
    Sfri_2471
Transporters [BR:sfr02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   Sfri_2471
SSDB
Motif
Pfam: TonB_dep_Rec_b-barrel Plug
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABI72316
UniProt: Q080J9
LinkDB
Position
2945933..2948806
AA seq 957 aa
MQANSHLAKAIRFALISGVAVSAATTFNTVAAEDAANTAPAVERISVTGSRIIREGAVAP
TPVTVITGDELLSTGVTNIGEALNQLPALGNTYSLANSGRFIGTSGLNLLDLRSMGTART
LVLVDGKRHVSSSAGTSSVDVNTIPSVWIDRVEVITGGASAIYGADAVTGVVNFILKKDI
NGLDVSATKGWADDSGHNKDRFSLSYGSDFAQGDGNVAFAVEYSAQEQLRAFDRDQTSTA
FSSLANKNRTEDNNDPSDPDKIWTPNAGHYTISNAGTFNLDGWKSFNPDGSLSDVYSGQN
VDGIRCANCDVTNLNQFVELQPEFERYNINFKANYQLNDNHNVYFEAKYVNSQSTDEGQP
AFFFGNPVNDIKIDNAFINPELVALMKANKDSDGNSAPLDTLNIRRFMTDLGARIEDDTR
ETQRYVIGLEGIVFQDWDYDAYAIYGQTDLERVNKNNLIYDNYTNALDSVLENGIAVCRD
QSARDAGCVPVNIFGFGAPSQDAINYINTASTGTSIIKQTVLGGSLTNSSLFELPAGYAG
FSTGVEYRKEESEIFEPSNAAGTFFNALGEDKGDFDVSEIFAEITLPLLADLPMVRQLDL
DLAIRFADYSTIGNATTWKTGLSWEVDDQIRVRTTYSEAIRAPNISELYGAASQTFFSVD
DSCRAKNLNDLADPTQRQANCAALGIPAGFDADYDDKTLEGLSGGNRELQAEESKSFTLG
IVYQPDFIDGLSITTDYWNIEIENAISAVGAQDIIDRCVDSKSGVNNEYCSLITRDSTSH
EITQIRQFSLNIASLEAAGIDFDIGYNFEAFSGDVRTNLIATRLLKRKDFSFQDEPDTFE
ELAGTAGYAEWQANWSLSYSIDSWDVSWRTRYVEGVSLYTDKELALNANPNSNMEFGDYF
INDMAVAYNFDSGIRLKFGIDNVFNRELPYGYTGTDTDSSAYDNVGRFFHTTATYKF
NT seq 2874 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcaagctaattcacatttagccaaagctattcgctttgcgctaatcagtggcgttgcc
gtttctgcagcaaccacattcaatactgttgcagcagaagacgcagcgaatactgcacct
gctgtcgagagaatctcggtaacgggctcacgaattattcgtgaaggtgctgttgcacca
acgccagttacagtaattactggcgacgagttattatcaactggtgtaacaaatattggt
gaagcgctaaaccaattacctgcactaggtaacacctactcacttgccaactcaggccgc
tttattggtacttcgggtcttaacttactcgatttaagaagcatgggtaccgccagaaca
ctcgtgttagtggacggtaaacgccatgtatcaagttctgcaggtacttcttcagtcgac
gtcaataccattccaagtgtatggatcgatagagttgaagtaattaccggcggtgcatct
gcaatttacggtgccgatgcggtaaccggtgttgtaaacttcattttaaagaaagatatt
aatggcttagatgtatctgcaaccaaaggttgggctgacgatagtggtcacaataaagac
cgtttctcattatcttatggttctgattttgcccagggtgatggtaacgttgcctttgcg
gttgagtacagcgctcaagagcaattaagagcatttgatcgcgatcagacttcaactgct
ttttcgagcctagcaaataaaaaccgcactgaagataataatgacccatcagatccagac
aaaatatggactcctaatgcaggtcactacacaattagtaatgccggtaccttcaattta
gatggttggaaaagctttaaccctgatggctcattaagcgatgtttatagcggtcaaaat
gttgatggtattcgttgtgcaaattgcgatgtcactaacttaaaccagtttgtagaatta
caacctgaattcgaacgttacaatattaactttaaagcaaactaccagcttaacgataat
cataacgtttattttgaagctaaatacgttaacagccaatcaacagatgaaggtcaacca
gcatttttctttggtaatccggttaacgatatcaaaattgataacgcttttatcaatcct
gaactggttgctttaatgaaagcaaacaaggatagcgacggtaattcagcgccattagat
acacttaatattcgtcgttttatgacggacttgggtgcgcgcattgaagatgatactcgc
gaaactcaacgttatgttatcggtcttgaaggtatagtattccaagattgggattacgat
gcctatgctatttatggtcaaactgatttagagcgcgttaataaaaataacttaatctat
gacaattacaccaacgcccttgattctgtattagaaaacgggattgcggtttgtcgtgat
cagtcagctagagatgcaggctgtgtgccagtcaacatttttggttttggcgcaccaagt
caagatgcgattaattatattaataccgcttcaactggtacatcgattattaagcaaacc
gtattaggtggctcactaactaactctagtttatttgaattacctgccggttatgcaggc
ttctctactggtgttgaataccgtaaagaagaaagtgagatatttgaaccttcaaatgca
gcaggtactttcttcaatgcattaggcgaagataaaggcgattttgatgtaagcgaaatc
tttgctgaaatcacgcttcctttgttagccgatttaccaatggtacgtcagctagactta
gatcttgcaatacgctttgctgattacagcaccattggtaatgctacaacatggaaaacg
ggtttaagctgggaagttgatgatcagatccgcgttcgtactacatactcagaagctatt
cgtgcacctaacatcagtgagctttatggtgctgcaagccaaacattcttctctgtagat
gactcttgtcgtgctaaaaacttaaatgatctggctgatccaactcaacgccaagctaac
tgtgcggcgttagggatccctgctggttttgacgctgactacgacgataaaacgcttgaa
ggattaagtggtggtaatcgcgagctacaagcagaagaatcgaaaagtttcacgttaggg
attgtttatcaacctgattttattgatggtttatcgatcactaccgattattggaatatt
gagatcgaaaatgccatcagtgctgttggcgcccaagatattatcgatcgttgtgttgat
tctaaatctggtgtgaataatgaatactgtagtttgattactcgtgattcaactagccac
gaaatcactcaaattagacagttctcgttgaacattgcgtcgcttgaagctgctggtatt
gactttgatattggttataactttgaagcctttagtggtgacgtacgcactaaccttatt
gcgactcgtctactaaaacgtaaagacttttcattccaggatgaaccagatacctttgaa
gaacttgcaggcacggctggctatgctgaatggcaagcaaactggagcctaagttactca
atcgatagctgggatgttagctggagaacgcgctatgtcgagggtgtaagcctttatact
gataaggaattagccttaaacgcgaatcctaatagcaacatggaatttggcgattacttt
atcaacgatatggcagttgcatacaacttcgattcaggtattagattgaagtttggtatc
gacaacgtgtttaaccgtgaattaccttacggctacacaggtactgatactgatagttca
gcttacgataacgttggccgtttcttccatactacggctacttacaagttctaa

DBGET integrated database retrieval system